MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_021848	AGCA	2	8	2699007	2699014	50 %	0 %	25 %	25 %	525959440
52003	NC_021848	CAG	2	6	2699030	2699035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959440
52004	NC_021848	CTGG	2	8	2699102	2699109	0 %	25 %	50 %	25 %	525959440
52005	NC_021848	GATTG	2	10	2699116	2699125	20 %	40 %	40 %	0 %	525959440
52006	NC_021848	TCA	2	6	2699250	2699255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959440
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52009	NC_021848	TTAC	2	8	2699463	2699470	25 %	50 %	0 %	25 %	525959440
52010	NC_021848	TAA	2	6	2699503	2699508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959441
52011	NC_021848	CAC	2	6	2699510	2699515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959441
52012	NC_021848	AAG	2	6	2699527	2699532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959441
52013	NC_021848	TTG	2	6	2699590	2699595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959441
52014	NC_021848	GAT	2	6	2699598	2699603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959441
52015	NC_021848	GACG	2	8	2699849	2699856	25 %	0 %	50 %	25 %	525959441
52016	NC_021848	CCGCAA	2	12	2699918	2699929	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525959441
52017	NC_021848	CAA	2	6	2699978	2699983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959441
52018	NC_021848	TTG	2	6	2700061	2700066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959441
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52021	NC_021848	T	6	6	2700323	2700328	0 %	100 %	0 %	0 %	525959442
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52031	NC_021848	TCTT	2	8	2700814	2700821	0 %	75 %	0 %	25 %	525959442
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52056	NC_021848	ATG	2	6	2702750	2702755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959444
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52070	NC_021848	CTTT	2	8	2703550	2703557	0 %	75 %	0 %	25 %	525959445
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52087	NC_021848	A	6	6	2704103	2704108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52112	NC_021848	ACTCA	2	10	2705435	2705444	40 %	20 %	0 %	40 %	525959448
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52119	NC_021848	GA	3	6	2705861	2705866	50 %	0 %	50 %	0 %	525959448
52120	NC_021848	TAA	2	6	2705929	2705934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959448
52121	NC_021848	GT	3	6	2705970	2705975	0 %	50 %	50 %	0 %	525959448
52122	NC_021848	TGCG	2	8	2705988	2705995	0 %	25 %	50 %	25 %	525959448
52123	NC_021848	TTG	2	6	2706017	2706022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959448
52124	NC_021848	TCA	2	6	2706030	2706035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959448
52125	NC_021848	TGGT	2	8	2706115	2706122	0 %	50 %	50 %	0 %	525959448
52126	NC_021848	A	6	6	2706141	2706146	100 %	0 %	0 %	0 %	525959448
52127	NC_021848	ATCA	2	8	2706167	2706174	50 %	25 %	0 %	25 %	525959448
52128	NC_021848	TTTC	2	8	2706325	2706332	0 %	75 %	0 %	25 %	525959448
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52130	NC_021848	CAT	3	9	2706395	2706403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959448
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52132	NC_021848	CTGT	2	8	2706443	2706450	0 %	50 %	25 %	25 %	525959448
52133	NC_021848	CTG	2	6	2706480	2706485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959448
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52136	NC_021848	ACC	2	6	2706584	2706589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52137	NC_021848	T	6	6	2706592	2706597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52138	NC_021848	T	6	6	2706648	2706653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52139	NC_021848	GATTT	2	10	2706691	2706700	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52140	NC_021848	GAAA	2	8	2706778	2706785	75 %	0 %	25 %	0 %	525959449
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52159	NC_021848	GCA	2	6	2707740	2707745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959449
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52163	NC_021848	A	6	6	2708134	2708139	100 %	0 %	0 %	0 %	525959450
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52193	NC_021848	AAAAG	2	10	2709674	2709683	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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52211	NC_021848	TCT	2	6	2710404	2710409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52212	NC_021848	A	7	7	2710441	2710447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52220	NC_021848	CA	3	6	2710672	2710677	50 %	0 %	0 %	50 %	525959453
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52225	NC_021848	GAGT	2	8	2710977	2710984	25 %	25 %	50 %	0 %	525959453
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52228	NC_021848	GAG	2	6	2711212	2711217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52229	NC_021848	TTGG	2	8	2711226	2711233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52230	NC_021848	CT	3	6	2711365	2711370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52231	NC_021848	A	6	6	2711382	2711387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52232	NC_021848	GAT	2	6	2711405	2711410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959454
52233	NC_021848	GC	3	6	2711430	2711435	0 %	0 %	50 %	50 %	525959454
52234	NC_021848	AAG	2	6	2711437	2711442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959454
52235	NC_021848	GCA	2	6	2711622	2711627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959454
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52354	NC_021848	T	7	7	2718379	2718385	0 %	100 %	0 %	0 %	525960374
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52359	NC_021848	CT	3	6	2718631	2718636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52360	NC_021848	CTAA	2	8	2718651	2718658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52361	NC_021848	AGC	2	6	2718793	2718798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960375
52362	NC_021848	TAAG	2	8	2718806	2718813	50 %	25 %	25 %	0 %	525960375
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52393	NC_021848	ATG	2	6	2720599	2720604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960376
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52398	NC_021848	TACT	2	8	2720896	2720903	25 %	50 %	0 %	25 %	525960377
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52467	NC_021848	TGA	2	6	2724448	2724453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960381
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52472	NC_021848	TCT	2	6	2724596	2724601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960381
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52477	NC_021848	GGA	2	6	2724800	2724805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525960381
52478	NC_021848	TCC	2	6	2724822	2724827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525960381
52479	NC_021848	ACC	2	6	2724837	2724842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960381
52480	NC_021848	A	6	6	2724843	2724848	100 %	0 %	0 %	0 %	525960381
52481	NC_021848	A	6	6	2724873	2724878	100 %	0 %	0 %	0 %	525960381
52482	NC_021848	AG	3	6	2724965	2724970	50 %	0 %	50 %	0 %	525960381
52483	NC_021848	AG	4	8	2725000	2725007	50 %	0 %	50 %	0 %	525960381
52484	NC_021848	ACAA	2	8	2725029	2725036	75 %	0 %	0 %	25 %	525960381
52485	NC_021848	ACTC	2	8	2725047	2725054	25 %	25 %	0 %	50 %	525960381
52486	NC_021848	TGG	2	6	2725093	2725098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52487	NC_021848	A	6	6	2725101	2725106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52488	NC_021848	AAAT	2	8	2725159	2725166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52489	NC_021848	AAT	2	6	2725190	2725195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52490	NC_021848	TTTAT	2	10	2725243	2725252	20 %	80 %	0 %	0 %	525960382
52491	NC_021848	GTG	2	6	2725294	2725299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525960382
52492	NC_021848	GCC	2	6	2725325	2725330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525960382
52493	NC_021848	CGC	2	6	2725339	2725344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525960382
52494	NC_021848	ACC	2	6	2725358	2725363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960382
52495	NC_021848	CAT	2	6	2725414	2725419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960382
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52497	NC_021848	TCA	2	6	2725458	2725463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960382
52498	NC_021848	CTG	2	6	2725468	2725473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960382
52499	NC_021848	AGAT	2	8	2725493	2725500	50 %	25 %	25 %	0 %	525960382
52500	NC_021848	CAA	2	6	2725539	2725544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960382

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