MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021848	GTA	2	6	69	74	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021848	GTA	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021848	AGG	2	6	182	187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021848	GCG	2	6	254	259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021848	CGA	2	6	318	323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021848	GAC	2	6	347	352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021848	GT	3	6	353	358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021848	G	6	6	406	411	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021848	TCC	2	6	416	421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_021848	TAC	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021848	TGAC	2	8	437	444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021848	GTAC	2	8	520	527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021848	GGA	2	6	725	730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021848	TAC	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021848	AGTA	2	8	923	930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021848	AC	3	6	942	947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021848	CGTC	2	8	960	967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021848	AAC	2	6	979	984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021848	TAC	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021848	AGC	2	6	1068	1073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021848	CAT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021848	AAAG	2	8	1082	1089	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021848	AGT	2	6	1141	1146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021848	GT	3	6	1212	1217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021848	CCT	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_021848	CTT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021848	G	6	6	1417	1422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021848	GT	3	6	1467	1472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021848	CT	3	6	1498	1503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021848	ACG	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021848	GGT	2	6	1617	1622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021848	GA	3	6	1647	1652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021848	TTA	2	6	1774	1779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021848	CGG	2	6	1900	1905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021848	ATG	2	6	1976	1981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021848	TGAAAT	2	12	2009	2020	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021848	TAC	2	6	2074	2079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021848	TG	3	6	2149	2154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021848	ACC	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021848	TGG	2	6	2231	2236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021848	TCC	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_021848	GGA	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021848	GGT	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021848	CGG	2	6	2481	2486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021848	TCA	2	6	2509	2514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_021848	CGT	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021848	GCT	2	6	2643	2648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021848	ACG	2	6	2824	2829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021848	GT	3	6	2842	2847	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021848	ACA	2	6	2903	2908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021848	ATTCC	2	10	3025	3034	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_021848	TCCGC	2	10	3205	3214	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_021848	T	7	7	3246	3252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021848	ACA	2	6	3280	3285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021848	AGC	2	6	3308	3313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021848	TC	3	6	3345	3350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021848	T	6	6	3392	3397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021848	TC	3	6	3424	3429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021848	TTA	2	6	3437	3442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021848	GAT	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021848	TTGG	2	8	3577	3584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021848	CAAC	2	8	3601	3608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021848	TGA	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021848	TCT	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021848	CCAT	2	8	3711	3718	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021848	CTC	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_021848	ATG	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021848	TTA	2	6	3786	3791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021848	ATAG	2	8	3974	3981	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021848	T	6	6	4007	4012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021848	CAGT	2	8	4039	4046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021848	TGG	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021848	TTC	2	6	4166	4171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021848	CAG	2	6	4272	4277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021848	GAG	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021848	ATA	2	6	4380	4385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021848	TTG	2	6	4386	4391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021848	A	6	6	4417	4422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021848	GCT	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021848	AGCT	2	8	4505	4512	25 %	25 %	25 %	25 %	525957491
81	NC_021848	T	9	9	4525	4533	0 %	100 %	0 %	0 %	525957491
82	NC_021848	GAT	2	6	4622	4627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957491
83	NC_021848	ACC	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957491
84	NC_021848	GCC	2	6	4703	4708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957491
85	NC_021848	TATG	2	8	4775	4782	25 %	50 %	25 %	0 %	525957491
86	NC_021848	CAT	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957491
87	NC_021848	TCT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957491
88	NC_021848	AGC	2	6	4869	4874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957491
89	NC_021848	CTA	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957491
90	NC_021848	GGT	2	6	4945	4950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957491
91	NC_021848	CT	3	6	4956	4961	0 %	50 %	0 %	50 %	525957491
92	NC_021848	CTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957491
93	NC_021848	AGTA	2	8	5081	5088	50 %	25 %	25 %	0 %	525957491
94	NC_021848	CTT	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957491
95	NC_021848	AGAGT	2	10	5188	5197	40 %	20 %	40 %	0 %	525957491
96	NC_021848	CAT	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957491
97	NC_021848	AGCA	2	8	5388	5395	50 %	0 %	25 %	25 %	525957491
98	NC_021848	GAA	2	6	5456	5461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957491
99	NC_021848	GCC	2	6	5543	5548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957491
100	NC_021848	CAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957491
101	NC_021848	GTT	2	6	5645	5650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957491
102	NC_021848	AGAA	2	8	5675	5682	75 %	0 %	25 %	0 %	525957491
103	NC_021848	TGG	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957491
104	NC_021848	GCG	2	6	5760	5765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957491
105	NC_021848	CT	3	6	5802	5807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021848	T	6	6	5863	5868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021848	AAG	2	6	5888	5893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021848	AAT	2	6	5901	5906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021848	TG	3	6	5945	5950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021848	ACA	2	6	6006	6011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957492
111	NC_021848	ATTG	2	8	6042	6049	25 %	50 %	25 %	0 %	525957492
112	NC_021848	TGG	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
113	NC_021848	GAG	2	6	6104	6109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957492
114	NC_021848	CAA	2	6	6144	6149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957492
115	NC_021848	TTG	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
116	NC_021848	AGCC	2	8	6166	6173	25 %	0 %	25 %	50 %	525957492
117	NC_021848	ACC	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957492
118	NC_021848	CGC	2	6	6306	6311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957492
119	NC_021848	CCAA	2	8	6394	6401	50 %	0 %	0 %	50 %	525957492
120	NC_021848	TTTC	2	8	6452	6459	0 %	75 %	0 %	25 %	525957492
121	NC_021848	CT	3	6	6690	6695	0 %	50 %	0 %	50 %	525957492
122	NC_021848	AGA	2	6	6855	6860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
123	NC_021848	AGC	2	6	6889	6894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957492
124	NC_021848	TGG	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
125	NC_021848	TGT	2	6	6919	6924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
126	NC_021848	GTC	2	6	7010	7015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957492
127	NC_021848	TC	3	6	7014	7019	0 %	50 %	0 %	50 %	525957492
128	NC_021848	TCA	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
129	NC_021848	AGA	2	6	7119	7124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
130	NC_021848	CG	3	6	7149	7154	0 %	0 %	50 %	50 %	525957492
131	NC_021848	ATC	2	6	7180	7185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
132	NC_021848	AAGGTA	2	12	7337	7348	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525957492
133	NC_021848	GAAG	2	8	7368	7375	50 %	0 %	50 %	0 %	525957492
134	NC_021848	TTG	2	6	7388	7393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
135	NC_021848	CGT	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957492
136	NC_021848	CG	5	10	7469	7478	0 %	0 %	50 %	50 %	525957492
137	NC_021848	AGA	2	6	7539	7544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
138	NC_021848	ATT	2	6	7546	7551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957492
139	NC_021848	TGA	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
140	NC_021848	CAA	2	6	7596	7601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957492
141	NC_021848	GAT	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
142	NC_021848	TCTTTC	2	12	7687	7698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957492
143	NC_021848	TAA	2	6	7704	7709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957492
144	NC_021848	AGA	2	6	7839	7844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
145	NC_021848	TTG	2	6	7882	7887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
146	NC_021848	AGA	3	9	7926	7934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
147	NC_021848	GTTA	2	8	7989	7996	25 %	50 %	25 %	0 %	525957492
148	NC_021848	GAA	2	6	8029	8034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
149	NC_021848	GATG	2	8	8082	8089	25 %	25 %	50 %	0 %	525957492
150	NC_021848	GTG	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
151	NC_021848	TGA	2	6	8162	8167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
152	NC_021848	TTA	2	6	8195	8200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957492
153	NC_021848	TTG	2	6	8239	8244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
154	NC_021848	TAA	2	6	8307	8312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957492
155	NC_021848	ATC	2	6	8320	8325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
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157	NC_021848	TGG	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
158	NC_021848	CCG	2	6	8516	8521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957492
159	NC_021848	GGT	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
160	NC_021848	CG	3	6	8573	8578	0 %	0 %	50 %	50 %	525957492
161	NC_021848	AAG	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
162	NC_021848	CCA	2	6	8758	8763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957492
163	NC_021848	GAT	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
164	NC_021848	GAA	2	6	8893	8898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
165	NC_021848	GAG	2	6	8905	8910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957492
166	NC_021848	ATG	2	6	8927	8932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
167	NC_021848	GCT	2	6	8940	8945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957492
168	NC_021848	TGA	2	6	9018	9023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
169	NC_021848	ACT	2	6	9113	9118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
170	NC_021848	GAAA	2	8	9318	9325	75 %	0 %	25 %	0 %	525957492
171	NC_021848	GCA	2	6	9337	9342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957492
172	NC_021848	ATG	2	6	9359	9364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
173	NC_021848	GAT	2	6	9583	9588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
174	NC_021848	AG	3	6	9594	9599	50 %	0 %	50 %	0 %	525957492
175	NC_021848	GTT	2	6	9724	9729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021848	A	6	6	9735	9740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_021848	GCTT	2	8	9830	9837	0 %	50 %	25 %	25 %	525957493
178	NC_021848	TCT	2	6	9911	9916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957493
179	NC_021848	CAAA	2	8	9982	9989	75 %	0 %	0 %	25 %	525957493
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183	NC_021848	AAG	2	6	10169	10174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957493
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185	NC_021848	TGA	2	6	10268	10273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957493
186	NC_021848	GCC	2	6	10285	10290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957493
187	NC_021848	CAA	2	6	10314	10319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957493
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232	NC_021848	CG	3	6	12818	12823	0 %	0 %	50 %	50 %	525957494
233	NC_021848	A	6	6	12956	12961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_021848	GAAG	2	8	12964	12971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
235	NC_021848	T	6	6	12980	12985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_021848	ACA	2	6	14403	14408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957495
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261	NC_021848	GTTT	2	8	14440	14447	0 %	75 %	25 %	0 %	525957495
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265	NC_021848	TAG	2	6	14761	14766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957495
266	NC_021848	AT	4	8	14769	14776	50 %	50 %	0 %	0 %	525957495
267	NC_021848	GTT	2	6	14780	14785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_021848	TGAA	2	8	14787	14794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
269	NC_021848	A	6	6	14793	14798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_021848	T	6	6	14832	14837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_021848	TG	3	6	14868	14873	0 %	50 %	50 %	0 %	525957496
272	NC_021848	TCT	2	6	14896	14901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957496
273	NC_021848	TC	3	6	14921	14926	0 %	50 %	0 %	50 %	525957496
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275	NC_021848	CTG	2	6	14969	14974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957496
276	NC_021848	TGA	2	6	14978	14983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957496
277	NC_021848	GCT	2	6	15053	15058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957496
278	NC_021848	GTT	2	6	15082	15087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957496
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283	NC_021848	AC	3	6	15366	15371	50 %	0 %	0 %	50 %	525957496
284	NC_021848	AAG	2	6	15397	15402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957496
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383	NC_021848	ATG	2	6	20593	20598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
384	NC_021848	TAAGC	2	10	20642	20651	40 %	20 %	20 %	20 %	525957500
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399	NC_021848	A	6	6	21195	21200	100 %	0 %	0 %	0 %	525957500
400	NC_021848	TTGA	2	8	21237	21244	25 %	50 %	25 %	0 %	525957500
401	NC_021848	GC	3	6	21258	21263	0 %	0 %	50 %	50 %	525957500
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403	NC_021848	GAA	2	6	21432	21437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957500
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