MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_022234	ATCG	2	8	305623	305630	25 %	25 %	25 %	25 %	538344489
8002	NC_022234	CGC	2	6	305663	305668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344489
8003	NC_022234	TGG	2	6	305672	305677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344489
8004	NC_022234	CG	3	6	305680	305685	0 %	0 %	50 %	50 %	538344489
8005	NC_022234	CGG	2	6	305856	305861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344490
8006	NC_022234	CCGA	2	8	305867	305874	25 %	0 %	25 %	50 %	538344490
8007	NC_022234	GC	3	6	305882	305887	0 %	0 %	50 %	50 %	538344490
8008	NC_022234	GGA	2	6	305954	305959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344490
8009	NC_022234	GCC	2	6	305969	305974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344490
8010	NC_022234	GGC	2	6	305977	305982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344490
8011	NC_022234	TCG	2	6	306012	306017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344490
8012	NC_022234	GCGCC	2	10	306036	306045	0 %	0 %	40 %	60 %	538344490
8013	NC_022234	AAG	2	6	306056	306061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344490
8014	NC_022234	CGC	2	6	306114	306119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344490
8015	NC_022234	TCA	2	6	306204	306209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344490
8016	NC_022234	GTT	2	6	306250	306255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344490
8017	NC_022234	CGGC	2	8	306264	306271	0 %	0 %	50 %	50 %	538344490
8018	NC_022234	CCGGC	2	10	306303	306312	0 %	0 %	40 %	60 %	538344490
8019	NC_022234	CGG	2	6	306328	306333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344490
8020	NC_022234	TGC	2	6	306468	306473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344490
8021	NC_022234	CGC	2	6	306522	306527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344490
8022	NC_022234	GCC	2	6	306551	306556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344490
8023	NC_022234	ACCG	2	8	306587	306594	25 %	0 %	25 %	50 %	538344490
8024	NC_022234	GCT	2	6	306616	306621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344490
8025	NC_022234	GCCG	2	8	306622	306629	0 %	0 %	50 %	50 %	538344490
8026	NC_022234	CGGCG	2	10	306640	306649	0 %	0 %	60 %	40 %	538344490
8027	NC_022234	TCGC	2	8	306675	306682	0 %	25 %	25 %	50 %	538344490
8028	NC_022234	GGC	2	6	306694	306699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344490
8029	NC_022234	TC	3	6	306711	306716	0 %	50 %	0 %	50 %	538344490
8030	NC_022234	GCA	3	9	306731	306739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344491
8031	NC_022234	CGGTC	2	10	306762	306771	0 %	20 %	40 %	40 %	538344491
8032	NC_022234	GCC	2	6	306778	306783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344491
8033	NC_022234	GC	3	6	306797	306802	0 %	0 %	50 %	50 %	538344491
8034	NC_022234	GC	4	8	306810	306817	0 %	0 %	50 %	50 %	538344491
8035	NC_022234	CCTG	2	8	306854	306861	0 %	25 %	25 %	50 %	538344491
8036	NC_022234	AGA	2	6	306881	306886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344491
8037	NC_022234	GGC	3	9	306888	306896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344491
8038	NC_022234	TGCGG	2	10	306908	306917	0 %	20 %	60 %	20 %	538344491
8039	NC_022234	GTC	2	6	306946	306951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344491
8040	NC_022234	GCG	2	6	306955	306960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344491
8041	NC_022234	GCA	2	6	307097	307102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344491
8042	NC_022234	GTC	2	6	307143	307148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344491
8043	NC_022234	GAG	2	6	307198	307203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344491
8044	NC_022234	GC	6	12	307242	307253	0 %	0 %	50 %	50 %	538344491
8045	NC_022234	CG	3	6	307281	307286	0 %	0 %	50 %	50 %	538344491
8046	NC_022234	TCGA	2	8	307364	307371	25 %	25 %	25 %	25 %	538344491
8047	NC_022234	CGGC	2	8	307421	307428	0 %	0 %	50 %	50 %	538344491
8048	NC_022234	CAC	2	6	307442	307447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344491
8049	NC_022234	TTC	2	6	307462	307467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344491
8050	NC_022234	GAG	2	6	307471	307476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344491
8051	NC_022234	GTCCG	2	10	307626	307635	0 %	20 %	40 %	40 %	538344491
8052	NC_022234	GAC	2	6	307666	307671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344491
8053	NC_022234	CGA	2	6	307709	307714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344491
8054	NC_022234	TGCA	2	8	307738	307745	25 %	25 %	25 %	25 %	538344491
8055	NC_022234	CG	3	6	307868	307873	0 %	0 %	50 %	50 %	538344491
8056	NC_022234	TGC	2	6	307946	307951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344491
8057	NC_022234	GCG	2	6	308008	308013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344491
8058	NC_022234	GCG	3	9	308038	308046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344491
8059	NC_022234	GTG	2	6	308086	308091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344491
8060	NC_022234	AGCG	2	8	308140	308147	25 %	0 %	50 %	25 %	538344491
8061	NC_022234	CGG	2	6	308239	308244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344492
8062	NC_022234	CCG	2	6	308304	308309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344492
8063	NC_022234	ACA	2	6	308315	308320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344492
8064	NC_022234	TGCGC	2	10	308322	308331	0 %	20 %	40 %	40 %	538344492
8065	NC_022234	GCG	2	6	308368	308373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344492
8066	NC_022234	AGTGC	2	10	308488	308497	20 %	20 %	40 %	20 %	538344492
8067	NC_022234	GCA	2	6	308505	308510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344492
8068	NC_022234	CTGC	2	8	308538	308545	0 %	25 %	25 %	50 %	538344492
8069	NC_022234	GGC	2	6	308563	308568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344492
8070	NC_022234	TGG	2	6	308583	308588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344492
8071	NC_022234	ATC	2	6	308591	308596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344492
8072	NC_022234	CGA	2	6	308631	308636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344492
8073	NC_022234	CTT	2	6	308661	308666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344492
8074	NC_022234	CGA	2	6	308667	308672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344492
8075	NC_022234	CGG	2	6	308758	308763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344492
8076	NC_022234	CGT	2	6	308814	308819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344492
8077	NC_022234	CAAA	2	8	308826	308833	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8078	NC_022234	GCG	2	6	308861	308866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344493
8079	NC_022234	CAG	2	6	308936	308941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344493
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8081	NC_022234	CGCAG	2	10	308965	308974	20 %	0 %	40 %	40 %	538344493
8082	NC_022234	TTC	2	6	309063	309068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344493
8083	NC_022234	CG	3	6	309092	309097	0 %	0 %	50 %	50 %	538344493
8084	NC_022234	ACG	2	6	309147	309152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344493
8085	NC_022234	GC	3	6	309176	309181	0 %	0 %	50 %	50 %	538344493
8086	NC_022234	GGT	2	6	309188	309193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344493
8087	NC_022234	GC	3	6	309194	309199	0 %	0 %	50 %	50 %	538344493
8088	NC_022234	GGC	2	6	309224	309229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344493
8089	NC_022234	CAG	2	6	309260	309265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344493
8090	NC_022234	GTC	2	6	309278	309283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344493
8091	NC_022234	TCCA	2	8	309290	309297	25 %	25 %	0 %	50 %	538344493
8092	NC_022234	GC	3	6	309345	309350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8093	NC_022234	CTG	2	6	309411	309416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344494
8094	NC_022234	TAG	2	6	309451	309456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344494
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8096	NC_022234	CTG	2	6	309534	309539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344494
8097	NC_022234	CAG	2	6	309540	309545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344494
8098	NC_022234	GCCG	2	8	309564	309571	0 %	0 %	50 %	50 %	538344494
8099	NC_022234	GGT	2	6	309573	309578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344494
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8103	NC_022234	GCA	2	6	309740	309745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344494
8104	NC_022234	GCA	2	6	309776	309781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344494
8105	NC_022234	CATCG	2	10	309789	309798	20 %	20 %	20 %	40 %	538344494
8106	NC_022234	TGA	2	6	310001	310006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344494
8107	NC_022234	TGG	2	6	310046	310051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344494
8108	NC_022234	GC	3	6	310064	310069	0 %	0 %	50 %	50 %	538344494
8109	NC_022234	CGCAGG	2	12	310075	310086	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538344494
8110	NC_022234	TCG	2	6	310096	310101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344494
8111	NC_022234	GCC	2	6	310119	310124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344494
8112	NC_022234	AAT	2	6	310238	310243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538344494
8113	NC_022234	GCC	2	6	310258	310263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344494
8114	NC_022234	CG	4	8	310274	310281	0 %	0 %	50 %	50 %	538344494
8115	NC_022234	GAA	2	6	310287	310292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344494
8116	NC_022234	TGA	2	6	310304	310309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344494
8117	NC_022234	GC	3	6	310405	310410	0 %	0 %	50 %	50 %	538344494
8118	NC_022234	GGT	2	6	310436	310441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344494
8119	NC_022234	TGC	2	6	310466	310471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344494
8120	NC_022234	AG	3	6	310590	310595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_022234	GGC	2	6	310608	310613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_022234	TCT	2	6	310616	310621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_022234	CGA	2	6	310630	310635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_022234	GGA	2	6	310652	310657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_022234	CGC	2	6	310669	310674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344495
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8368	NC_022234	GC	3	6	319636	319641	0 %	0 %	50 %	50 %	538344504
8369	NC_022234	GCA	2	6	319651	319656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344504
8370	NC_022234	TGGCC	2	10	319688	319697	0 %	20 %	40 %	40 %	538344504
8371	NC_022234	ACG	2	6	319731	319736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344504
8372	NC_022234	GCA	2	6	319822	319827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344504
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8374	NC_022234	CGT	2	6	319856	319861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344504
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8385	NC_022234	TCG	2	6	320489	320494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8387	NC_022234	CGG	2	6	320547	320552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8389	NC_022234	GCATC	2	10	320627	320636	20 %	20 %	20 %	40 %	538344505
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8397	NC_022234	A	6	6	320902	320907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8398	NC_022234	ACGA	2	8	320911	320918	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8399	NC_022234	A	7	7	320924	320930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8402	NC_022234	GGC	2	6	321214	321219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344506
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8474	NC_022234	ACG	2	6	323970	323975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344508
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8480	NC_022234	CAG	2	6	324227	324232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344508
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8482	NC_022234	CTG	2	6	324422	324427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344508
8483	NC_022234	GCCGG	2	10	324429	324438	0 %	0 %	60 %	40 %	538344508
8484	NC_022234	GCC	2	6	324454	324459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344508
8485	NC_022234	GCT	2	6	324460	324465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344508
8486	NC_022234	CGA	2	6	324466	324471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344508
8487	NC_022234	AGC	2	6	324510	324515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344508
8488	NC_022234	CGCAG	2	10	324533	324542	20 %	0 %	40 %	40 %	538344508
8489	NC_022234	GGC	2	6	324565	324570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344508
8490	NC_022234	CGG	2	6	324676	324681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344508
8491	NC_022234	CGCC	2	8	324684	324691	0 %	0 %	25 %	75 %	538344508
8492	NC_022234	GGTC	2	8	324703	324710	0 %	25 %	50 %	25 %	538344508
8493	NC_022234	ACG	3	9	324747	324755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344508
8494	NC_022234	GA	3	6	324787	324792	50 %	0 %	50 %	0 %	538344508
8495	NC_022234	CAG	2	6	324830	324835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344508
8496	NC_022234	GC	3	6	324857	324862	0 %	0 %	50 %	50 %	538344508
8497	NC_022234	CG	3	6	324935	324940	0 %	0 %	50 %	50 %	538344508
8498	NC_022234	TGC	2	6	324972	324977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344508
8499	NC_022234	CG	4	8	325126	325133	0 %	0 %	50 %	50 %	538344508
8500	NC_022234	AGCGC	2	10	325168	325177	20 %	0 %	40 %	40 %	538344508

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