MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 34897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_019971	GGC	2	6	1555923	1555928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660549
30002	NC_019971	GCT	2	6	1555986	1555991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660549
30003	NC_019971	GTC	2	6	1556170	1556175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660549
30004	NC_019971	TCA	3	9	1556228	1556236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660549
30005	NC_019971	ACA	2	6	1556244	1556249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660549
30006	NC_019971	CAG	2	6	1556280	1556285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660549
30007	NC_019971	TTC	2	6	1556296	1556301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660549
30008	NC_019971	ACAA	2	8	1556372	1556379	75 %	0 %	0 %	25 %	433660549
30009	NC_019971	TGA	2	6	1556444	1556449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660549
30010	NC_019971	TCA	2	6	1556510	1556515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660549
30011	NC_019971	CAA	2	6	1556541	1556546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660549
30012	NC_019971	GAT	2	6	1556566	1556571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660549
30013	NC_019971	TGT	2	6	1556661	1556666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660549
30014	NC_019971	CGT	2	6	1556757	1556762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660549
30015	NC_019971	ATT	2	6	1556809	1556814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433660549
30016	NC_019971	CAAA	2	8	1556816	1556823	75 %	0 %	0 %	25 %	433660549
30017	NC_019971	AC	3	6	1556844	1556849	50 %	0 %	0 %	50 %	433660549
30018	NC_019971	TTG	2	6	1557220	1557225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660549
30019	NC_019971	AGAA	2	8	1557226	1557233	75 %	0 %	25 %	0 %	433660549
30020	NC_019971	TAT	2	6	1557282	1557287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433660549
30021	NC_019971	ATC	2	6	1557323	1557328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660549
30022	NC_019971	CAA	2	6	1557348	1557353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660549
30023	NC_019971	CTCG	2	8	1557378	1557385	0 %	25 %	25 %	50 %	433660549
30024	NC_019971	ATG	2	6	1557418	1557423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660549
30025	NC_019971	AT	3	6	1557445	1557450	50 %	50 %	0 %	0 %	433660549
30026	NC_019971	TCCA	2	8	1557454	1557461	25 %	25 %	0 %	50 %	433660549
30027	NC_019971	AGAA	2	8	1557469	1557476	75 %	0 %	25 %	0 %	433660549
30028	NC_019971	CAC	2	6	1557526	1557531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660549
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30031	NC_019971	CTT	2	6	1557717	1557722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660549
30032	NC_019971	TCA	2	6	1557741	1557746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660549
30033	NC_019971	GTT	2	6	1557797	1557802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660549
30034	NC_019971	CCA	2	6	1557813	1557818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660549
30035	NC_019971	TTG	2	6	1557827	1557832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660549
30036	NC_019971	TCT	2	6	1557867	1557872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660549
30037	NC_019971	A	6	6	1557949	1557954	100 %	0 %	0 %	0 %	433660549
30038	NC_019971	CT	3	6	1558057	1558062	0 %	50 %	0 %	50 %	433660549
30039	NC_019971	AAC	2	6	1558102	1558107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660549
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30041	NC_019971	ATT	2	6	1558136	1558141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433660549
30042	NC_019971	TTA	2	6	1558152	1558157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433660549
30043	NC_019971	T	7	7	1558173	1558179	0 %	100 %	0 %	0 %	433660549
30044	NC_019971	TCT	2	6	1558210	1558215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660550
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30047	NC_019971	GTA	2	6	1558251	1558256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660550
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30049	NC_019971	T	6	6	1558287	1558292	0 %	100 %	0 %	0 %	433660550
30050	NC_019971	T	6	6	1558361	1558366	0 %	100 %	0 %	0 %	433660550
30051	NC_019971	CAT	2	6	1558460	1558465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660550
30052	NC_019971	ATG	2	6	1558471	1558476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660550
30053	NC_019971	TCG	2	6	1558630	1558635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660550
30054	NC_019971	CCG	2	6	1558694	1558699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660550
30055	NC_019971	AGT	2	6	1558706	1558711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660550
30056	NC_019971	CCAC	2	8	1558795	1558802	25 %	0 %	0 %	75 %	433660550
30057	NC_019971	GTAC	2	8	1558874	1558881	25 %	25 %	25 %	25 %	433660550
30058	NC_019971	CAC	2	6	1559012	1559017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660550
30059	NC_019971	GAA	2	6	1559053	1559058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660550
30060	NC_019971	CAG	2	6	1559087	1559092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660550
30061	NC_019971	TGAC	2	8	1559114	1559121	25 %	25 %	25 %	25 %	433660550
30062	NC_019971	CCTTC	2	10	1559133	1559142	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
30063	NC_019971	ACG	2	6	1559181	1559186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30064	NC_019971	AGT	2	6	1559195	1559200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660551
30065	NC_019971	TCA	2	6	1559242	1559247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660551
30066	NC_019971	GT	3	6	1559256	1559261	0 %	50 %	50 %	0 %	433660551
30067	NC_019971	CGTGT	2	10	1559280	1559289	0 %	40 %	40 %	20 %	433660551
30068	NC_019971	CAT	2	6	1559291	1559296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660551
30069	NC_019971	GAT	2	6	1559325	1559330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660551
30070	NC_019971	TTC	2	6	1559340	1559345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660551
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30072	NC_019971	TTCG	2	8	1559379	1559386	0 %	50 %	25 %	25 %	433660551
30073	NC_019971	CAT	2	6	1559390	1559395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660551
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30084	NC_019971	TGT	2	6	1560351	1560356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660551
30085	NC_019971	TCGT	2	8	1560374	1560381	0 %	50 %	25 %	25 %	433660551
30086	NC_019971	GCT	2	6	1560450	1560455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660551
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30088	NC_019971	T	7	7	1560593	1560599	0 %	100 %	0 %	0 %	433660551
30089	NC_019971	ATT	2	6	1560624	1560629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30090	NC_019971	ATT	2	6	1560664	1560669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30091	NC_019971	T	6	6	1560692	1560697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30092	NC_019971	T	6	6	1560727	1560732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30093	NC_019971	TGA	2	6	1560741	1560746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30094	NC_019971	CCAA	2	8	1560767	1560774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30095	NC_019971	AAC	2	6	1560777	1560782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30096	NC_019971	TAA	2	6	1560834	1560839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30097	NC_019971	AAAC	2	8	1560853	1560860	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30098	NC_019971	ATTA	2	8	1560901	1560908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30099	NC_019971	AT	3	6	1561026	1561031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30100	NC_019971	AGT	2	6	1561044	1561049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30101	NC_019971	CAAA	2	8	1561051	1561058	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30102	NC_019971	AAG	2	6	1561125	1561130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30103	NC_019971	GCG	2	6	1561166	1561171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660552
30104	NC_019971	GCT	2	6	1561172	1561177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660552
30105	NC_019971	TGA	2	6	1561182	1561187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660552
30106	NC_019971	AG	3	6	1561264	1561269	50 %	0 %	50 %	0 %	433660552
30107	NC_019971	GTA	2	6	1561382	1561387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660552
30108	NC_019971	GCGG	2	8	1561397	1561404	0 %	0 %	75 %	25 %	433660552
30109	NC_019971	GGAA	2	8	1561495	1561502	50 %	0 %	50 %	0 %	433660552
30110	NC_019971	CCAA	2	8	1561506	1561513	50 %	0 %	0 %	50 %	433660552
30111	NC_019971	TGA	2	6	1561563	1561568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660552
30112	NC_019971	TGG	2	6	1561576	1561581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433660552
30113	NC_019971	GGC	2	6	1561616	1561621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660552
30114	NC_019971	GC	3	6	1561625	1561630	0 %	0 %	50 %	50 %	433660552
30115	NC_019971	TG	4	8	1561633	1561640	0 %	50 %	50 %	0 %	433660552
30116	NC_019971	TCTG	2	8	1561662	1561669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30117	NC_019971	CGATG	2	10	1561716	1561725	20 %	20 %	40 %	20 %	433660553
30118	NC_019971	GCA	2	6	1561753	1561758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660553
30119	NC_019971	GC	3	6	1561795	1561800	0 %	0 %	50 %	50 %	433660553
30120	NC_019971	TTGG	2	8	1561823	1561830	0 %	50 %	50 %	0 %	433660553
30121	NC_019971	TAT	2	6	1561855	1561860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433660553
30122	NC_019971	TAA	2	6	1561946	1561951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433660553
30123	NC_019971	CTT	2	6	1562101	1562106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660553
30124	NC_019971	TGC	2	6	1562196	1562201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660553
30125	NC_019971	GCG	2	6	1562239	1562244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660553
30126	NC_019971	GGC	2	6	1562278	1562283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660553
30127	NC_019971	TGC	2	6	1562316	1562321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660553
30128	NC_019971	CAC	2	6	1562594	1562599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660553
30129	NC_019971	CTC	2	6	1562627	1562632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433660553
30130	NC_019971	TCA	2	6	1562661	1562666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660553
30131	NC_019971	GCGT	2	8	1562772	1562779	0 %	25 %	50 %	25 %	433660553
30132	NC_019971	GCC	2	6	1562994	1562999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660553
30133	NC_019971	CAAA	2	8	1563005	1563012	75 %	0 %	0 %	25 %	433660553
30134	NC_019971	GTG	2	6	1563021	1563026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433660553
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30136	NC_019971	CCT	2	6	1563063	1563068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30137	NC_019971	TAT	2	6	1563078	1563083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433660554
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30139	NC_019971	CTT	2	6	1563385	1563390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660554
30140	NC_019971	GCTC	2	8	1563393	1563400	0 %	25 %	25 %	50 %	433660554
30141	NC_019971	ATC	2	6	1563494	1563499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660554
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30143	NC_019971	ACCATC	2	12	1563608	1563619	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	433660554
30144	NC_019971	CTG	3	9	1563656	1563664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660554
30145	NC_019971	GACT	2	8	1563700	1563707	25 %	25 %	25 %	25 %	433660554
30146	NC_019971	TCA	2	6	1563753	1563758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660554
30147	NC_019971	TCAA	2	8	1563765	1563772	50 %	25 %	0 %	25 %	433660554
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30150	NC_019971	TCCTT	2	10	1563814	1563823	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30151	NC_019971	TTTC	2	8	1563869	1563876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30152	NC_019971	TGG	3	9	1563913	1563921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30153	NC_019971	AACA	2	8	1563941	1563948	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30154	NC_019971	CCA	2	6	1563967	1563972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30155	NC_019971	CG	3	6	1563992	1563997	0 %	0 %	50 %	50 %	433660555
30156	NC_019971	CAT	3	9	1564064	1564072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660555
30157	NC_019971	TGA	2	6	1564076	1564081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660555
30158	NC_019971	CAT	2	6	1564103	1564108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660555
30159	NC_019971	TCA	2	6	1564177	1564182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660555
30160	NC_019971	GTTCAT	2	12	1564209	1564220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433660555
30161	NC_019971	CAA	2	6	1564271	1564276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660555
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30163	NC_019971	GCA	3	9	1564370	1564378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660555
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30182	NC_019971	GTAAA	2	10	1565248	1565257	60 %	20 %	20 %	0 %	433660556
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30210	NC_019971	TG	3	6	1566655	1566660	0 %	50 %	50 %	0 %	433660559
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30217	NC_019971	GCTAAG	2	12	1567140	1567151	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433660560
30218	NC_019971	ATC	2	6	1567153	1567158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660560
30219	NC_019971	CGGA	2	8	1567211	1567218	25 %	0 %	50 %	25 %	433660560
30220	NC_019971	GAA	2	6	1567318	1567323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660560
30221	NC_019971	TGA	2	6	1567374	1567379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660560
30222	NC_019971	TTC	2	6	1567402	1567407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660560
30223	NC_019971	ACA	2	6	1567489	1567494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30224	NC_019971	TGC	2	6	1567506	1567511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660561
30225	NC_019971	ACCA	2	8	1567537	1567544	50 %	0 %	0 %	50 %	433660561
30226	NC_019971	CAG	2	6	1567548	1567553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660561
30227	NC_019971	GGC	2	6	1567654	1567659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660561
30228	NC_019971	GC	3	6	1567658	1567663	0 %	0 %	50 %	50 %	433660561
30229	NC_019971	ACC	2	6	1567694	1567699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660561
30230	NC_019971	CAGA	2	8	1567737	1567744	50 %	0 %	25 %	25 %	433660561
30231	NC_019971	TTG	2	6	1567762	1567767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660561
30232	NC_019971	ATG	2	6	1567768	1567773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660561
30233	NC_019971	CCA	2	6	1567850	1567855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660561
30234	NC_019971	TCTTG	2	10	1567894	1567903	0 %	60 %	20 %	20 %	433660561
30235	NC_019971	CAT	2	6	1567995	1568000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660561
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