MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_021848	TGAG	2	8	1015665	1015672	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19502	NC_021848	AGCT	2	8	1015678	1015685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19503	NC_021848	T	6	6	1015784	1015789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19504	NC_021848	CTT	2	6	1015801	1015806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19505	NC_021848	TGT	2	6	1015810	1015815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19506	NC_021848	GTT	2	6	1015850	1015855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19507	NC_021848	GTT	2	6	1015907	1015912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19508	NC_021848	CAT	2	6	1016016	1016021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19509	NC_021848	ACA	2	6	1016199	1016204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19510	NC_021848	ATG	2	6	1016237	1016242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19511	NC_021848	TGAA	2	8	1016442	1016449	50 %	25 %	25 %	0 %	525960099
19512	NC_021848	AGA	2	6	1016474	1016479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960099
19513	NC_021848	TCC	2	6	1016533	1016538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525960099
19514	NC_021848	GATA	2	8	1016684	1016691	50 %	25 %	25 %	0 %	525960099
19515	NC_021848	GCT	2	6	1016728	1016733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960099
19516	NC_021848	TTGG	2	8	1016791	1016798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19517	NC_021848	AACA	2	8	1016945	1016952	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19518	NC_021848	TTA	2	6	1016958	1016963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19519	NC_021848	TAGTT	2	10	1017028	1017037	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19520	NC_021848	TTG	2	6	1017184	1017189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958234
19521	NC_021848	GAAA	2	8	1017269	1017276	75 %	0 %	25 %	0 %	525958234
19522	NC_021848	GAA	2	6	1017278	1017283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958234
19523	NC_021848	TTG	2	6	1017339	1017344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958234
19524	NC_021848	CAC	2	6	1017379	1017384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958234
19525	NC_021848	GCT	2	6	1017429	1017434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958234
19526	NC_021848	CTG	2	6	1017448	1017453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958234
19527	NC_021848	ATT	2	6	1017477	1017482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958234
19528	NC_021848	GCT	2	6	1017501	1017506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958234
19529	NC_021848	TCC	2	6	1017677	1017682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19530	NC_021848	TAT	2	6	1017696	1017701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525960100
19531	NC_021848	CTT	2	6	1017787	1017792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960100
19532	NC_021848	TC	3	6	1017806	1017811	0 %	50 %	0 %	50 %	525960100
19533	NC_021848	TGT	2	6	1017832	1017837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960100
19534	NC_021848	GCG	2	6	1017860	1017865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525960100
19535	NC_021848	TCA	2	6	1018104	1018109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960100
19536	NC_021848	TCT	2	6	1018185	1018190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960100
19537	NC_021848	GTA	2	6	1018204	1018209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960100
19538	NC_021848	CTT	2	6	1018255	1018260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19539	NC_021848	CTA	2	6	1018319	1018324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19540	NC_021848	TTG	2	6	1018392	1018397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19541	NC_021848	ATT	2	6	1018430	1018435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958235
19542	NC_021848	ATCA	2	8	1018445	1018452	50 %	25 %	0 %	25 %	525958235
19543	NC_021848	GTA	2	6	1018463	1018468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958235
19544	NC_021848	CAG	2	6	1018519	1018524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958235
19545	NC_021848	CAG	2	6	1018654	1018659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958235
19546	NC_021848	TTC	2	6	1018727	1018732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958235
19547	NC_021848	ATG	2	6	1018819	1018824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19548	NC_021848	AGTT	2	8	1018906	1018913	25 %	50 %	25 %	0 %	525960101
19549	NC_021848	CTT	2	6	1018975	1018980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960101
19550	NC_021848	GTG	2	6	1018981	1018986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525960101
19551	NC_021848	CCA	2	6	1019009	1019014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960101
19552	NC_021848	TCT	2	6	1019028	1019033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960101
19553	NC_021848	TGG	2	6	1019173	1019178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525960101
19554	NC_021848	GTC	2	6	1019189	1019194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960101
19555	NC_021848	CAAA	2	8	1019205	1019212	75 %	0 %	0 %	25 %	525960101
19556	NC_021848	CT	3	6	1019220	1019225	0 %	50 %	0 %	50 %	525960101
19557	NC_021848	CCT	2	6	1019337	1019342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19558	NC_021848	TTG	2	6	1019479	1019484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19559	NC_021848	GA	3	6	1019507	1019512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19560	NC_021848	CTAT	2	8	1019566	1019573	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19561	NC_021848	AATT	2	8	1019606	1019613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19562	NC_021848	GTTCA	2	10	1019634	1019643	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19563	NC_021848	GAA	2	6	1019697	1019702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960102
19564	NC_021848	CAA	2	6	1019715	1019720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960102
19565	NC_021848	GTAC	2	8	1019870	1019877	25 %	25 %	25 %	25 %	525960102
19566	NC_021848	TGT	2	6	1019946	1019951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960102
19567	NC_021848	CTA	2	6	1020003	1020008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960102
19568	NC_021848	CGTC	2	8	1020047	1020054	0 %	25 %	25 %	50 %	525960102
19569	NC_021848	ATC	2	6	1020100	1020105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960102
19570	NC_021848	GCTTTT	2	12	1020201	1020212	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19571	NC_021848	GAT	2	6	1020229	1020234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958236
19572	NC_021848	GAA	3	9	1020235	1020243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958236
19573	NC_021848	CAA	2	6	1020255	1020260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958236
19574	NC_021848	GTC	2	6	1020287	1020292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958236
19575	NC_021848	ACA	2	6	1020330	1020335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958236
19576	NC_021848	AAG	2	6	1020474	1020479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958236
19577	NC_021848	TAAG	2	8	1020544	1020551	50 %	25 %	25 %	0 %	525958236
19578	NC_021848	GCC	2	6	1020616	1020621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958236
19579	NC_021848	CAT	2	6	1020660	1020665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958236
19580	NC_021848	CGA	2	6	1020738	1020743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958236
19581	NC_021848	GCTG	2	8	1020778	1020785	0 %	25 %	50 %	25 %	525958236
19582	NC_021848	ATC	2	6	1020797	1020802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958236
19583	NC_021848	TTG	2	6	1020828	1020833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958236
19584	NC_021848	TTC	2	6	1020902	1020907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958236
19585	NC_021848	T	6	6	1020922	1020927	0 %	100 %	0 %	0 %	525958236
19586	NC_021848	T	6	6	1020948	1020953	0 %	100 %	0 %	0 %	525958236
19587	NC_021848	CAG	2	6	1020964	1020969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958236
19588	NC_021848	TTGC	2	8	1021011	1021018	0 %	50 %	25 %	25 %	525958236
19589	NC_021848	AT	3	6	1021019	1021024	50 %	50 %	0 %	0 %	525958236
19590	NC_021848	AG	3	6	1021070	1021075	50 %	0 %	50 %	0 %	525958236
19591	NC_021848	AGA	2	6	1021080	1021085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958236
19592	NC_021848	AG	3	6	1021147	1021152	50 %	0 %	50 %	0 %	525958236
19593	NC_021848	GA	3	6	1021161	1021166	50 %	0 %	50 %	0 %	525958236
19594	NC_021848	T	6	6	1021186	1021191	0 %	100 %	0 %	0 %	525958236
19595	NC_021848	GAT	2	6	1021196	1021201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958236
19596	NC_021848	AGT	2	6	1021221	1021226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958236
19597	NC_021848	TCA	2	6	1021260	1021265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958236
19598	NC_021848	TTGC	2	8	1021273	1021280	0 %	50 %	25 %	25 %	525958236
19599	NC_021848	GCC	2	6	1021327	1021332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958236
19600	NC_021848	GAT	2	6	1021378	1021383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958236
19601	NC_021848	CATC	2	8	1021398	1021405	25 %	25 %	0 %	50 %	525958236
19602	NC_021848	GT	3	6	1021507	1021512	0 %	50 %	50 %	0 %	525958236
19603	NC_021848	AGA	2	6	1021547	1021552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958236
19604	NC_021848	CATC	2	8	1021555	1021562	25 %	25 %	0 %	50 %	525958236
19605	NC_021848	A	6	6	1021603	1021608	100 %	0 %	0 %	0 %	525958236
19606	NC_021848	AAT	2	6	1021639	1021644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525958236
19607	NC_021848	GCG	2	6	1021665	1021670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958236
19608	NC_021848	TCGC	2	8	1021758	1021765	0 %	25 %	25 %	50 %	525960103
19609	NC_021848	TAC	2	6	1021963	1021968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960103
19610	NC_021848	ACG	2	6	1022020	1022025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960103
19611	NC_021848	GGT	2	6	1022067	1022072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525960103
19612	NC_021848	TTG	2	6	1022091	1022096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960103
19613	NC_021848	GCG	2	6	1022119	1022124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525960103
19614	NC_021848	ACA	2	6	1022175	1022180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960103
19615	NC_021848	AGA	2	6	1022199	1022204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960103
19616	NC_021848	GTT	2	6	1022239	1022244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960103
19617	NC_021848	ATG	2	6	1022372	1022377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960103
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19619	NC_021848	CGATT	2	10	1022487	1022496	20 %	40 %	20 %	20 %	525960103
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