MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 34897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_019971	GCA	2	6	856445	856450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659942
16502	NC_019971	TCAA	2	8	856490	856497	50 %	25 %	0 %	25 %	433659942
16503	NC_019971	TCG	2	6	856551	856556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659942
16504	NC_019971	ATT	2	6	856711	856716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659942
16505	NC_019971	GTCAC	2	10	856780	856789	20 %	20 %	20 %	40 %	433659942
16506	NC_019971	CGA	2	6	856903	856908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659942
16507	NC_019971	TCT	2	6	856911	856916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659942
16508	NC_019971	CCTA	2	8	857052	857059	25 %	25 %	0 %	50 %	433659942
16509	NC_019971	AATC	2	8	857069	857076	50 %	25 %	0 %	25 %	433659942
16510	NC_019971	AAG	2	6	857128	857133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659942
16511	NC_019971	AGC	2	6	857151	857156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659942
16512	NC_019971	AAC	2	6	857356	857361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659942
16513	NC_019971	AAC	2	6	857383	857388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659942
16514	NC_019971	ATT	2	6	857489	857494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659942
16515	NC_019971	AGT	2	6	857584	857589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659942
16516	NC_019971	GCA	2	6	857643	857648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659943
16517	NC_019971	GTG	2	6	857663	857668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659943
16518	NC_019971	TTG	2	6	857720	857725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659943
16519	NC_019971	CCG	2	6	857788	857793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659943
16520	NC_019971	ACA	2	6	857817	857822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659943
16521	NC_019971	CTGA	2	8	857831	857838	25 %	25 %	25 %	25 %	433659943
16522	NC_019971	CGC	2	6	857999	858004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659943
16523	NC_019971	AAG	2	6	858075	858080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659943
16524	NC_019971	GAAA	2	8	858112	858119	75 %	0 %	25 %	0 %	433659943
16525	NC_019971	CGG	2	6	858174	858179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659943
16526	NC_019971	AGC	2	6	858278	858283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659943
16527	NC_019971	CAA	2	6	858374	858379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659943
16528	NC_019971	TCA	2	6	858454	858459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659943
16529	NC_019971	CCG	2	6	858519	858524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659943
16530	NC_019971	GT	3	6	858528	858533	0 %	50 %	50 %	0 %	433659943
16531	NC_019971	TAT	2	6	858599	858604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659943
16532	NC_019971	TCA	2	6	858606	858611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659943
16533	NC_019971	CCG	2	6	858613	858618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659943
16534	NC_019971	CAT	2	6	858661	858666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659943
16535	NC_019971	TGG	2	6	858693	858698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659943
16536	NC_019971	ATG	2	6	858705	858710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659943
16537	NC_019971	CAA	2	6	858793	858798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659943
16538	NC_019971	AG	3	6	858922	858927	50 %	0 %	50 %	0 %	433659943
16539	NC_019971	TCA	2	6	859102	859107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659943
16540	NC_019971	A	6	6	859146	859151	100 %	0 %	0 %	0 %	433659943
16541	NC_019971	ATC	2	6	859433	859438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659943
16542	NC_019971	TCGC	2	8	859455	859462	0 %	25 %	25 %	50 %	433659943
16543	NC_019971	GAAGT	2	10	859481	859490	40 %	20 %	40 %	0 %	433659943
16544	NC_019971	AGCA	2	8	859515	859522	50 %	0 %	25 %	25 %	433659943
16545	NC_019971	CCA	2	6	859524	859529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659943
16546	NC_019971	GCGA	2	8	859540	859547	25 %	0 %	50 %	25 %	433659943
16547	NC_019971	ATC	2	6	859559	859564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659943
16548	NC_019971	TGA	2	6	859582	859587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659943
16549	NC_019971	TGG	2	6	859707	859712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659943
16550	NC_019971	AAG	2	6	859812	859817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659943
16551	NC_019971	TAT	2	6	859954	859959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659944
16552	NC_019971	GAT	3	9	859965	859973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659944
16553	NC_019971	TGA	2	6	860002	860007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659944
16554	NC_019971	ATC	2	6	860012	860017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659944
16555	NC_019971	TC	3	6	860065	860070	0 %	50 %	0 %	50 %	433659944
16556	NC_019971	GGGC	2	8	860077	860084	0 %	0 %	75 %	25 %	433659944
16557	NC_019971	GTT	2	6	860085	860090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659944
16558	NC_019971	GAT	2	6	860138	860143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659944
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16562	NC_019971	GTG	2	6	860427	860432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659944
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16564	NC_019971	ATG	2	6	860487	860492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659944
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16567	NC_019971	TGA	2	6	860558	860563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659944
16568	NC_019971	CAG	2	6	860577	860582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659944
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16570	NC_019971	GTG	2	6	860778	860783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659944
16571	NC_019971	GAC	2	6	860811	860816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659944
16572	NC_019971	CTT	2	6	860837	860842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659944
16573	NC_019971	GAT	2	6	861036	861041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659944
16574	NC_019971	TGG	2	6	861043	861048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659944
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16577	NC_019971	ATC	2	6	861118	861123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659944
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16580	NC_019971	AAC	2	6	861268	861273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16584	NC_019971	GAC	2	6	861482	861487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659945
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16586	NC_019971	TCA	2	6	861534	861539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659945
16587	NC_019971	TTCT	2	8	861567	861574	0 %	75 %	0 %	25 %	433659945
16588	NC_019971	AGGTC	2	10	861581	861590	20 %	20 %	40 %	20 %	433659945
16589	NC_019971	CAAA	2	8	861621	861628	75 %	0 %	0 %	25 %	433659945
16590	NC_019971	ATGCC	2	10	861652	861661	20 %	20 %	20 %	40 %	433659945
16591	NC_019971	GAGCA	2	10	861696	861705	40 %	0 %	40 %	20 %	433659945
16592	NC_019971	ATG	2	6	861722	861727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659945
16593	NC_019971	TAG	2	6	861748	861753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659945
16594	NC_019971	AGT	2	6	861764	861769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659945
16595	NC_019971	ATC	2	6	861842	861847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659945
16596	NC_019971	ATG	2	6	861908	861913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659945
16597	NC_019971	AT	3	6	861947	861952	50 %	50 %	0 %	0 %	433659945
16598	NC_019971	ATTTT	2	10	862043	862052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16599	NC_019971	T	6	6	862049	862054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16600	NC_019971	TTG	2	6	862120	862125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16601	NC_019971	A	7	7	862175	862181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16602	NC_019971	GTT	2	6	862238	862243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16603	NC_019971	TTG	2	6	862330	862335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659946
16604	NC_019971	ATG	2	6	862345	862350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659946
16605	NC_019971	ATCG	2	8	862353	862360	25 %	25 %	25 %	25 %	433659946
16606	NC_019971	AGTTG	2	10	862390	862399	20 %	40 %	40 %	0 %	433659946
16607	NC_019971	TGG	2	6	862411	862416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659946
16608	NC_019971	ATC	2	6	862455	862460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659946
16609	NC_019971	CCAAA	2	10	862469	862478	60 %	0 %	0 %	40 %	433659946
16610	NC_019971	GC	3	6	862507	862512	0 %	0 %	50 %	50 %	433659946
16611	NC_019971	GCA	2	6	862532	862537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659946
16612	NC_019971	GAT	2	6	862548	862553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659946
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16614	NC_019971	CGC	2	6	862634	862639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659946
16615	NC_019971	GC	3	6	862687	862692	0 %	0 %	50 %	50 %	433659946
16616	NC_019971	GTC	2	6	862698	862703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659946
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16618	NC_019971	CAG	2	6	862907	862912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659946
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