MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 34897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019971	TC	3	6	155563	155568	0 %	50 %	0 %	50 %	433659320
3002	NC_019971	TGT	2	6	155756	155761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659321
3003	NC_019971	TGG	2	6	155788	155793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659321
3004	NC_019971	ACT	2	6	155815	155820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659321
3005	NC_019971	GTG	2	6	155868	155873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659321
3006	NC_019971	ATG	2	6	155887	155892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659321
3007	NC_019971	GAT	2	6	155928	155933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659321
3008	NC_019971	CAA	2	6	155951	155956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659321
3009	NC_019971	CGTT	2	8	156019	156026	0 %	50 %	25 %	25 %	433659321
3010	NC_019971	CAA	2	6	156034	156039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659321
3011	NC_019971	CGAG	2	8	156064	156071	25 %	0 %	50 %	25 %	433659321
3012	NC_019971	CG	3	6	156116	156121	0 %	0 %	50 %	50 %	433659321
3013	NC_019971	ATG	2	6	156144	156149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659321
3014	NC_019971	TGT	2	6	156163	156168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659321
3015	NC_019971	CGG	2	6	156187	156192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659321
3016	NC_019971	TGT	2	6	156349	156354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659321
3017	NC_019971	TTG	2	6	156382	156387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659321
3018	NC_019971	GAA	2	6	156396	156401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659321
3019	NC_019971	TTGA	2	8	156498	156505	25 %	50 %	25 %	0 %	433659321
3020	NC_019971	GCAA	2	8	156522	156529	50 %	0 %	25 %	25 %	433659321
3021	NC_019971	GATA	2	8	156571	156578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_019971	TGG	2	6	156670	156675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_019971	GTT	2	6	156688	156693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_019971	CAAA	2	8	156889	156896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3025	NC_019971	CGCT	2	8	156937	156944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_019971	TCG	2	6	156949	156954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_019971	TGG	2	6	156970	156975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_019971	GT	3	6	156987	156992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_019971	ACA	2	6	157046	157051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_019971	TCA	2	6	157132	157137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_019971	GTT	2	6	157178	157183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_019971	GGC	2	6	157276	157281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_019971	GTG	2	6	157313	157318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659323
3034	NC_019971	CGCTG	2	10	157377	157386	0 %	20 %	40 %	40 %	433659323
3035	NC_019971	CGG	2	6	157404	157409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659323
3036	NC_019971	GCA	2	6	157468	157473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659323
3037	NC_019971	GTT	2	6	157533	157538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659323
3038	NC_019971	TGC	3	9	157562	157570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659323
3039	NC_019971	GCG	2	6	157648	157653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659323
3040	NC_019971	GTTCG	2	10	157707	157716	0 %	40 %	40 %	20 %	433659323
3041	NC_019971	TTGC	2	8	157747	157754	0 %	50 %	25 %	25 %	433659323
3042	NC_019971	GCT	2	6	157760	157765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659323
3043	NC_019971	ATC	2	6	157768	157773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659323
3044	NC_019971	CTG	4	12	157774	157785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659323
3045	NC_019971	CGTG	2	8	157839	157846	0 %	25 %	50 %	25 %	433659323
3046	NC_019971	ATG	2	6	157882	157887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659323
3047	NC_019971	CGC	2	6	157905	157910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659323
3048	NC_019971	TAG	2	6	157934	157939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659323
3049	NC_019971	CTG	2	6	157945	157950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659323
3050	NC_019971	TCT	2	6	158011	158016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659323
3051	NC_019971	TTGC	2	8	158030	158037	0 %	50 %	25 %	25 %	433659323
3052	NC_019971	TTGG	2	8	158038	158045	0 %	50 %	50 %	0 %	433659323
3053	NC_019971	ATC	2	6	158095	158100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659323
3054	NC_019971	GCT	2	6	158110	158115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659323
3055	NC_019971	TTC	2	6	158116	158121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659323
3056	NC_019971	ATT	2	6	158143	158148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659323
3057	NC_019971	ATGAAA	2	12	158196	158207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	433659324
3058	NC_019971	TTTAGG	2	12	158216	158227	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	433659324
3059	NC_019971	TCA	2	6	158250	158255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659324
3060	NC_019971	TGA	2	6	158317	158322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659324
3061	NC_019971	TAATT	2	10	158621	158630	40 %	60 %	0 %	0 %	433659324
3062	NC_019971	CAA	2	6	158703	158708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659324
3063	NC_019971	GCGT	2	8	158722	158729	0 %	25 %	50 %	25 %	433659324
3064	NC_019971	CAA	3	9	158742	158750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659324
3065	NC_019971	TGA	2	6	158788	158793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659324
3066	NC_019971	AGA	2	6	158804	158809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659324
3067	NC_019971	GTC	2	6	158835	158840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659324
3068	NC_019971	TGGT	2	8	158925	158932	0 %	50 %	50 %	0 %	433659324
3069	NC_019971	A	6	6	158940	158945	100 %	0 %	0 %	0 %	433659324
3070	NC_019971	CTT	2	6	158962	158967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659324
3071	NC_019971	ATA	2	6	158998	159003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659324
3072	NC_019971	T	7	7	159113	159119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_019971	AAT	2	6	159132	159137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_019971	ATA	2	6	159161	159166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_019971	GTTT	2	8	159171	159178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_019971	TAC	2	6	159193	159198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_019971	ACAA	2	8	159256	159263	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3078	NC_019971	AATGAA	2	12	159280	159291	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	433659325
3079	NC_019971	GGC	2	6	159310	159315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659325
3080	NC_019971	ACA	2	6	159354	159359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659325
3081	NC_019971	CGG	2	6	159382	159387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659325
3082	NC_019971	ACT	2	6	159526	159531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659325
3083	NC_019971	GGT	2	6	159536	159541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659325
3084	NC_019971	GTT	2	6	159602	159607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659325
3085	NC_019971	TAC	2	6	159629	159634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659325
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3087	NC_019971	GGCTC	2	10	159707	159716	0 %	20 %	40 %	40 %	433659325
3088	NC_019971	TTGG	2	8	159786	159793	0 %	50 %	50 %	0 %	433659325
3089	NC_019971	ATG	2	6	159813	159818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659325
3090	NC_019971	TGC	2	6	159970	159975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659325
3091	NC_019971	GAT	2	6	160097	160102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659325
3092	NC_019971	GTT	2	6	160117	160122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659325
3093	NC_019971	GAA	2	6	160217	160222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659325
3094	NC_019971	TAC	2	6	160250	160255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659325
3095	NC_019971	TAA	2	6	160259	160264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659325
3096	NC_019971	TTTC	2	8	160331	160338	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3097	NC_019971	TGG	2	6	160344	160349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_019971	AGG	2	6	160366	160371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_019971	CAAA	2	8	160417	160424	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_019971	T	6	6	160473	160478	0 %	100 %	0 %	0 %	433659326
3101	NC_019971	GAA	2	6	160494	160499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659326
3102	NC_019971	TCT	2	6	160516	160521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659326
3103	NC_019971	GCC	2	6	160548	160553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659326
3104	NC_019971	AAC	2	6	160579	160584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659326
3105	NC_019971	TCG	2	6	160594	160599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659326
3106	NC_019971	TTTCA	2	10	160602	160611	20 %	60 %	0 %	20 %	433659326
3107	NC_019971	TGT	2	6	160671	160676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659326
3108	NC_019971	TGT	2	6	160754	160759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659326
3109	NC_019971	TCA	2	6	160774	160779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659326
3110	NC_019971	GTG	2	6	160789	160794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659326
3111	NC_019971	TCA	2	6	160807	160812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659326
3112	NC_019971	AAC	2	6	160824	160829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659326
3113	NC_019971	TAA	2	6	160883	160888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659326
3114	NC_019971	CCGC	2	8	160906	160913	0 %	0 %	25 %	75 %	433659326
3115	NC_019971	CCA	2	6	160918	160923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659326
3116	NC_019971	T	6	6	161016	161021	0 %	100 %	0 %	0 %	433659326
3117	NC_019971	TCTT	2	8	161185	161192	0 %	75 %	0 %	25 %	433659326
3118	NC_019971	ATG	2	6	161254	161259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659326
3119	NC_019971	GTA	2	6	161349	161354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659326
3120	NC_019971	AGT	2	6	161364	161369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659326
3121	NC_019971	GTA	2	6	161379	161384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659326
3122	NC_019971	T	6	6	161394	161399	0 %	100 %	0 %	0 %	433659326
3123	NC_019971	CGCT	2	8	161498	161505	0 %	25 %	25 %	50 %	433659326
3124	NC_019971	GCT	2	6	161519	161524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659326
3125	NC_019971	GGT	2	6	161534	161539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659326
3126	NC_019971	CAA	2	6	161558	161563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659326
3127	NC_019971	GTC	2	6	161574	161579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659326
3128	NC_019971	TCA	2	6	161636	161641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659326
3129	NC_019971	GAT	2	6	161769	161774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659326
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3132	NC_019971	GTA	2	6	161850	161855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659326
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3134	NC_019971	TCA	2	6	161884	161889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659326
3135	NC_019971	T	6	6	161952	161957	0 %	100 %	0 %	0 %	433659326
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3137	NC_019971	GTAA	2	8	162026	162033	50 %	25 %	25 %	0 %	433659326
3138	NC_019971	TTTAAT	2	12	162051	162062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659326
3139	NC_019971	CGG	2	6	162073	162078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659326
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3142	NC_019971	TTCGTA	2	12	162231	162242	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433659326
3143	NC_019971	AGT	2	6	162269	162274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659326
3144	NC_019971	GTC	2	6	162300	162305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659326
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3148	NC_019971	AGT	3	9	162446	162454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659326
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3150	NC_019971	T	8	8	162497	162504	0 %	100 %	0 %	0 %	433659326
3151	NC_019971	TGC	2	6	162578	162583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659326
3152	NC_019971	AG	3	6	162732	162737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_019971	TTG	2	6	162788	162793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_019971	TCA	2	6	162871	162876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3155	NC_019971	A	6	6	162900	162905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_019971	AC	3	6	162909	162914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3157	NC_019971	GT	3	6	162921	162926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_019971	CAT	2	6	163046	163051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659327
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3160	NC_019971	TGT	2	6	163190	163195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659327
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3162	NC_019971	CCA	2	6	163242	163247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659327
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3165	NC_019971	ACG	2	6	163340	163345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659327
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3178	NC_019971	CCA	2	6	163897	163902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659327
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3182	NC_019971	A	6	6	164182	164187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3183	NC_019971	TA	3	6	164280	164285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3184	NC_019971	ATG	2	6	164375	164380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3185	NC_019971	ATGCGT	2	12	164593	164604	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433659328
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3198	NC_019971	GAC	2	6	165352	165357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659328
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3200	NC_019971	CGTCTG	2	12	165397	165408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659328
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3203	NC_019971	TTGT	2	8	165597	165604	0 %	75 %	25 %	0 %	433659329
3204	NC_019971	CAT	2	6	165645	165650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659329
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3225	NC_019971	GCATC	2	10	166676	166685	20 %	20 %	20 %	40 %	433659329
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3227	NC_019971	CTTG	2	8	166768	166775	0 %	50 %	25 %	25 %	433659329
3228	NC_019971	GAGGC	2	10	166795	166804	20 %	0 %	60 %	20 %	433659329
3229	NC_019971	CTT	2	6	166847	166852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659329
3230	NC_019971	AC	3	6	166962	166967	50 %	0 %	0 %	50 %	433659329
3231	NC_019971	TTG	2	6	166983	166988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659329
3232	NC_019971	CAA	2	6	167007	167012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659329
3233	NC_019971	GCTA	2	8	167067	167074	25 %	25 %	25 %	25 %	433659329
3234	NC_019971	CCA	2	6	167084	167089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659329
3235	NC_019971	GTT	2	6	167096	167101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659329
3236	NC_019971	TTTG	2	8	167133	167140	0 %	75 %	25 %	0 %	433659329
3237	NC_019971	TTC	2	6	167151	167156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659329
3238	NC_019971	CTG	2	6	167241	167246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659329
3239	NC_019971	TCA	2	6	167329	167334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659329
3240	NC_019971	AGT	2	6	167357	167362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659329
3241	NC_019971	CG	3	6	167376	167381	0 %	0 %	50 %	50 %	433659329
3242	NC_019971	TTAA	2	8	167442	167449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3243	NC_019971	A	6	6	167466	167471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3244	NC_019971	GC	3	6	167518	167523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3245	NC_019971	ATC	2	6	167566	167571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3247	NC_019971	CTG	2	6	167630	167635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3499	NC_019971	AAT	2	6	181860	181865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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