MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 64427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021848	AT	3	6	237638	237643	50 %	50 %	0 %	0 %	525957672
4502	NC_021848	ATT	2	6	237664	237669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957672
4503	NC_021848	TC	3	6	237670	237675	0 %	50 %	0 %	50 %	525957672
4504	NC_021848	TGGCGT	2	12	237680	237691	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525957672
4505	NC_021848	GGGC	2	8	237707	237714	0 %	0 %	75 %	25 %	525957672
4506	NC_021848	CAT	2	6	237738	237743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957672
4507	NC_021848	CCT	2	6	237758	237763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525957672
4508	NC_021848	TGG	2	6	237768	237773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957672
4509	NC_021848	ATG	2	6	237841	237846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957672
4510	NC_021848	TGT	2	6	237885	237890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957672
4511	NC_021848	ATG	2	6	237892	237897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957672
4512	NC_021848	CTTG	2	8	237915	237922	0 %	50 %	25 %	25 %	525957672
4513	NC_021848	TTC	2	6	238010	238015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957672
4514	NC_021848	TGC	2	6	238038	238043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957672
4515	NC_021848	GAG	2	6	238052	238057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957672
4516	NC_021848	TCTAA	2	10	238093	238102	40 %	40 %	0 %	20 %	525957672
4517	NC_021848	AAG	2	6	238159	238164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957672
4518	NC_021848	TGG	2	6	238190	238195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957672
4519	NC_021848	TGT	2	6	238226	238231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957672
4520	NC_021848	CCG	2	6	238248	238253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957672
4521	NC_021848	CGA	2	6	238496	238501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957672
4522	NC_021848	GCTC	2	8	238531	238538	0 %	25 %	25 %	50 %	525957672
4523	NC_021848	TGGTG	2	10	238548	238557	0 %	40 %	60 %	0 %	525957672
4524	NC_021848	GTT	2	6	238579	238584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957672
4525	NC_021848	TGG	2	6	238586	238591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957672
4526	NC_021848	TGG	2	6	238593	238598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957672
4527	NC_021848	GC	4	8	238683	238690	0 %	0 %	50 %	50 %	525957672
4528	NC_021848	TTG	2	6	238748	238753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957672
4529	NC_021848	GT	3	6	238778	238783	0 %	50 %	50 %	0 %	525957672
4530	NC_021848	CAT	2	6	238794	238799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957672
4531	NC_021848	ATT	2	6	238801	238806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957672
4532	NC_021848	CGA	2	6	238857	238862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957672
4533	NC_021848	GTT	2	6	238923	238928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957672
4534	NC_021848	TC	3	6	238935	238940	0 %	50 %	0 %	50 %	525957672
4535	NC_021848	GT	3	6	238958	238963	0 %	50 %	50 %	0 %	525957672
4536	NC_021848	AC	3	6	238983	238988	50 %	0 %	0 %	50 %	525957672
4537	NC_021848	TGA	2	6	239009	239014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957672
4538	NC_021848	TTG	2	6	239113	239118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957672
4539	NC_021848	GCT	2	6	239291	239296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_021848	GCG	2	6	239308	239313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_021848	T	7	7	239315	239321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_021848	ATC	2	6	239403	239408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_021848	CGA	2	6	239415	239420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_021848	CTA	2	6	239448	239453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_021848	GCGG	2	8	239560	239567	0 %	0 %	75 %	25 %	525957673
4546	NC_021848	A	6	6	239602	239607	100 %	0 %	0 %	0 %	525957673
4547	NC_021848	CTT	2	6	239623	239628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957673
4548	NC_021848	CAT	2	6	239664	239669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957673
4549	NC_021848	CTT	2	6	239672	239677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957673
4550	NC_021848	TTCAAC	2	12	239776	239787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957673
4551	NC_021848	CAA	2	6	239818	239823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957673
4552	NC_021848	GAA	2	6	239880	239885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957673
4553	NC_021848	GGT	2	6	239932	239937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957673
4554	NC_021848	CGT	2	6	239944	239949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957673
4555	NC_021848	TGA	2	6	239951	239956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957673
4556	NC_021848	CG	3	6	239962	239967	0 %	0 %	50 %	50 %	525957673
4557	NC_021848	CTG	2	6	239986	239991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957673
4558	NC_021848	CGT	2	6	240031	240036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957673
4559	NC_021848	ATCA	2	8	240061	240068	50 %	25 %	0 %	25 %	525957673
4560	NC_021848	GCA	2	6	240069	240074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957673
4561	NC_021848	TAC	2	6	240093	240098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957673
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4563	NC_021848	TTGA	2	8	240160	240167	25 %	50 %	25 %	0 %	525957673
4564	NC_021848	AGA	2	6	240396	240401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957673
4565	NC_021848	AG	3	6	240421	240426	50 %	0 %	50 %	0 %	525957673
4566	NC_021848	G	6	6	240426	240431	0 %	0 %	100 %	0 %	525957673
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4570	NC_021848	GTT	2	6	240720	240725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957674
4571	NC_021848	TCA	2	6	240749	240754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957674
4572	NC_021848	GTG	2	6	240773	240778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957674
4573	NC_021848	TGGT	2	8	240794	240801	0 %	50 %	50 %	0 %	525957674
4574	NC_021848	CGTG	2	8	240812	240819	0 %	25 %	50 %	25 %	525957674
4575	NC_021848	GCT	2	6	240822	240827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957674
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4578	NC_021848	TGG	2	6	240903	240908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957674
4579	NC_021848	TGA	2	6	240939	240944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957674
4580	NC_021848	CGC	2	6	240974	240979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957674
4581	NC_021848	GT	3	6	240995	241000	0 %	50 %	50 %	0 %	525957674
4582	NC_021848	GT	3	6	241139	241144	0 %	50 %	50 %	0 %	525957674
4583	NC_021848	TTG	2	6	241145	241150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957674
4584	NC_021848	AGC	2	6	241231	241236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_021848	GCT	2	6	241244	241249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_021848	TGCA	2	8	241254	241261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4587	NC_021848	CAA	2	6	241262	241267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_021848	TAA	2	6	241320	241325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_021848	CGC	3	9	241351	241359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957675
4590	NC_021848	T	6	6	241360	241365	0 %	100 %	0 %	0 %	525957675
4591	NC_021848	TGGC	2	8	241401	241408	0 %	25 %	50 %	25 %	525957675
4592	NC_021848	GTTGC	2	10	241480	241489	0 %	40 %	40 %	20 %	525957675
4593	NC_021848	A	6	6	241586	241591	100 %	0 %	0 %	0 %	525957675
4594	NC_021848	TTG	2	6	241675	241680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957675
4595	NC_021848	GTG	2	6	241728	241733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957675
4596	NC_021848	TGAT	2	8	241873	241880	25 %	50 %	25 %	0 %	525957675
4597	NC_021848	GCCA	2	8	241959	241966	25 %	0 %	25 %	50 %	525957675
4598	NC_021848	T	6	6	241983	241988	0 %	100 %	0 %	0 %	525957675
4599	NC_021848	CAA	2	6	242038	242043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957675
4600	NC_021848	ATC	2	6	242080	242085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957675
4601	NC_021848	A	6	6	242176	242181	100 %	0 %	0 %	0 %	525957675
4602	NC_021848	A	6	6	242273	242278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_021848	TGC	2	6	242331	242336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957676
4604	NC_021848	CAT	2	6	242342	242347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957676
4605	NC_021848	TCA	2	6	242500	242505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957676
4606	NC_021848	ATG	2	6	242548	242553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957676
4607	NC_021848	ATC	2	6	242562	242567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957676
4608	NC_021848	GCC	2	6	242571	242576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957676
4609	NC_021848	CTG	2	6	242587	242592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957676
4610	NC_021848	AGCA	2	8	242610	242617	50 %	0 %	25 %	25 %	525957676
4611	NC_021848	CAG	2	6	242646	242651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957676
4612	NC_021848	TC	3	6	242684	242689	0 %	50 %	0 %	50 %	525957676
4613	NC_021848	TCA	2	6	242731	242736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957676
4614	NC_021848	GTT	2	6	242759	242764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957676
4615	NC_021848	GTC	2	6	242830	242835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957676
4616	NC_021848	CGA	2	6	242897	242902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957676
4617	NC_021848	GAT	2	6	242931	242936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957676
4618	NC_021848	TCT	2	6	242992	242997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957676
4619	NC_021848	CTG	2	6	243197	243202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957676
4620	NC_021848	CGT	2	6	243253	243258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957677
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4622	NC_021848	ACCGAT	2	12	243422	243433	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525957677
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4848	NC_021848	CTTTA	2	10	255879	255888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4849	NC_021848	TAA	2	6	255896	255901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4850	NC_021848	AGG	2	6	255905	255910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4861	NC_021848	GAAAGC	2	12	256335	256346	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525957683
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4863	NC_021848	GAA	2	6	256420	256425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957683
4864	NC_021848	A	6	6	256424	256429	100 %	0 %	0 %	0 %	525957683
4865	NC_021848	GAT	2	6	256471	256476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957683
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4868	NC_021848	CAAA	2	8	256593	256600	75 %	0 %	0 %	25 %	525957683
4869	NC_021848	TGT	2	6	256647	256652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957683
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4879	NC_021848	TCT	2	6	257026	257031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957683
4880	NC_021848	TGGT	2	8	257096	257103	0 %	50 %	50 %	0 %	525957683
4881	NC_021848	GTG	2	6	257111	257116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957683
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4951	NC_021848	T	7	7	260842	260848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4952	NC_021848	GTT	2	6	260858	260863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4953	NC_021848	ACAT	2	8	260874	260881	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4954	NC_021848	ATA	2	6	260882	260887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4955	NC_021848	A	6	6	260936	260941	100 %	0 %	0 %	0 %	525957685
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4984	NC_021848	TGGTG	2	10	262911	262920	0 %	40 %	60 %	0 %	525957686
4985	NC_021848	TTAC	2	8	262980	262987	25 %	50 %	0 %	25 %	525957686
4986	NC_021848	TTG	2	6	263037	263042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957686
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4988	NC_021848	TGC	2	6	263053	263058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957686
4989	NC_021848	ATC	2	6	263060	263065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957686
4990	NC_021848	TGG	2	6	263304	263309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957686
4991	NC_021848	GTA	2	6	263334	263339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957686
4992	NC_021848	TAAA	2	8	263352	263359	75 %	25 %	0 %	0 %	525957686
4993	NC_021848	CACG	2	8	263385	263392	25 %	0 %	25 %	50 %	525957686
4994	NC_021848	GTG	2	6	263448	263453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957686
4995	NC_021848	TTG	2	6	263468	263473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957686
4996	NC_021848	CT	3	6	263506	263511	0 %	50 %	0 %	50 %	525957686
4997	NC_021848	TA	3	6	263553	263558	50 %	50 %	0 %	0 %	525957686
4998	NC_021848	CTGC	2	8	263594	263601	0 %	25 %	25 %	50 %	525957686
4999	NC_021848	TTG	2	6	263606	263611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957686
5000	NC_021848	TTG	2	6	263616	263621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957686

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