MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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62004	NC_021848	AAC	2	6	3208178	3208183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959798
62005	NC_021848	TCA	2	6	3208254	3208259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959798
62006	NC_021848	TCA	2	6	3208284	3208289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959798
62007	NC_021848	ACC	2	6	3208391	3208396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959798
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62009	NC_021848	CAA	2	6	3208498	3208503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959798
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62011	NC_021848	CTG	3	9	3208582	3208590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959798
62012	NC_021848	GCC	2	6	3208703	3208708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959798
62013	NC_021848	TCC	2	6	3208753	3208758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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62015	NC_021848	AGT	2	6	3208827	3208832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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62053	NC_021848	GTTT	2	8	3210952	3210959	0 %	75 %	25 %	0 %	525959802
62054	NC_021848	GCT	2	6	3210967	3210972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959802
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62063	NC_021848	TGG	2	6	3211461	3211466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959803
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62109	NC_021848	GA	3	6	3213611	3213616	50 %	0 %	50 %	0 %	525959805
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62235	NC_021848	TTG	2	6	3220757	3220762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959811
62236	NC_021848	GCC	2	6	3220779	3220784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959811
62237	NC_021848	TGT	2	6	3220806	3220811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959811
62238	NC_021848	CTG	2	6	3220826	3220831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959811
62239	NC_021848	CGA	2	6	3220840	3220845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959811
62240	NC_021848	T	6	6	3220848	3220853	0 %	100 %	0 %	0 %	525959811
62241	NC_021848	ATTG	2	8	3220857	3220864	25 %	50 %	25 %	0 %	525959811
62242	NC_021848	CGTG	2	8	3220888	3220895	0 %	25 %	50 %	25 %	525959811
62243	NC_021848	TCACCT	2	12	3220947	3220958	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525959811
62244	NC_021848	AG	3	6	3220970	3220975	50 %	0 %	50 %	0 %	525959811
62245	NC_021848	GTA	2	6	3221002	3221007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959811
62246	NC_021848	GAT	2	6	3221039	3221044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959811
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62251	NC_021848	CG	3	6	3221242	3221247	0 %	0 %	50 %	50 %	525959811
62252	NC_021848	GTG	2	6	3221265	3221270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959811
62253	NC_021848	CGA	2	6	3221305	3221310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959811
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62255	NC_021848	CCA	2	6	3221326	3221331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959811
62256	NC_021848	GTT	2	6	3221345	3221350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959811
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62258	NC_021848	TTGT	2	8	3221417	3221424	0 %	75 %	25 %	0 %	525959811
62259	NC_021848	AG	3	6	3221615	3221620	50 %	0 %	50 %	0 %	525959811
62260	NC_021848	CG	3	6	3221630	3221635	0 %	0 %	50 %	50 %	525959811
62261	NC_021848	CAT	2	6	3221662	3221667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959811
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62263	NC_021848	CAT	2	6	3221699	3221704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959811
62264	NC_021848	TTC	2	6	3221792	3221797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959811
62265	NC_021848	TGA	2	6	3222016	3222021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62266	NC_021848	GCAAT	2	10	3222053	3222062	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62267	NC_021848	TCA	2	6	3222076	3222081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62268	NC_021848	AGA	2	6	3222165	3222170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959812
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62270	NC_021848	TGG	2	6	3222280	3222285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959812
62271	NC_021848	TGC	2	6	3222391	3222396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959812
62272	NC_021848	CAA	2	6	3222409	3222414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959812
62273	NC_021848	TCGCGG	2	12	3222417	3222428	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525959812
62274	NC_021848	CAAC	2	8	3222451	3222458	50 %	0 %	0 %	50 %	525959812
62275	NC_021848	AC	3	6	3222457	3222462	50 %	0 %	0 %	50 %	525959812
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62279	NC_021848	CTT	2	6	3222618	3222623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959812
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62287	NC_021848	GCTC	2	8	3222801	3222808	0 %	25 %	25 %	50 %	525959812
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62300	NC_021848	GCA	2	6	3223430	3223435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959812
62301	NC_021848	AGA	2	6	3223436	3223441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959812
62302	NC_021848	CAA	2	6	3223450	3223455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959812
62303	NC_021848	CAT	2	6	3223504	3223509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959812
62304	NC_021848	A	6	6	3223529	3223534	100 %	0 %	0 %	0 %	525959812
62305	NC_021848	AG	3	6	3223663	3223668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62306	NC_021848	TCA	2	6	3223696	3223701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62307	NC_021848	A	7	7	3223704	3223710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62308	NC_021848	T	6	6	3223751	3223756	0 %	100 %	0 %	0 %	525959813
62309	NC_021848	GGTT	2	8	3223781	3223788	0 %	50 %	50 %	0 %	525959813
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62312	NC_021848	CTG	2	6	3223912	3223917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959813
62313	NC_021848	TGCC	2	8	3223963	3223970	0 %	25 %	25 %	50 %	525959813
62314	NC_021848	ACCA	2	8	3224003	3224010	50 %	0 %	0 %	50 %	525959813
62315	NC_021848	ATAC	2	8	3224046	3224053	50 %	25 %	0 %	25 %	525959813
62316	NC_021848	CTG	2	6	3224092	3224097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959813
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62329	NC_021848	TCTG	2	8	3224622	3224629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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62336	NC_021848	CTT	2	6	3224945	3224950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959814
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62339	NC_021848	GTG	2	6	3225043	3225048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959814
62340	NC_021848	CTT	2	6	3225083	3225088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959814
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62342	NC_021848	CAA	2	6	3225155	3225160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959814
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62344	NC_021848	CAA	2	6	3225324	3225329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959814
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62347	NC_021848	AGT	2	6	3225458	3225463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959814
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62349	NC_021848	ACG	2	6	3225585	3225590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959814
62350	NC_021848	TTGC	2	8	3225673	3225680	0 %	50 %	25 %	25 %	525959814
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62352	NC_021848	CTT	2	6	3225713	3225718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959814
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62354	NC_021848	GTTG	2	8	3225737	3225744	0 %	50 %	50 %	0 %	525959814
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62475	NC_021848	GTG	2	6	3231879	3231884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959818
62476	NC_021848	CTGT	2	8	3231890	3231897	0 %	50 %	25 %	25 %	525959818
62477	NC_021848	AATA	2	8	3231905	3231912	75 %	25 %	0 %	0 %	525959818
62478	NC_021848	CAAG	2	8	3232017	3232024	50 %	0 %	25 %	25 %	525959818
62479	NC_021848	TCG	2	6	3232123	3232128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959818
62480	NC_021848	AAC	2	6	3232133	3232138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959818
62481	NC_021848	GGTC	2	8	3232159	3232166	0 %	25 %	50 %	25 %	525959818
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62483	NC_021848	CAAA	2	8	3232341	3232348	75 %	0 %	0 %	25 %	525959818
62484	NC_021848	TAAG	2	8	3232349	3232356	50 %	25 %	25 %	0 %	525959818
62485	NC_021848	CCAA	2	8	3232405	3232412	50 %	0 %	0 %	50 %	525959819
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62490	NC_021848	GTC	2	6	3232591	3232596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959819
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62494	NC_021848	CTG	2	6	3232780	3232785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959819
62495	NC_021848	CCCAT	2	10	3232786	3232795	20 %	20 %	0 %	60 %	525959819
62496	NC_021848	A	6	6	3232864	3232869	100 %	0 %	0 %	0 %	525959819
62497	NC_021848	GCG	2	6	3233010	3233015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959819
62498	NC_021848	GT	3	6	3233016	3233021	0 %	50 %	50 %	0 %	525959819
62499	NC_021848	TTGAGC	2	12	3233053	3233064	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525959819
62500	NC_021848	CAC	2	6	3233093	3233098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959819

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