MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
59001	NC_021848	AGC	2	6	3051383	3051388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959712
59002	NC_021848	GCA	2	6	3051429	3051434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959712
59003	NC_021848	CGG	2	6	3051518	3051523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959712
59004	NC_021848	GTC	2	6	3051524	3051529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959712
59005	NC_021848	ACAAA	2	10	3051531	3051540	80 %	0 %	0 %	20 %	525959712
59006	NC_021848	TGA	2	6	3051578	3051583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959712
59007	NC_021848	TGA	2	6	3051591	3051596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959712
59008	NC_021848	CAC	2	6	3051602	3051607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959712
59009	NC_021848	CTC	2	6	3051683	3051688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525959712
59010	NC_021848	GGC	2	6	3051730	3051735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959712
59011	NC_021848	CAA	2	6	3051899	3051904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960417
59012	NC_021848	GGT	2	6	3051923	3051928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525960417
59013	NC_021848	TTG	2	6	3052016	3052021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960417
59014	NC_021848	CCGA	2	8	3052046	3052053	25 %	0 %	25 %	50 %	525960417
59015	NC_021848	ACC	2	6	3052146	3052151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960417
59016	NC_021848	GT	3	6	3052170	3052175	0 %	50 %	50 %	0 %	525960417
59017	NC_021848	GCG	2	6	3052244	3052249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525960417
59018	NC_021848	GTT	2	6	3052281	3052286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960417
59019	NC_021848	CT	3	6	3052298	3052303	0 %	50 %	0 %	50 %	525960417
59020	NC_021848	GGT	2	6	3052304	3052309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525960417
59021	NC_021848	AAC	3	9	3052311	3052319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960417
59022	NC_021848	TTA	2	6	3052358	3052363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525960417
59023	NC_021848	GT	3	6	3052410	3052415	0 %	50 %	50 %	0 %	525960417
59024	NC_021848	GAA	2	6	3052427	3052432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960417
59025	NC_021848	CACG	2	8	3052465	3052472	25 %	0 %	25 %	50 %	525960417
59026	NC_021848	TTGAA	2	10	3052512	3052521	40 %	40 %	20 %	0 %	525960417
59027	NC_021848	AGA	2	6	3052543	3052548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960417
59028	NC_021848	GAAAGG	2	12	3052577	3052588	50 %	0 %	50 %	0 %	525959713
59029	NC_021848	T	6	6	3052619	3052624	0 %	100 %	0 %	0 %	525959713
59030	NC_021848	TGCCA	2	10	3052721	3052730	20 %	20 %	20 %	40 %	525959713
59031	NC_021848	TTGT	2	8	3052733	3052740	0 %	75 %	25 %	0 %	525959713
59032	NC_021848	CTTA	2	8	3052804	3052811	25 %	50 %	0 %	25 %	525959713
59033	NC_021848	AAG	2	6	3052879	3052884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959713
59034	NC_021848	AT	3	6	3052889	3052894	50 %	50 %	0 %	0 %	525959713
59035	NC_021848	AAG	2	6	3053038	3053043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959713
59036	NC_021848	CAA	3	9	3053049	3053057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959713
59037	NC_021848	GC	3	6	3053094	3053099	0 %	0 %	50 %	50 %	525959713
59038	NC_021848	ATT	2	6	3053127	3053132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959713
59039	NC_021848	AGA	2	6	3053216	3053221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959713
59040	NC_021848	CGAC	2	8	3053248	3053255	25 %	0 %	25 %	50 %	525959713
59041	NC_021848	TGA	2	6	3053350	3053355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959713
59042	NC_021848	AGA	2	6	3053366	3053371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959713
59043	NC_021848	CTG	3	9	3053430	3053438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959713
59044	NC_021848	CG	3	6	3053471	3053476	0 %	0 %	50 %	50 %	525959713
59045	NC_021848	CAGCG	2	10	3053482	3053491	20 %	0 %	40 %	40 %	525959713
59046	NC_021848	TGA	2	6	3053521	3053526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59047	NC_021848	TTA	2	6	3053545	3053550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59048	NC_021848	CTT	2	6	3053608	3053613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59049	NC_021848	TGA	2	6	3053681	3053686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59050	NC_021848	AAG	2	6	3053702	3053707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960418
59051	NC_021848	CAG	2	6	3053783	3053788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960418
59052	NC_021848	GTT	2	6	3053875	3053880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960418
59053	NC_021848	GTAC	2	8	3054039	3054046	25 %	25 %	25 %	25 %	525960418
59054	NC_021848	CAA	2	6	3054074	3054079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960418
59055	NC_021848	TTC	2	6	3054100	3054105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960418
59056	NC_021848	A	6	6	3054121	3054126	100 %	0 %	0 %	0 %	525960418
59057	NC_021848	GGTT	2	8	3054133	3054140	0 %	50 %	50 %	0 %	525960418
59058	NC_021848	GCG	2	6	3054220	3054225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525960418
59059	NC_021848	GAC	2	6	3054253	3054258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960418
59060	NC_021848	AGA	2	6	3054303	3054308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960418
59061	NC_021848	TCG	2	6	3054313	3054318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960418
59062	NC_021848	ACA	2	6	3054329	3054334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960418
59063	NC_021848	AAT	2	6	3054364	3054369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525960418
59064	NC_021848	TGA	2	6	3054468	3054473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960418
59065	NC_021848	GAA	2	6	3054522	3054527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960418
59066	NC_021848	T	6	6	3054615	3054620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59067	NC_021848	TCGA	2	8	3054625	3054632	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59068	NC_021848	ATAG	2	8	3054635	3054642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59069	NC_021848	ATT	2	6	3054693	3054698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59070	NC_021848	AC	3	6	3054770	3054775	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59071	NC_021848	ATC	2	6	3054788	3054793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59072	NC_021848	TG	3	6	3054870	3054875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59073	NC_021848	GGC	2	6	3054934	3054939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59074	NC_021848	AGC	2	6	3054977	3054982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59075	NC_021848	ATC	2	6	3055168	3055173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959714
59076	NC_021848	ACGAT	2	10	3055180	3055189	40 %	20 %	20 %	20 %	525959714
59077	NC_021848	AGC	2	6	3055254	3055259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959714
59078	NC_021848	GCGCA	2	10	3055264	3055273	20 %	0 %	40 %	40 %	525959714
59079	NC_021848	AAT	2	6	3055388	3055393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959715
59080	NC_021848	AGAT	2	8	3055437	3055444	50 %	25 %	25 %	0 %	525959715
59081	NC_021848	GAT	2	6	3055450	3055455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959715
59082	NC_021848	CAGC	2	8	3055495	3055502	25 %	0 %	25 %	50 %	525959715
59083	NC_021848	ATCC	2	8	3055545	3055552	25 %	25 %	0 %	50 %	525959715
59084	NC_021848	CAT	2	6	3055627	3055632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959715
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59087	NC_021848	AC	3	6	3055820	3055825	50 %	0 %	0 %	50 %	525959715
59088	NC_021848	ATC	2	6	3055826	3055831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959715
59089	NC_021848	TTG	2	6	3055838	3055843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959715
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59091	NC_021848	TGG	2	6	3055858	3055863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959715
59092	NC_021848	CT	3	6	3055925	3055930	0 %	50 %	0 %	50 %	525959715
59093	NC_021848	CGG	2	6	3055966	3055971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959715
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59099	NC_021848	A	7	7	3056220	3056226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59100	NC_021848	TTAC	2	8	3056265	3056272	25 %	50 %	0 %	25 %	525959716
59101	NC_021848	TCT	2	6	3056372	3056377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959716
59102	NC_021848	GTTT	2	8	3056408	3056415	0 %	75 %	25 %	0 %	525959716
59103	NC_021848	CAA	2	6	3056463	3056468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959716
59104	NC_021848	TTG	2	6	3056479	3056484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959716
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59106	NC_021848	ATG	2	6	3056495	3056500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959716
59107	NC_021848	T	6	6	3056527	3056532	0 %	100 %	0 %	0 %	525959716
59108	NC_021848	AAT	2	6	3056650	3056655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959716
59109	NC_021848	TTTC	2	8	3056690	3056697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59110	NC_021848	GTT	2	6	3056788	3056793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59111	NC_021848	CTT	2	6	3056861	3056866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959717
59112	NC_021848	GAA	2	6	3056893	3056898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959717
59113	NC_021848	GAA	2	6	3056935	3056940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959717
59114	NC_021848	CGT	2	6	3056956	3056961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959717
59115	NC_021848	AGC	2	6	3056966	3056971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959717
59116	NC_021848	CTG	2	6	3056995	3057000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959717
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59118	NC_021848	AG	3	6	3057076	3057081	50 %	0 %	50 %	0 %	525959717
59119	NC_021848	GTC	2	6	3057082	3057087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959717
59120	NC_021848	TG	3	6	3057089	3057094	0 %	50 %	50 %	0 %	525959717
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59215	NC_021848	ATC	2	6	3061847	3061852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959721
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59225	NC_021848	TCG	2	6	3062719	3062724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959722
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59228	NC_021848	TTAGCT	2	12	3062799	3062810	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525959722
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59230	NC_021848	GCG	2	6	3062902	3062907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959722
59231	NC_021848	GCA	2	6	3062917	3062922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959722
59232	NC_021848	GCT	2	6	3062945	3062950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959722
59233	NC_021848	T	6	6	3062954	3062959	0 %	100 %	0 %	0 %	525959722
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59236	NC_021848	GGC	2	6	3062997	3063002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959722
59237	NC_021848	CTGAT	2	10	3063097	3063106	20 %	40 %	20 %	20 %	525959722
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59247	NC_021848	TGA	2	6	3063586	3063591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959722
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59320	NC_021848	T	7	7	3066924	3066930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59341	NC_021848	CAC	2	6	3068220	3068225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960420
59342	NC_021848	CCA	2	6	3068302	3068307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960420
59343	NC_021848	A	6	6	3068458	3068463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59344	NC_021848	A	6	6	3068465	3068470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59345	NC_021848	ACC	2	6	3068548	3068553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960421
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59347	NC_021848	CAT	2	6	3068609	3068614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960421
59348	NC_021848	TCA	2	6	3068632	3068637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960421
59349	NC_021848	ATC	2	6	3068650	3068655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960421
59350	NC_021848	TGC	2	6	3068673	3068678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960421
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59353	NC_021848	CAT	2	6	3068780	3068785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960421
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59400	NC_021848	CTCC	2	8	3071408	3071415	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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