MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 63871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019955	AT	4	8	13	20	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019955	TA	4	8	27	34	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019955	TAT	2	6	52	57	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019955	ACT	2	6	66	71	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019955	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019955	TCT	2	6	110	115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019955	GTT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019955	T	6	6	276	281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019955	T	6	6	297	302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019955	GCA	2	6	408	413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656323
11	NC_019955	TCT	2	6	414	419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656323
12	NC_019955	ATCA	2	8	440	447	50 %	25 %	0 %	25 %	433656323
13	NC_019955	TCT	2	6	480	485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656323
14	NC_019955	TGC	2	6	596	601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656323
15	NC_019955	GTGG	2	8	641	648	0 %	25 %	75 %	0 %	433656323
16	NC_019955	GGTT	2	8	696	703	0 %	50 %	50 %	0 %	433656323
17	NC_019955	CAC	2	6	769	774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656323
18	NC_019955	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656323
19	NC_019955	CTT	2	6	807	812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_019955	ATT	2	6	909	914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656324
21	NC_019955	GAAGA	2	10	929	938	60 %	0 %	40 %	0 %	433656324
22	NC_019955	GTC	2	6	952	957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
23	NC_019955	TGC	2	6	989	994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
24	NC_019955	GCT	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
25	NC_019955	GAC	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
26	NC_019955	GC	3	6	1108	1113	0 %	0 %	50 %	50 %	433656324
27	NC_019955	GGT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656324
28	NC_019955	TTG	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656324
29	NC_019955	GTCG	2	8	1348	1355	0 %	25 %	50 %	25 %	433656324
30	NC_019955	CCA	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
31	NC_019955	T	6	6	1425	1430	0 %	100 %	0 %	0 %	433656324
32	NC_019955	TCA	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656324
33	NC_019955	CAG	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
34	NC_019955	GAT	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656324
35	NC_019955	GCA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
36	NC_019955	GAC	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
37	NC_019955	CTT	2	6	1656	1661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656324
38	NC_019955	GAT	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656324
39	NC_019955	TCT	2	6	1736	1741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656324
40	NC_019955	CCA	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
41	NC_019955	TGC	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
42	NC_019955	GCT	2	6	1853	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
43	NC_019955	ATCA	2	8	1873	1880	50 %	25 %	0 %	25 %	433656324
44	NC_019955	GCT	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
45	NC_019955	TTGG	2	8	2182	2189	0 %	50 %	50 %	0 %	433656324
46	NC_019955	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656324
47	NC_019955	ACC	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
48	NC_019955	ATTA	2	8	2311	2318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019955	CAAAAA	2	12	2336	2347	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_019955	GCC	2	6	2360	2365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_019955	GT	3	6	2395	2400	0 %	50 %	50 %	0 %	433656325
52	NC_019955	T	6	6	2406	2411	0 %	100 %	0 %	0 %	433656325
53	NC_019955	ACCA	2	8	2464	2471	50 %	0 %	0 %	50 %	433656325
54	NC_019955	GAA	2	6	2493	2498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
55	NC_019955	AAG	4	12	2500	2511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
56	NC_019955	TCT	2	6	2540	2545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656325
57	NC_019955	GTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
58	NC_019955	TCT	2	6	2579	2584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656325
59	NC_019955	AGT	2	6	2611	2616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
60	NC_019955	GTA	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
61	NC_019955	GAA	2	6	2664	2669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
62	NC_019955	CTTTCT	2	12	2771	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656325
63	NC_019955	CAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656325
64	NC_019955	GTC	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
65	NC_019955	CAC	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
66	NC_019955	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
67	NC_019955	AGCA	2	8	2985	2992	50 %	0 %	25 %	25 %	433656325
68	NC_019955	GTGA	2	8	2993	3000	25 %	25 %	50 %	0 %	433656325
69	NC_019955	AGCC	2	8	3022	3029	25 %	0 %	25 %	50 %	433656325
70	NC_019955	CTAGGT	2	12	3041	3052	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433656325
71	NC_019955	CTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
72	NC_019955	TTG	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
73	NC_019955	TACG	2	8	3152	3159	25 %	25 %	25 %	25 %	433656325
74	NC_019955	AGC	2	6	3228	3233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656325
75	NC_019955	AGT	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
76	NC_019955	TGC	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
77	NC_019955	T	6	6	3324	3329	0 %	100 %	0 %	0 %	433656325
78	NC_019955	ACC	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
79	NC_019955	GTT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
80	NC_019955	GTT	2	6	3453	3458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
81	NC_019955	GCT	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
82	NC_019955	CAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656325
83	NC_019955	TGA	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
84	NC_019955	TGA	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
85	NC_019955	CAG	2	6	3728	3733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656325
86	NC_019955	CCA	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
87	NC_019955	TCGA	2	8	3778	3785	25 %	25 %	25 %	25 %	433656325
88	NC_019955	TCA	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656325
89	NC_019955	TGC	2	6	3887	3892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
90	NC_019955	TTGA	2	8	3893	3900	25 %	50 %	25 %	0 %	433656325
91	NC_019955	TTG	2	6	3945	3950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
92	NC_019955	AAGA	2	8	3958	3965	75 %	0 %	25 %	0 %	433656325
93	NC_019955	GTTA	2	8	4012	4019	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019955	TGG	2	6	4040	4045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019955	C	6	6	4058	4063	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96	NC_019955	TTCA	2	8	4064	4071	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019955	GATAAA	2	12	4213	4224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019955	AAC	2	6	4280	4285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656326
99	NC_019955	GC	3	6	4314	4319	0 %	0 %	50 %	50 %	433656326
100	NC_019955	TTC	2	6	4322	4327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656326
101	NC_019955	CAA	2	6	4335	4340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656326
102	NC_019955	TTTG	2	8	4345	4352	0 %	75 %	25 %	0 %	433656326
103	NC_019955	CGAC	2	8	4409	4416	25 %	0 %	25 %	50 %	433656326
104	NC_019955	ATG	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656326
105	NC_019955	ATT	2	6	4606	4611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656327
106	NC_019955	GC	3	6	4619	4624	0 %	0 %	50 %	50 %	433656327
107	NC_019955	ACG	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656327
108	NC_019955	AGT	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019955	AAG	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019955	TA	3	6	4824	4829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019955	GAA	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019955	CAA	2	6	4852	4857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019955	CCGG	2	8	4917	4924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019955	T	6	6	5010	5015	0 %	100 %	0 %	0 %	433656328
115	NC_019955	CGA	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656328
116	NC_019955	CTT	2	6	5108	5113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
117	NC_019955	GT	3	6	5130	5135	0 %	50 %	50 %	0 %	433656328
118	NC_019955	ACC	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656328
119	NC_019955	CTT	2	6	5169	5174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
120	NC_019955	GA	3	6	5182	5187	50 %	0 %	50 %	0 %	433656328
121	NC_019955	TCA	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
122	NC_019955	GCT	3	9	5282	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
123	NC_019955	CCA	2	6	5293	5298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656328
124	NC_019955	ATC	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
125	NC_019955	CTG	2	6	5355	5360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
126	NC_019955	TTC	2	6	5383	5388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
127	NC_019955	CACG	2	8	5393	5400	25 %	0 %	25 %	50 %	433656328
128	NC_019955	AAAC	2	8	5465	5472	75 %	0 %	0 %	25 %	433656328
129	NC_019955	GTC	2	6	5535	5540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
130	NC_019955	TCG	2	6	5557	5562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
131	NC_019955	GAT	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656328
132	NC_019955	ATC	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
133	NC_019955	GTAC	2	8	5722	5729	25 %	25 %	25 %	25 %	433656329
134	NC_019955	CAC	3	9	5777	5785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656329
135	NC_019955	AGT	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656329
136	NC_019955	TCA	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656329
137	NC_019955	CCGA	2	8	6003	6010	25 %	0 %	25 %	50 %	433656329
138	NC_019955	GAT	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656329
139	NC_019955	GCA	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656329
140	NC_019955	CCA	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656329
141	NC_019955	TAA	2	6	6162	6167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656329
142	NC_019955	GAA	2	6	6203	6208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656329
143	NC_019955	GCA	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656329
144	NC_019955	AAATC	2	10	6375	6384	60 %	20 %	0 %	20 %	433656329
145	NC_019955	AGAAA	2	10	6409	6418	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019955	AATG	2	8	6430	6437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019955	CCAG	2	8	6668	6675	25 %	0 %	25 %	50 %	433656330
148	NC_019955	CAT	2	6	6759	6764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656330
149	NC_019955	GTA	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656330
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151	NC_019955	CAAA	2	8	7032	7039	75 %	0 %	0 %	25 %	433656330
152	NC_019955	ATA	2	6	7253	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656330
153	NC_019955	TAC	2	6	7285	7290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_019955	GTTA	2	8	7292	7299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019955	TAAA	2	8	7307	7314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_019955	AG	3	6	7339	7344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019955	TAA	2	6	7345	7350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_019955	ATA	2	6	7368	7373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019955	AGG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019955	A	6	6	7428	7433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019955	GAAA	2	8	7443	7450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_019955	ATA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_019955	TG	3	6	7512	7517	0 %	50 %	50 %	0 %	433656331
164	NC_019955	GT	3	6	7535	7540	0 %	50 %	50 %	0 %	433656331
165	NC_019955	AAT	2	6	7562	7567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656331
166	NC_019955	TCG	2	6	7597	7602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656331
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169	NC_019955	CGG	2	6	7963	7968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656332
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172	NC_019955	GCG	2	6	8142	8147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656332
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174	NC_019955	GGT	2	6	8199	8204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656332
175	NC_019955	AAC	2	6	8259	8264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656332
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183	NC_019955	ATC	2	6	8475	8480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656332
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237	NC_019955	TAT	2	6	10923	10928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656334
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242	NC_019955	GA	3	6	11345	11350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
243	NC_019955	GAC	2	6	11446	11451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656335
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250	NC_019955	TGG	2	6	11655	11660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656335
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252	NC_019955	GTA	2	6	11719	11724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656335
253	NC_019955	CCAT	2	8	11753	11760	25 %	25 %	0 %	50 %	433656335
254	NC_019955	TGA	2	6	11970	11975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656335
255	NC_019955	CAAG	2	8	11988	11995	50 %	0 %	25 %	25 %	433656335
256	NC_019955	GGT	2	6	12013	12018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656335
257	NC_019955	CGTT	2	8	12026	12033	0 %	50 %	25 %	25 %	433656335
258	NC_019955	CAA	2	6	12048	12053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656335
259	NC_019955	ATC	2	6	12061	12066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656335
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261	NC_019955	CAA	2	6	12168	12173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656335
262	NC_019955	TGG	2	6	12189	12194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656335
263	NC_019955	AAG	2	6	12254	12259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656335
264	NC_019955	GAA	2	6	12267	12272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656335
265	NC_019955	CGA	2	6	12294	12299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656335
266	NC_019955	GTT	2	6	12322	12327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656335
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268	NC_019955	TCT	2	6	12382	12387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656335
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273	NC_019955	CT	3	6	12607	12612	0 %	50 %	0 %	50 %	433656335
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398	NC_019955	CTT	2	6	18662	18667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656340
399	NC_019955	AAC	2	6	18687	18692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656340
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401	NC_019955	TTC	2	6	18924	18929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656340
402	NC_019955	GTTT	2	8	18955	18962	0 %	75 %	25 %	0 %	433656340
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495	NC_019955	ACTG	2	8	23689	23696	25 %	25 %	25 %	25 %	433656344
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