MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022234	CCGG	2	8	170311	170318	0 %	0 %	50 %	50 %	538344367
4502	NC_022234	TGG	2	6	170396	170401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344367
4503	NC_022234	CAT	2	6	170424	170429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344367
4504	NC_022234	ACG	2	6	170458	170463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344367
4505	NC_022234	GTT	2	6	170484	170489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344367
4506	NC_022234	AGT	2	6	170495	170500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344367
4507	NC_022234	GCC	2	6	170524	170529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344367
4508	NC_022234	CAC	2	6	170554	170559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344367
4509	NC_022234	GCG	2	6	170569	170574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344367
4510	NC_022234	GTC	2	6	170577	170582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344367
4511	NC_022234	GAG	3	9	170593	170601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344367
4512	NC_022234	AGCGC	2	10	170603	170612	20 %	0 %	40 %	40 %	538344367
4513	NC_022234	GC	3	6	170624	170629	0 %	0 %	50 %	50 %	538344367
4514	NC_022234	GGC	2	6	170655	170660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344367
4515	NC_022234	CGG	2	6	170692	170697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344367
4516	NC_022234	CCGT	2	8	170853	170860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_022234	GC	3	6	170875	170880	0 %	0 %	50 %	50 %	538344368
4518	NC_022234	CGC	2	6	170900	170905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344368
4519	NC_022234	GCGT	2	8	170908	170915	0 %	25 %	50 %	25 %	538344368
4520	NC_022234	CGG	2	6	170924	170929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344368
4521	NC_022234	AAG	2	6	170934	170939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344368
4522	NC_022234	GGCC	2	8	170940	170947	0 %	0 %	50 %	50 %	538344368
4523	NC_022234	TTC	2	6	170964	170969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344368
4524	NC_022234	TGA	2	6	170999	171004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344368
4525	NC_022234	GCC	2	6	171024	171029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344368
4526	NC_022234	GGCG	2	8	171057	171064	0 %	0 %	75 %	25 %	538344368
4527	NC_022234	CG	3	6	171105	171110	0 %	0 %	50 %	50 %	538344368
4528	NC_022234	CAG	2	6	171120	171125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344368
4529	NC_022234	GGT	2	6	171135	171140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344368
4530	NC_022234	CGTC	2	8	171209	171216	0 %	25 %	25 %	50 %	538344368
4531	NC_022234	TCG	2	6	171218	171223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344368
4532	NC_022234	CGG	2	6	171239	171244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344368
4533	NC_022234	CG	3	6	171296	171301	0 %	0 %	50 %	50 %	538344368
4534	NC_022234	CGA	2	6	171320	171325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344368
4535	NC_022234	TCG	2	6	171334	171339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344368
4536	NC_022234	ACC	2	6	171346	171351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344368
4537	NC_022234	AGC	2	6	171394	171399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344368
4538	NC_022234	AGG	2	6	171529	171534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344368
4539	NC_022234	GC	3	6	171584	171589	0 %	0 %	50 %	50 %	538344368
4540	NC_022234	GGCC	2	8	171602	171609	0 %	0 %	50 %	50 %	538344368
4541	NC_022234	ATC	2	6	171765	171770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_022234	CGCT	2	8	171786	171793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4543	NC_022234	GGC	2	6	171794	171799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_022234	AGG	2	6	171841	171846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_022234	CAA	2	6	171878	171883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_022234	GCT	2	6	171926	171931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_022234	GGC	2	6	171932	171937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_022234	GCG	2	6	171943	171948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_022234	GCA	3	9	171998	172006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_022234	GCG	2	6	172021	172026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_022234	GCA	2	6	172028	172033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_022234	CCA	2	6	172048	172053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_022234	CTCG	2	8	172055	172062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_022234	GCT	2	6	172133	172138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_022234	GGCA	2	8	172153	172160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_022234	GAC	2	6	172260	172265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_022234	GC	3	6	172320	172325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_022234	ACGCC	2	10	172335	172344	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4559	NC_022234	ACC	2	6	172412	172417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_022234	ACGCGG	2	12	172457	172468	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_022234	AAG	2	6	172502	172507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_022234	CGA	2	6	172528	172533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_022234	GC	3	6	172579	172584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_022234	GCC	2	6	172598	172603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_022234	GCC	2	6	172654	172659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_022234	GAA	2	6	172661	172666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_022234	GC	3	6	172678	172683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4568	NC_022234	GC	3	6	172766	172771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_022234	GCAAT	2	10	172817	172826	40 %	20 %	20 %	20 %	538344369
4570	NC_022234	TCG	3	9	172876	172884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344369
4571	NC_022234	GCCG	2	8	172886	172893	0 %	0 %	50 %	50 %	538344369
4572	NC_022234	CG	3	6	172903	172908	0 %	0 %	50 %	50 %	538344369
4573	NC_022234	GGC	2	6	172959	172964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344369
4574	NC_022234	CTGCGC	2	12	172980	172991	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344369
4575	NC_022234	GCG	2	6	173051	173056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344369
4576	NC_022234	ATCG	2	8	173082	173089	25 %	25 %	25 %	25 %	538344369
4577	NC_022234	TTC	2	6	173092	173097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344369
4578	NC_022234	GCGG	2	8	173188	173195	0 %	0 %	75 %	25 %	538344369
4579	NC_022234	GCAG	2	8	173266	173273	25 %	0 %	50 %	25 %	538344369
4580	NC_022234	GCA	2	6	173291	173296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344369
4581	NC_022234	TGC	2	6	173366	173371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344369
4582	NC_022234	A	6	6	173396	173401	100 %	0 %	0 %	0 %	538344370
4583	NC_022234	GCC	2	6	173457	173462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344370
4584	NC_022234	CAAGCT	2	12	173529	173540	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538344370
4585	NC_022234	CGA	2	6	173541	173546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344370
4586	NC_022234	AGC	2	6	173572	173577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344370
4587	NC_022234	GCC	2	6	173597	173602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344370
4588	NC_022234	CGA	2	6	173628	173633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344370
4589	NC_022234	CGA	2	6	173742	173747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344370
4590	NC_022234	CGC	2	6	173769	173774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344370
4591	NC_022234	GCACC	2	10	173850	173859	20 %	0 %	20 %	60 %	538344370
4592	NC_022234	GCT	2	6	173871	173876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344370
4593	NC_022234	GCC	2	6	173878	173883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344370
4594	NC_022234	CGG	2	6	173944	173949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344370
4595	NC_022234	CG	3	6	173955	173960	0 %	0 %	50 %	50 %	538344370
4596	NC_022234	CG	3	6	173973	173978	0 %	0 %	50 %	50 %	538344370
4597	NC_022234	CGAG	2	8	173987	173994	25 %	0 %	50 %	25 %	538344370
4598	NC_022234	AAG	2	6	173998	174003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344370
4599	NC_022234	CGC	2	6	174012	174017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344370
4600	NC_022234	GC	3	6	174044	174049	0 %	0 %	50 %	50 %	538344370
4601	NC_022234	CGC	2	6	174090	174095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344370
4602	NC_022234	GGC	2	6	174102	174107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344370
4603	NC_022234	GACA	2	8	174150	174157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4604	NC_022234	TGG	2	6	174224	174229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344371
4605	NC_022234	ACCG	2	8	174262	174269	25 %	0 %	25 %	50 %	538344371
4606	NC_022234	CAC	2	6	174328	174333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344371
4607	NC_022234	GCCG	2	8	174353	174360	0 %	0 %	50 %	50 %	538344371
4608	NC_022234	TCGT	2	8	174394	174401	0 %	50 %	25 %	25 %	538344371
4609	NC_022234	GC	4	8	174436	174443	0 %	0 %	50 %	50 %	538344371
4610	NC_022234	CCA	2	6	174458	174463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344371
4611	NC_022234	GAC	2	6	174598	174603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344371
4612	NC_022234	GAG	2	6	174625	174630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344371
4613	NC_022234	GCG	2	6	174700	174705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344371
4614	NC_022234	CG	3	6	174704	174709	0 %	0 %	50 %	50 %	538344371
4615	NC_022234	CGT	2	6	174811	174816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344372
4616	NC_022234	GCA	2	6	174853	174858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344372
4617	NC_022234	GGC	2	6	174901	174906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344372
4618	NC_022234	GCA	2	6	174907	174912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344372
4619	NC_022234	CCG	2	6	174962	174967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344372
4620	NC_022234	ACC	3	9	175014	175022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344372
4621	NC_022234	AGG	2	6	175023	175028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344372
4622	NC_022234	GCC	2	6	175034	175039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344372
4623	NC_022234	AGC	2	6	175062	175067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344372
4624	NC_022234	GC	3	6	175101	175106	0 %	0 %	50 %	50 %	538344372
4625	NC_022234	TCA	2	6	175170	175175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344372
4626	NC_022234	GGGC	2	8	175183	175190	0 %	0 %	75 %	25 %	538344372
4627	NC_022234	ACG	2	6	175245	175250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344372
4628	NC_022234	CGG	2	6	175315	175320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344372
4629	NC_022234	CGA	2	6	175345	175350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344372
4630	NC_022234	CG	3	6	175364	175369	0 %	0 %	50 %	50 %	538344372
4631	NC_022234	AGC	2	6	175409	175414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344372
4632	NC_022234	TCA	2	6	175449	175454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344372
4633	NC_022234	CGG	2	6	175512	175517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344372
4634	NC_022234	AAG	2	6	175532	175537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344372
4635	NC_022234	CCG	2	6	175538	175543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344372
4636	NC_022234	TGC	2	6	175596	175601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344372
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4639	NC_022234	GCG	2	6	175645	175650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4640	NC_022234	TCG	2	6	175712	175717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344373
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4643	NC_022234	CG	4	8	175833	175840	0 %	0 %	50 %	50 %	538344373
4644	NC_022234	GCGG	2	8	175903	175910	0 %	0 %	75 %	25 %	538344373
4645	NC_022234	GC	4	8	175933	175940	0 %	0 %	50 %	50 %	538344373
4646	NC_022234	GCT	3	9	175959	175967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344373
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4654	NC_022234	TGC	2	6	176228	176233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344373
4655	NC_022234	GCT	2	6	176271	176276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344373
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4657	NC_022234	GAT	2	6	176292	176297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344373
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4666	NC_022234	GC	3	6	176566	176571	0 %	0 %	50 %	50 %	538344373
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4680	NC_022234	GC	3	6	177197	177202	0 %	0 %	50 %	50 %	538344374
4681	NC_022234	GGGC	2	8	177205	177212	0 %	0 %	75 %	25 %	538344374
4682	NC_022234	ACG	2	6	177237	177242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344374
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4686	NC_022234	TGG	2	6	177314	177319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344375
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4689	NC_022234	GGCCAT	2	12	177363	177374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538344375
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4699	NC_022234	GC	3	6	177751	177756	0 %	0 %	50 %	50 %	538344375
4700	NC_022234	CG	3	6	177810	177815	0 %	0 %	50 %	50 %	538344375
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4710	NC_022234	CTG	2	6	178036	178041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344375
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4733	NC_022234	CG	3	6	178933	178938	0 %	0 %	50 %	50 %	538344377
4734	NC_022234	CGT	2	6	179006	179011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344377
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4746	NC_022234	GCCT	2	8	179335	179342	0 %	25 %	25 %	50 %	538344377
4747	NC_022234	CGTCGA	2	12	179348	179359	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538344377
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4752	NC_022234	AT	3	6	179626	179631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4856	NC_022234	CACG	2	8	182777	182784	25 %	0 %	25 %	50 %	538344380
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4860	NC_022234	GCT	2	6	182897	182902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344380
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4991	NC_022234	CGG	2	6	186938	186943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4992	NC_022234	CAG	2	6	187032	187037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344385
4993	NC_022234	GCC	2	6	187056	187061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344385
4994	NC_022234	TTC	2	6	187064	187069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344385
4995	NC_022234	CG	3	6	187114	187119	0 %	0 %	50 %	50 %	538344385
4996	NC_022234	AGG	2	6	187150	187155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344385
4997	NC_022234	CGCC	2	8	187168	187175	0 %	0 %	25 %	75 %	538344385
4998	NC_022234	CAC	2	6	187190	187195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344385
4999	NC_022234	GAA	2	6	187289	187294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344385
5000	NC_022234	CGGC	2	8	187312	187319	0 %	0 %	50 %	50 %	538344385

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