MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 65151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021847	GT	3	6	285098	285103	0 %	50 %	50 %	0 %	525950110
5502	NC_021847	CCA	2	6	285183	285188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950110
5503	NC_021847	CTG	2	6	285249	285254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950110
5504	NC_021847	CTT	2	6	285276	285281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950110
5505	NC_021847	GC	3	6	285291	285296	0 %	0 %	50 %	50 %	525950110
5506	NC_021847	AAG	2	6	285308	285313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950110
5507	NC_021847	CCAA	2	8	285335	285342	50 %	0 %	0 %	50 %	525950110
5508	NC_021847	TCAT	2	8	285425	285432	25 %	50 %	0 %	25 %	525950110
5509	NC_021847	CGC	2	6	285433	285438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950110
5510	NC_021847	ATG	2	6	285443	285448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950110
5511	NC_021847	GT	3	6	285467	285472	0 %	50 %	50 %	0 %	525950110
5512	NC_021847	TGC	2	6	285511	285516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950110
5513	NC_021847	TGA	2	6	285554	285559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950110
5514	NC_021847	CAA	2	6	285574	285579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950110
5515	NC_021847	TCA	2	6	285614	285619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950110
5516	NC_021847	ACC	3	9	285637	285645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950110
5517	NC_021847	TCA	2	6	285686	285691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950110
5518	NC_021847	TAGG	2	8	285786	285793	25 %	25 %	50 %	0 %	525950110
5519	NC_021847	GC	3	6	285819	285824	0 %	0 %	50 %	50 %	525950110
5520	NC_021847	TGT	2	6	285846	285851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950110
5521	NC_021847	CGCC	2	8	285939	285946	0 %	0 %	25 %	75 %	525950110
5522	NC_021847	GC	3	6	286013	286018	0 %	0 %	50 %	50 %	525950110
5523	NC_021847	CTG	2	6	286026	286031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950110
5524	NC_021847	TTC	2	6	286061	286066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950110
5525	NC_021847	CCGC	2	8	286073	286080	0 %	0 %	25 %	75 %	525950110
5526	NC_021847	CAC	2	6	286101	286106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950110
5527	NC_021847	CA	3	6	286187	286192	50 %	0 %	0 %	50 %	525950110
5528	NC_021847	CAT	2	6	286329	286334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950110
5529	NC_021847	CTG	2	6	286382	286387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_021847	TTA	2	6	286414	286419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950111
5531	NC_021847	TGT	2	6	286436	286441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950111
5532	NC_021847	ACA	2	6	286509	286514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950111
5533	NC_021847	T	6	6	286525	286530	0 %	100 %	0 %	0 %	525950111
5534	NC_021847	ATT	2	6	286547	286552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_021847	CAC	2	6	286575	286580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5536	NC_021847	TCA	2	6	286625	286630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950112
5537	NC_021847	TGG	2	6	286633	286638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950112
5538	NC_021847	ATC	2	6	286653	286658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950112
5539	NC_021847	GAA	2	6	286659	286664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950112
5540	NC_021847	GAT	2	6	286671	286676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950112
5541	NC_021847	ATC	3	9	286746	286754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950112
5542	NC_021847	TTGG	2	8	286781	286788	0 %	50 %	50 %	0 %	525950112
5543	NC_021847	GGT	2	6	286800	286805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950112
5544	NC_021847	GATT	2	8	286907	286914	25 %	50 %	25 %	0 %	525950112
5545	NC_021847	CAAAA	2	10	286940	286949	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5546	NC_021847	TAG	2	6	287008	287013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950113
5547	NC_021847	CGGTG	2	10	287016	287025	0 %	20 %	60 %	20 %	525950113
5548	NC_021847	CAT	2	6	287032	287037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950113
5549	NC_021847	ATG	2	6	287049	287054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950113
5550	NC_021847	ATGA	2	8	287075	287082	50 %	25 %	25 %	0 %	525950113
5551	NC_021847	TAA	2	6	287110	287115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950113
5552	NC_021847	GTC	2	6	287135	287140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5553	NC_021847	ATC	2	6	287175	287180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950113
5554	NC_021847	AGA	2	6	287272	287277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950113
5555	NC_021847	GCG	2	6	287356	287361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950113
5556	NC_021847	TGC	2	6	287386	287391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5557	NC_021847	AC	3	6	287428	287433	50 %	0 %	0 %	50 %	525950113
5558	NC_021847	GCG	3	9	287489	287497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950113
5559	NC_021847	AAG	2	6	287543	287548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950113
5560	NC_021847	CAC	2	6	287572	287577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950113
5561	NC_021847	TTC	2	6	287583	287588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950113
5562	NC_021847	TGG	2	6	287615	287620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950113
5563	NC_021847	TGA	2	6	287848	287853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950113
5564	NC_021847	TCG	2	6	287899	287904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5565	NC_021847	GAC	2	6	287905	287910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5566	NC_021847	TCAC	2	8	287940	287947	25 %	25 %	0 %	50 %	525950113
5567	NC_021847	CAC	2	6	287987	287992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950113
5568	NC_021847	TGA	2	6	288016	288021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950113
5569	NC_021847	AAAG	2	8	288029	288036	75 %	0 %	25 %	0 %	525950113
5570	NC_021847	CTT	2	6	288151	288156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950113
5571	NC_021847	GATGT	2	10	288297	288306	20 %	40 %	40 %	0 %	525950113
5572	NC_021847	ATG	2	6	288368	288373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950113
5573	NC_021847	ACG	2	6	288476	288481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5574	NC_021847	ACCGA	2	10	288489	288498	40 %	0 %	20 %	40 %	525950113
5575	NC_021847	ACG	2	6	288545	288550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5576	NC_021847	AGT	2	6	288616	288621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950113
5577	NC_021847	TG	4	8	288690	288697	0 %	50 %	50 %	0 %	525950113
5578	NC_021847	TTC	2	6	288800	288805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950113
5579	NC_021847	TCG	2	6	288888	288893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5580	NC_021847	TGG	2	6	288911	288916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950113
5581	NC_021847	CGCAC	2	10	288951	288960	20 %	0 %	20 %	60 %	525950113
5582	NC_021847	TCA	2	6	288972	288977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950113
5583	NC_021847	AGCAAA	2	12	288978	288989	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525950113
5584	NC_021847	TGC	2	6	288990	288995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5585	NC_021847	CATC	2	8	289054	289061	25 %	25 %	0 %	50 %	525950113
5586	NC_021847	AAG	3	9	289062	289070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950113
5587	NC_021847	TTG	2	6	289119	289124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950113
5588	NC_021847	TCG	2	6	289140	289145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5589	NC_021847	ATAC	2	8	289164	289171	50 %	25 %	0 %	25 %	525950113
5590	NC_021847	TAC	2	6	289216	289221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950113
5591	NC_021847	TA	3	6	289228	289233	50 %	50 %	0 %	0 %	525950113
5592	NC_021847	GTC	2	6	289292	289297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5593	NC_021847	CGT	2	6	289357	289362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5594	NC_021847	GC	3	6	289450	289455	0 %	0 %	50 %	50 %	525950113
5595	NC_021847	GCT	2	6	289465	289470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
5596	NC_021847	ATG	2	6	289494	289499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950113
5597	NC_021847	CTG	2	6	289552	289557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_021847	CTAA	2	8	289706	289713	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5599	NC_021847	TCCT	2	8	289772	289779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_021847	TAAC	3	12	289793	289804	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5601	NC_021847	TGG	2	6	290037	290042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950114
5602	NC_021847	TGA	2	6	290217	290222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950114
5603	NC_021847	GTC	2	6	290239	290244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950114
5604	NC_021847	CAT	2	6	290295	290300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950114
5605	NC_021847	ACG	2	6	290360	290365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950114
5606	NC_021847	GAC	2	6	290491	290496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950114
5607	NC_021847	CCG	2	6	290540	290545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950114
5608	NC_021847	TGT	2	6	290552	290557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950114
5609	NC_021847	TGA	2	6	290631	290636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950114
5610	NC_021847	CG	3	6	290647	290652	0 %	0 %	50 %	50 %	525950114
5611	NC_021847	TCG	2	6	290654	290659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950114
5612	NC_021847	GC	3	6	290845	290850	0 %	0 %	50 %	50 %	525950115
5613	NC_021847	CT	3	6	290855	290860	0 %	50 %	0 %	50 %	525950115
5614	NC_021847	CAC	2	6	290886	290891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950115
5615	NC_021847	TTG	2	6	290908	290913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950115
5616	NC_021847	CAT	2	6	291025	291030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950115
5617	NC_021847	A	6	6	291064	291069	100 %	0 %	0 %	0 %	525950115
5618	NC_021847	CAG	3	9	291171	291179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950115
5619	NC_021847	GGA	2	6	291201	291206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525950115
5620	NC_021847	AG	3	6	291271	291276	50 %	0 %	50 %	0 %	525950115
5621	NC_021847	TCG	2	6	291340	291345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950115
5622	NC_021847	GTG	2	6	291352	291357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950115
5623	NC_021847	AAC	2	6	291358	291363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950115
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5628	NC_021847	GCT	2	6	291519	291524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950115
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5878	NC_021847	TTAA	2	8	304010	304017	50 %	50 %	0 %	0 %	525950120
5879	NC_021847	ATG	2	6	304148	304153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950120
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5883	NC_021847	CTG	2	6	304444	304449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5920	NC_021847	TAAT	2	8	305895	305902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5921	NC_021847	AAAAC	2	10	305922	305931	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5973	NC_021847	CTTA	2	8	308889	308896	25 %	50 %	0 %	25 %	525950124
5974	NC_021847	GC	3	6	308957	308962	0 %	0 %	50 %	50 %	525950124
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5981	NC_021847	A	6	6	309385	309390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5982	NC_021847	CGC	2	6	309441	309446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950125
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5995	NC_021847	CAA	2	6	310182	310187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5996	NC_021847	AAGCG	2	10	310224	310233	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5997	NC_021847	AAT	2	6	310416	310421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950126
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