MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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64002	NC_021848	TGGC	2	8	3308628	3308635	0 %	25 %	50 %	25 %	525959886
64003	NC_021848	TGTT	2	8	3308676	3308683	0 %	75 %	25 %	0 %	525959886
64004	NC_021848	GCGTC	2	10	3308714	3308723	0 %	20 %	40 %	40 %	525959886
64005	NC_021848	CAA	2	6	3308763	3308768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959886
64006	NC_021848	TGA	2	6	3308834	3308839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959886
64007	NC_021848	TTGATA	2	12	3309007	3309018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525959886
64008	NC_021848	CGT	2	6	3309039	3309044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959886
64009	NC_021848	TTC	2	6	3309045	3309050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959886
64010	NC_021848	CAT	2	6	3309137	3309142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959886
64011	NC_021848	GA	3	6	3309151	3309156	50 %	0 %	50 %	0 %	525959886
64012	NC_021848	A	6	6	3309166	3309171	100 %	0 %	0 %	0 %	525959886
64013	NC_021848	TGG	2	6	3309258	3309263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959886
64014	NC_021848	GCA	2	6	3309296	3309301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959886
64015	NC_021848	TGAC	2	8	3309385	3309392	25 %	25 %	25 %	25 %	525959886
64016	NC_021848	ATG	2	6	3309403	3309408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959886
64017	NC_021848	CCA	2	6	3309459	3309464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959886
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64019	NC_021848	ATG	2	6	3309496	3309501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959886
64020	NC_021848	CAG	2	6	3309507	3309512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959886
64021	NC_021848	TAG	2	6	3309595	3309600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959886
64022	NC_021848	CTT	2	6	3309643	3309648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959886
64023	NC_021848	GTG	2	6	3309657	3309662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959886
64024	NC_021848	TGC	2	6	3309674	3309679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959886
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64028	NC_021848	TGA	2	6	3309830	3309835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959886
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64030	NC_021848	GATA	2	8	3310087	3310094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64031	NC_021848	AGC	2	6	3310111	3310116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960458
64032	NC_021848	AGG	2	6	3310136	3310141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525960458
64033	NC_021848	TTG	2	6	3310207	3310212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960458
64034	NC_021848	AT	3	6	3310319	3310324	50 %	50 %	0 %	0 %	525960458
64035	NC_021848	GAAGC	2	10	3310329	3310338	40 %	0 %	40 %	20 %	525960458
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64039	NC_021848	A	6	6	3310518	3310523	100 %	0 %	0 %	0 %	525960458
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64041	NC_021848	A	6	6	3310569	3310574	100 %	0 %	0 %	0 %	525960458
64042	NC_021848	TG	3	6	3310583	3310588	0 %	50 %	50 %	0 %	525960458
64043	NC_021848	TCG	2	6	3310610	3310615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960458
64044	NC_021848	GC	3	6	3310617	3310622	0 %	0 %	50 %	50 %	525960458
64045	NC_021848	ACTTC	2	10	3310678	3310687	20 %	40 %	0 %	40 %	525960458
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64052	NC_021848	GC	3	6	3310998	3311003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64053	NC_021848	ACT	2	6	3311029	3311034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64054	NC_021848	TCCA	2	8	3311065	3311072	25 %	25 %	0 %	50 %	525959887
64055	NC_021848	TG	3	6	3311197	3311202	0 %	50 %	50 %	0 %	525959887
64056	NC_021848	CAT	2	6	3311272	3311277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959887
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64065	NC_021848	CG	3	6	3311812	3311817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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64091	NC_021848	CAATG	2	10	3313570	3313579	40 %	20 %	20 %	20 %	525959892
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64101	NC_021848	TTG	2	6	3314291	3314296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64102	NC_021848	TTA	2	6	3314317	3314322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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64105	NC_021848	TAG	2	6	3314529	3314534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64106	NC_021848	CTCA	2	8	3314611	3314618	25 %	25 %	0 %	50 %	525959893
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64117	NC_021848	TG	3	6	3315259	3315264	0 %	50 %	50 %	0 %	525959893
64118	NC_021848	GCA	2	6	3315278	3315283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959893
64119	NC_021848	CGG	2	6	3315319	3315324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959893
64120	NC_021848	TGA	2	6	3315331	3315336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959893
64121	NC_021848	ACCAA	2	10	3315367	3315376	60 %	0 %	0 %	40 %	525959893
64122	NC_021848	GAT	2	6	3315396	3315401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959893
64123	NC_021848	TCT	2	6	3315420	3315425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959893
64124	NC_021848	AGA	2	6	3315445	3315450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959893
64125	NC_021848	CGT	2	6	3315510	3315515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959893
64126	NC_021848	TCGC	2	8	3315623	3315630	0 %	25 %	25 %	50 %	525959893
64127	NC_021848	TGA	2	6	3315788	3315793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959893
64128	NC_021848	CGG	2	6	3315826	3315831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959893
64129	NC_021848	AAT	2	6	3315833	3315838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959893
64130	NC_021848	AAC	2	6	3315847	3315852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959893
64131	NC_021848	ACA	2	6	3315893	3315898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959893
64132	NC_021848	TGA	3	9	3315938	3315946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959893
64133	NC_021848	GCAT	2	8	3315979	3315986	25 %	25 %	25 %	25 %	525959894
64134	NC_021848	GCA	2	6	3316002	3316007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959894
64135	NC_021848	AAAGT	2	10	3316040	3316049	60 %	20 %	20 %	0 %	525959894
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64137	NC_021848	GC	3	6	3316161	3316166	0 %	0 %	50 %	50 %	525959894
64138	NC_021848	AAC	2	6	3316240	3316245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959894
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64140	NC_021848	ATG	2	6	3316373	3316378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959894
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64143	NC_021848	ATT	2	6	3316597	3316602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959894
64144	NC_021848	CCAG	2	8	3316653	3316660	25 %	0 %	25 %	50 %	525959894
64145	NC_021848	TGA	2	6	3316661	3316666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959894
64146	NC_021848	GGT	2	6	3316726	3316731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959894
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64148	NC_021848	T	7	7	3317087	3317093	0 %	100 %	0 %	0 %	525959895
64149	NC_021848	TCT	2	6	3317095	3317100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959895
64150	NC_021848	CT	3	6	3317269	3317274	0 %	50 %	0 %	50 %	525959895
64151	NC_021848	AAC	2	6	3317374	3317379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959895
64152	NC_021848	TCG	2	6	3317380	3317385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959895
64153	NC_021848	TGA	2	6	3317412	3317417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959895
64154	NC_021848	CTG	2	6	3317551	3317556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959895
64155	NC_021848	TTC	2	6	3317568	3317573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959895
64156	NC_021848	AAGA	2	8	3317599	3317606	75 %	0 %	25 %	0 %	525959895
64157	NC_021848	GAC	2	6	3317697	3317702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959895
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64159	NC_021848	AC	3	6	3317834	3317839	50 %	0 %	0 %	50 %	525959895
64160	NC_021848	GTT	2	6	3317863	3317868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959895
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64164	NC_021848	TTG	2	6	3318065	3318070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959895
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64172	NC_021848	GTC	2	6	3318454	3318459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959896
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64174	NC_021848	GCTC	2	8	3318491	3318498	0 %	25 %	25 %	50 %	525959896
64175	NC_021848	TTG	2	6	3318509	3318514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959896
64176	NC_021848	TCCATG	2	12	3318524	3318535	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525959896
64177	NC_021848	AATA	2	8	3318589	3318596	75 %	25 %	0 %	0 %	525959896
64178	NC_021848	TTG	2	6	3318637	3318642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959896
64179	NC_021848	TCA	2	6	3318650	3318655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959896
64180	NC_021848	T	6	6	3318699	3318704	0 %	100 %	0 %	0 %	525959896
64181	NC_021848	ATGAT	2	10	3318781	3318790	40 %	40 %	20 %	0 %	525960459
64182	NC_021848	CCA	2	6	3318796	3318801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960459
64183	NC_021848	CAGGG	2	10	3318821	3318830	20 %	0 %	60 %	20 %	525960459
64184	NC_021848	A	8	8	3318885	3318892	100 %	0 %	0 %	0 %	525960459
64185	NC_021848	TAAT	2	8	3318931	3318938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64186	NC_021848	TCA	2	6	3319193	3319198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959897
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64189	NC_021848	A	6	6	3319397	3319402	100 %	0 %	0 %	0 %	525959897
64190	NC_021848	CGG	2	6	3319428	3319433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959897
64191	NC_021848	ATCGGT	2	12	3319480	3319491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525959897
64192	NC_021848	ATC	2	6	3319544	3319549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959897
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64209	NC_021848	AAAAG	2	10	3320693	3320702	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64210	NC_021848	T	6	6	3320769	3320774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64211	NC_021848	ATG	3	9	3320832	3320840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959898
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64214	NC_021848	CACC	2	8	3320971	3320978	25 %	0 %	0 %	75 %	525959898
64215	NC_021848	CTT	2	6	3320989	3320994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959898
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64219	NC_021848	GC	3	6	3321234	3321239	0 %	0 %	50 %	50 %	525959898
64220	NC_021848	TTC	2	6	3321246	3321251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959899
64221	NC_021848	TTTC	2	8	3321259	3321266	0 %	75 %	0 %	25 %	525959899
64222	NC_021848	GGA	2	6	3321272	3321277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525959899
64223	NC_021848	TTGG	2	8	3321311	3321318	0 %	50 %	50 %	0 %	525959899
64224	NC_021848	CAC	2	6	3321394	3321399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959899
64225	NC_021848	AAC	2	6	3321448	3321453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959899
64226	NC_021848	TAA	2	6	3321457	3321462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959899
64227	NC_021848	CT	3	6	3321555	3321560	0 %	50 %	0 %	50 %	525959899
64228	NC_021848	GCG	2	6	3321596	3321601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959899
64229	NC_021848	TTG	2	6	3321691	3321696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959899
64230	NC_021848	TGAT	2	8	3321896	3321903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64231	NC_021848	T	6	6	3321952	3321957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64232	NC_021848	CTG	2	6	3321965	3321970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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64234	NC_021848	CTG	2	6	3322102	3322107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959900
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