MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 65151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021847	GCA	2	6	55654	55659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949930
1002	NC_021847	GCA	2	6	55759	55764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_021847	A	6	6	55787	55792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021847	CAA	2	6	55805	55810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021847	ATT	2	6	55817	55822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021847	TAT	2	6	55846	55851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_021847	TTA	2	6	55896	55901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021847	TA	3	6	55904	55909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021847	CTG	2	6	55918	55923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021847	TTG	2	6	56014	56019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021847	A	6	6	56036	56041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021847	CCA	2	6	56225	56230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949931
1013	NC_021847	TAAA	2	8	56248	56255	75 %	25 %	0 %	0 %	525949931
1014	NC_021847	AAG	2	6	56296	56301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949931
1015	NC_021847	CAAC	2	8	56370	56377	50 %	0 %	0 %	50 %	525949931
1016	NC_021847	TGA	2	6	56396	56401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949931
1017	NC_021847	TTG	2	6	56470	56475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949931
1018	NC_021847	TAC	2	6	56523	56528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949931
1019	NC_021847	ACAA	2	8	56548	56555	75 %	0 %	0 %	25 %	525949931
1020	NC_021847	TCG	2	6	56579	56584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949931
1021	NC_021847	AGA	2	6	56621	56626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949931
1022	NC_021847	GCTTG	2	10	56861	56870	0 %	40 %	40 %	20 %	525949932
1023	NC_021847	ATC	3	9	56896	56904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949932
1024	NC_021847	CATC	2	8	56926	56933	25 %	25 %	0 %	50 %	525949932
1025	NC_021847	CGC	2	6	57028	57033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949932
1026	NC_021847	AGA	2	6	57075	57080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949932
1027	NC_021847	GCC	2	6	57179	57184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949932
1028	NC_021847	TAG	2	6	57214	57219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949932
1029	NC_021847	CATA	2	8	57237	57244	50 %	25 %	0 %	25 %	525949932
1030	NC_021847	CCA	2	6	57257	57262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949932
1031	NC_021847	CAC	2	6	57273	57278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949932
1032	NC_021847	ATC	2	6	57316	57321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949932
1033	NC_021847	TCAA	2	8	57329	57336	50 %	25 %	0 %	25 %	525949932
1034	NC_021847	GTGAG	2	10	57362	57371	20 %	20 %	60 %	0 %	525949932
1035	NC_021847	GCA	2	6	57374	57379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949932
1036	NC_021847	GAGT	2	8	57416	57423	25 %	25 %	50 %	0 %	525949932
1037	NC_021847	TTC	2	6	57514	57519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949932
1038	NC_021847	GCT	2	6	57529	57534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949932
1039	NC_021847	A	6	6	57541	57546	100 %	0 %	0 %	0 %	525949932
1040	NC_021847	TGCG	2	8	57613	57620	0 %	25 %	50 %	25 %	525949932
1041	NC_021847	TAA	2	6	57759	57764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021847	AAC	2	6	57806	57811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_021847	AGGA	2	8	57850	57857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021847	A	6	6	57860	57865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021847	AAT	2	6	57910	57915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949933
1046	NC_021847	GATTG	2	10	57937	57946	20 %	40 %	40 %	0 %	525949933
1047	NC_021847	TGT	2	6	58031	58036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949933
1048	NC_021847	GCA	2	6	58043	58048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949933
1049	NC_021847	CG	3	6	58067	58072	0 %	0 %	50 %	50 %	525949933
1050	NC_021847	GC	3	6	58116	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	525949933
1051	NC_021847	GAA	2	6	58172	58177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949933
1052	NC_021847	AG	3	6	58222	58227	50 %	0 %	50 %	0 %	525949933
1053	NC_021847	CCAGA	2	10	58280	58289	40 %	0 %	20 %	40 %	525949933
1054	NC_021847	TTG	2	6	58368	58373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949933
1055	NC_021847	CTG	2	6	58419	58424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949933
1056	NC_021847	CAC	2	6	58478	58483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949933
1057	NC_021847	GTA	2	6	58590	58595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949933
1058	NC_021847	AATG	2	8	58637	58644	50 %	25 %	25 %	0 %	525949933
1059	NC_021847	TCA	2	6	58714	58719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949933
1060	NC_021847	TCA	3	9	58774	58782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949933
1061	NC_021847	ACC	2	6	58795	58800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949933
1062	NC_021847	TCA	2	6	58819	58824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949933
1063	NC_021847	CGCTAC	2	12	58953	58964	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525949933
1064	NC_021847	GTGC	2	8	59084	59091	0 %	25 %	50 %	25 %	525949933
1065	NC_021847	TTC	2	6	59128	59133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949933
1066	NC_021847	CTT	2	6	59171	59176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949933
1067	NC_021847	AG	3	6	59289	59294	50 %	0 %	50 %	0 %	525949933
1068	NC_021847	TTG	2	6	59344	59349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949933
1069	NC_021847	CAA	2	6	59382	59387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949933
1070	NC_021847	TGA	2	6	59405	59410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949933
1071	NC_021847	AAT	2	6	59702	59707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949933
1072	NC_021847	ATG	2	6	59770	59775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949933
1073	NC_021847	CCT	2	6	59804	59809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525949933
1074	NC_021847	TGT	2	6	59908	59913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949933
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1076	NC_021847	TAA	2	6	60066	60071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525949933
1077	NC_021847	CGG	2	6	60188	60193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949933
1078	NC_021847	ACC	3	9	60196	60204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949933
1079	NC_021847	GTAA	2	8	60248	60255	50 %	25 %	25 %	0 %	525949933
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1082	NC_021847	AGC	2	6	60335	60340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949934
1083	NC_021847	TCT	2	6	60384	60389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949934
1084	NC_021847	AGC	2	6	60408	60413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949934
1085	NC_021847	CTT	2	6	60442	60447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949934
1086	NC_021847	CCA	2	6	60501	60506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949934
1087	NC_021847	AACA	2	8	60542	60549	75 %	0 %	0 %	25 %	525949934
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1089	NC_021847	CTG	2	6	60680	60685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949934
1090	NC_021847	GTAG	2	8	60688	60695	25 %	25 %	50 %	0 %	525949934
1091	NC_021847	TTC	2	6	60716	60721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949934
1092	NC_021847	CCA	2	6	60812	60817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949934
1093	NC_021847	TGCG	2	8	60830	60837	0 %	25 %	50 %	25 %	525949934
1094	NC_021847	CAC	2	6	60854	60859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949934
1095	NC_021847	ACC	2	6	60860	60865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949934
1096	NC_021847	GCA	2	6	61014	61019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949934
1097	NC_021847	CCA	2	6	61179	61184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949934
1098	NC_021847	CAA	2	6	61201	61206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949934
1099	NC_021847	ATC	2	6	61211	61216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949934
1100	NC_021847	CAC	2	6	61271	61276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949934
1101	NC_021847	CT	3	6	61311	61316	0 %	50 %	0 %	50 %	525949934
1102	NC_021847	GTTG	2	8	61391	61398	0 %	50 %	50 %	0 %	525949934
1103	NC_021847	TGG	2	6	61409	61414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949934
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1105	NC_021847	TGA	2	6	61509	61514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021847	ATCT	2	8	61551	61558	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_021847	AAC	2	6	61560	61565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_021847	CTGTT	2	10	61578	61587	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1109	NC_021847	A	6	6	61601	61606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021847	TTA	2	6	61693	61698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021847	A	7	7	61765	61771	100 %	0 %	0 %	0 %	525949935
1112	NC_021847	A	8	8	61782	61789	100 %	0 %	0 %	0 %	525949935
1113	NC_021847	CTGA	2	8	61825	61832	25 %	25 %	25 %	25 %	525949935
1114	NC_021847	TCG	2	6	61842	61847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949935
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1116	NC_021847	ACT	2	6	61884	61889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949935
1117	NC_021847	AGAC	2	8	61953	61960	50 %	0 %	25 %	25 %	525949935
1118	NC_021847	GAA	2	6	62029	62034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949935
1119	NC_021847	A	6	6	62094	62099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021847	GTA	2	6	62233	62238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949936
1121	NC_021847	ATG	2	6	62262	62267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949936
1122	NC_021847	CCG	2	6	62359	62364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949936
1123	NC_021847	GTC	2	6	62375	62380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949936
1124	NC_021847	CAC	2	6	62410	62415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949936
1125	NC_021847	ACA	2	6	62434	62439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949936
1126	NC_021847	GTT	2	6	62441	62446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949936
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1128	NC_021847	TGG	2	6	62588	62593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949936
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1252	NC_021847	T	6	6	68815	68820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_021847	A	6	6	68822	68827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_021847	CTTA	2	8	68851	68858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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