MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021848	GAT	2	6	516159	516164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957893
10002	NC_021848	ACG	2	6	516238	516243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957893
10003	NC_021848	AATG	2	8	516275	516282	50 %	25 %	25 %	0 %	525957893
10004	NC_021848	AAG	3	9	516370	516378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957893
10005	NC_021848	ACG	2	6	516391	516396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957893
10006	NC_021848	AAC	2	6	516416	516421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957893
10007	NC_021848	GGT	2	6	516429	516434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957893
10008	NC_021848	GTAC	2	8	516451	516458	25 %	25 %	25 %	25 %	525957893
10009	NC_021848	GGT	2	6	516546	516551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957893
10010	NC_021848	CAG	2	6	516562	516567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957893
10011	NC_021848	AAG	2	6	516568	516573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957893
10012	NC_021848	CAA	2	6	516629	516634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957893
10013	NC_021848	AGAA	2	8	516646	516653	75 %	0 %	25 %	0 %	525957893
10014	NC_021848	CGA	2	6	516677	516682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957893
10015	NC_021848	AGC	2	6	516688	516693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957893
10016	NC_021848	AAC	2	6	516872	516877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957893
10017	NC_021848	AAG	2	6	516892	516897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957893
10018	NC_021848	ACA	2	6	516997	517002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957893
10019	NC_021848	GAAA	2	8	517055	517062	75 %	0 %	25 %	0 %	525957893
10020	NC_021848	TTC	2	6	517087	517092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957893
10021	NC_021848	AGCA	2	8	517093	517100	50 %	0 %	25 %	25 %	525957893
10022	NC_021848	TTG	2	6	517152	517157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957893
10023	NC_021848	TCC	2	6	517253	517258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525957894
10024	NC_021848	CGC	2	6	517368	517373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957894
10025	NC_021848	AGA	2	6	517453	517458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957894
10026	NC_021848	A	6	6	517464	517469	100 %	0 %	0 %	0 %	525957894
10027	NC_021848	ATGA	2	8	517481	517488	50 %	25 %	25 %	0 %	525957894
10028	NC_021848	CAA	2	6	517504	517509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957894
10029	NC_021848	GAA	2	6	517532	517537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957894
10030	NC_021848	GTGAT	2	10	517578	517587	20 %	40 %	40 %	0 %	525957894
10031	NC_021848	TGA	2	6	517600	517605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957894
10032	NC_021848	CA	3	6	517640	517645	50 %	0 %	0 %	50 %	525957894
10033	NC_021848	GGC	2	6	517726	517731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957895
10034	NC_021848	CAAT	2	8	517814	517821	50 %	25 %	0 %	25 %	525957895
10035	NC_021848	GAC	2	6	517933	517938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957895
10036	NC_021848	AGA	2	6	518043	518048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957895
10037	NC_021848	TGA	2	6	518088	518093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957895
10038	NC_021848	GTTC	2	8	518110	518117	0 %	50 %	25 %	25 %	525957895
10039	NC_021848	ATG	2	6	518195	518200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957895
10040	NC_021848	CT	3	6	518233	518238	0 %	50 %	0 %	50 %	525957895
10041	NC_021848	ATC	2	6	518246	518251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957895
10042	NC_021848	GAA	2	6	518338	518343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957895
10043	NC_021848	TGC	2	6	518349	518354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957895
10044	NC_021848	AGA	2	6	518358	518363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957895
10045	NC_021848	CAA	2	6	518389	518394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957895
10046	NC_021848	CTG	3	9	518498	518506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957895
10047	NC_021848	GCT	2	6	518515	518520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957895
10048	NC_021848	AAG	2	6	518531	518536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957895
10049	NC_021848	AAT	2	6	518695	518700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957895
10050	NC_021848	GCC	2	6	518701	518706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957895
10051	NC_021848	TTACG	2	10	518727	518736	20 %	40 %	20 %	20 %	525957895
10052	NC_021848	AAG	2	6	518741	518746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957895
10053	NC_021848	AGC	2	6	518750	518755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957895
10054	NC_021848	GTG	2	6	518831	518836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957895
10055	NC_021848	CAAGC	2	10	518851	518860	40 %	0 %	20 %	40 %	525957895
10056	NC_021848	A	6	6	518906	518911	100 %	0 %	0 %	0 %	525957895
10057	NC_021848	CGA	2	6	518913	518918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957895
10058	NC_021848	GAA	2	6	518956	518961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957895
10059	NC_021848	TGC	2	6	519005	519010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957895
10060	NC_021848	AAC	2	6	519040	519045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957895
10061	NC_021848	GCC	2	6	519108	519113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957895
10062	NC_021848	ACG	2	6	519364	519369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957895
10063	NC_021848	TTC	2	6	519445	519450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957895
10064	NC_021848	GGT	2	6	519451	519456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957895
10065	NC_021848	GCA	2	6	519515	519520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957895
10066	NC_021848	GA	3	6	519530	519535	50 %	0 %	50 %	0 %	525957895
10067	NC_021848	ATG	2	6	519566	519571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957895
10068	NC_021848	CGC	2	6	519589	519594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957895
10069	NC_021848	TAA	2	6	519697	519702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957895
10070	NC_021848	GAA	2	6	519781	519786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957896
10071	NC_021848	TTC	2	6	519788	519793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957896
10072	NC_021848	ATT	2	6	519838	519843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957896
10073	NC_021848	CAA	2	6	519844	519849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957896
10074	NC_021848	CAG	2	6	519985	519990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957896
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10076	NC_021848	TTTA	2	8	520000	520007	25 %	75 %	0 %	0 %	525957896
10077	NC_021848	A	6	6	520045	520050	100 %	0 %	0 %	0 %	525957897
10078	NC_021848	CAGC	2	8	520062	520069	25 %	0 %	25 %	50 %	525957897
10079	NC_021848	AGC	2	6	520143	520148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957897
10080	NC_021848	ATT	3	9	520204	520212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957897
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10082	NC_021848	ACC	2	6	520310	520315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957897
10083	NC_021848	CGA	2	6	520335	520340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957897
10084	NC_021848	ATT	2	6	520351	520356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957897
10085	NC_021848	GCA	2	6	520411	520416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957897
10086	NC_021848	TAA	2	6	520429	520434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957897
10087	NC_021848	CAA	2	6	520482	520487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_021848	AAATA	2	10	520554	520563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_021848	TAG	2	6	520572	520577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_021848	T	7	7	520588	520594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_021848	GTG	2	6	520633	520638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_021848	CTT	2	6	520646	520651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_021848	CTTA	2	8	520713	520720	25 %	50 %	0 %	25 %	525957898
10094	NC_021848	GCT	2	6	520737	520742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957898
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10096	NC_021848	AT	3	6	520784	520789	50 %	50 %	0 %	0 %	525957898
10097	NC_021848	TTG	2	6	520796	520801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957898
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10099	NC_021848	CTT	2	6	520948	520953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957898
10100	NC_021848	TTG	2	6	520997	521002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957898
10101	NC_021848	TGT	2	6	521088	521093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957898
10102	NC_021848	TAG	2	6	521129	521134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957898
10103	NC_021848	AAG	2	6	521153	521158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957898
10104	NC_021848	CGGGTA	2	12	521219	521230	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525957898
10105	NC_021848	AAG	2	6	521231	521236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957898
10106	NC_021848	TGA	2	6	521424	521429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957898
10107	NC_021848	GTT	2	6	521486	521491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957898
10108	NC_021848	AC	3	6	521548	521553	50 %	0 %	0 %	50 %	525957898
10109	NC_021848	GAA	2	6	521575	521580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957898
10110	NC_021848	TTA	2	6	521671	521676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957898
10111	NC_021848	TGA	2	6	521684	521689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957898
10112	NC_021848	GGC	2	6	521707	521712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957898
10113	NC_021848	CGC	2	6	521729	521734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957898
10114	NC_021848	TTG	2	6	521795	521800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957898
10115	NC_021848	CGA	2	6	521852	521857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957898
10116	NC_021848	AAGAGC	2	12	521918	521929	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525957898
10117	NC_021848	TCT	2	6	521948	521953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957898
10118	NC_021848	ACC	2	6	522018	522023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957898
10119	NC_021848	GTTG	2	8	522147	522154	0 %	50 %	50 %	0 %	525957898
10120	NC_021848	ATAAC	2	10	522265	522274	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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10234	NC_021848	CTTCA	2	10	528120	528129	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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10241	NC_021848	CAAG	2	8	528366	528373	50 %	0 %	25 %	25 %	525957904
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10243	NC_021848	AAG	2	6	528404	528409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957904
10244	NC_021848	AGA	2	6	528441	528446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957904
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10287	NC_021848	T	7	7	530997	531003	0 %	100 %	0 %	0 %	525957907
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10322	NC_021848	CAG	2	6	532663	532668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957907
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10334	NC_021848	AGC	2	6	533253	533258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957908
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10348	NC_021848	CCGA	2	8	533970	533977	25 %	0 %	25 %	50 %	525957909
10349	NC_021848	TGGCGG	2	12	534014	534025	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	525957909
10350	NC_021848	ACGT	2	8	534115	534122	25 %	25 %	25 %	25 %	525957909
10351	NC_021848	ATT	2	6	534234	534239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957909
10352	NC_021848	TC	3	6	534337	534342	0 %	50 %	0 %	50 %	525957909
10353	NC_021848	CTT	2	6	534383	534388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957909
10354	NC_021848	GAT	2	6	534423	534428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957909
10355	NC_021848	GAT	2	6	534432	534437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957909
10356	NC_021848	TTGAT	2	10	534454	534463	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10357	NC_021848	GAT	2	6	534633	534638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957910
10358	NC_021848	CGT	2	6	534642	534647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957910
10359	NC_021848	CAT	2	6	534659	534664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957910
10360	NC_021848	ACC	2	6	535012	535017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957911
10361	NC_021848	GCA	2	6	535098	535103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957911
10362	NC_021848	TGG	2	6	535187	535192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957911
10363	NC_021848	CAGT	2	8	535275	535282	25 %	25 %	25 %	25 %	525957911
10364	NC_021848	AATCC	2	10	535316	535325	40 %	20 %	0 %	40 %	525957911
10365	NC_021848	TTC	2	6	535369	535374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957912
10366	NC_021848	TGC	2	6	535384	535389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957912
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10369	NC_021848	CTT	2	6	535594	535599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957912
10370	NC_021848	TGA	2	6	535617	535622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957912
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10374	NC_021848	GC	3	6	535805	535810	0 %	0 %	50 %	50 %	525957912
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10377	NC_021848	ATC	2	6	536018	536023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957912
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10380	NC_021848	TGG	2	6	536118	536123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957912
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10382	NC_021848	CTT	2	6	536349	536354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957913
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10388	NC_021848	CTG	2	6	536650	536655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957914
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10392	NC_021848	TGC	2	6	536917	536922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957914
10393	NC_021848	TGG	2	6	536926	536931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957914
10394	NC_021848	TTGGC	2	10	537002	537011	0 %	40 %	40 %	20 %	525957914
10395	NC_021848	CAT	2	6	537050	537055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957914
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10411	NC_021848	GCT	2	6	537862	537867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957915
10412	NC_021848	ATTG	2	8	537872	537879	25 %	50 %	25 %	0 %	525957915
10413	NC_021848	GCA	2	6	537911	537916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957915
10414	NC_021848	CAAG	2	8	537938	537945	50 %	0 %	25 %	25 %	525957915
10415	NC_021848	TCGTAT	2	12	537995	538006	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525957915
10416	NC_021848	GAT	2	6	538034	538039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957915
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10418	NC_021848	CCA	2	6	538215	538220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957915
10419	NC_021848	TACCA	2	10	538236	538245	40 %	20 %	0 %	40 %	525957915
10420	NC_021848	GTG	2	6	538336	538341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957915
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10422	NC_021848	CAAT	2	8	538435	538442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10423	NC_021848	ATT	2	6	538471	538476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10424	NC_021848	GC	3	6	538697	538702	0 %	0 %	50 %	50 %	525957916
10425	NC_021848	TGG	2	6	538730	538735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957916
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10427	NC_021848	TGG	2	6	538796	538801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957916
10428	NC_021848	TGT	2	6	538802	538807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957916
10429	NC_021848	TA	3	6	538817	538822	50 %	50 %	0 %	0 %	525957916
10430	NC_021848	CGC	2	6	538825	538830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957916
10431	NC_021848	CGC	2	6	538842	538847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957916
10432	NC_021848	TGC	2	6	538859	538864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957916
10433	NC_021848	GTT	2	6	538875	538880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957916
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10439	NC_021848	ATGG	2	8	539221	539228	25 %	25 %	50 %	0 %	525957916
10440	NC_021848	GCGAT	2	10	539249	539258	20 %	20 %	40 %	20 %	525957916
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10446	NC_021848	CGG	2	6	539513	539518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957916
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10454	NC_021848	TGAT	2	8	539984	539991	25 %	50 %	25 %	0 %	525957916
10455	NC_021848	AGC	2	6	540047	540052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957916
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10461	NC_021848	GTG	3	9	540247	540255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957916
10462	NC_021848	TTG	2	6	540271	540276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957916
10463	NC_021848	GCG	2	6	540367	540372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957916
10464	NC_021848	CTG	2	6	540503	540508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957916
10465	NC_021848	GCAAGA	2	12	540561	540572	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525957916
10466	NC_021848	GAA	2	6	540639	540644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957916
10467	NC_021848	TAAT	2	8	540723	540730	50 %	50 %	0 %	0 %	525957916
10468	NC_021848	CAT	2	6	540737	540742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10469	NC_021848	T	6	6	540773	540778	0 %	100 %	0 %	0 %	525957917
10470	NC_021848	GCT	2	6	540799	540804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957917
10471	NC_021848	TTG	2	6	540876	540881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957917
10472	NC_021848	AATCC	2	10	540897	540906	40 %	20 %	0 %	40 %	525957917
10473	NC_021848	CTT	2	6	540921	540926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957917
10474	NC_021848	GTG	2	6	540939	540944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957917
10475	NC_021848	AATCG	2	10	540951	540960	40 %	20 %	20 %	20 %	525957917
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10477	NC_021848	GTG	2	6	541107	541112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957917
10478	NC_021848	GCA	2	6	541115	541120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957917
10479	NC_021848	ATTG	2	8	541249	541256	25 %	50 %	25 %	0 %	525957917
10480	NC_021848	CGT	2	6	541313	541318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957917
10481	NC_021848	TCG	2	6	541390	541395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957917
10482	NC_021848	CTG	2	6	541397	541402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957917
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10491	NC_021848	AGA	2	6	541862	541867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957917
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10498	NC_021848	GCG	2	6	542271	542276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10499	NC_021848	ACT	2	6	542278	542283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10500	NC_021848	CAAG	2	8	542308	542315	50 %	0 %	25 %	25 %	525957918

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