MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_021848	ATC	2	6	769758	769763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958104
15003	NC_021848	CGG	2	6	769766	769771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958104
15004	NC_021848	GCGT	2	8	769850	769857	0 %	25 %	50 %	25 %	525958104
15005	NC_021848	AGT	2	6	769870	769875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958104
15006	NC_021848	CCG	2	6	769946	769951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958104
15007	NC_021848	AAAC	2	8	769982	769989	75 %	0 %	0 %	25 %	525958104
15008	NC_021848	ATT	2	6	770066	770071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_021848	GCAA	2	8	770086	770093	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15010	NC_021848	TAT	2	6	770127	770132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_021848	GC	3	6	770202	770207	0 %	0 %	50 %	50 %	525959973
15012	NC_021848	GCT	2	6	770214	770219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959973
15013	NC_021848	TCG	2	6	770240	770245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959973
15014	NC_021848	TGGTT	2	10	770265	770274	0 %	60 %	40 %	0 %	525959973
15015	NC_021848	TGA	2	6	770292	770297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959973
15016	NC_021848	GAT	2	6	770326	770331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959973
15017	NC_021848	TGT	2	6	770337	770342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959973
15018	NC_021848	TG	3	6	770545	770550	0 %	50 %	50 %	0 %	525959973
15019	NC_021848	TTA	2	6	770605	770610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_021848	TC	3	6	770691	770696	0 %	50 %	0 %	50 %	525958105
15021	NC_021848	TC	3	6	770701	770706	0 %	50 %	0 %	50 %	525958105
15022	NC_021848	GATG	2	8	770727	770734	25 %	25 %	50 %	0 %	525958105
15023	NC_021848	GTTTT	2	10	770766	770775	0 %	80 %	20 %	0 %	525958105
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15028	NC_021848	CGA	2	6	771142	771147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958105
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15030	NC_021848	AACC	2	8	771281	771288	50 %	0 %	0 %	50 %	525958105
15031	NC_021848	TGG	2	6	771297	771302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958105
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15033	NC_021848	TTG	2	6	771458	771463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958105
15034	NC_021848	AGA	2	6	771466	771471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958105
15035	NC_021848	TAG	2	6	771498	771503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958105
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15037	NC_021848	CAT	2	6	771571	771576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958105
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15041	NC_021848	CGT	2	6	771641	771646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958105
15042	NC_021848	TTG	2	6	771663	771668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958105
15043	NC_021848	CGT	2	6	771690	771695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958105
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15045	NC_021848	GTTT	2	8	771807	771814	0 %	75 %	25 %	0 %	525958105
15046	NC_021848	CTTG	2	8	771931	771938	0 %	50 %	25 %	25 %	525958105
15047	NC_021848	TGG	2	6	772059	772064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958105
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15050	NC_021848	TCG	2	6	772212	772217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958105
15051	NC_021848	TGA	2	6	772239	772244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958105
15052	NC_021848	GCT	2	6	772321	772326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958105
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15056	NC_021848	TGC	2	6	772521	772526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958105
15057	NC_021848	CGG	2	6	772641	772646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958105
15058	NC_021848	TGA	2	6	772681	772686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958105
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15065	NC_021848	GCTG	2	8	772994	773001	0 %	25 %	50 %	25 %	525958106
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15068	NC_021848	T	6	6	773287	773292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_021848	TG	3	6	773326	773331	0 %	50 %	50 %	0 %	525958107
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15076	NC_021848	TCCA	2	8	773580	773587	25 %	25 %	0 %	50 %	525958107
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15085	NC_021848	ACA	2	6	773851	773856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15089	NC_021848	TA	3	6	773964	773969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_021848	ATG	2	6	773981	773986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15092	NC_021848	A	6	6	774141	774146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_021848	TAA	2	6	774156	774161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_021848	AGG	2	6	774212	774217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15099	NC_021848	CCAT	2	8	774416	774423	25 %	25 %	0 %	50 %	525959974
15100	NC_021848	GC	3	6	774457	774462	0 %	0 %	50 %	50 %	525959974
15101	NC_021848	TGA	2	6	774501	774506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959974
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15103	NC_021848	CAA	2	6	774583	774588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959974
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15107	NC_021848	TG	3	6	774810	774815	0 %	50 %	50 %	0 %	525959974
15108	NC_021848	AACA	2	8	774863	774870	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15109	NC_021848	TCGGG	2	10	774906	774915	0 %	20 %	60 %	20 %	525958108
15110	NC_021848	AGC	2	6	774939	774944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958108
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15230	NC_021848	TTTC	2	8	781901	781908	0 %	75 %	0 %	25 %	525958115
15231	NC_021848	TGA	2	6	781944	781949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958115
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15235	NC_021848	CAAAC	2	10	782215	782224	60 %	0 %	0 %	40 %	525958115
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15240	NC_021848	ATC	2	6	782387	782392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958115
15241	NC_021848	CAT	2	6	782431	782436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958115
15242	NC_021848	ACT	2	6	782502	782507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958115
15243	NC_021848	GAT	2	6	782514	782519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15244	NC_021848	ATA	2	6	782592	782597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15245	NC_021848	GAA	2	6	782642	782647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958116
15246	NC_021848	GTC	2	6	782708	782713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958116
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15255	NC_021848	TGC	2	6	783198	783203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15257	NC_021848	AAG	2	6	783232	783237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15277	NC_021848	TTTC	2	8	784272	784279	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15278	NC_021848	ATT	2	6	784305	784310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15279	NC_021848	A	6	6	784330	784335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15280	NC_021848	CCG	2	6	784364	784369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15281	NC_021848	ACGA	2	8	784378	784385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15282	NC_021848	TCG	2	6	784387	784392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15283	NC_021848	A	6	6	784426	784431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15284	NC_021848	TGA	2	6	784542	784547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958118
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15322	NC_021848	A	7	7	786566	786572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15323	NC_021848	T	7	7	786592	786598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15351	NC_021848	GA	3	6	788301	788306	50 %	0 %	50 %	0 %	525958121
15352	NC_021848	CTT	2	6	788424	788429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958121
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15355	NC_021848	TCAC	2	8	788762	788769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15356	NC_021848	ATA	2	6	788784	788789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15357	NC_021848	TGA	2	6	788832	788837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958122
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15359	NC_021848	CGG	2	6	788868	788873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958122
15360	NC_021848	GTC	2	6	788921	788926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958122
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15489	NC_021848	ATT	2	6	796497	796502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958124
15490	NC_021848	TTG	2	6	796519	796524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958124
15491	NC_021848	CGATGA	2	12	796525	796536	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525958124
15492	NC_021848	TAAC	2	8	796561	796568	50 %	25 %	0 %	25 %	525958124
15493	NC_021848	GCA	2	6	796590	796595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958124
15494	NC_021848	CTCG	2	8	796680	796687	0 %	25 %	25 %	50 %	525958124
15495	NC_021848	CG	3	6	796761	796766	0 %	0 %	50 %	50 %	525958124
15496	NC_021848	GA	3	6	796775	796780	50 %	0 %	50 %	0 %	525958124
15497	NC_021848	ATGAG	2	10	796831	796840	40 %	20 %	40 %	0 %	525958124
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15499	NC_021848	AGC	3	9	796877	796885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958124
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