MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 65151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021847	TTCAA	2	10	260690	260699	40 %	40 %	0 %	20 %	525952339
5002	NC_021847	CGTG	2	8	260739	260746	0 %	25 %	50 %	25 %	525952339
5003	NC_021847	TTC	2	6	260779	260784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525952339
5004	NC_021847	AC	3	6	260796	260801	50 %	0 %	0 %	50 %	525952339
5005	NC_021847	TAA	2	6	260848	260853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525952339
5006	NC_021847	GTT	3	9	260892	260900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525952339
5007	NC_021847	CAC	2	6	260901	260906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525952339
5008	NC_021847	AAC	2	6	260925	260930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952339
5009	NC_021847	CGC	2	6	260962	260967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525952339
5010	NC_021847	AC	3	6	261036	261041	50 %	0 %	0 %	50 %	525952339
5011	NC_021847	GGT	2	6	261060	261065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525952339
5012	NC_021847	GCG	2	6	261088	261093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525952339
5013	NC_021847	TCGG	2	8	261158	261165	0 %	25 %	50 %	25 %	525952339
5014	NC_021847	CAA	2	6	261190	261195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952339
5015	NC_021847	ACC	2	6	261283	261288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525952339
5016	NC_021847	TTG	2	6	261307	261312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525952339
5017	NC_021847	CGC	2	6	261475	261480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950084
5018	NC_021847	ATC	2	6	261614	261619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950084
5019	NC_021847	TCA	2	6	261628	261633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950084
5020	NC_021847	TTTGT	2	10	261671	261680	0 %	80 %	20 %	0 %	525950084
5021	NC_021847	GAC	2	6	261682	261687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950084
5022	NC_021847	CCG	2	6	261688	261693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950084
5023	NC_021847	TGC	2	6	261777	261782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950084
5024	NC_021847	GCT	2	6	261823	261828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950084
5025	NC_021847	TGG	3	9	261913	261921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950084
5026	NC_021847	ACCA	2	8	261941	261948	50 %	0 %	0 %	50 %	525950084
5027	NC_021847	TAGA	2	8	262003	262010	50 %	25 %	25 %	0 %	525950084
5028	NC_021847	TCT	2	6	262023	262028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950084
5029	NC_021847	CAG	2	6	262031	262036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950084
5030	NC_021847	CAC	2	6	262066	262071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950084
5031	NC_021847	GTT	2	6	262091	262096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950084
5032	NC_021847	GAT	2	6	262097	262102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950084
5033	NC_021847	TGG	2	6	262108	262113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950084
5034	NC_021847	GTC	2	6	262166	262171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950084
5035	NC_021847	T	7	7	262177	262183	0 %	100 %	0 %	0 %	525950084
5036	NC_021847	GCGA	2	8	262250	262257	25 %	0 %	50 %	25 %	525950084
5037	NC_021847	CTTCTG	9	54	262318	262371	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525950084
5038	NC_021847	TTG	2	6	262418	262423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950084
5039	NC_021847	TGC	2	6	262449	262454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950084
5040	NC_021847	CTT	2	6	262477	262482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950084
5041	NC_021847	TTC	2	6	262493	262498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950084
5042	NC_021847	TTTTGG	2	12	262502	262513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950084
5043	NC_021847	TTC	2	6	262520	262525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950084
5044	NC_021847	CTT	2	6	262559	262564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950084
5045	NC_021847	T	7	7	262563	262569	0 %	100 %	0 %	0 %	525950084
5046	NC_021847	T	6	6	262618	262623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_021847	ATT	2	6	262630	262635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_021847	A	6	6	262644	262649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_021847	TTA	2	6	262697	262702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_021847	TTA	2	6	262779	262784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_021847	A	6	6	262791	262796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_021847	A	7	7	262831	262837	100 %	0 %	0 %	0 %	525950085
5053	NC_021847	CAA	2	6	262840	262845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950085
5054	NC_021847	ATT	2	6	262860	262865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950085
5055	NC_021847	GAAA	2	8	262937	262944	75 %	0 %	25 %	0 %	525950085
5056	NC_021847	GCAA	2	8	262976	262983	50 %	0 %	25 %	25 %	525950085
5057	NC_021847	ATTT	2	8	262993	263000	25 %	75 %	0 %	0 %	525950085
5058	NC_021847	TGG	2	6	263009	263014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950085
5059	NC_021847	CAG	2	6	263085	263090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950085
5060	NC_021847	A	7	7	263095	263101	100 %	0 %	0 %	0 %	525950085
5061	NC_021847	CGTCG	2	10	263102	263111	0 %	20 %	40 %	40 %	525950085
5062	NC_021847	GTG	2	6	263133	263138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950085
5063	NC_021847	AAC	2	6	263164	263169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950085
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5065	NC_021847	ATT	2	6	263219	263224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950085
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5068	NC_021847	ACT	2	6	263433	263438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950086
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5071	NC_021847	TGC	2	6	263514	263519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950086
5072	NC_021847	CAT	2	6	263532	263537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950086
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5074	NC_021847	TCA	2	6	263552	263557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950086
5075	NC_021847	TCG	2	6	263670	263675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950086
5076	NC_021847	ATG	2	6	263683	263688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950086
5077	NC_021847	TGT	2	6	263732	263737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_021847	ATC	2	6	263791	263796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950087
5079	NC_021847	AAG	2	6	263884	263889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950087
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5082	NC_021847	CGC	2	6	264033	264038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950087
5083	NC_021847	ATC	2	6	264070	264075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950087
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5088	NC_021847	GAACAA	2	12	264165	264176	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525950087
5089	NC_021847	ACG	3	9	264222	264230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950087
5090	NC_021847	ACA	2	6	264257	264262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950087
5091	NC_021847	AGAA	2	8	264315	264322	75 %	0 %	25 %	0 %	525950087
5092	NC_021847	CGA	2	6	264340	264345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_021847	A	7	7	264345	264351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_021847	AAC	2	6	264431	264436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_021847	CGC	2	6	264443	264448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_021847	GAC	2	6	264476	264481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950088
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5100	NC_021847	GTA	2	6	264631	264636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950088
5101	NC_021847	TCG	2	6	264715	264720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_021847	CAA	2	6	264757	264762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950089
5103	NC_021847	CG	3	6	264806	264811	0 %	0 %	50 %	50 %	525950089
5104	NC_021847	AGCG	2	8	264845	264852	25 %	0 %	50 %	25 %	525950089
5105	NC_021847	ATG	2	6	264864	264869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950089
5106	NC_021847	AAG	2	6	265004	265009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950089
5107	NC_021847	GGC	2	6	265028	265033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950089
5108	NC_021847	CAA	2	6	265037	265042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950089
5109	NC_021847	CAA	2	6	265046	265051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950089
5110	NC_021847	CCA	2	6	265052	265057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950089
5111	NC_021847	GCA	2	6	265122	265127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950089
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5113	NC_021847	ACC	2	6	265190	265195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950089
5114	NC_021847	AAG	3	9	265247	265255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950089
5115	NC_021847	GCTT	2	8	265299	265306	0 %	50 %	25 %	25 %	525950089
5116	NC_021847	ATAC	2	8	265322	265329	50 %	25 %	0 %	25 %	525950089
5117	NC_021847	GCCA	2	8	265344	265351	25 %	0 %	25 %	50 %	525950089
5118	NC_021847	CGC	2	6	265386	265391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_021847	CT	3	6	265474	265479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_021847	AAT	2	6	265492	265497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_021847	TG	3	6	265539	265544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_021847	A	6	6	265546	265551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_021847	TG	3	6	265559	265564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_021847	TTTG	2	8	265679	265686	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_021847	AAC	2	6	265705	265710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5134	NC_021847	A	6	6	266044	266049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5249	NC_021847	TCAA	2	8	272117	272124	50 %	25 %	0 %	25 %	525950097
5250	NC_021847	CATC	2	8	272131	272138	25 %	25 %	0 %	50 %	525950097
5251	NC_021847	TGC	2	6	272147	272152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950097
5252	NC_021847	GTA	2	6	272161	272166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950097
5253	NC_021847	CT	3	6	272246	272251	0 %	50 %	0 %	50 %	525950097
5254	NC_021847	TGCAA	2	10	272252	272261	40 %	20 %	20 %	20 %	525950097
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5257	NC_021847	TA	3	6	272377	272382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_021847	TTTA	2	8	272399	272406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_021847	AG	3	6	272463	272468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_021847	CGA	2	6	272479	272484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950098
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5319	NC_021847	GCAG	2	8	275547	275554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5320	NC_021847	AGTC	2	8	275590	275597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5331	NC_021847	TGA	2	6	276397	276402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950101
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5343	NC_021847	AAT	2	6	277031	277036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5344	NC_021847	CTG	2	6	277087	277092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950103
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5367	NC_021847	CATCC	2	10	278139	278148	20 %	20 %	0 %	60 %	525950103
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5370	NC_021847	CATC	2	8	278199	278206	25 %	25 %	0 %	50 %	525950103
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5372	NC_021847	CTG	2	6	278275	278280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950103
5373	NC_021847	ATTGG	2	10	278286	278295	20 %	40 %	40 %	0 %	525950103
5374	NC_021847	AAG	2	6	278376	278381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950103
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5380	NC_021847	AGCA	2	8	278764	278771	50 %	0 %	25 %	25 %	525950104
5381	NC_021847	ACC	2	6	278789	278794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950104
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5386	NC_021847	GAT	2	6	278957	278962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950104
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5393	NC_021847	A	6	6	279232	279237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_021847	T	7	7	279254	279260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5402	NC_021847	TCT	3	9	279871	279879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950105
5403	NC_021847	TGGC	2	8	279901	279908	0 %	25 %	50 %	25 %	525950105
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5435	NC_021847	TGA	2	6	281537	281542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950105
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5438	NC_021847	CGT	2	6	281819	281824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5439	NC_021847	A	6	6	281916	281921	100 %	0 %	0 %	0 %	525950106
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5445	NC_021847	GCA	2	6	282134	282139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950106
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5463	NC_021847	T	6	6	283207	283212	0 %	100 %	0 %	0 %	525950107
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5484	NC_021847	A	7	7	284167	284173	100 %	0 %	0 %	0 %	525950108
5485	NC_021847	CCA	2	6	284199	284204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950108
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5492	NC_021847	ATG	2	6	284665	284670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950109
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5499	NC_021847	ACG	2	6	284991	284996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950109
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