MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021848	TAA	2	6	668010	668015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_021848	TGT	2	6	668016	668021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_021848	A	6	6	668022	668027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_021848	AG	3	6	668090	668095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_021848	T	6	6	668096	668101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_021848	CAA	2	6	668301	668306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959962
13007	NC_021848	TTA	2	6	668333	668338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959962
13008	NC_021848	GTCT	2	8	668344	668351	0 %	50 %	25 %	25 %	525959962
13009	NC_021848	CAA	2	6	668414	668419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959962
13010	NC_021848	T	6	6	668429	668434	0 %	100 %	0 %	0 %	525959962
13011	NC_021848	CAT	2	6	668540	668545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959962
13012	NC_021848	ACG	2	6	668559	668564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959962
13013	NC_021848	CGA	3	9	668584	668592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959962
13014	NC_021848	AACA	2	8	668645	668652	75 %	0 %	0 %	25 %	525959962
13015	NC_021848	GCGT	2	8	668741	668748	0 %	25 %	50 %	25 %	525959962
13016	NC_021848	TGA	2	6	668788	668793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959962
13017	NC_021848	TCCAA	2	10	668846	668855	40 %	20 %	0 %	40 %	525959962
13018	NC_021848	GATG	2	8	668888	668895	25 %	25 %	50 %	0 %	525959962
13019	NC_021848	CAT	2	6	668910	668915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959962
13020	NC_021848	ATG	2	6	668983	668988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959962
13021	NC_021848	TGA	2	6	669161	669166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959962
13022	NC_021848	TTGA	2	8	669180	669187	25 %	50 %	25 %	0 %	525959962
13023	NC_021848	CAAA	2	8	669207	669214	75 %	0 %	0 %	25 %	525959962
13024	NC_021848	CTT	2	6	669227	669232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959962
13025	NC_021848	CGC	2	6	669256	669261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959962
13026	NC_021848	CGG	2	6	669275	669280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959962
13027	NC_021848	T	6	6	669295	669300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_021848	AG	4	8	669301	669308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_021848	GAA	2	6	669456	669461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958029
13030	NC_021848	TTG	2	6	669484	669489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958029
13031	NC_021848	AAG	2	6	669499	669504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958029
13032	NC_021848	GTA	2	6	669516	669521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958029
13033	NC_021848	ACAA	2	8	669523	669530	75 %	0 %	0 %	25 %	525958029
13034	NC_021848	TGA	2	6	669539	669544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958029
13035	NC_021848	CG	3	6	669558	669563	0 %	0 %	50 %	50 %	525958029
13036	NC_021848	AAG	2	6	669676	669681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958029
13037	NC_021848	GTT	2	6	669698	669703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958029
13038	NC_021848	ATT	2	6	669834	669839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958029
13039	NC_021848	CAG	2	6	669843	669848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958029
13040	NC_021848	AC	3	6	669938	669943	50 %	0 %	0 %	50 %	525958030
13041	NC_021848	GCGAA	2	10	669957	669966	40 %	0 %	40 %	20 %	525958030
13042	NC_021848	CGTG	2	8	669997	670004	0 %	25 %	50 %	25 %	525958030
13043	NC_021848	CAC	2	6	670070	670075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958030
13044	NC_021848	AGC	2	6	670117	670122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958030
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13046	NC_021848	AGA	2	6	670362	670367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958030
13047	NC_021848	GCT	2	6	670563	670568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958031
13048	NC_021848	TGC	2	6	670569	670574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958031
13049	NC_021848	ATCG	2	8	670584	670591	25 %	25 %	25 %	25 %	525958031
13050	NC_021848	CTG	3	9	670734	670742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958032
13051	NC_021848	TGA	2	6	670858	670863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958032
13052	NC_021848	GCG	2	6	670926	670931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958032
13053	NC_021848	CGCGG	2	10	670967	670976	0 %	0 %	60 %	40 %	525958032
13054	NC_021848	TGCG	2	8	670984	670991	0 %	25 %	50 %	25 %	525958032
13055	NC_021848	A	6	6	671033	671038	100 %	0 %	0 %	0 %	525958032
13056	NC_021848	CG	3	6	671073	671078	0 %	0 %	50 %	50 %	525958032
13057	NC_021848	ATC	2	6	671085	671090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958032
13058	NC_021848	AGC	2	6	671092	671097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958032
13059	NC_021848	A	6	6	671137	671142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_021848	T	7	7	671172	671178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_021848	A	6	6	671277	671282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_021848	AT	3	6	671292	671297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_021848	ATT	2	6	671303	671308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_021848	ATA	2	6	671338	671343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_021848	TG	3	6	671475	671480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_021848	TTA	2	6	671482	671487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_021848	ATT	2	6	671492	671497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_021848	T	7	7	671500	671506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_021848	TG	3	6	671545	671550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_021848	A	7	7	671598	671604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_021848	A	6	6	671657	671662	100 %	0 %	0 %	0 %	525958033
13072	NC_021848	CG	3	6	671697	671702	0 %	0 %	50 %	50 %	525958033
13073	NC_021848	TTTA	2	8	671704	671711	25 %	75 %	0 %	0 %	525958033
13074	NC_021848	AGA	2	6	671761	671766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958033
13075	NC_021848	GGC	2	6	671773	671778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958033
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13082	NC_021848	TGA	3	9	672270	672278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958033
13083	NC_021848	CA	3	6	672284	672289	50 %	0 %	0 %	50 %	525958033
13084	NC_021848	TTG	2	6	672357	672362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958033
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13089	NC_021848	TACT	2	8	672613	672620	25 %	50 %	0 %	25 %	525958033
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13091	NC_021848	TGA	2	6	672652	672657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958033
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13093	NC_021848	AAG	2	6	672810	672815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958033
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13102	NC_021848	CAA	2	6	673096	673101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958033
13103	NC_021848	CAC	2	6	673102	673107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958033
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13107	NC_021848	GTGG	2	8	673283	673290	0 %	25 %	75 %	0 %	525958033
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13109	NC_021848	GAA	2	6	673310	673315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958033
13110	NC_021848	AAAT	2	8	673427	673434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_021848	CAA	2	6	673524	673529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958034
13112	NC_021848	TCTT	3	12	673550	673561	0 %	75 %	0 %	25 %	525958034
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13119	NC_021848	CAT	2	6	674209	674214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958034
13120	NC_021848	TGT	2	6	674224	674229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958034
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13123	NC_021848	A	6	6	674429	674434	100 %	0 %	0 %	0 %	525958035
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13235	NC_021848	T	6	6	680245	680250	0 %	100 %	0 %	0 %	525958037
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13241	NC_021848	TGG	2	6	680519	680524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958037
13242	NC_021848	T	6	6	680551	680556	0 %	100 %	0 %	0 %	525958037
13243	NC_021848	GT	3	6	680587	680592	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13244	NC_021848	AAC	2	6	680597	680602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13245	NC_021848	A	6	6	680603	680608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13246	NC_021848	CGA	2	6	680614	680619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13248	NC_021848	CTA	2	6	680718	680723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958038
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13250	NC_021848	GCA	2	6	680766	680771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958038
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13328	NC_021848	T	6	6	684461	684466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13353	NC_021848	GA	3	6	685556	685561	50 %	0 %	50 %	0 %	525958041
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13491	NC_021848	AGT	2	6	692065	692070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958045
13492	NC_021848	CAG	2	6	692075	692080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958045
13493	NC_021848	AG	3	6	692172	692177	50 %	0 %	50 %	0 %	525958045
13494	NC_021848	TCGC	2	8	692258	692265	0 %	25 %	25 %	50 %	525958045
13495	NC_021848	CGTG	2	8	692325	692332	0 %	25 %	50 %	25 %	525958045
13496	NC_021848	CCCAG	2	10	692401	692410	20 %	0 %	20 %	60 %	525958045
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