MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 63871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019955	AGC	2	6	199348	199353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656500
4002	NC_019955	CAATC	2	10	199388	199397	40 %	20 %	0 %	40 %	433656500
4003	NC_019955	A	6	6	199416	199421	100 %	0 %	0 %	0 %	433656500
4004	NC_019955	AGA	2	6	199459	199464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656500
4005	NC_019955	G	6	6	199514	199519	0 %	0 %	100 %	0 %	433656500
4006	NC_019955	GAT	2	6	199568	199573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656500
4007	NC_019955	AAAC	2	8	199579	199586	75 %	0 %	0 %	25 %	433656500
4008	NC_019955	TAC	2	6	199590	199595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656500
4009	NC_019955	ACTTTG	2	12	199599	199610	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433656500
4010	NC_019955	T	6	6	199633	199638	0 %	100 %	0 %	0 %	433656500
4011	NC_019955	T	6	6	199659	199664	0 %	100 %	0 %	0 %	433656500
4012	NC_019955	T	6	6	199693	199698	0 %	100 %	0 %	0 %	433656500
4013	NC_019955	AGAT	2	8	199818	199825	50 %	25 %	25 %	0 %	433656500
4014	NC_019955	TCC	2	6	199837	199842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433656500
4015	NC_019955	GAA	2	6	199843	199848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656500
4016	NC_019955	AC	3	6	199850	199855	50 %	0 %	0 %	50 %	433656500
4017	NC_019955	AAG	2	6	199872	199877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656500
4018	NC_019955	G	7	7	199883	199889	0 %	0 %	100 %	0 %	433656500
4019	NC_019955	ATT	2	6	199940	199945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656500
4020	NC_019955	TGA	3	9	199990	199998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656500
4021	NC_019955	A	6	6	200044	200049	100 %	0 %	0 %	0 %	433656500
4022	NC_019955	AGA	2	6	200102	200107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656500
4023	NC_019955	TCA	2	6	200212	200217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656500
4024	NC_019955	AAC	2	6	200246	200251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656500
4025	NC_019955	AGGT	2	8	200260	200267	25 %	25 %	50 %	0 %	433656500
4026	NC_019955	GAA	2	6	200281	200286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656500
4027	NC_019955	TGC	2	6	200308	200313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656500
4028	NC_019955	CTT	2	6	200399	200404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656500
4029	NC_019955	TGC	2	6	200419	200424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656500
4030	NC_019955	GAATG	2	10	200431	200440	40 %	20 %	40 %	0 %	433656500
4031	NC_019955	AAT	2	6	200442	200447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656500
4032	NC_019955	AAG	2	6	200448	200453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_019955	CTT	2	6	200469	200474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_019955	CAT	2	6	200525	200530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_019955	CCT	2	6	200611	200616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433656501
4036	NC_019955	GA	3	6	200624	200629	50 %	0 %	50 %	0 %	433656501
4037	NC_019955	ATG	2	6	200645	200650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656501
4038	NC_019955	TTGAA	2	10	200666	200675	40 %	40 %	20 %	0 %	433656501
4039	NC_019955	GAT	2	6	200719	200724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656501
4040	NC_019955	GAT	2	6	200743	200748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656501
4041	NC_019955	GAC	2	6	200822	200827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656501
4042	NC_019955	GAAA	2	8	200837	200844	75 %	0 %	25 %	0 %	433656501
4043	NC_019955	TTA	2	6	200882	200887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656501
4044	NC_019955	CTG	2	6	200951	200956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656501
4045	NC_019955	CGA	2	6	200988	200993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656501
4046	NC_019955	A	6	6	200993	200998	100 %	0 %	0 %	0 %	433656501
4047	NC_019955	GAAAA	2	10	201039	201048	80 %	0 %	20 %	0 %	433656501
4048	NC_019955	CAA	2	6	201131	201136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656501
4049	NC_019955	AGA	2	6	201183	201188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656501
4050	NC_019955	AG	3	6	201225	201230	50 %	0 %	50 %	0 %	433656501
4051	NC_019955	TAA	2	6	201260	201265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656501
4052	NC_019955	TC	3	6	201317	201322	0 %	50 %	0 %	50 %	433656501
4053	NC_019955	TTTC	2	8	201375	201382	0 %	75 %	0 %	25 %	433656501
4054	NC_019955	CTG	2	6	201421	201426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656501
4055	NC_019955	ATC	2	6	201470	201475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656501
4056	NC_019955	A	8	8	201540	201547	100 %	0 %	0 %	0 %	433656501
4057	NC_019955	A	8	8	201556	201563	100 %	0 %	0 %	0 %	433656501
4058	NC_019955	AGTA	2	8	201576	201583	50 %	25 %	25 %	0 %	433656501
4059	NC_019955	GAA	2	6	201673	201678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656501
4060	NC_019955	CT	3	6	201710	201715	0 %	50 %	0 %	50 %	433656501
4061	NC_019955	GA	3	6	201775	201780	50 %	0 %	50 %	0 %	433656501
4062	NC_019955	TAC	2	6	201790	201795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656501
4063	NC_019955	TAA	2	6	201798	201803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656501
4064	NC_019955	AGC	2	6	201816	201821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656501
4065	NC_019955	GTG	2	6	201866	201871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656501
4066	NC_019955	GT	3	6	201899	201904	0 %	50 %	50 %	0 %	433656501
4067	NC_019955	AAG	2	6	201968	201973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656501
4068	NC_019955	TGGC	2	8	202001	202008	0 %	25 %	50 %	25 %	433656501
4069	NC_019955	TC	3	6	202061	202066	0 %	50 %	0 %	50 %	433656501
4070	NC_019955	AAC	2	6	202107	202112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656501
4071	NC_019955	TAGT	2	8	202149	202156	25 %	50 %	25 %	0 %	433656501
4072	NC_019955	TGA	2	6	202157	202162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_019955	TG	3	6	202206	202211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_019955	TGA	2	6	202237	202242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_019955	GTA	2	6	202280	202285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656502
4076	NC_019955	CTA	2	6	202288	202293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656502
4077	NC_019955	CTT	2	6	202315	202320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656502
4078	NC_019955	GCG	2	6	202442	202447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656502
4079	NC_019955	TGG	2	6	202490	202495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656502
4080	NC_019955	GT	3	6	202549	202554	0 %	50 %	50 %	0 %	433656502
4081	NC_019955	AAG	2	6	202784	202789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656502
4082	NC_019955	A	6	6	202849	202854	100 %	0 %	0 %	0 %	433656502
4083	NC_019955	CT	3	6	202893	202898	0 %	50 %	0 %	50 %	433656502
4084	NC_019955	CCA	2	6	202905	202910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656502
4085	NC_019955	CAT	2	6	202912	202917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656502
4086	NC_019955	GCT	2	6	202981	202986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656502
4087	NC_019955	GAT	2	6	203045	203050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656502
4088	NC_019955	GA	3	6	203104	203109	50 %	0 %	50 %	0 %	433656502
4089	NC_019955	GATA	2	8	203119	203126	50 %	25 %	25 %	0 %	433656502
4090	NC_019955	ATC	2	6	203189	203194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656502
4091	NC_019955	ATT	2	6	203196	203201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656502
4092	NC_019955	GCTT	2	8	203211	203218	0 %	50 %	25 %	25 %	433656502
4093	NC_019955	TTTC	2	8	203226	203233	0 %	75 %	0 %	25 %	433656502
4094	NC_019955	GCT	2	6	203277	203282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656502
4095	NC_019955	CCT	2	6	203332	203337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433656502
4096	NC_019955	TTCTT	2	10	203338	203347	0 %	80 %	0 %	20 %	433656502
4097	NC_019955	TAGA	2	8	203399	203406	50 %	25 %	25 %	0 %	433656502
4098	NC_019955	ACCATC	2	12	203408	203419	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	433656502
4099	NC_019955	GAC	2	6	203425	203430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656502
4100	NC_019955	T	6	6	203434	203439	0 %	100 %	0 %	0 %	433656502
4101	NC_019955	TGT	2	6	203554	203559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_019955	TAC	2	6	203568	203573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_019955	TGA	2	6	203631	203636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_019955	GAT	2	6	203655	203660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_019955	ACA	2	6	203665	203670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_019955	GT	3	6	203700	203705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_019955	TCTAT	2	10	203720	203729	20 %	60 %	0 %	20 %	433656503
4108	NC_019955	AGCG	2	8	203814	203821	25 %	0 %	50 %	25 %	433656503
4109	NC_019955	CAT	2	6	203847	203852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656503
4110	NC_019955	GAC	3	9	203861	203869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656503
4111	NC_019955	T	6	6	203883	203888	0 %	100 %	0 %	0 %	433656503
4112	NC_019955	TTTC	2	8	203903	203910	0 %	75 %	0 %	25 %	433656503
4113	NC_019955	CAC	2	6	204081	204086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656503
4114	NC_019955	GTT	2	6	204110	204115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656503
4115	NC_019955	TCA	2	6	204178	204183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656503
4116	NC_019955	GCA	2	6	204187	204192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656503
4117	NC_019955	TTG	2	6	204202	204207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656503
4118	NC_019955	CAG	2	6	204311	204316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656503
4119	NC_019955	TGC	2	6	204366	204371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656503
4120	NC_019955	CTT	2	6	204551	204556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656503
4121	NC_019955	GC	3	6	204558	204563	0 %	0 %	50 %	50 %	433656503
4122	NC_019955	ATC	2	6	204583	204588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656503
4123	NC_019955	T	6	6	204606	204611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_019955	AG	3	6	204623	204628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_019955	CCAA	2	8	204760	204767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4250	NC_019955	AG	3	6	211192	211197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_019955	GAT	2	6	211202	211207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656510
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4263	NC_019955	T	6	6	211885	211890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4271	NC_019955	AG	3	6	212123	212128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_019955	CCA	2	6	212135	212140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4355	NC_019955	T	6	6	217200	217205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4356	NC_019955	CG	3	6	217322	217327	0 %	0 %	50 %	50 %	433656518
4357	NC_019955	CAA	2	6	217441	217446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656518
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4361	NC_019955	ACA	2	6	217729	217734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656518
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4369	NC_019955	A	6	6	218144	218149	100 %	0 %	0 %	0 %	433656519
4370	NC_019955	ATG	2	6	218251	218256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656519
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4375	NC_019955	TGC	2	6	218564	218569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656519
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4497	NC_019955	GAT	2	6	225248	225253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656528
4498	NC_019955	TTAG	2	8	225338	225345	25 %	50 %	25 %	0 %	433656528
4499	NC_019955	TTA	2	6	225384	225389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656528
4500	NC_019955	GAT	2	6	225404	225409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656528

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