MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 63871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_019955	GAT	2	6	2375102	2375107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46002	NC_019955	CAA	2	6	2375160	2375165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46003	NC_019955	CA	3	6	2375251	2375256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46004	NC_019955	GAT	2	6	2375325	2375330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46005	NC_019955	CATT	2	8	2375763	2375770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46006	NC_019955	AGA	2	6	2375837	2375842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46007	NC_019955	TTC	2	6	2375847	2375852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46008	NC_019955	TTAA	2	8	2375893	2375900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46009	NC_019955	T	6	6	2376016	2376021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46010	NC_019955	TTA	2	6	2376030	2376035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46011	NC_019955	AAGA	2	8	2376081	2376088	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46012	NC_019955	GCA	2	6	2376125	2376130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46013	NC_019955	CTA	2	6	2376137	2376142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46014	NC_019955	CAT	2	6	2376157	2376162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46015	NC_019955	ATA	2	6	2376165	2376170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46016	NC_019955	ATC	2	6	2376223	2376228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46017	NC_019955	TCA	2	6	2376346	2376351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46018	NC_019955	TGA	2	6	2376361	2376366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46019	NC_019955	ATCA	2	8	2376401	2376408	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46020	NC_019955	CTG	2	6	2376479	2376484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46021	NC_019955	T	8	8	2376537	2376544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46022	NC_019955	TAA	2	6	2376557	2376562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46023	NC_019955	ATT	3	9	2376571	2376579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46024	NC_019955	TGA	2	6	2376615	2376620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46025	NC_019955	TC	3	6	2376655	2376660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46026	NC_019955	ACC	2	6	2376694	2376699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46027	NC_019955	ATG	2	6	2376709	2376714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46028	NC_019955	TTA	2	6	2376727	2376732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46029	NC_019955	AGC	2	6	2376786	2376791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658400
46030	NC_019955	AGA	3	9	2376940	2376948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433658400
46031	NC_019955	CGTG	2	8	2377086	2377093	0 %	25 %	50 %	25 %	433658401
46032	NC_019955	GAAC	2	8	2377099	2377106	50 %	0 %	25 %	25 %	433658401
46033	NC_019955	TCAC	2	8	2377167	2377174	25 %	25 %	0 %	50 %	433658401
46034	NC_019955	TCG	2	6	2377218	2377223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433658401
46035	NC_019955	TCA	2	6	2377244	2377249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658401
46036	NC_019955	TCA	2	6	2377277	2377282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658401
46037	NC_019955	TTCA	2	8	2377483	2377490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46038	NC_019955	CAG	2	6	2377524	2377529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46039	NC_019955	A	6	6	2377550	2377555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46040	NC_019955	T	7	7	2377575	2377581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46041	NC_019955	TGAG	2	8	2377587	2377594	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46042	NC_019955	GT	3	6	2377612	2377617	0 %	50 %	50 %	0 %	433658402
46043	NC_019955	CAG	2	6	2377676	2377681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658402
46044	NC_019955	GCA	2	6	2377714	2377719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658402
46045	NC_019955	TTC	2	6	2377749	2377754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433658402
46046	NC_019955	TCA	2	6	2377795	2377800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658402
46047	NC_019955	TGA	2	6	2377807	2377812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433658402
46048	NC_019955	TAGCAT	2	12	2377874	2377885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	433658402
46049	NC_019955	ATC	2	6	2377935	2377940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658402
46050	NC_019955	CA	3	6	2377954	2377959	50 %	0 %	0 %	50 %	433658402
46051	NC_019955	GAAT	2	8	2377963	2377970	50 %	25 %	25 %	0 %	433658402
46052	NC_019955	GAA	2	6	2377973	2377978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433658402
46053	NC_019955	AAAG	2	8	2378060	2378067	75 %	0 %	25 %	0 %	433658402
46054	NC_019955	CAA	2	6	2378068	2378073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433658402
46055	NC_019955	GAA	2	6	2378084	2378089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433658402
46056	NC_019955	CATCG	2	10	2378132	2378141	20 %	20 %	20 %	40 %	433658402
46057	NC_019955	CGGT	2	8	2378151	2378158	0 %	25 %	50 %	25 %	433658402
46058	NC_019955	CGA	2	6	2378224	2378229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658402
46059	NC_019955	TCT	2	6	2378286	2378291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433658402
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46061	NC_019955	CAAC	2	8	2378323	2378330	50 %	0 %	0 %	50 %	433658402
46062	NC_019955	TCT	2	6	2378359	2378364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433658402
46063	NC_019955	CTT	2	6	2378413	2378418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433658402
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46065	NC_019955	GCT	2	6	2378559	2378564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433658402
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46069	NC_019955	TGC	2	6	2378816	2378821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433658402
46070	NC_019955	CAA	2	6	2378896	2378901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433658402
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46072	NC_019955	GCA	2	6	2378979	2378984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658402
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46076	NC_019955	AGCG	2	8	2379245	2379252	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46077	NC_019955	TA	3	6	2379432	2379437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46078	NC_019955	GT	3	6	2379456	2379461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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46080	NC_019955	ATC	2	6	2379619	2379624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46087	NC_019955	TTTCA	2	10	2380072	2380081	20 %	60 %	0 %	20 %	433658404
46088	NC_019955	TGTTA	2	10	2380100	2380109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46089	NC_019955	TAAT	2	8	2380118	2380125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46090	NC_019955	GAA	2	6	2380187	2380192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46091	NC_019955	CAT	2	6	2380223	2380228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658405
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46093	NC_019955	TC	3	6	2380354	2380359	0 %	50 %	0 %	50 %	433658405
46094	NC_019955	AACC	2	8	2380408	2380415	50 %	0 %	0 %	50 %	433658405
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46102	NC_019955	TAAC	2	8	2380978	2380985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46103	NC_019955	TAA	2	6	2380988	2380993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46104	NC_019955	TCT	2	6	2381024	2381029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46105	NC_019955	ACG	2	6	2381053	2381058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46106	NC_019955	AGT	2	6	2381063	2381068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46108	NC_019955	TGC	2	6	2381152	2381157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433658406
46109	NC_019955	TCGT	2	8	2381173	2381180	0 %	50 %	25 %	25 %	433658406
46110	NC_019955	GTT	2	6	2381223	2381228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433658406
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46112	NC_019955	CGT	2	6	2381433	2381438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433658406
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46118	NC_019955	TCGT	2	8	2381896	2381903	0 %	50 %	25 %	25 %	433658406
46119	NC_019955	ACCT	2	8	2381938	2381945	25 %	25 %	0 %	50 %	433658406
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46121	NC_019955	TGGCGC	2	12	2382083	2382094	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433658406
46122	NC_019955	ACT	2	6	2382112	2382117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433658406
46123	NC_019955	AGA	2	6	2382158	2382163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433658406
46124	NC_019955	ACGTA	2	10	2382167	2382176	40 %	20 %	20 %	20 %	433658406
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46126	NC_019955	GTT	2	6	2382357	2382362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433658406
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46133	NC_019955	TTG	2	6	2382691	2382696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433658406
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46135	NC_019955	TAAA	2	8	2382742	2382749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46136	NC_019955	AGG	2	6	2382874	2382879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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46191	NC_019955	CGG	3	9	2385442	2385450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433658410
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46198	NC_019955	TACA	2	8	2385644	2385651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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46203	NC_019955	AAT	2	6	2385753	2385758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46231	NC_019955	TC	3	6	2387197	2387202	0 %	50 %	0 %	50 %	433658411
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46235	NC_019955	GCA	2	6	2387685	2387690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658411
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46239	NC_019955	GCA	2	6	2388031	2388036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433658411
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46242	NC_019955	ATG	2	6	2388126	2388131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433658411
46243	NC_019955	TGA	2	6	2388200	2388205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433658411
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46247	NC_019955	CT	3	6	2388543	2388548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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46330	NC_019955	AGTG	2	8	2392935	2392942	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46331	NC_019955	AT	3	6	2392957	2392962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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46349	NC_019955	GAG	2	6	2394249	2394254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46350	NC_019955	CA	3	6	2394282	2394287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46351	NC_019955	TAA	2	6	2394384	2394389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46352	NC_019955	CA	3	6	2394406	2394411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46353	NC_019955	ACT	2	6	2394416	2394421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46354	NC_019955	TA	3	6	2394511	2394516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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