MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 34719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_021822	GAAC	2	8	1769889	1769896	50 %	0 %	25 %	25 %	525854172
34003	NC_021822	GGC	2	6	1769916	1769921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854172
34004	NC_021822	AGA	2	6	1769973	1769978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854172
34005	NC_021822	TGA	2	6	1769994	1769999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854172
34006	NC_021822	TGG	2	6	1770014	1770019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854172
34007	NC_021822	TGG	2	6	1770031	1770036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854172
34008	NC_021822	CA	3	6	1770098	1770103	50 %	0 %	0 %	50 %	525854172
34009	NC_021822	GAA	2	6	1770109	1770114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854172
34010	NC_021822	CG	3	6	1770140	1770145	0 %	0 %	50 %	50 %	525854172
34011	NC_021822	ATT	2	6	1770163	1770168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854172
34012	NC_021822	AGA	2	6	1770174	1770179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854172
34013	NC_021822	CAT	2	6	1770180	1770185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854172
34014	NC_021822	GC	3	6	1770275	1770280	0 %	0 %	50 %	50 %	525854172
34015	NC_021822	AAG	2	6	1770281	1770286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854172
34016	NC_021822	CGG	2	6	1770287	1770292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854172
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34018	NC_021822	CAGA	2	8	1770383	1770390	50 %	0 %	25 %	25 %	525854172
34019	NC_021822	GAA	2	6	1770516	1770521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854172
34020	NC_021822	CAA	2	6	1770555	1770560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854172
34021	NC_021822	TGC	2	6	1770564	1770569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854172
34022	NC_021822	TGC	2	6	1770596	1770601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854172
34023	NC_021822	ACA	2	6	1770638	1770643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854172
34024	NC_021822	A	6	6	1770725	1770730	100 %	0 %	0 %	0 %	525854172
34025	NC_021822	ATGT	2	8	1770750	1770757	25 %	50 %	25 %	0 %	525854172
34026	NC_021822	TGA	2	6	1770759	1770764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854172
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34029	NC_021822	GCA	2	6	1770907	1770912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854172
34030	NC_021822	AACC	2	8	1771020	1771027	50 %	0 %	0 %	50 %	525854172
34031	NC_021822	GT	3	6	1771061	1771066	0 %	50 %	50 %	0 %	525854172
34032	NC_021822	AGA	2	6	1771119	1771124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854172
34033	NC_021822	GTT	2	6	1771146	1771151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854172
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34035	NC_021822	GCG	2	6	1771249	1771254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854172
34036	NC_021822	ATG	2	6	1771264	1771269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854172
34037	NC_021822	TTC	2	6	1771279	1771284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854172
34038	NC_021822	CA	3	6	1771298	1771303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34039	NC_021822	C	6	6	1771321	1771326	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34040	NC_021822	AACG	2	8	1771344	1771351	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34041	NC_021822	ATAA	2	8	1771363	1771370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34042	NC_021822	T	7	7	1771399	1771405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34043	NC_021822	CA	3	6	1771417	1771422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34044	NC_021822	CTG	2	6	1771540	1771545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854173
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34048	NC_021822	CG	3	6	1771713	1771718	0 %	0 %	50 %	50 %	525854173
34049	NC_021822	TGCG	2	8	1771741	1771748	0 %	25 %	50 %	25 %	525854173
34050	NC_021822	ATC	2	6	1771778	1771783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854173
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34053	NC_021822	TGC	2	6	1771871	1771876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854173
34054	NC_021822	GGT	2	6	1771901	1771906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854173
34055	NC_021822	T	7	7	1771939	1771945	0 %	100 %	0 %	0 %	525854173
34056	NC_021822	ATG	2	6	1771958	1771963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34057	NC_021822	TCA	2	6	1772003	1772008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854174
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34062	NC_021822	ATCA	2	8	1772254	1772261	50 %	25 %	0 %	25 %	525854174
34063	NC_021822	GTT	2	6	1772410	1772415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854174
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34065	NC_021822	AG	3	6	1772535	1772540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34066	NC_021822	CAT	2	6	1772795	1772800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854175
34067	NC_021822	AG	3	6	1772804	1772809	50 %	0 %	50 %	0 %	525854175
34068	NC_021822	TGT	2	6	1772813	1772818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854175
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34070	NC_021822	CAT	2	6	1772830	1772835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854175
34071	NC_021822	TGC	2	6	1772841	1772846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854175
34072	NC_021822	TGGT	2	8	1772849	1772856	0 %	50 %	50 %	0 %	525854175
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34085	NC_021822	TAAA	2	8	1773430	1773437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34086	NC_021822	AAT	2	6	1773438	1773443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34087	NC_021822	GTGG	2	8	1773455	1773462	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34088	NC_021822	AGG	2	6	1773539	1773544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34089	NC_021822	ATT	2	6	1773572	1773577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854176
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34100	NC_021822	ATG	2	6	1774375	1774380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854176
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34110	NC_021822	TCT	2	6	1774786	1774791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854176
34111	NC_021822	TTA	2	6	1774943	1774948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34112	NC_021822	TGA	2	6	1775020	1775025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854177
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34114	NC_021822	CTG	2	6	1775116	1775121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854177
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34116	NC_021822	ATC	2	6	1775238	1775243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854177
34117	NC_021822	TGC	2	6	1775305	1775310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854177
34118	NC_021822	GCT	2	6	1775363	1775368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854177
34119	NC_021822	A	6	6	1775502	1775507	100 %	0 %	0 %	0 %	525854177
34120	NC_021822	GGCG	2	8	1775508	1775515	0 %	0 %	75 %	25 %	525854177
34121	NC_021822	GAC	2	6	1775517	1775522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854177
34122	NC_021822	TGG	2	6	1775555	1775560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854177
34123	NC_021822	GTACGC	2	12	1775591	1775602	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525854177
34124	NC_021822	CAT	2	6	1775609	1775614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854177
34125	NC_021822	AGA	2	6	1775633	1775638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854177
34126	NC_021822	TTA	2	6	1775652	1775657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854177
34127	NC_021822	ATCA	2	8	1775766	1775773	50 %	25 %	0 %	25 %	525854177
34128	NC_021822	TGA	2	6	1775804	1775809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854177
34129	NC_021822	TGA	2	6	1775908	1775913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854177
34130	NC_021822	TGGT	2	8	1775940	1775947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34131	NC_021822	AAC	2	6	1775959	1775964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34132	NC_021822	ATG	2	6	1776000	1776005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34133	NC_021822	TTC	2	6	1776033	1776038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854178
34134	NC_021822	TCT	2	6	1776079	1776084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854178
34135	NC_021822	TCT	2	6	1776115	1776120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854178
34136	NC_021822	GGT	2	6	1776122	1776127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854178
34137	NC_021822	ATG	2	6	1776133	1776138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854178
34138	NC_021822	GTC	2	6	1776192	1776197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854178
34139	NC_021822	TTTCA	2	10	1776264	1776273	20 %	60 %	0 %	20 %	525854178
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34142	NC_021822	TTCATT	2	12	1776484	1776495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525854178
34143	NC_021822	TG	3	6	1776511	1776516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34144	NC_021822	GTT	2	6	1776524	1776529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34145	NC_021822	ATA	2	6	1776595	1776600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34146	NC_021822	GTGAA	2	10	1776670	1776679	40 %	20 %	40 %	0 %	525854179
34147	NC_021822	TGA	2	6	1776683	1776688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854179
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34153	NC_021822	AAT	2	6	1777062	1777067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854180
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34162	NC_021822	CGA	2	6	1777384	1777389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854180
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34169	NC_021822	TGC	2	6	1777802	1777807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854181
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34197	NC_021822	TGC	2	6	1779288	1779293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854182
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34202	NC_021822	GCT	2	6	1779617	1779622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854182
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34213	NC_021822	ATT	2	6	1780270	1780275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34214	NC_021822	TAG	2	6	1780369	1780374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34215	NC_021822	TGT	2	6	1780381	1780386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34216	NC_021822	TTG	2	6	1780435	1780440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854449
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34218	NC_021822	AGT	2	6	1780587	1780592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854449
34219	NC_021822	TGA	2	6	1780601	1780606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854449
34220	NC_021822	TGA	2	6	1780715	1780720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854449
34221	NC_021822	ACTG	2	8	1780755	1780762	25 %	25 %	25 %	25 %	525854449
34222	NC_021822	TTCA	2	8	1780803	1780810	25 %	50 %	0 %	25 %	525854449
34223	NC_021822	A	6	6	1780825	1780830	100 %	0 %	0 %	0 %	525854449
34224	NC_021822	T	6	6	1780851	1780856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34225	NC_021822	T	6	6	1780872	1780877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34226	NC_021822	TCG	2	6	1780898	1780903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34227	NC_021822	CAT	2	6	1780972	1780977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854450
34228	NC_021822	TTTC	2	8	1781020	1781027	0 %	75 %	0 %	25 %	525854450
34229	NC_021822	TTA	2	6	1781067	1781072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854450
34230	NC_021822	TCC	2	6	1781090	1781095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34231	NC_021822	TCGC	2	8	1781100	1781107	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34232	NC_021822	GCA	2	6	1781110	1781115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34233	NC_021822	TA	3	6	1781166	1781171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34234	NC_021822	T	6	6	1781202	1781207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34235	NC_021822	TTG	2	6	1781358	1781363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854183
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34341	NC_021822	TAGG	2	8	1787657	1787664	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34342	NC_021822	TGA	2	6	1787720	1787725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854452
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34351	NC_021822	TTG	2	6	1788049	1788054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34352	NC_021822	GCT	2	6	1788067	1788072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34353	NC_021822	GTG	2	6	1788087	1788092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34354	NC_021822	TCT	2	6	1788099	1788104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34355	NC_021822	AT	3	6	1788139	1788144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34356	NC_021822	CAC	2	6	1788246	1788251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854453
34357	NC_021822	GCT	2	6	1788271	1788276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854453
34358	NC_021822	TAC	2	6	1788284	1788289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854453
34359	NC_021822	TGC	2	6	1788320	1788325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854453
34360	NC_021822	TCT	2	6	1788337	1788342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854453
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34364	NC_021822	CCTG	2	8	1788495	1788502	0 %	25 %	25 %	50 %	525854453
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34373	NC_021822	GT	3	6	1788934	1788939	0 %	50 %	50 %	0 %	525854187
34374	NC_021822	CG	4	8	1788988	1788995	0 %	0 %	50 %	50 %	525854187
34375	NC_021822	ATA	2	6	1789006	1789011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854187
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34378	NC_021822	GGTT	2	8	1789547	1789554	0 %	50 %	50 %	0 %	525854454
34379	NC_021822	CAAAA	2	10	1789575	1789584	80 %	0 %	0 %	20 %	525854454
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34382	NC_021822	AGTT	2	8	1789991	1789998	25 %	50 %	25 %	0 %	525854188
34383	NC_021822	GCTG	2	8	1790029	1790036	0 %	25 %	50 %	25 %	525854188
34384	NC_021822	TGGCAT	2	12	1790069	1790080	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525854188
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34386	NC_021822	ATC	2	6	1790215	1790220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854188
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34389	NC_021822	AAG	2	6	1790478	1790483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854189
34390	NC_021822	CTT	2	6	1790520	1790525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854189
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34416	NC_021822	TGT	2	6	1791781	1791786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34418	NC_021822	AG	3	6	1791866	1791871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34419	NC_021822	ATG	2	6	1791882	1791887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34420	NC_021822	CTAC	2	8	1791903	1791910	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34421	NC_021822	AGT	2	6	1791913	1791918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34455	NC_021822	A	6	6	1793804	1793809	100 %	0 %	0 %	0 %	525854192
34456	NC_021822	CTC	2	6	1793889	1793894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854192
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34458	NC_021822	CA	3	6	1793931	1793936	50 %	0 %	0 %	50 %	525854192
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34460	NC_021822	CAG	2	6	1794045	1794050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854192
34461	NC_021822	CAA	2	6	1794158	1794163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854192
34462	NC_021822	AGC	2	6	1794171	1794176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854192
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34465	NC_021822	GGT	2	6	1794266	1794271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854192
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34469	NC_021822	CAC	2	6	1794497	1794502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854192
34470	NC_021822	CGG	2	6	1794573	1794578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854192
34471	NC_021822	CAC	2	6	1794610	1794615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854192
34472	NC_021822	AATGG	2	10	1794793	1794802	40 %	20 %	40 %	0 %	525854192
34473	NC_021822	GGC	2	6	1794820	1794825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854192
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34479	NC_021822	TTGG	2	8	1795283	1795290	0 %	50 %	50 %	0 %	525854192
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34487	NC_021822	A	6	6	1795529	1795534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34488	NC_021822	AAG	2	6	1795550	1795555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34491	NC_021822	GA	3	6	1795611	1795616	50 %	0 %	50 %	0 %	525854193
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34498	NC_021822	CGAAA	2	10	1795827	1795836	60 %	0 %	20 %	20 %	525854193
34499	NC_021822	TTG	2	6	1795935	1795940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854193
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