MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58002	NC_021848	CT	3	6	3002407	3002412	0 %	50 %	0 %	50 %	525959670
58003	NC_021848	TTAT	2	8	3002482	3002489	25 %	75 %	0 %	0 %	525959670
58004	NC_021848	AG	3	6	3002541	3002546	50 %	0 %	50 %	0 %	525959670
58005	NC_021848	ATT	2	6	3002574	3002579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959670
58006	NC_021848	CGCTT	2	10	3002762	3002771	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58007	NC_021848	TTG	2	6	3002808	3002813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58008	NC_021848	CAAAC	2	10	3002865	3002874	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
58009	NC_021848	GCA	2	6	3002909	3002914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959671
58010	NC_021848	TATC	2	8	3002927	3002934	25 %	50 %	0 %	25 %	525959671
58011	NC_021848	ATT	2	6	3002955	3002960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959671
58012	NC_021848	CAC	2	6	3003011	3003016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959671
58013	NC_021848	ATC	2	6	3003099	3003104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959671
58014	NC_021848	ATTGCG	2	12	3003219	3003230	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525959671
58015	NC_021848	CTTA	2	8	3003241	3003248	25 %	50 %	0 %	25 %	525959671
58016	NC_021848	GTG	2	6	3003302	3003307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959671
58017	NC_021848	TGG	2	6	3003427	3003432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959671
58018	NC_021848	TTGT	2	8	3003465	3003472	0 %	75 %	25 %	0 %	525959671
58019	NC_021848	AAG	2	6	3003507	3003512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959671
58020	NC_021848	T	6	6	3003605	3003610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58021	NC_021848	CCAA	2	8	3003778	3003785	50 %	0 %	0 %	50 %	525959672
58022	NC_021848	CAG	2	6	3003819	3003824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959672
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58024	NC_021848	GCA	2	6	3003951	3003956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959672
58025	NC_021848	GCA	2	6	3003960	3003965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959672
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58028	NC_021848	T	6	6	3004123	3004128	0 %	100 %	0 %	0 %	525959672
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58032	NC_021848	GCTT	2	8	3004514	3004521	0 %	50 %	25 %	25 %	525959672
58033	NC_021848	GAGT	2	8	3004541	3004548	25 %	25 %	50 %	0 %	525959672
58034	NC_021848	CA	3	6	3004619	3004624	50 %	0 %	0 %	50 %	525959672
58035	NC_021848	CCAA	2	8	3004627	3004634	50 %	0 %	0 %	50 %	525959672
58036	NC_021848	TTTGC	2	10	3004668	3004677	0 %	60 %	20 %	20 %	525959672
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58050	NC_021848	GCAG	2	8	3005397	3005404	25 %	0 %	50 %	25 %	525959673
58051	NC_021848	GT	3	6	3005448	3005453	0 %	50 %	50 %	0 %	525959673
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58060	NC_021848	T	6	6	3005902	3005907	0 %	100 %	0 %	0 %	525959673
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58079	NC_021848	CG	3	6	3007113	3007118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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58116	NC_021848	A	6	6	3008507	3008512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58117	NC_021848	TGG	2	6	3008513	3008518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58118	NC_021848	T	6	6	3008520	3008525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58119	NC_021848	AGC	2	6	3008545	3008550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58120	NC_021848	CAA	2	6	3008586	3008591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959676
58121	NC_021848	TGT	2	6	3008596	3008601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959676
58122	NC_021848	GGT	2	6	3008801	3008806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959676
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58143	NC_021848	TGG	2	6	3009792	3009797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525960414
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58148	NC_021848	TG	3	6	3010056	3010061	0 %	50 %	50 %	0 %	525960414
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58210	NC_021848	T	6	6	3012563	3012568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58211	NC_021848	T	8	8	3012603	3012610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58212	NC_021848	A	6	6	3012612	3012617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58213	NC_021848	AACTC	2	10	3012631	3012640	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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58216	NC_021848	GA	3	6	3012778	3012783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58217	NC_021848	AAGC	2	8	3012797	3012804	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58218	NC_021848	TG	3	6	3012831	3012836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58219	NC_021848	TGA	2	6	3012846	3012851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58220	NC_021848	GGC	2	6	3013024	3013029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58221	NC_021848	GCG	2	6	3013098	3013103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58222	NC_021848	ATG	2	6	3013175	3013180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58223	NC_021848	CGA	2	6	3013273	3013278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58224	NC_021848	GAT	2	6	3013298	3013303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58225	NC_021848	GCA	2	6	3013347	3013352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58226	NC_021848	GT	3	6	3013400	3013405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58227	NC_021848	GAA	2	6	3013406	3013411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58228	NC_021848	GTAGT	2	10	3013450	3013459	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58229	NC_021848	ATT	2	6	3013470	3013475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58230	NC_021848	AGA	2	6	3013489	3013494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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58233	NC_021848	G	6	6	3013662	3013667	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58234	NC_021848	GGC	2	6	3013726	3013731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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58236	NC_021848	TGC	2	6	3014045	3014050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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58238	NC_021848	GGA	2	6	3014171	3014176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58239	NC_021848	GAC	2	6	3014184	3014189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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58242	NC_021848	GGC	2	6	3014251	3014256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58243	NC_021848	CGT	2	6	3014290	3014295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58244	NC_021848	AC	3	6	3014391	3014396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58245	NC_021848	GTAG	2	8	3014432	3014439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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58268	NC_021848	G	6	6	3015457	3015462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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58272	NC_021848	GTAC	2	8	3015571	3015578	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58273	NC_021848	GGA	2	6	3015776	3015781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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58364	NC_021848	ACG	2	6	3020216	3020221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959679
58365	NC_021848	TACG	2	8	3020227	3020234	25 %	25 %	25 %	25 %	525959679
58366	NC_021848	AGT	2	6	3020239	3020244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959679
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58369	NC_021848	ATT	2	6	3020463	3020468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959679
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58371	NC_021848	ACG	2	6	3020500	3020505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959680
58372	NC_021848	TTG	2	6	3020578	3020583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959680
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58374	NC_021848	GTC	2	6	3020626	3020631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959680
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58376	NC_021848	GTG	2	6	3020678	3020683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959680
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58380	NC_021848	AG	3	6	3020840	3020845	50 %	0 %	50 %	0 %	525959680
58381	NC_021848	TCA	2	6	3020847	3020852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959680
58382	NC_021848	TCT	2	6	3020876	3020881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959680
58383	NC_021848	AGT	2	6	3020918	3020923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959680
58384	NC_021848	TGC	2	6	3020951	3020956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959680
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58386	NC_021848	AGTTG	2	10	3021104	3021113	20 %	40 %	40 %	0 %	525959680
58387	NC_021848	TGT	2	6	3021251	3021256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959680
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58392	NC_021848	TTG	2	6	3021516	3021521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959680
58393	NC_021848	CTG	2	6	3021525	3021530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959680
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58395	NC_021848	T	7	7	3021647	3021653	0 %	100 %	0 %	0 %	525959680
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58397	NC_021848	TTGG	2	8	3021720	3021727	0 %	50 %	50 %	0 %	525959681
58398	NC_021848	GCTG	2	8	3021788	3021795	0 %	25 %	50 %	25 %	525959681
58399	NC_021848	TTG	2	6	3021810	3021815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959681
58400	NC_021848	AAT	2	6	3021857	3021862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959681
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58406	NC_021848	TCC	2	6	3022023	3022028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525959681
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58414	NC_021848	GC	3	6	3022576	3022581	0 %	0 %	50 %	50 %	525959682
58415	NC_021848	TCA	2	6	3022593	3022598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959682
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58418	NC_021848	CGT	2	6	3022864	3022869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959682
58419	NC_021848	ATG	2	6	3022929	3022934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959682
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58421	NC_021848	TCA	2	6	3023007	3023012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959682
58422	NC_021848	TGC	2	6	3023014	3023019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959682
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58425	NC_021848	GTTA	3	12	3023425	3023436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58426	NC_021848	AAGG	2	8	3023449	3023456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58427	NC_021848	TAT	2	6	3023511	3023516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58428	NC_021848	CAG	2	6	3023672	3023677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58429	NC_021848	CAT	2	6	3023730	3023735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959683
58430	NC_021848	CAG	2	6	3023758	3023763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959683
58431	NC_021848	ATCG	2	8	3023767	3023774	25 %	25 %	25 %	25 %	525959683
58432	NC_021848	CG	3	6	3023773	3023778	0 %	0 %	50 %	50 %	525959683
58433	NC_021848	TAC	2	6	3023863	3023868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959683
58434	NC_021848	CGA	2	6	3023931	3023936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959683
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58445	NC_021848	GCAGT	2	10	3024266	3024275	20 %	20 %	40 %	20 %	525959683
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58449	NC_021848	CA	4	8	3024532	3024539	50 %	0 %	0 %	50 %	525959683
58450	NC_021848	TAC	2	6	3024607	3024612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959683
58451	NC_021848	CGT	2	6	3024679	3024684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959683
58452	NC_021848	TCGGT	2	10	3024731	3024740	0 %	40 %	40 %	20 %	525959683
58453	NC_021848	CGT	2	6	3024748	3024753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959683
58454	NC_021848	GAT	2	6	3024814	3024819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959683
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58456	NC_021848	CAT	2	6	3024856	3024861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959683
58457	NC_021848	ACATC	2	10	3024923	3024932	40 %	20 %	0 %	40 %	525959683
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58459	NC_021848	CTTT	2	8	3025193	3025200	0 %	75 %	0 %	25 %	525959683
58460	NC_021848	TCA	2	6	3025208	3025213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959683
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58462	NC_021848	GTGA	2	8	3025282	3025289	25 %	25 %	50 %	0 %	525959683
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58464	NC_021848	CGA	2	6	3025325	3025330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959683
58465	NC_021848	TCA	2	6	3025376	3025381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959683
58466	NC_021848	CCA	2	6	3025609	3025614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959683
58467	NC_021848	GTG	2	6	3025652	3025657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959683
58468	NC_021848	CTT	2	6	3025681	3025686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959683
58469	NC_021848	CGC	3	9	3025732	3025740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959683
58470	NC_021848	CGC	2	6	3025789	3025794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959683
58471	NC_021848	GCA	2	6	3025838	3025843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959683
58472	NC_021848	CAA	2	6	3025851	3025856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959683
58473	NC_021848	CGC	2	6	3025868	3025873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959683
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58475	NC_021848	AGATG	2	10	3026043	3026052	40 %	20 %	40 %	0 %	525959683
58476	NC_021848	GAC	2	6	3026089	3026094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959683
58477	NC_021848	TTA	2	6	3026114	3026119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959683
58478	NC_021848	CAT	2	6	3026175	3026180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959683
58479	NC_021848	ATG	2	6	3026192	3026197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959683
58480	NC_021848	CTA	2	6	3026216	3026221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959683
58481	NC_021848	TTTTG	2	10	3026275	3026284	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58482	NC_021848	CAAT	2	8	3026309	3026316	50 %	25 %	0 %	25 %	525959684
58483	NC_021848	ACC	2	6	3026419	3026424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959684
58484	NC_021848	CCAA	2	8	3026436	3026443	50 %	0 %	0 %	50 %	525959684
58485	NC_021848	TGA	3	9	3026469	3026477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959684
58486	NC_021848	ATC	2	6	3026548	3026553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959684
58487	NC_021848	TTC	2	6	3026560	3026565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959684
58488	NC_021848	GAT	2	6	3026566	3026571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959684
58489	NC_021848	CCA	2	6	3026586	3026591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959684
58490	NC_021848	TGA	2	6	3026594	3026599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959684
58491	NC_021848	GTG	2	6	3026644	3026649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58492	NC_021848	AAT	2	6	3026672	3026677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58493	NC_021848	A	6	6	3026694	3026699	100 %	0 %	0 %	0 %	525959685
58494	NC_021848	TGT	2	6	3026710	3026715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959685
58495	NC_021848	CAA	2	6	3026784	3026789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959685
58496	NC_021848	AATA	2	8	3026803	3026810	75 %	25 %	0 %	0 %	525959685
58497	NC_021848	CAG	2	6	3026838	3026843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58498	NC_021848	GAT	2	6	3026890	3026895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959686
58499	NC_021848	CTC	2	6	3026951	3026956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525959686
58500	NC_021848	TG	3	6	3027033	3027038	0 %	50 %	50 %	0 %	525959686

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