MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50502	NC_021848	AAT	2	6	2621049	2621054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959376
50503	NC_021848	ACTT	2	8	2621137	2621144	25 %	50 %	0 %	25 %	525959376
50504	NC_021848	TTG	2	6	2621145	2621150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959376
50505	NC_021848	GCT	2	6	2621155	2621160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959376
50506	NC_021848	AGC	2	6	2621171	2621176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959376
50507	NC_021848	TTTG	2	8	2621182	2621189	0 %	75 %	25 %	0 %	525959376
50508	NC_021848	TGC	2	6	2621211	2621216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959376
50509	NC_021848	CGA	2	6	2621229	2621234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959376
50510	NC_021848	CTA	2	6	2621262	2621267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50511	NC_021848	ATT	2	6	2621405	2621410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50512	NC_021848	TAA	2	6	2621455	2621460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50513	NC_021848	AAATT	2	10	2621479	2621488	60 %	40 %	0 %	0 %	525959377
50514	NC_021848	AAGC	2	8	2621506	2621513	50 %	0 %	25 %	25 %	525959377
50515	NC_021848	CAA	2	6	2621645	2621650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959377
50516	NC_021848	AC	3	6	2621666	2621671	50 %	0 %	0 %	50 %	525959377
50517	NC_021848	AGC	2	6	2621681	2621686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959377
50518	NC_021848	AAG	2	6	2621692	2621697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959377
50519	NC_021848	GCA	2	6	2621709	2621714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959377
50520	NC_021848	ATC	2	6	2621793	2621798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959377
50521	NC_021848	GGTTG	2	10	2621940	2621949	0 %	40 %	60 %	0 %	525959377
50522	NC_021848	GCA	2	6	2622051	2622056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959377
50523	NC_021848	CTA	2	6	2622075	2622080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959377
50524	NC_021848	GCG	2	6	2622122	2622127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50525	NC_021848	T	7	7	2622140	2622146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50526	NC_021848	ATA	2	6	2622152	2622157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50527	NC_021848	TCAG	2	8	2622165	2622172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50528	NC_021848	A	7	7	2622180	2622186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50529	NC_021848	ACA	2	6	2622192	2622197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50530	NC_021848	AGC	2	6	2622315	2622320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959378
50531	NC_021848	CTA	2	6	2622384	2622389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959378
50532	NC_021848	GCA	2	6	2622430	2622435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959378
50533	NC_021848	CAA	2	6	2622471	2622476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959378
50534	NC_021848	GAT	2	6	2622605	2622610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959378
50535	NC_021848	ATT	2	6	2622668	2622673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959378
50536	NC_021848	GTAA	2	8	2622703	2622710	50 %	25 %	25 %	0 %	525959378
50537	NC_021848	A	6	6	2622804	2622809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50538	NC_021848	CAG	2	6	2622854	2622859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959379
50539	NC_021848	CTT	2	6	2622860	2622865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959379
50540	NC_021848	CAG	2	6	2622866	2622871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959379
50541	NC_021848	AGC	2	6	2622963	2622968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959379
50542	NC_021848	ACT	2	6	2623003	2623008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959379
50543	NC_021848	GAC	2	6	2623037	2623042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959379
50544	NC_021848	CTTTTG	2	12	2623103	2623114	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525959379
50545	NC_021848	AGT	2	6	2623119	2623124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959379
50546	NC_021848	AG	3	6	2623147	2623152	50 %	0 %	50 %	0 %	525959379
50547	NC_021848	GTTGA	2	10	2623197	2623206	20 %	40 %	40 %	0 %	525959379
50548	NC_021848	AGAC	2	8	2623307	2623314	50 %	0 %	25 %	25 %	525959380
50549	NC_021848	T	6	6	2623352	2623357	0 %	100 %	0 %	0 %	525959380
50550	NC_021848	GGATC	2	10	2623489	2623498	20 %	20 %	40 %	20 %	525959380
50551	NC_021848	CTTC	2	8	2623513	2623520	0 %	50 %	0 %	50 %	525959380
50552	NC_021848	TAG	2	6	2623579	2623584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959380
50553	NC_021848	ACG	2	6	2623589	2623594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959380
50554	NC_021848	GTTT	2	8	2623622	2623629	0 %	75 %	25 %	0 %	525959380
50555	NC_021848	GCT	2	6	2623677	2623682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959380
50556	NC_021848	CTA	2	6	2623726	2623731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959380
50557	NC_021848	TCT	2	6	2623755	2623760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959380
50558	NC_021848	ACCACG	2	12	2623793	2623804	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525959380
50559	NC_021848	TCT	2	6	2624019	2624024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959380
50560	NC_021848	CTT	2	6	2624032	2624037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959380
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50563	NC_021848	GCG	2	6	2624114	2624119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959380
50564	NC_021848	CT	3	6	2624255	2624260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50565	NC_021848	CTTA	2	8	2624272	2624279	25 %	50 %	0 %	25 %	525959381
50566	NC_021848	CGA	2	6	2624290	2624295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959381
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50569	NC_021848	GCT	2	6	2624421	2624426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959381
50570	NC_021848	AAC	2	6	2624465	2624470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959381
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50578	NC_021848	CGA	2	6	2624760	2624765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959381
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50580	NC_021848	CG	3	6	2624813	2624818	0 %	0 %	50 %	50 %	525959381
50581	NC_021848	ACG	2	6	2624852	2624857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959381
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50583	NC_021848	GAC	2	6	2624944	2624949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959382
50584	NC_021848	CAG	2	6	2625109	2625114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959382
50585	NC_021848	ACC	2	6	2625164	2625169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959382
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50587	NC_021848	CTTG	2	8	2625265	2625272	0 %	50 %	25 %	25 %	525959382
50588	NC_021848	GTTG	2	8	2625294	2625301	0 %	50 %	50 %	0 %	525959382
50589	NC_021848	ATT	2	6	2625328	2625333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959383
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50593	NC_021848	AGTT	2	8	2625539	2625546	25 %	50 %	25 %	0 %	525959383
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50597	NC_021848	T	7	7	2625921	2625927	0 %	100 %	0 %	0 %	525959384
50598	NC_021848	CCG	2	6	2625979	2625984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50599	NC_021848	TTC	2	6	2626015	2626020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959385
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50601	NC_021848	TAG	2	6	2626098	2626103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959385
50602	NC_021848	CCG	2	6	2626111	2626116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959385
50603	NC_021848	ACGT	2	8	2626125	2626132	25 %	25 %	25 %	25 %	525959385
50604	NC_021848	CAT	2	6	2626143	2626148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959385
50605	NC_021848	CAGA	2	8	2626161	2626168	50 %	0 %	25 %	25 %	525959385
50606	NC_021848	CTT	2	6	2626275	2626280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959385
50607	NC_021848	CTG	2	6	2626289	2626294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959385
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50611	NC_021848	TACA	2	8	2626365	2626372	50 %	25 %	0 %	25 %	525959385
50612	NC_021848	AACC	2	8	2626411	2626418	50 %	0 %	0 %	50 %	525959385
50613	NC_021848	GCT	2	6	2626425	2626430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959385
50614	NC_021848	GCA	2	6	2626549	2626554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959385
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