MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 63871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_019955	GACA	2	8	2529632	2529639	50 %	0 %	25 %	25 %	433658524
49003	NC_019955	A	6	6	2529756	2529761	100 %	0 %	0 %	0 %	433658524
49004	NC_019955	GGA	2	6	2529824	2529829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433658524
49005	NC_019955	TGAAA	2	10	2529848	2529857	60 %	20 %	20 %	0 %	433658524
49006	NC_019955	CAG	2	6	2529860	2529865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658524
49007	NC_019955	A	6	6	2529903	2529908	100 %	0 %	0 %	0 %	433658524
49008	NC_019955	TGA	2	6	2529978	2529983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49009	NC_019955	TAG	2	6	2530178	2530183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433658525
49010	NC_019955	CTT	2	6	2530242	2530247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433658525
49011	NC_019955	TAAA	2	8	2530350	2530357	75 %	25 %	0 %	0 %	433658525
49012	NC_019955	CCA	2	6	2530392	2530397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433658525
49013	NC_019955	GTT	2	6	2530540	2530545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433658526
49014	NC_019955	GAA	2	6	2530700	2530705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433658526
49015	NC_019955	TCT	2	6	2530719	2530724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433658526
49016	NC_019955	CGA	2	6	2530798	2530803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658526
49017	NC_019955	TCT	2	6	2530899	2530904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433658526
49018	NC_019955	CTT	2	6	2530909	2530914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433658526
49019	NC_019955	TTG	2	6	2530949	2530954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433658526
49020	NC_019955	TAA	2	6	2530967	2530972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433658526
49021	NC_019955	CTGGA	2	10	2530973	2530982	20 %	20 %	40 %	20 %	433658526
49022	NC_019955	CAC	2	6	2531087	2531092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49023	NC_019955	TGTT	2	8	2531120	2531127	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49024	NC_019955	TGG	2	6	2531134	2531139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49025	NC_019955	T	6	6	2531162	2531167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49026	NC_019955	TAT	2	6	2531179	2531184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49027	NC_019955	TAA	2	6	2531211	2531216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49028	NC_019955	AGTTAT	2	12	2531229	2531240	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49029	NC_019955	ACG	2	6	2531325	2531330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49030	NC_019955	ACA	2	6	2531422	2531427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433658527
49031	NC_019955	CTTT	2	8	2531457	2531464	0 %	75 %	0 %	25 %	433658527
49032	NC_019955	T	6	6	2531462	2531467	0 %	100 %	0 %	0 %	433658527
49033	NC_019955	A	6	6	2531480	2531485	100 %	0 %	0 %	0 %	433658527
49034	NC_019955	GTGA	2	8	2531501	2531508	25 %	25 %	50 %	0 %	433658527
49035	NC_019955	GAA	2	6	2531540	2531545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433658527
49036	NC_019955	ATC	2	6	2531546	2531551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658527
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49038	NC_019955	TAC	2	6	2531606	2531611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658527
49039	NC_019955	GTG	2	6	2531729	2531734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433658527
49040	NC_019955	CT	3	6	2531776	2531781	0 %	50 %	0 %	50 %	433658527
49041	NC_019955	GAA	2	6	2531783	2531788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433658527
49042	NC_019955	ATT	2	6	2531818	2531823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433658527
49043	NC_019955	CTG	3	9	2531834	2531842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433658527
49044	NC_019955	CAT	3	9	2531854	2531862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658527
49045	NC_019955	GCT	2	6	2531914	2531919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433658527
49046	NC_019955	GAA	2	6	2531924	2531929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433658527
49047	NC_019955	CT	3	6	2531930	2531935	0 %	50 %	0 %	50 %	433658527
49048	NC_019955	CGA	2	6	2531947	2531952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658527
49049	NC_019955	A	6	6	2531960	2531965	100 %	0 %	0 %	0 %	433658527
49050	NC_019955	GTTT	2	8	2532007	2532014	0 %	75 %	25 %	0 %	433658527
49051	NC_019955	GC	3	6	2532024	2532029	0 %	0 %	50 %	50 %	433658527
49052	NC_019955	ATT	2	6	2532098	2532103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433658527
49053	NC_019955	AC	3	6	2532123	2532128	50 %	0 %	0 %	50 %	433658527
49054	NC_019955	GTC	2	6	2532139	2532144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433658527
49055	NC_019955	AAC	2	6	2532219	2532224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433658527
49056	NC_019955	TCGATA	2	12	2532261	2532272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	433658527
49057	NC_019955	TCA	2	6	2532301	2532306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658527
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49059	NC_019955	CTG	2	6	2532353	2532358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433658527
49060	NC_019955	ATC	2	6	2532371	2532376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658527
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49062	NC_019955	CAT	2	6	2532403	2532408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658527
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49064	NC_019955	AACC	2	8	2532473	2532480	50 %	0 %	0 %	50 %	433658527
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49067	NC_019955	AAG	2	6	2532651	2532656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433658527
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49075	NC_019955	GCTTT	2	10	2533116	2533125	0 %	60 %	20 %	20 %	433658527
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49077	NC_019955	TGA	2	6	2533186	2533191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433658527
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49091	NC_019955	GATT	2	8	2533968	2533975	25 %	50 %	25 %	0 %	433658528
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49100	NC_019955	CT	4	8	2534372	2534379	0 %	50 %	0 %	50 %	433658528
49101	NC_019955	GCA	2	6	2534398	2534403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658528
49102	NC_019955	GC	3	6	2534475	2534480	0 %	0 %	50 %	50 %	433658528
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49105	NC_019955	TTAC	2	8	2534687	2534694	25 %	50 %	0 %	25 %	433658529
49106	NC_019955	AAAG	2	8	2534700	2534707	75 %	0 %	25 %	0 %	433658529
49107	NC_019955	GTG	2	6	2534817	2534822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433658529
49108	NC_019955	CCA	2	6	2534827	2534832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433658529
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49112	NC_019955	TCGAAG	2	12	2535112	2535123	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	433658529
49113	NC_019955	GCT	2	6	2535163	2535168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433658529
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49469	NC_019955	AAC	2	6	2550631	2550636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433658542
49470	NC_019955	CTT	2	6	2550648	2550653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433658542
49471	NC_019955	AG	3	6	2550656	2550661	50 %	0 %	50 %	0 %	433658542
49472	NC_019955	CAC	2	6	2550690	2550695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433658542
49473	NC_019955	ATG	2	6	2550704	2550709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433658542
49474	NC_019955	T	6	6	2550729	2550734	0 %	100 %	0 %	0 %	433658542
49475	NC_019955	GAGCAA	2	12	2550741	2550752	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	433658542
49476	NC_019955	GAATT	2	10	2550761	2550770	40 %	40 %	20 %	0 %	433658542
49477	NC_019955	ACC	2	6	2550772	2550777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433658542
49478	NC_019955	GA	3	6	2550838	2550843	50 %	0 %	50 %	0 %	433658542
49479	NC_019955	TAA	2	6	2550858	2550863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433658542
49480	NC_019955	ATA	2	6	2550866	2550871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433658542
49481	NC_019955	TAT	3	9	2550902	2550910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49482	NC_019955	TCTT	2	8	2550930	2550937	0 %	75 %	0 %	25 %	433658543
49483	NC_019955	GAA	3	9	2550954	2550962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433658543
49484	NC_019955	CTG	2	6	2551087	2551092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433658543
49485	NC_019955	ATC	2	6	2551124	2551129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658543
49486	NC_019955	GCAT	2	8	2551179	2551186	25 %	25 %	25 %	25 %	433658543
49487	NC_019955	TGT	2	6	2551195	2551200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433658543
49488	NC_019955	GAT	2	6	2551238	2551243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433658543
49489	NC_019955	TCA	2	6	2551254	2551259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658543
49490	NC_019955	ATC	2	6	2551277	2551282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658543
49491	NC_019955	TCT	2	6	2551335	2551340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433658543
49492	NC_019955	CAA	2	6	2551633	2551638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433658543
49493	NC_019955	TCT	2	6	2551680	2551685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433658543
49494	NC_019955	CAT	2	6	2551715	2551720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658543
49495	NC_019955	GCA	2	6	2551779	2551784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658543
49496	NC_019955	ACT	2	6	2551944	2551949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658543
49497	NC_019955	GCA	2	6	2552010	2552015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658543
49498	NC_019955	ATA	2	6	2552022	2552027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433658543
49499	NC_019955	CCAT	2	8	2552046	2552053	25 %	25 %	0 %	50 %	433658543
49500	NC_019955	CTA	2	6	2552056	2552061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658543

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