MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021848	T	6	6	313353	313358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_021848	ATC	2	6	313379	313384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_021848	GGC	2	6	313404	313409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_021848	TTA	2	6	313473	313478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021848	TCG	2	6	313502	313507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_021848	AC	3	6	313592	313597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6007	NC_021848	GTT	2	6	313656	313661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957720
6008	NC_021848	CAG	3	9	313726	313734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6009	NC_021848	CAG	2	6	313756	313761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6010	NC_021848	GTT	2	6	313773	313778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957720
6011	NC_021848	A	6	6	313782	313787	100 %	0 %	0 %	0 %	525957720
6012	NC_021848	TTC	2	6	313809	313814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957720
6013	NC_021848	CTT	2	6	313871	313876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957720
6014	NC_021848	GTC	2	6	313888	313893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6015	NC_021848	CAA	2	6	314029	314034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957720
6016	NC_021848	GCA	2	6	314094	314099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6017	NC_021848	GAA	3	9	314235	314243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957720
6018	NC_021848	AGC	2	6	314249	314254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6019	NC_021848	CAA	3	9	314274	314282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957720
6020	NC_021848	AGA	2	6	314351	314356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957720
6021	NC_021848	AAGCT	2	10	314395	314404	40 %	20 %	20 %	20 %	525957720
6022	NC_021848	GCA	2	6	314463	314468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6023	NC_021848	TGCT	2	8	314485	314492	0 %	50 %	25 %	25 %	525957720
6024	NC_021848	CA	3	6	314523	314528	50 %	0 %	0 %	50 %	525957720
6025	NC_021848	AGA	2	6	314545	314550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957720
6026	NC_021848	TGT	2	6	314552	314557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957720
6027	NC_021848	CGT	2	6	314559	314564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6028	NC_021848	CAT	2	6	314567	314572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957720
6029	NC_021848	TTC	2	6	314641	314646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957720
6030	NC_021848	AC	3	6	314652	314657	50 %	0 %	0 %	50 %	525957720
6031	NC_021848	GTG	2	6	314677	314682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957720
6032	NC_021848	ATC	2	6	314733	314738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957720
6033	NC_021848	CTA	2	6	314772	314777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957720
6034	NC_021848	TG	3	6	314799	314804	0 %	50 %	50 %	0 %	525957720
6035	NC_021848	CGT	2	6	314835	314840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6036	NC_021848	AAG	2	6	315052	315057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957720
6037	NC_021848	TGT	2	6	315068	315073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957720
6038	NC_021848	CGA	2	6	315092	315097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6039	NC_021848	ACC	2	6	315100	315105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957720
6040	NC_021848	GATG	2	8	315251	315258	25 %	25 %	50 %	0 %	525957720
6041	NC_021848	CA	3	6	315309	315314	50 %	0 %	0 %	50 %	525957720
6042	NC_021848	AGA	2	6	315331	315336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957720
6043	NC_021848	GGT	2	6	315357	315362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957720
6044	NC_021848	ATCGAA	2	12	315402	315413	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525957720
6045	NC_021848	GAC	2	6	315414	315419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6046	NC_021848	GCA	2	6	315435	315440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6047	NC_021848	GCA	2	6	315450	315455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6048	NC_021848	AAG	2	6	315460	315465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957720
6049	NC_021848	CCG	2	6	315470	315475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957720
6050	NC_021848	CTG	2	6	315490	315495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6051	NC_021848	AAG	2	6	315652	315657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957720
6052	NC_021848	AAG	2	6	315712	315717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957720
6053	NC_021848	CTG	2	6	315730	315735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6054	NC_021848	AAG	2	6	315736	315741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957720
6055	NC_021848	CAG	2	6	315757	315762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957720
6056	NC_021848	AGA	2	6	315767	315772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957720
6057	NC_021848	TTA	2	6	315800	315805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_021848	T	8	8	315853	315860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_021848	GAG	2	6	315871	315876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_021848	TTAT	2	8	315894	315901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_021848	CCA	2	6	316050	316055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957721
6062	NC_021848	CAA	2	6	316083	316088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957721
6063	NC_021848	ACT	2	6	316115	316120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957721
6064	NC_021848	GTGC	2	8	316146	316153	0 %	25 %	50 %	25 %	525957721
6065	NC_021848	TAC	2	6	316179	316184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957721
6066	NC_021848	AT	3	6	316258	316263	50 %	50 %	0 %	0 %	525957721
6067	NC_021848	TCT	2	6	316268	316273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957721
6068	NC_021848	TTTAC	2	10	316279	316288	20 %	60 %	0 %	20 %	525957721
6069	NC_021848	TAC	2	6	316389	316394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957721
6070	NC_021848	CAT	2	6	316481	316486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957721
6071	NC_021848	AGCA	2	8	316507	316514	50 %	0 %	25 %	25 %	525957721
6072	NC_021848	GCA	2	6	316526	316531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957721
6073	NC_021848	CAA	2	6	316539	316544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957721
6074	NC_021848	GAA	2	6	316554	316559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957721
6075	NC_021848	TGA	2	6	316601	316606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957721
6076	NC_021848	TGC	2	6	316616	316621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957721
6077	NC_021848	ATGG	2	8	316626	316633	25 %	25 %	50 %	0 %	525957721
6078	NC_021848	TCA	2	6	316697	316702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957721
6079	NC_021848	GCC	2	6	316851	316856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957721
6080	NC_021848	CAA	2	6	316860	316865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957721
6081	NC_021848	AAT	2	6	316873	316878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957721
6082	NC_021848	T	6	6	316903	316908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_021848	TGA	2	6	316914	316919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_021848	CTAA	2	8	316953	316960	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_021848	AGA	2	6	317042	317047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957722
6086	NC_021848	TTAC	2	8	317081	317088	25 %	50 %	0 %	25 %	525957722
6087	NC_021848	AGAAA	2	10	317186	317195	80 %	0 %	20 %	0 %	525957722
6088	NC_021848	TTGC	2	8	317212	317219	0 %	50 %	25 %	25 %	525957722
6089	NC_021848	A	6	6	317269	317274	100 %	0 %	0 %	0 %	525957722
6090	NC_021848	ATG	2	6	317316	317321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957722
6091	NC_021848	AAG	2	6	317338	317343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957722
6092	NC_021848	AATT	2	8	317382	317389	50 %	50 %	0 %	0 %	525957722
6093	NC_021848	ATTT	2	8	317399	317406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_021848	TTAG	2	8	317413	317420	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_021848	GTC	2	6	317526	317531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957723
6096	NC_021848	GAT	2	6	317624	317629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957723
6097	NC_021848	CAAG	2	8	317663	317670	50 %	0 %	25 %	25 %	525957723
6098	NC_021848	CAA	2	6	317682	317687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957723
6099	NC_021848	TTG	2	6	317724	317729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957723
6100	NC_021848	TGA	2	6	317771	317776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957723
6101	NC_021848	T	6	6	317857	317862	0 %	100 %	0 %	0 %	525957723
6102	NC_021848	ACA	2	6	317902	317907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957723
6103	NC_021848	CTT	2	6	318062	318067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957723
6104	NC_021848	AG	3	6	318099	318104	50 %	0 %	50 %	0 %	525957723
6105	NC_021848	T	6	6	318159	318164	0 %	100 %	0 %	0 %	525957723
6106	NC_021848	GGT	2	6	318399	318404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957723
6107	NC_021848	TGA	2	6	318421	318426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957723
6108	NC_021848	CAG	2	6	318471	318476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957723
6109	NC_021848	TGG	2	6	318493	318498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957723
6110	NC_021848	CAA	2	6	318572	318577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957723
6111	NC_021848	GGTA	2	8	318602	318609	25 %	25 %	50 %	0 %	525957723
6112	NC_021848	TCA	2	6	318637	318642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957723
6113	NC_021848	TGA	2	6	318715	318720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957723
6114	NC_021848	TTC	2	6	318852	318857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957724
6115	NC_021848	AGCC	2	8	318865	318872	25 %	0 %	25 %	50 %	525957724
6116	NC_021848	GGC	2	6	318898	318903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957724
6117	NC_021848	CTT	2	6	319084	319089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957724
6118	NC_021848	GCT	2	6	319100	319105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957724
6119	NC_021848	GCA	2	6	319133	319138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957724
6120	NC_021848	ATC	2	6	319148	319153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957724
6121	NC_021848	AGC	2	6	319183	319188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957724
6122	NC_021848	GACTTC	2	12	319226	319237	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525957724
6123	NC_021848	GT	3	6	319356	319361	0 %	50 %	50 %	0 %	525957724
6124	NC_021848	AT	3	6	319470	319475	50 %	50 %	0 %	0 %	525957724
6125	NC_021848	TTC	2	6	319476	319481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957724
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6127	NC_021848	TGG	2	6	319519	319524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957724
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6129	NC_021848	CTTT	2	8	319644	319651	0 %	75 %	0 %	25 %	525957724
6130	NC_021848	GTAA	2	8	319657	319664	50 %	25 %	25 %	0 %	525957724
6131	NC_021848	CAG	2	6	319697	319702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957724
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6135	NC_021848	TGC	2	6	319948	319953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957725
6136	NC_021848	TGGT	2	8	319989	319996	0 %	50 %	50 %	0 %	525957725
6137	NC_021848	T	6	6	320017	320022	0 %	100 %	0 %	0 %	525957725
6138	NC_021848	TGT	2	6	320109	320114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957725
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6143	NC_021848	TGA	2	6	320315	320320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957725
6144	NC_021848	AATC	2	8	320376	320383	50 %	25 %	0 %	25 %	525957725
6145	NC_021848	AGCTCA	2	12	320423	320434	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525957725
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6149	NC_021848	CAAT	2	8	320702	320709	50 %	25 %	0 %	25 %	525957725
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6151	NC_021848	GAA	2	6	320800	320805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6152	NC_021848	GGC	2	6	320918	320923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957726
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6155	NC_021848	TGA	2	6	321083	321088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957726
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6160	NC_021848	TCA	2	6	321284	321289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957726
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6183	NC_021848	CG	3	6	322321	322326	0 %	0 %	50 %	50 %	525957726
6184	NC_021848	CAAA	2	8	322336	322343	75 %	0 %	0 %	25 %	525957726
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6233	NC_021848	AAC	2	6	325187	325192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959940
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6236	NC_021848	GCA	2	6	325270	325275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959940
6237	NC_021848	GTGC	2	8	325478	325485	0 %	25 %	50 %	25 %	525957730
6238	NC_021848	GTTAC	2	10	325552	325561	20 %	40 %	20 %	20 %	525957730
6239	NC_021848	TCG	2	6	325734	325739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957730
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6242	NC_021848	ATC	2	6	325786	325791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957730
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6490	NC_021848	GTT	2	6	338229	338234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957740
6491	NC_021848	A	6	6	338271	338276	100 %	0 %	0 %	0 %	525957740
6492	NC_021848	GT	3	6	338293	338298	0 %	50 %	50 %	0 %	525957740
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