MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_021848	GTT	2	6	849543	849548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958161
16502	NC_021848	TCAGT	2	10	849551	849560	20 %	40 %	20 %	20 %	525958161
16503	NC_021848	AAC	2	6	849570	849575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958161
16504	NC_021848	GTG	2	6	849623	849628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958161
16505	NC_021848	TCA	2	6	849760	849765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958161
16506	NC_021848	TCTT	2	8	849781	849788	0 %	75 %	0 %	25 %	525958161
16507	NC_021848	GTTT	2	8	849822	849829	0 %	75 %	25 %	0 %	525958161
16508	NC_021848	AGT	2	6	849887	849892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958161
16509	NC_021848	ATTGC	2	10	849893	849902	20 %	40 %	20 %	20 %	525958161
16510	NC_021848	GTA	2	6	849969	849974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958161
16511	NC_021848	AACACC	2	12	849987	849998	50 %	0 %	0 %	50 %	525958161
16512	NC_021848	ACG	2	6	850005	850010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958161
16513	NC_021848	TTG	2	6	850016	850021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958161
16514	NC_021848	CGC	2	6	850029	850034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958161
16515	NC_021848	AGT	2	6	850060	850065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958161
16516	NC_021848	AAC	2	6	850080	850085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958161
16517	NC_021848	ATC	2	6	850107	850112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958161
16518	NC_021848	ATC	2	6	850173	850178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958161
16519	NC_021848	CTT	2	6	850368	850373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958161
16520	NC_021848	TTC	2	6	850416	850421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958161
16521	NC_021848	GAA	2	6	850431	850436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958161
16522	NC_021848	CGT	2	6	850439	850444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958161
16523	NC_021848	GTTT	2	8	850514	850521	0 %	75 %	25 %	0 %	525958161
16524	NC_021848	GTT	2	6	850572	850577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958161
16525	NC_021848	TGC	2	6	850632	850637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958161
16526	NC_021848	ACC	2	6	850638	850643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958161
16527	NC_021848	ACC	2	6	850650	850655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958161
16528	NC_021848	AAC	2	6	850661	850666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958161
16529	NC_021848	TG	3	6	850710	850715	0 %	50 %	50 %	0 %	525958161
16530	NC_021848	GATACC	2	12	850770	850781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525958161
16531	NC_021848	CAC	2	6	850844	850849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958161
16532	NC_021848	GTAC	2	8	850888	850895	25 %	25 %	25 %	25 %	525958161
16533	NC_021848	GTAG	2	8	850912	850919	25 %	25 %	50 %	0 %	525958161
16534	NC_021848	AG	3	6	850918	850923	50 %	0 %	50 %	0 %	525958161
16535	NC_021848	TTTC	2	8	850976	850983	0 %	75 %	0 %	25 %	525958161
16536	NC_021848	AC	3	6	851054	851059	50 %	0 %	0 %	50 %	525958161
16537	NC_021848	AGT	2	6	851168	851173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958161
16538	NC_021848	GGC	2	6	851239	851244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958161
16539	NC_021848	T	6	6	851262	851267	0 %	100 %	0 %	0 %	525958161
16540	NC_021848	AGC	2	6	851292	851297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958161
16541	NC_021848	TGA	2	6	851348	851353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958161
16542	NC_021848	CGT	2	6	851384	851389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958161
16543	NC_021848	GA	3	6	851420	851425	50 %	0 %	50 %	0 %	525958161
16544	NC_021848	CTTT	2	8	851491	851498	0 %	75 %	0 %	25 %	525958161
16545	NC_021848	GTT	2	6	851525	851530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958161
16546	NC_021848	TGTT	2	8	851580	851587	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16547	NC_021848	GCG	2	6	851611	851616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16548	NC_021848	TCTA	2	8	851632	851639	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16549	NC_021848	TA	3	6	851638	851643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16550	NC_021848	ACA	2	6	851657	851662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16551	NC_021848	TTTG	2	8	851675	851682	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16552	NC_021848	TAA	2	6	851750	851755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16553	NC_021848	A	8	8	851759	851766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16554	NC_021848	A	9	9	851856	851864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16555	NC_021848	GGTT	2	8	851902	851909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16556	NC_021848	CATA	2	8	851935	851942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16557	NC_021848	A	7	7	851950	851956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_021848	AAG	2	6	852012	852017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16559	NC_021848	T	6	6	852045	852050	0 %	100 %	0 %	0 %	525958162
16560	NC_021848	ATC	2	6	852160	852165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958162
16561	NC_021848	TCA	2	6	852167	852172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958162
16562	NC_021848	CAG	2	6	852176	852181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958162
16563	NC_021848	TGA	2	6	852185	852190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958162
16564	NC_021848	CGTG	2	8	852203	852210	0 %	25 %	50 %	25 %	525958162
16565	NC_021848	GAA	2	6	852291	852296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958162
16566	NC_021848	TCC	2	6	852303	852308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525958162
16567	NC_021848	AG	3	6	852342	852347	50 %	0 %	50 %	0 %	525958162
16568	NC_021848	CCTT	2	8	852529	852536	0 %	50 %	0 %	50 %	525958162
16569	NC_021848	GCC	3	9	852558	852566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958162
16570	NC_021848	CAAC	2	8	852568	852575	50 %	0 %	0 %	50 %	525958162
16571	NC_021848	AAGCG	2	10	852628	852637	40 %	0 %	40 %	20 %	525958162
16572	NC_021848	TGA	2	6	852646	852651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958162
16573	NC_021848	CCA	2	6	852678	852683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958162
16574	NC_021848	CTT	2	6	852821	852826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16575	NC_021848	T	6	6	852850	852855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16576	NC_021848	TGG	2	6	852865	852870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16577	NC_021848	TGA	2	6	852980	852985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16578	NC_021848	TG	3	6	852988	852993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16579	NC_021848	CCG	2	6	853190	853195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958163
16580	NC_021848	A	6	6	853245	853250	100 %	0 %	0 %	0 %	525958163
16581	NC_021848	CGTA	2	8	853322	853329	25 %	25 %	25 %	25 %	525958163
16582	NC_021848	CTG	2	6	853402	853407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958163
16583	NC_021848	ACAGA	2	10	853509	853518	60 %	0 %	20 %	20 %	525958163
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16585	NC_021848	GGTA	2	8	853580	853587	25 %	25 %	50 %	0 %	525958163
16586	NC_021848	CAAC	2	8	853591	853598	50 %	0 %	0 %	50 %	525958163
16587	NC_021848	AAT	2	6	853650	853655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525958163
16588	NC_021848	GAA	2	6	853656	853661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958163
16589	NC_021848	TGA	2	6	853670	853675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958163
16590	NC_021848	GCG	2	6	853713	853718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958163
16591	NC_021848	CAT	2	6	853826	853831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958163
16592	NC_021848	AAC	2	6	854004	854009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958163
16593	NC_021848	CGT	2	6	854124	854129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958163
16594	NC_021848	ATC	2	6	854229	854234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958163
16595	NC_021848	CTG	2	6	854260	854265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958163
16596	NC_021848	AGC	2	6	854312	854317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958163
16597	NC_021848	CTGA	2	8	854400	854407	25 %	25 %	25 %	25 %	525958163
16598	NC_021848	ACA	2	6	854408	854413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958163
16599	NC_021848	GCAA	2	8	854417	854424	50 %	0 %	25 %	25 %	525958163
16600	NC_021848	AGA	2	6	854498	854503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958163
16601	NC_021848	GAA	2	6	854562	854567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958163
16602	NC_021848	CAG	2	6	854617	854622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958163
16603	NC_021848	TGACAT	2	12	854630	854641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525958163
16604	NC_021848	GTG	2	6	854737	854742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958163
16605	NC_021848	TCT	2	6	854792	854797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958163
16606	NC_021848	ACA	2	6	854815	854820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958163
16607	NC_021848	AGA	2	6	854927	854932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958163
16608	NC_021848	TTC	2	6	854953	854958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958163
16609	NC_021848	TGA	2	6	854963	854968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958163
16610	NC_021848	CAG	2	6	854974	854979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958163
16611	NC_021848	AAG	2	6	855018	855023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958163
16612	NC_021848	ACGT	2	8	855046	855053	25 %	25 %	25 %	25 %	525958163
16613	NC_021848	TGA	2	6	855083	855088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958163
16614	NC_021848	CAT	2	6	855131	855136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958163
16615	NC_021848	GTT	2	6	855159	855164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958163
16616	NC_021848	GCTG	2	8	855227	855234	0 %	25 %	50 %	25 %	525958163
16617	NC_021848	ACG	2	6	855235	855240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958163
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16619	NC_021848	GCTG	2	8	855323	855330	0 %	25 %	50 %	25 %	525958163
16620	NC_021848	AGT	2	6	855398	855403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958163
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16622	NC_021848	CGA	2	6	855428	855433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958163
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16743	NC_021848	CAA	2	6	860839	860844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958168
16744	NC_021848	TTC	2	6	860881	860886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958168
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16746	NC_021848	GTT	2	6	860995	861000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958168
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16808	NC_021848	T	6	6	864159	864164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16829	NC_021848	AAT	2	6	865426	865431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16834	NC_021848	TGC	2	6	865547	865552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959985
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16852	NC_021848	CAT	2	6	866642	866647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959985
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16855	NC_021848	ATA	3	9	866748	866756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16856	NC_021848	GTT	2	6	866796	866801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16857	NC_021848	TGG	2	6	866897	866902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959986
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16864	NC_021848	CAT	2	6	867203	867208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959986
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