MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 34719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_021822	TCA	2	6	1796027	1796032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854193
34503	NC_021822	AAC	2	6	1796071	1796076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854193
34504	NC_021822	AAAG	2	8	1796131	1796138	75 %	0 %	25 %	0 %	525854193
34505	NC_021822	AGC	2	6	1796143	1796148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854193
34506	NC_021822	TGC	2	6	1796171	1796176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854193
34507	NC_021822	CAG	2	6	1796177	1796182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854193
34508	NC_021822	AAAGTA	2	12	1796194	1796205	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525854193
34509	NC_021822	GAT	2	6	1796268	1796273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854193
34510	NC_021822	AACA	2	8	1796280	1796287	75 %	0 %	0 %	25 %	525854193
34511	NC_021822	CAT	2	6	1796295	1796300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854193
34512	NC_021822	T	6	6	1796310	1796315	0 %	100 %	0 %	0 %	525854193
34513	NC_021822	GTTTT	2	10	1796332	1796341	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34514	NC_021822	GA	3	6	1796430	1796435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34515	NC_021822	TGA	2	6	1796448	1796453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34516	NC_021822	TGA	2	6	1796456	1796461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34517	NC_021822	AGTA	2	8	1796523	1796530	50 %	25 %	25 %	0 %	525854194
34518	NC_021822	CTG	2	6	1796533	1796538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854194
34519	NC_021822	TTGG	2	8	1796541	1796548	0 %	50 %	50 %	0 %	525854194
34520	NC_021822	CCA	2	6	1796634	1796639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854194
34521	NC_021822	CGA	2	6	1796644	1796649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854194
34522	NC_021822	GTG	2	6	1796661	1796666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854194
34523	NC_021822	T	6	6	1796702	1796707	0 %	100 %	0 %	0 %	525854194
34524	NC_021822	CAAT	2	8	1796830	1796837	50 %	25 %	0 %	25 %	525854194
34525	NC_021822	CTG	2	6	1796851	1796856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854194
34526	NC_021822	TGA	2	6	1796923	1796928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854194
34527	NC_021822	TTG	2	6	1797080	1797085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854194
34528	NC_021822	GTC	2	6	1797086	1797091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854194
34529	NC_021822	TTC	2	6	1797221	1797226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854195
34530	NC_021822	ATC	2	6	1797242	1797247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854195
34531	NC_021822	GCA	2	6	1797327	1797332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854195
34532	NC_021822	TGC	2	6	1797353	1797358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854195
34533	NC_021822	CAGT	2	8	1797367	1797374	25 %	25 %	25 %	25 %	525854195
34534	NC_021822	CAT	2	6	1797410	1797415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854195
34535	NC_021822	ATT	2	6	1797425	1797430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854195
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34538	NC_021822	TTC	2	6	1797500	1797505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854195
34539	NC_021822	AAG	2	6	1797510	1797515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854195
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34542	NC_021822	CTTTG	2	10	1797562	1797571	0 %	60 %	20 %	20 %	525854195
34543	NC_021822	TGCT	2	8	1797572	1797579	0 %	50 %	25 %	25 %	525854195
34544	NC_021822	GGCG	2	8	1797637	1797644	0 %	0 %	75 %	25 %	525854195
34545	NC_021822	CG	3	6	1797649	1797654	0 %	0 %	50 %	50 %	525854195
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34551	NC_021822	TTG	2	6	1798013	1798018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854196
34552	NC_021822	GCTG	2	8	1798078	1798085	0 %	25 %	50 %	25 %	525854196
34553	NC_021822	CAGC	2	8	1798099	1798106	25 %	0 %	25 %	50 %	525854196
34554	NC_021822	CCG	2	6	1798158	1798163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854196
34555	NC_021822	TGG	2	6	1798404	1798409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854196
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34559	NC_021822	CG	3	6	1798503	1798508	0 %	0 %	50 %	50 %	525854196
34560	NC_021822	TGC	2	6	1798584	1798589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854196
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34584	NC_021822	TTTC	2	8	1799640	1799647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34585	NC_021822	T	6	6	1799673	1799678	0 %	100 %	0 %	0 %	525854198
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34589	NC_021822	GCA	2	6	1799777	1799782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854198
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34593	NC_021822	GAT	3	9	1800012	1800020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854198
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34596	NC_021822	GT	3	6	1800232	1800237	0 %	50 %	50 %	0 %	525854198
34597	NC_021822	CGT	2	6	1800248	1800253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854198
34598	NC_021822	CAG	2	6	1800366	1800371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854198
34599	NC_021822	GT	3	6	1800384	1800389	0 %	50 %	50 %	0 %	525854198
34600	NC_021822	TGC	2	6	1800479	1800484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854455
34601	NC_021822	TGG	2	6	1800514	1800519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854455
34602	NC_021822	AAC	2	6	1800532	1800537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854455
34603	NC_021822	GTGCT	2	10	1800541	1800550	0 %	40 %	40 %	20 %	525854455
34604	NC_021822	CTT	2	6	1800600	1800605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854455
34605	NC_021822	AG	4	8	1800655	1800662	50 %	0 %	50 %	0 %	525854455
34606	NC_021822	CATC	2	8	1800708	1800715	25 %	25 %	0 %	50 %	525854455
34607	NC_021822	GCGTAA	2	12	1800797	1800808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525854455
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34611	NC_021822	TGCCA	2	10	1800999	1801008	20 %	20 %	20 %	40 %	525854455
34612	NC_021822	AAG	2	6	1801215	1801220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854199
34613	NC_021822	GTT	2	6	1801319	1801324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854199
34614	NC_021822	CAG	2	6	1801436	1801441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854199
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34616	NC_021822	GTC	2	6	1801514	1801519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854199
34617	NC_021822	TGC	2	6	1801571	1801576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854199
34618	NC_021822	TGA	2	6	1801597	1801602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854199
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34622	NC_021822	CCA	2	6	1801735	1801740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854199
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34703	NC_021822	CT	3	6	1806340	1806345	0 %	50 %	0 %	50 %	525854203
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34709	NC_021822	ATTG	2	8	1806653	1806660	25 %	50 %	25 %	0 %	525854203
34710	NC_021822	AAC	2	6	1806681	1806686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34713	NC_021822	T	8	8	1806743	1806750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34714	NC_021822	AGC	2	6	1806825	1806830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34716	NC_021822	GA	3	6	1806918	1806923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34717	NC_021822	AAGC	2	8	1806937	1806944	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34718	NC_021822	TG	3	6	1806971	1806976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34719	NC_021822	TGA	2	6	1806986	1806991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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