MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 65151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021847	ATG	2	6	559653	559658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950323
11002	NC_021847	TGC	2	6	559731	559736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950323
11003	NC_021847	TCA	2	6	559737	559742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950323
11004	NC_021847	ATG	2	6	559743	559748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950323
11005	NC_021847	TGA	2	6	559761	559766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950323
11006	NC_021847	AGCC	2	8	559878	559885	25 %	0 %	25 %	50 %	525950323
11007	NC_021847	GTT	2	6	559933	559938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950323
11008	NC_021847	AGC	2	6	559944	559949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950323
11009	NC_021847	CGA	2	6	560014	560019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950323
11010	NC_021847	CAT	2	6	560057	560062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950323
11011	NC_021847	CAC	2	6	560099	560104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950323
11012	NC_021847	T	6	6	560153	560158	0 %	100 %	0 %	0 %	525950323
11013	NC_021847	TGC	2	6	560206	560211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950323
11014	NC_021847	GAGC	2	8	560236	560243	25 %	0 %	50 %	25 %	525950323
11015	NC_021847	TTC	2	6	560246	560251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950323
11016	NC_021847	TCA	2	6	560286	560291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950323
11017	NC_021847	GGC	2	6	560313	560318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950323
11018	NC_021847	GCA	2	6	560380	560385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950323
11019	NC_021847	TGCT	2	8	560420	560427	0 %	50 %	25 %	25 %	525950323
11020	NC_021847	ACC	2	6	560561	560566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950323
11021	NC_021847	TTC	2	6	560616	560621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950323
11022	NC_021847	A	6	6	560640	560645	100 %	0 %	0 %	0 %	525950323
11023	NC_021847	CGTAG	2	10	560797	560806	20 %	20 %	40 %	20 %	525950323
11024	NC_021847	AAC	2	6	560817	560822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950323
11025	NC_021847	CAG	2	6	560905	560910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950323
11026	NC_021847	AAG	2	6	561003	561008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_021847	CCA	2	6	561069	561074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950324
11028	NC_021847	GAT	2	6	561087	561092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950324
11029	NC_021847	TCG	2	6	561103	561108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950324
11030	NC_021847	TCT	2	6	561211	561216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950324
11031	NC_021847	TGCC	2	8	561227	561234	0 %	25 %	25 %	50 %	525950324
11032	NC_021847	ATC	2	6	561310	561315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950324
11033	NC_021847	AAT	2	6	561318	561323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950324
11034	NC_021847	T	6	6	561342	561347	0 %	100 %	0 %	0 %	525950324
11035	NC_021847	GAT	2	6	561384	561389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950324
11036	NC_021847	GTT	2	6	561636	561641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950324
11037	NC_021847	GGT	2	6	561710	561715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950324
11038	NC_021847	TAAA	2	8	561734	561741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_021847	A	7	7	561750	561756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_021847	GTGG	2	8	561773	561780	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_021847	TTCT	2	8	561793	561800	0 %	75 %	0 %	25 %	525950325
11042	NC_021847	TGG	2	6	561872	561877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950325
11043	NC_021847	TTC	2	6	561915	561920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950325
11044	NC_021847	TGG	2	6	561988	561993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950325
11045	NC_021847	AAC	2	6	562116	562121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950325
11046	NC_021847	ATG	2	6	562150	562155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950325
11047	NC_021847	CAG	2	6	562177	562182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950325
11048	NC_021847	CAG	2	6	562194	562199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950325
11049	NC_021847	TCT	2	6	562229	562234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950325
11050	NC_021847	TGGAA	2	10	562245	562254	40 %	20 %	40 %	0 %	525950325
11051	NC_021847	ACG	2	6	562290	562295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950325
11052	NC_021847	TGC	2	6	562332	562337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950325
11053	NC_021847	CTT	2	6	562379	562384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950325
11054	NC_021847	GAC	2	6	562418	562423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950325
11055	NC_021847	GGC	2	6	562442	562447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950325
11056	NC_021847	TTC	2	6	562464	562469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950325
11057	NC_021847	TGA	2	6	562568	562573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950325
11058	NC_021847	CTTA	2	8	562602	562609	25 %	50 %	0 %	25 %	525950325
11059	NC_021847	CAA	2	6	562712	562717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950325
11060	NC_021847	TGT	2	6	562807	562812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950325
11061	NC_021847	CAAG	2	8	562817	562824	50 %	0 %	25 %	25 %	525950325
11062	NC_021847	CAA	2	6	563108	563113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950325
11063	NC_021847	ATG	2	6	563137	563142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950325
11064	NC_021847	TTG	2	6	563173	563178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950325
11065	NC_021847	ACG	2	6	563209	563214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950325
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11068	NC_021847	T	6	6	563445	563450	0 %	100 %	0 %	0 %	525950325
11069	NC_021847	TGT	2	6	563480	563485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950325
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11071	NC_021847	TCT	2	6	563659	563664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950325
11072	NC_021847	GCA	2	6	563696	563701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950325
11073	NC_021847	AGC	2	6	563703	563708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950325
11074	NC_021847	GAT	2	6	563769	563774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950325
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11076	NC_021847	GTT	2	6	563926	563931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_021847	TGC	2	6	563966	563971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950326
11078	NC_021847	CTT	2	6	563993	563998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950326
11079	NC_021847	CTT	2	6	564035	564040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950326
11080	NC_021847	CTT	2	6	564053	564058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950326
11081	NC_021847	TCT	2	6	564097	564102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950326
11082	NC_021847	GCG	2	6	564144	564149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950326
11083	NC_021847	ACT	2	6	564276	564281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_021847	TG	3	6	564311	564316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_021847	TC	3	6	564322	564327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11086	NC_021847	TAT	2	6	564333	564338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_021847	GACT	2	8	564383	564390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11088	NC_021847	TAA	2	6	564412	564417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950327
11089	NC_021847	AGC	2	6	564442	564447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950327
11090	NC_021847	CTTC	2	8	564456	564463	0 %	50 %	0 %	50 %	525950327
11091	NC_021847	ATC	2	6	564514	564519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950327
11092	NC_021847	ACG	2	6	564625	564630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950327
11093	NC_021847	CTT	2	6	564846	564851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950327
11094	NC_021847	CGA	2	6	564855	564860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950327
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11097	NC_021847	AG	3	6	565008	565013	50 %	0 %	50 %	0 %	525950327
11098	NC_021847	GATTG	2	10	565044	565053	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_021847	GGC	2	6	565100	565105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_021847	ACG	2	6	565249	565254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525952371
11101	NC_021847	A	6	6	565255	565260	100 %	0 %	0 %	0 %	525952371
11102	NC_021847	GACT	2	8	565289	565296	25 %	25 %	25 %	25 %	525952371
11103	NC_021847	CTG	2	6	565394	565399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950328
11104	NC_021847	TTGC	2	8	565409	565416	0 %	50 %	25 %	25 %	525950328
11105	NC_021847	GTT	2	6	565430	565435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950328
11106	NC_021847	GCA	2	6	565504	565509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950328
11107	NC_021847	T	6	6	565608	565613	0 %	100 %	0 %	0 %	525950328
11108	NC_021847	GAT	2	6	565620	565625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950328
11109	NC_021847	TTG	2	6	565647	565652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950328
11110	NC_021847	TCTA	2	8	565668	565675	25 %	50 %	0 %	25 %	525950328
11111	NC_021847	AAG	2	6	565762	565767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950328
11112	NC_021847	T	6	6	565896	565901	0 %	100 %	0 %	0 %	525950328
11113	NC_021847	CGA	2	6	565976	565981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950328
11114	NC_021847	CTTT	2	8	566027	566034	0 %	75 %	0 %	25 %	525950328
11115	NC_021847	TGT	2	6	566121	566126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950328
11116	NC_021847	TTC	2	6	566178	566183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950328
11117	NC_021847	GCT	2	6	566275	566280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950328
11118	NC_021847	A	6	6	566308	566313	100 %	0 %	0 %	0 %	525950328
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11120	NC_021847	CTG	2	6	566359	566364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950328
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11228	NC_021847	TCAA	2	8	571587	571594	50 %	25 %	0 %	25 %	525952372
11229	NC_021847	AG	5	10	571601	571610	50 %	0 %	50 %	0 %	525952372
11230	NC_021847	CTT	2	6	571639	571644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525952372
11231	NC_021847	TCA	2	6	571725	571730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952372
11232	NC_021847	CTG	2	6	571783	571788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525952372
11233	NC_021847	AGA	2	6	571815	571820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525952372
11234	NC_021847	ACG	2	6	571892	571897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525952372
11235	NC_021847	AGTG	2	8	571921	571928	25 %	25 %	50 %	0 %	525952372
11236	NC_021847	CAC	2	6	572035	572040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525952372
11237	NC_021847	AGA	2	6	572043	572048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525952372
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11239	NC_021847	CTG	2	6	572086	572091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525952372
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11364	NC_021847	TGG	2	6	578429	578434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11365	NC_021847	GCA	2	6	578480	578485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11367	NC_021847	GCTA	2	8	578580	578587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11368	NC_021847	AAG	2	6	578632	578637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11385	NC_021847	T	6	6	579533	579538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11488	NC_021847	TTG	2	6	585345	585350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950341
11489	NC_021847	CTG	2	6	585454	585459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950341
11490	NC_021847	TGC	2	6	585509	585514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950341
11491	NC_021847	CTT	2	6	585694	585699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950341
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11493	NC_021847	ATC	2	6	585726	585731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950341
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11495	NC_021847	AG	3	6	585766	585771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11498	NC_021847	ATT	2	6	585925	585930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11500	NC_021847	ACTC	2	8	586152	586159	25 %	25 %	0 %	50 %	525950342

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