MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 34897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_019971	A	6	6	1249020	1249025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24002	NC_019971	GATT	2	8	1249043	1249050	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24003	NC_019971	TTC	2	6	1249089	1249094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24004	NC_019971	TAAA	2	8	1249148	1249155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24005	NC_019971	TA	3	6	1249160	1249165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24006	NC_019971	TACA	2	8	1249175	1249182	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24007	NC_019971	AAT	3	9	1249261	1249269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24008	NC_019971	AAC	2	6	1249367	1249372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24009	NC_019971	A	6	6	1249383	1249388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24010	NC_019971	AT	3	6	1249393	1249398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24011	NC_019971	GAA	2	6	1249405	1249410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24012	NC_019971	TAT	2	6	1249449	1249454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24013	NC_019971	ATTTTA	2	12	1249480	1249491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24014	NC_019971	CTAA	2	8	1249511	1249518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24015	NC_019971	GTA	2	6	1249542	1249547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24016	NC_019971	TCA	2	6	1249599	1249604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24017	NC_019971	CTTT	2	8	1249645	1249652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24018	NC_019971	GAT	3	9	1249733	1249741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660276
24019	NC_019971	CGC	2	6	1249793	1249798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660276
24020	NC_019971	CGG	2	6	1249844	1249849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660276
24021	NC_019971	CAC	2	6	1249927	1249932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660276
24022	NC_019971	CTG	2	6	1250082	1250087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660276
24023	NC_019971	GGC	2	6	1250121	1250126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660276
24024	NC_019971	A	6	6	1250156	1250161	100 %	0 %	0 %	0 %	433660276
24025	NC_019971	TGA	2	6	1250170	1250175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660276
24026	NC_019971	TGA	2	6	1250194	1250199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660276
24027	NC_019971	TGA	2	6	1250279	1250284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660277
24028	NC_019971	GAA	2	6	1250400	1250405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660277
24029	NC_019971	A	6	6	1250404	1250409	100 %	0 %	0 %	0 %	433660277
24030	NC_019971	A	7	7	1250519	1250525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24031	NC_019971	GCA	2	6	1250638	1250643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660278
24032	NC_019971	AATCGA	2	12	1250651	1250662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	433660278
24033	NC_019971	CAGA	2	8	1250674	1250681	50 %	0 %	25 %	25 %	433660278
24034	NC_019971	CTC	2	6	1250722	1250727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433660278
24035	NC_019971	TCT	2	6	1250820	1250825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660278
24036	NC_019971	ATG	2	6	1250874	1250879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660278
24037	NC_019971	CAGCA	2	10	1250912	1250921	40 %	0 %	20 %	40 %	433660278
24038	NC_019971	AAG	2	6	1250961	1250966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660278
24039	NC_019971	CAT	2	6	1250983	1250988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660278
24040	NC_019971	AC	3	6	1251061	1251066	50 %	0 %	0 %	50 %	433660278
24041	NC_019971	CAA	2	6	1251071	1251076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660278
24042	NC_019971	CAA	2	6	1251121	1251126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660278
24043	NC_019971	ACA	2	6	1251138	1251143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660278
24044	NC_019971	GA	3	6	1251154	1251159	50 %	0 %	50 %	0 %	433660278
24045	NC_019971	CTT	2	6	1251199	1251204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660278
24046	NC_019971	GTTA	2	8	1251305	1251312	25 %	50 %	25 %	0 %	433660278
24047	NC_019971	GCT	2	6	1251313	1251318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660278
24048	NC_019971	ACC	2	6	1251344	1251349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660278
24049	NC_019971	ATG	2	6	1251414	1251419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660278
24050	NC_019971	GTA	2	6	1251429	1251434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660278
24051	NC_019971	ACG	2	6	1251496	1251501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660279
24052	NC_019971	AAATT	2	10	1251516	1251525	60 %	40 %	0 %	0 %	433660279
24053	NC_019971	CGG	2	6	1251636	1251641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660279
24054	NC_019971	TAG	2	6	1251648	1251653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660279
24055	NC_019971	ATA	2	6	1251758	1251763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433660279
24056	NC_019971	AGCAA	2	10	1251839	1251848	60 %	0 %	20 %	20 %	433660279
24057	NC_019971	CAAA	2	8	1251859	1251866	75 %	0 %	0 %	25 %	433660279
24058	NC_019971	GCG	2	6	1251907	1251912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433660279
24059	NC_019971	TGC	2	6	1251961	1251966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660279
24060	NC_019971	CG	3	6	1252051	1252056	0 %	0 %	50 %	50 %	433660279
24061	NC_019971	CTG	2	6	1252072	1252077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660279
24062	NC_019971	GTTT	2	8	1252186	1252193	0 %	75 %	25 %	0 %	433660279
24063	NC_019971	ACC	2	6	1252261	1252266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660279
24064	NC_019971	GAA	2	6	1252395	1252400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660279
24065	NC_019971	GCT	2	6	1252411	1252416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660279
24066	NC_019971	CT	3	6	1252526	1252531	0 %	50 %	0 %	50 %	433660279
24067	NC_019971	TTC	2	6	1252570	1252575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660279
24068	NC_019971	TTG	2	6	1252603	1252608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660279
24069	NC_019971	CGA	2	6	1252615	1252620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660279
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24071	NC_019971	TGCT	2	8	1252732	1252739	0 %	50 %	25 %	25 %	433660279
24072	NC_019971	CAC	2	6	1252791	1252796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660279
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24085	NC_019971	TCA	2	6	1253277	1253282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660279
24086	NC_019971	TGC	2	6	1253297	1253302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660279
24087	NC_019971	T	7	7	1253310	1253316	0 %	100 %	0 %	0 %	433660279
24088	NC_019971	CAT	2	6	1253325	1253330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24089	NC_019971	TAA	2	6	1253355	1253360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24090	NC_019971	AC	3	6	1253370	1253375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24091	NC_019971	TCG	2	6	1253443	1253448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24093	NC_019971	TCA	2	6	1253677	1253682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660280
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24099	NC_019971	CCG	2	6	1254193	1254198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433660281
24100	NC_019971	GAAC	2	8	1254238	1254245	50 %	0 %	25 %	25 %	433660281
24101	NC_019971	ACC	2	6	1254249	1254254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660281
24102	NC_019971	GCTCTT	2	12	1254383	1254394	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	433660281
24103	NC_019971	TGA	2	6	1254395	1254400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660281
24104	NC_019971	AG	3	6	1254414	1254419	50 %	0 %	50 %	0 %	433660281
24105	NC_019971	TCT	2	6	1254448	1254453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660281
24106	NC_019971	CCA	2	6	1254454	1254459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433660281
24107	NC_019971	AACC	2	8	1254490	1254497	50 %	0 %	0 %	50 %	433660281
24108	NC_019971	ATC	2	6	1254561	1254566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660281
24109	NC_019971	TTG	2	6	1254571	1254576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660281
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24111	NC_019971	A	6	6	1254729	1254734	100 %	0 %	0 %	0 %	433660281
24112	NC_019971	CAG	3	9	1254762	1254770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660281
24113	NC_019971	T	6	6	1254795	1254800	0 %	100 %	0 %	0 %	433660281
24114	NC_019971	CAA	2	6	1254885	1254890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660282
24115	NC_019971	ACT	2	6	1254893	1254898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433660282
24116	NC_019971	TCT	2	6	1254958	1254963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433660282
24117	NC_019971	AGC	2	6	1255052	1255057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660282
24118	NC_019971	GC	3	6	1255107	1255112	0 %	0 %	50 %	50 %	433660282
24119	NC_019971	AGA	2	6	1255167	1255172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433660282
24120	NC_019971	GCTC	2	8	1255245	1255252	0 %	25 %	25 %	50 %	433660282
24121	NC_019971	ATA	2	6	1255265	1255270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433660282
24122	NC_019971	CAA	2	6	1255318	1255323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433660282
24123	NC_019971	CTC	2	6	1255347	1255352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433660282
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24126	NC_019971	AACCA	2	10	1255477	1255486	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
24127	NC_019971	AAT	2	6	1255512	1255517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24128	NC_019971	TTAC	2	8	1255521	1255528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24129	NC_019971	T	6	6	1255534	1255539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24130	NC_019971	TAA	2	6	1255565	1255570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24131	NC_019971	GAT	2	6	1255590	1255595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24132	NC_019971	AGT	2	6	1255667	1255672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24133	NC_019971	T	6	6	1255878	1255883	0 %	100 %	0 %	0 %	433660283
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24139	NC_019971	TGA	2	6	1256219	1256224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660283
24140	NC_019971	CTG	2	6	1256232	1256237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660283
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24146	NC_019971	AATA	2	8	1256656	1256663	75 %	25 %	0 %	0 %	433660284
24147	NC_019971	CGA	2	6	1256711	1256716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660284
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24153	NC_019971	AATT	2	8	1257005	1257012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24154	NC_019971	ATG	2	6	1257064	1257069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24155	NC_019971	AAT	2	6	1257084	1257089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24156	NC_019971	GAT	2	6	1257121	1257126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433660285
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24172	NC_019971	TC	3	6	1257878	1257883	0 %	50 %	0 %	50 %	433660285
24173	NC_019971	TTGC	2	8	1257902	1257909	0 %	50 %	25 %	25 %	433660285
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24198	NC_019971	GCA	2	6	1259500	1259505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660287
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24206	NC_019971	GGT	2	6	1259851	1259856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24207	NC_019971	ACC	2	6	1259870	1259875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24229	NC_019971	T	6	6	1260953	1260958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24230	NC_019971	CGA	2	6	1261072	1261077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433660289
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24233	NC_019971	TGT	2	6	1261268	1261273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433660289
24234	NC_019971	TC	3	6	1261402	1261407	0 %	50 %	0 %	50 %	433660289
24235	NC_019971	TTAG	2	8	1261470	1261477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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24237	NC_019971	GAAA	2	8	1261567	1261574	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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24356	NC_019971	GCT	2	6	1268125	1268130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433660297
24357	NC_019971	GC	3	6	1268157	1268162	0 %	0 %	50 %	50 %	433660297
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24463	NC_019971	GTCT	2	8	1272675	1272682	0 %	50 %	25 %	25 %	433660299
24464	NC_019971	TTGA	2	8	1272751	1272758	25 %	50 %	25 %	0 %	433660299
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24470	NC_019971	CATC	2	8	1272871	1272878	25 %	25 %	0 %	50 %	433660299
24471	NC_019971	ACTAG	2	10	1272912	1272921	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24472	NC_019971	CA	3	6	1272925	1272930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24473	NC_019971	TAA	2	6	1272932	1272937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24474	NC_019971	TGA	2	6	1272945	1272950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24475	NC_019971	A	6	6	1272954	1272959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24476	NC_019971	CGG	2	6	1273000	1273005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24477	NC_019971	T	6	6	1273043	1273048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24478	NC_019971	ATC	2	6	1273050	1273055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24479	NC_019971	A	6	6	1273056	1273061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24480	NC_019971	AGC	2	6	1273094	1273099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24481	NC_019971	TCGTTA	2	12	1273217	1273228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24482	NC_019971	A	7	7	1273230	1273236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24483	NC_019971	TTA	2	6	1273246	1273251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24484	NC_019971	AAT	2	6	1273300	1273305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24485	NC_019971	CA	3	6	1273374	1273379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24486	NC_019971	ATT	2	6	1273382	1273387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24487	NC_019971	CCA	2	6	1273406	1273411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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24489	NC_019971	ACA	2	6	1273481	1273486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24490	NC_019971	ATCT	2	8	1273540	1273547	25 %	50 %	0 %	25 %	433660300
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24492	NC_019971	CA	3	6	1273691	1273696	50 %	0 %	0 %	50 %	433660300
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