MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 65151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021847	TTC	2	6	80493	80498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_021847	GCC	2	6	80552	80557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949956
1503	NC_021847	A	6	6	80606	80611	100 %	0 %	0 %	0 %	525949956
1504	NC_021847	CGA	2	6	80647	80652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949956
1505	NC_021847	CCA	2	6	80688	80693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949956
1506	NC_021847	TGA	2	6	80775	80780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949956
1507	NC_021847	TGGT	2	8	80797	80804	0 %	50 %	50 %	0 %	525949956
1508	NC_021847	TGA	2	6	80811	80816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949956
1509	NC_021847	A	6	6	80849	80854	100 %	0 %	0 %	0 %	525949956
1510	NC_021847	CGCT	2	8	80887	80894	0 %	25 %	25 %	50 %	525949956
1511	NC_021847	TGG	2	6	80959	80964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949956
1512	NC_021847	ACT	2	6	80979	80984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949956
1513	NC_021847	CCA	2	6	81021	81026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949956
1514	NC_021847	CAC	2	6	81036	81041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949956
1515	NC_021847	GGC	2	6	81049	81054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949956
1516	NC_021847	CT	3	6	81107	81112	0 %	50 %	0 %	50 %	525949956
1517	NC_021847	CAT	2	6	81140	81145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949956
1518	NC_021847	TGA	2	6	81211	81216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949956
1519	NC_021847	ATT	2	6	81258	81263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949956
1520	NC_021847	CAG	2	6	81293	81298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949956
1521	NC_021847	ATC	2	6	81317	81322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949956
1522	NC_021847	GAC	2	6	81332	81337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949956
1523	NC_021847	CGG	2	6	81409	81414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949956
1524	NC_021847	TAC	2	6	81482	81487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949956
1525	NC_021847	TCA	2	6	81551	81556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_021847	CAAAA	2	10	81680	81689	80 %	0 %	0 %	20 %	525949957
1527	NC_021847	CAAAG	2	10	81772	81781	60 %	0 %	20 %	20 %	525949957
1528	NC_021847	GTT	2	6	81828	81833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021847	GCT	2	6	81870	81875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_021847	TGTCA	2	10	81909	81918	20 %	40 %	20 %	20 %	525949958
1531	NC_021847	ACG	2	6	81970	81975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949958
1532	NC_021847	ATG	2	6	82003	82008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949958
1533	NC_021847	AGA	2	6	82149	82154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949958
1534	NC_021847	TGG	2	6	82311	82316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949958
1535	NC_021847	CTT	2	6	82356	82361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949958
1536	NC_021847	CTG	2	6	82645	82650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949958
1537	NC_021847	TGAT	2	8	82655	82662	25 %	50 %	25 %	0 %	525949958
1538	NC_021847	TTG	2	6	82691	82696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949958
1539	NC_021847	GGC	2	6	82702	82707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949958
1540	NC_021847	ACA	2	6	82749	82754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949958
1541	NC_021847	AG	3	6	82917	82922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021847	GCA	2	6	82926	82931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_021847	TAT	2	6	83019	83024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949959
1544	NC_021847	TTTC	2	8	83065	83072	0 %	75 %	0 %	25 %	525949959
1545	NC_021847	TAC	2	6	83143	83148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949959
1546	NC_021847	GAA	2	6	83185	83190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949959
1547	NC_021847	TTCT	2	8	83204	83211	0 %	75 %	0 %	25 %	525949959
1548	NC_021847	GAA	2	6	83254	83259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949959
1549	NC_021847	TTTC	2	8	83315	83322	0 %	75 %	0 %	25 %	525949959
1550	NC_021847	AAG	2	6	83323	83328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949959
1551	NC_021847	TCG	2	6	83388	83393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949959
1552	NC_021847	AAC	2	6	83480	83485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949959
1553	NC_021847	AGA	2	6	83595	83600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949959
1554	NC_021847	GTT	2	6	83635	83640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949959
1555	NC_021847	CCA	2	6	83692	83697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_021847	TGG	2	6	83708	83713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021847	TTTA	2	8	83717	83724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021847	CTG	2	6	83857	83862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949960
1559	NC_021847	CAA	2	6	83869	83874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949960
1560	NC_021847	CTT	2	6	83953	83958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949960
1561	NC_021847	TCG	2	6	83986	83991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949960
1562	NC_021847	AGC	2	6	84003	84008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949960
1563	NC_021847	TCACC	2	10	84025	84034	20 %	20 %	0 %	60 %	525949960
1564	NC_021847	CCTG	2	8	84057	84064	0 %	25 %	25 %	50 %	525949960
1565	NC_021847	GCCA	2	8	84156	84163	25 %	0 %	25 %	50 %	525949960
1566	NC_021847	CT	3	6	84177	84182	0 %	50 %	0 %	50 %	525949960
1567	NC_021847	TCT	2	6	84525	84530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949960
1568	NC_021847	TAAGA	2	10	84648	84657	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021847	AAT	2	6	84694	84699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_021847	GTCA	3	12	84732	84743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_021847	TAC	2	6	84791	84796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_021847	ATG	2	6	84807	84812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021847	CCG	2	6	84945	84950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949961
1574	NC_021847	GTA	2	6	84952	84957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949961
1575	NC_021847	CCA	2	6	84992	84997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949961
1576	NC_021847	CAC	2	6	85008	85013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949961
1577	NC_021847	CAA	2	6	85065	85070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949961
1578	NC_021847	GCA	2	6	85179	85184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949961
1579	NC_021847	TTC	2	6	85198	85203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949961
1580	NC_021847	GAT	2	6	85234	85239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949961
1581	NC_021847	AAAC	2	8	85248	85255	75 %	0 %	0 %	25 %	525949961
1582	NC_021847	GCC	2	6	85256	85261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949961
1583	NC_021847	TTGC	2	8	85311	85318	0 %	50 %	25 %	25 %	525949961
1584	NC_021847	CGC	2	6	85336	85341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949961
1585	NC_021847	TCG	2	6	85410	85415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949961
1586	NC_021847	CCA	2	6	85419	85424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949961
1587	NC_021847	GAGCA	2	10	85432	85441	40 %	0 %	40 %	20 %	525949961
1588	NC_021847	GAC	2	6	85470	85475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949961
1589	NC_021847	TGA	2	6	85503	85508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949961
1590	NC_021847	GAT	2	6	85519	85524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949961
1591	NC_021847	GTT	2	6	85576	85581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949961
1592	NC_021847	GCC	2	6	85582	85587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949961
1593	NC_021847	CTT	2	6	85761	85766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949961
1594	NC_021847	TAGC	2	8	85779	85786	25 %	25 %	25 %	25 %	525949961
1595	NC_021847	TTTC	2	8	86061	86068	0 %	75 %	0 %	25 %	525949961
1596	NC_021847	T	6	6	86085	86090	0 %	100 %	0 %	0 %	525949961
1597	NC_021847	TTTC	2	8	86097	86104	0 %	75 %	0 %	25 %	525949961
1598	NC_021847	T	6	6	86155	86160	0 %	100 %	0 %	0 %	525949961
1599	NC_021847	CGA	2	6	86166	86171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949961
1600	NC_021847	GCA	2	6	86174	86179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949961
1601	NC_021847	GCA	2	6	86186	86191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949961
1602	NC_021847	CCG	2	6	86211	86216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949961
1603	NC_021847	CTT	2	6	86241	86246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949961
1604	NC_021847	GTC	2	6	86340	86345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_021847	CGAA	2	8	86364	86371	50 %	0 %	25 %	25 %	525949962
1606	NC_021847	CTTC	2	8	86377	86384	0 %	50 %	0 %	50 %	525949962
1607	NC_021847	CGT	2	6	86437	86442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949962
1608	NC_021847	TGC	2	6	86453	86458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949962
1609	NC_021847	AAG	2	6	86496	86501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949962
1610	NC_021847	GAAT	2	8	86543	86550	50 %	25 %	25 %	0 %	525949962
1611	NC_021847	AGC	2	6	86646	86651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949962
1612	NC_021847	AGA	2	6	86809	86814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949962
1613	NC_021847	CAT	2	6	86918	86923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949962
1614	NC_021847	GTT	2	6	87017	87022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949962
1615	NC_021847	AGT	2	6	87033	87038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949962
1616	NC_021847	ACG	2	6	87042	87047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949962
1617	NC_021847	GGT	2	6	87140	87145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949962
1618	NC_021847	CCA	2	6	87178	87183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949962
1619	NC_021847	TTC	2	6	87266	87271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949962
1620	NC_021847	CGT	2	6	87328	87333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949962
1621	NC_021847	ACT	2	6	87357	87362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949962
1622	NC_021847	CTCC	2	8	87373	87380	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1623	NC_021847	AAG	2	6	87387	87392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021847	CTT	2	6	87518	87523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949963
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1626	NC_021847	TG	3	6	87535	87540	0 %	50 %	50 %	0 %	525949963
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