MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 65151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021847	CCA	2	6	310594	310599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950126
6002	NC_021847	CTT	2	6	310663	310668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950126
6003	NC_021847	GTG	2	6	310721	310726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950127
6004	NC_021847	ACG	2	6	310819	310824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950127
6005	NC_021847	ATCA	2	8	310844	310851	50 %	25 %	0 %	25 %	525950127
6006	NC_021847	TGG	2	6	310877	310882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950127
6007	NC_021847	CTT	2	6	310937	310942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950127
6008	NC_021847	TGC	2	6	310985	310990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950127
6009	NC_021847	AAT	2	6	311037	311042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950127
6010	NC_021847	CAG	2	6	311096	311101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950127
6011	NC_021847	CACG	2	8	311197	311204	25 %	0 %	25 %	50 %	525950127
6012	NC_021847	GCA	2	6	311224	311229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950127
6013	NC_021847	AC	3	6	311274	311279	50 %	0 %	0 %	50 %	525950127
6014	NC_021847	CTT	2	6	311296	311301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950127
6015	NC_021847	AGT	2	6	311377	311382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950127
6016	NC_021847	GAC	3	9	311395	311403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950127
6017	NC_021847	GCG	2	6	311492	311497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950127
6018	NC_021847	ACA	2	6	311524	311529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950127
6019	NC_021847	CAG	2	6	311539	311544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950127
6020	NC_021847	GTA	2	6	311579	311584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950127
6021	NC_021847	CAA	2	6	311617	311622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950127
6022	NC_021847	TTG	2	6	311637	311642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950127
6023	NC_021847	TCA	2	6	311685	311690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950127
6024	NC_021847	TCA	2	6	311721	311726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950127
6025	NC_021847	CGC	2	6	311750	311755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950127
6026	NC_021847	GTT	2	6	311765	311770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950127
6027	NC_021847	ATG	2	6	311820	311825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950127
6028	NC_021847	TGC	2	6	312030	312035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950127
6029	NC_021847	GCG	2	6	312051	312056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950127
6030	NC_021847	ATC	2	6	312114	312119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950127
6031	NC_021847	AC	3	6	312220	312225	50 %	0 %	0 %	50 %	525950127
6032	NC_021847	CAG	2	6	312227	312232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950127
6033	NC_021847	TGG	2	6	312247	312252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950127
6034	NC_021847	CA	3	6	312257	312262	50 %	0 %	0 %	50 %	525950127
6035	NC_021847	TCA	2	6	312307	312312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950127
6036	NC_021847	GCG	2	6	312322	312327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950127
6037	NC_021847	CCA	2	6	312387	312392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950127
6038	NC_021847	CCG	2	6	312430	312435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950127
6039	NC_021847	TCC	2	6	312486	312491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525950127
6040	NC_021847	AC	3	6	312493	312498	50 %	0 %	0 %	50 %	525950127
6041	NC_021847	CCA	2	6	312592	312597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_021847	CA	3	6	312599	312604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_021847	CAC	2	6	312668	312673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_021847	AC	3	6	312703	312708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_021847	AGA	2	6	312733	312738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950128
6046	NC_021847	ACA	2	6	312739	312744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950128
6047	NC_021847	GC	4	8	312745	312752	0 %	0 %	50 %	50 %	525950128
6048	NC_021847	CTC	2	6	312834	312839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525950128
6049	NC_021847	TCTT	2	8	312869	312876	0 %	75 %	0 %	25 %	525950128
6050	NC_021847	TTGC	2	8	312878	312885	0 %	50 %	25 %	25 %	525950128
6051	NC_021847	CTT	2	6	312890	312895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950128
6052	NC_021847	ATTG	2	8	312976	312983	25 %	50 %	25 %	0 %	525950128
6053	NC_021847	TTA	2	6	313048	313053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950128
6054	NC_021847	TGC	2	6	313074	313079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950128
6055	NC_021847	GCG	2	6	313146	313151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950128
6056	NC_021847	TGC	2	6	313230	313235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950128
6057	NC_021847	GTTT	2	8	313266	313273	0 %	75 %	25 %	0 %	525950128
6058	NC_021847	TTA	2	6	313289	313294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950128
6059	NC_021847	GCC	3	9	313298	313306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950128
6060	NC_021847	TCT	2	6	313312	313317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950128
6061	NC_021847	GTT	2	6	313375	313380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950128
6062	NC_021847	GTG	2	6	313394	313399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950128
6063	NC_021847	CTTG	2	8	313495	313502	0 %	50 %	25 %	25 %	525950128
6064	NC_021847	CAA	2	6	313600	313605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950128
6065	NC_021847	T	6	6	313643	313648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_021847	ACAAG	2	10	313649	313658	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6067	NC_021847	T	7	7	313700	313706	0 %	100 %	0 %	0 %	525950129
6068	NC_021847	TAC	2	6	313729	313734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950129
6069	NC_021847	CGAC	2	8	313736	313743	25 %	0 %	25 %	50 %	525950129
6070	NC_021847	TCA	2	6	313866	313871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950129
6071	NC_021847	TTA	2	6	313895	313900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950129
6072	NC_021847	GCC	2	6	313902	313907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950129
6073	NC_021847	ACG	2	6	313919	313924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950129
6074	NC_021847	T	6	6	313961	313966	0 %	100 %	0 %	0 %	525950129
6075	NC_021847	ACTT	2	8	313979	313986	25 %	50 %	0 %	25 %	525950129
6076	NC_021847	ATC	2	6	314041	314046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950129
6077	NC_021847	GGCAA	2	10	314178	314187	40 %	0 %	40 %	20 %	525950129
6078	NC_021847	TC	3	6	314212	314217	0 %	50 %	0 %	50 %	525950129
6079	NC_021847	GCT	2	6	314388	314393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950129
6080	NC_021847	TC	3	6	314486	314491	0 %	50 %	0 %	50 %	525950129
6081	NC_021847	TC	3	6	314501	314506	0 %	50 %	0 %	50 %	525950129
6082	NC_021847	AGC	2	6	314510	314515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950129
6083	NC_021847	T	6	6	314537	314542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_021847	CAA	2	6	314557	314562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_021847	ATGA	2	8	314603	314610	50 %	25 %	25 %	0 %	525950130
6086	NC_021847	CTG	2	6	314621	314626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950130
6087	NC_021847	GCCCAG	2	12	314661	314672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525950130
6088	NC_021847	GTG	2	6	314684	314689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950130
6089	NC_021847	TGC	2	6	314757	314762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950130
6090	NC_021847	GTT	2	6	314767	314772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950130
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6092	NC_021847	A	6	6	314900	314905	100 %	0 %	0 %	0 %	525950130
6093	NC_021847	CAA	2	6	314918	314923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950130
6094	NC_021847	AAAC	2	8	314928	314935	75 %	0 %	0 %	25 %	525950130
6095	NC_021847	CAA	2	6	314950	314955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950130
6096	NC_021847	CAAC	2	8	314982	314989	50 %	0 %	0 %	50 %	525950130
6097	NC_021847	TCA	2	6	315018	315023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950130
6098	NC_021847	GTTA	2	8	315079	315086	25 %	50 %	25 %	0 %	525950130
6099	NC_021847	TGGTT	2	10	315105	315114	0 %	60 %	40 %	0 %	525950130
6100	NC_021847	CAACG	2	10	315138	315147	40 %	0 %	20 %	40 %	525950130
6101	NC_021847	ACA	2	6	315163	315168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950130
6102	NC_021847	TGTGG	2	10	315194	315203	0 %	40 %	60 %	0 %	525950130
6103	NC_021847	GGC	2	6	315218	315223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950130
6104	NC_021847	CT	3	6	315263	315268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_021847	TTA	2	6	315296	315301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_021847	CGA	2	6	315313	315318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_021847	TCT	2	6	315319	315324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_021847	TCA	2	6	315368	315373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950131
6109	NC_021847	AAC	2	6	315500	315505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950131
6110	NC_021847	CAG	2	6	315533	315538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950131
6111	NC_021847	GGC	2	6	315583	315588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950131
6112	NC_021847	TGG	2	6	315605	315610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950131
6113	NC_021847	GCTTG	2	10	315624	315633	0 %	40 %	40 %	20 %	525950131
6114	NC_021847	TGG	2	6	315657	315662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950131
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6117	NC_021847	ATG	2	6	315713	315718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950131
6118	NC_021847	CGC	2	6	315738	315743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950131
6119	NC_021847	GAC	2	6	315763	315768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950131
6120	NC_021847	ATG	2	6	315791	315796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950131
6121	NC_021847	TGT	2	6	315842	315847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950131
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6123	NC_021847	TGGAA	2	10	315875	315884	40 %	20 %	40 %	0 %	525950131
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6247	NC_021847	GGTCA	2	10	321896	321905	20 %	20 %	40 %	20 %	525950135
6248	NC_021847	ACA	2	6	322165	322170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950135
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6250	NC_021847	AGG	2	6	322357	322362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525950135
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6259	NC_021847	CTGTC	2	10	322684	322693	0 %	40 %	20 %	40 %	525950136
6260	NC_021847	ACT	2	6	322700	322705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950136
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6267	NC_021847	GCGT	2	8	323244	323251	0 %	25 %	50 %	25 %	525950138
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6275	NC_021847	ACCA	2	8	323577	323584	50 %	0 %	0 %	50 %	525950138
6276	NC_021847	TG	4	8	323594	323601	0 %	50 %	50 %	0 %	525950138
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6279	NC_021847	TCA	2	6	323708	323713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950138
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6291	NC_021847	ATC	2	6	324463	324468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6294	NC_021847	ATT	2	6	324505	324510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6295	NC_021847	GCTC	2	8	324543	324550	0 %	25 %	25 %	50 %	525950139
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6312	NC_021847	TGT	2	6	325551	325556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6313	NC_021847	CAACA	2	10	325723	325732	60 %	0 %	0 %	40 %	525950140
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6343	NC_021847	TCT	2	6	327708	327713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950141
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6352	NC_021847	AG	3	6	328529	328534	50 %	0 %	50 %	0 %	525950141
6353	NC_021847	CAG	3	9	328624	328632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950141
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6359	NC_021847	TCGGG	2	10	329248	329257	0 %	20 %	60 %	20 %	525950142
6360	NC_021847	GCA	2	6	329310	329315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950142
6361	NC_021847	TCG	2	6	329437	329442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950142
6362	NC_021847	AG	3	6	329585	329590	50 %	0 %	50 %	0 %	525950143
6363	NC_021847	CAC	2	6	329638	329643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950143
6364	NC_021847	ATT	2	6	329647	329652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950143
6365	NC_021847	CT	3	6	329769	329774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6366	NC_021847	TGC	2	6	329804	329809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6367	NC_021847	ATT	2	6	329864	329869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950144
6368	NC_021847	CAC	2	6	329872	329877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950144
6369	NC_021847	AGC	2	6	329996	330001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950144
6370	NC_021847	CAC	2	6	330029	330034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950144
6371	NC_021847	TGC	2	6	330072	330077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950144
6372	NC_021847	TCA	2	6	330081	330086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950144
6373	NC_021847	AGC	2	6	330106	330111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950144
6374	NC_021847	AGT	2	6	330133	330138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950144
6375	NC_021847	CCAA	2	8	330161	330168	50 %	0 %	0 %	50 %	525950144
6376	NC_021847	GCC	2	6	330174	330179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950144
6377	NC_021847	TTGA	2	8	330212	330219	25 %	50 %	25 %	0 %	525950144
6378	NC_021847	ATTGA	2	10	330333	330342	40 %	40 %	20 %	0 %	525950144
6379	NC_021847	GCT	2	6	330352	330357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950144
6380	NC_021847	GATA	2	8	330400	330407	50 %	25 %	25 %	0 %	525950144
6381	NC_021847	TGC	2	6	330424	330429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950144
6382	NC_021847	TCA	3	9	330441	330449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950144
6383	NC_021847	CAG	2	6	330472	330477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950144
6384	NC_021847	TGC	2	6	330494	330499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950144
6385	NC_021847	ACCCA	2	10	330503	330512	40 %	0 %	0 %	60 %	525950144
6386	NC_021847	GAAT	2	8	330601	330608	50 %	25 %	25 %	0 %	525950144
6387	NC_021847	TCC	2	6	330631	330636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525950145
6388	NC_021847	TCA	2	6	330662	330667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950145
6389	NC_021847	ACC	2	6	330724	330729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950145
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6392	NC_021847	GTG	2	6	330898	330903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950145
6393	NC_021847	GCA	2	6	330956	330961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950145
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6396	NC_021847	TAA	2	6	331100	331105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950145
6397	NC_021847	GAC	2	6	331124	331129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950145
6398	NC_021847	CG	3	6	331140	331145	0 %	0 %	50 %	50 %	525950145
6399	NC_021847	CTG	2	6	331152	331157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950145
6400	NC_021847	CAA	2	6	331218	331223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950145
6401	NC_021847	CGT	2	6	331241	331246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950145
6402	NC_021847	TGA	2	6	331311	331316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950145
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6404	NC_021847	CTG	2	6	331392	331397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950145
6405	NC_021847	TAA	2	6	331415	331420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950145
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6407	NC_021847	AGCA	2	8	331488	331495	50 %	0 %	25 %	25 %	525950145
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6409	NC_021847	TCA	2	6	331576	331581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950145
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6426	NC_021847	ATC	2	6	332448	332453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950146
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6433	NC_021847	CTGCT	2	10	332927	332936	0 %	40 %	20 %	40 %	525950146
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6450	NC_021847	CTTG	2	8	333900	333907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6451	NC_021847	TAC	2	6	334013	334018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6453	NC_021847	TA	3	6	334161	334166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6454	NC_021847	GCTA	2	8	334217	334224	25 %	25 %	25 %	25 %	525950147
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6469	NC_021847	GAA	2	6	334816	334821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6470	NC_021847	ACT	2	6	334907	334912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952345
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6474	NC_021847	CT	3	6	335050	335055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6475	NC_021847	GAC	2	6	335122	335127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6476	NC_021847	TCTA	2	8	335190	335197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6477	NC_021847	C	7	7	335237	335243	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6478	NC_021847	ACA	2	6	335342	335347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6479	NC_021847	ACA	2	6	335355	335360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6480	NC_021847	A	6	6	335373	335378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6481	NC_021847	A	6	6	335449	335454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6482	NC_021847	TAA	2	6	335486	335491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6483	NC_021847	CAT	2	6	335495	335500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6484	NC_021847	GGA	2	6	335534	335539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6485	NC_021847	ATGG	2	8	335562	335569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6486	NC_021847	AGA	2	6	335585	335590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6487	NC_021847	TCA	2	6	335619	335624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6488	NC_021847	TTC	2	6	335638	335643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6489	NC_021847	GTTG	2	8	335673	335680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6490	NC_021847	CCAA	2	8	335697	335704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6491	NC_021847	CAT	2	6	335725	335730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6492	NC_021847	GATG	2	8	335802	335809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6493	NC_021847	AATT	2	8	335823	335830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6494	NC_021847	CGAC	2	8	335869	335876	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6495	NC_021847	ATTCTC	2	12	335903	335914	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6496	NC_021847	A	6	6	335929	335934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_021847	CTT	2	6	335956	335961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6498	NC_021847	GA	3	6	335972	335977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6499	NC_021847	TC	3	6	336051	336056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6500	NC_021847	TCA	3	9	336066	336074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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