MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 63871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_019955	TTC	2	6	558303	558308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_019955	GAG	2	6	558376	558381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_019955	A	6	6	558382	558387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_019955	AGA	2	6	558431	558436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_019955	GGC	2	6	558465	558470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_019955	GGGC	2	8	558578	558585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11007	NC_019955	GCC	2	6	558624	558629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11008	NC_019955	TCA	2	6	558749	558754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_019955	CGA	2	6	558853	558858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_019955	TGG	2	6	558881	558886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_019955	ACG	2	6	558919	558924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_019955	ATG	2	6	558996	559001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_019955	GAT	2	6	559113	559118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_019955	TAA	2	6	559208	559213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_019955	A	6	6	559284	559289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_019955	GCG	2	6	559335	559340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_019955	TG	3	6	559436	559441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_019955	T	6	6	559465	559470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_019955	T	6	6	559491	559496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_019955	TTGG	2	8	559541	559548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_019955	AAAT	2	8	559555	559562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_019955	A	6	6	559582	559587	100 %	0 %	0 %	0 %	433656827
11023	NC_019955	TTA	2	6	559627	559632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656827
11024	NC_019955	CAT	2	6	559715	559720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656827
11025	NC_019955	A	6	6	559725	559730	100 %	0 %	0 %	0 %	433656827
11026	NC_019955	AAC	2	6	559822	559827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656827
11027	NC_019955	CAC	2	6	559877	559882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656827
11028	NC_019955	CTG	2	6	559965	559970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656827
11029	NC_019955	GGAAAT	2	12	559982	559993	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	433656827
11030	NC_019955	GCAC	2	8	560070	560077	25 %	0 %	25 %	50 %	433656827
11031	NC_019955	AC	3	6	560091	560096	50 %	0 %	0 %	50 %	433656827
11032	NC_019955	CAAT	2	8	560167	560174	50 %	25 %	0 %	25 %	433656827
11033	NC_019955	GCAG	2	8	560180	560187	25 %	0 %	50 %	25 %	433656827
11034	NC_019955	GTTGC	2	10	560232	560241	0 %	40 %	40 %	20 %	433656827
11035	NC_019955	GTG	2	6	560281	560286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656827
11036	NC_019955	TGG	2	6	560368	560373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656827
11037	NC_019955	CGT	2	6	560406	560411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656827
11038	NC_019955	AGA	2	6	560426	560431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656827
11039	NC_019955	ATC	2	6	560466	560471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656827
11040	NC_019955	TGA	2	6	560476	560481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656827
11041	NC_019955	AATC	2	8	560505	560512	50 %	25 %	0 %	25 %	433656827
11042	NC_019955	GATGA	2	10	560529	560538	40 %	20 %	40 %	0 %	433656827
11043	NC_019955	TATC	2	8	560548	560555	25 %	50 %	0 %	25 %	433656827
11044	NC_019955	ACAA	2	8	560723	560730	75 %	0 %	0 %	25 %	433656828
11045	NC_019955	GCG	2	6	560827	560832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656828
11046	NC_019955	TTC	2	6	560897	560902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656828
11047	NC_019955	ATT	2	6	560983	560988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656828
11048	NC_019955	GGT	2	6	560989	560994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656828
11049	NC_019955	TG	3	6	561188	561193	0 %	50 %	50 %	0 %	433656828
11050	NC_019955	TGGT	2	8	561254	561261	0 %	50 %	50 %	0 %	433656828
11051	NC_019955	GTT	2	6	561351	561356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656828
11052	NC_019955	ACA	2	6	561357	561362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656828
11053	NC_019955	TGG	2	6	561548	561553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656828
11054	NC_019955	CAT	2	6	561591	561596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656828
11055	NC_019955	TCGCA	2	10	561599	561608	20 %	20 %	20 %	40 %	433656828
11056	NC_019955	GTGA	2	8	561712	561719	25 %	25 %	50 %	0 %	433656828
11057	NC_019955	AAAAG	2	10	561817	561826	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_019955	AGC	2	6	561827	561832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_019955	GCT	2	6	561838	561843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_019955	TAA	2	6	561872	561877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656829
11061	NC_019955	TCGTT	2	10	561878	561887	0 %	60 %	20 %	20 %	433656829
11062	NC_019955	AGTT	2	8	561935	561942	25 %	50 %	25 %	0 %	433656829
11063	NC_019955	ATCA	2	8	561969	561976	50 %	25 %	0 %	25 %	433656829
11064	NC_019955	TCT	2	6	562004	562009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656829
11065	NC_019955	TTC	2	6	562308	562313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656829
11066	NC_019955	TCT	2	6	562353	562358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656829
11067	NC_019955	AAG	3	9	562388	562396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656829
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11071	NC_019955	GA	3	6	562613	562618	50 %	0 %	50 %	0 %	433656829
11072	NC_019955	TGGT	2	8	562624	562631	0 %	50 %	50 %	0 %	433656829
11073	NC_019955	CCG	2	6	562747	562752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656829
11074	NC_019955	GAT	2	6	562770	562775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656829
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11077	NC_019955	ATT	2	6	562870	562875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_019955	ATTT	2	8	562895	562902	25 %	75 %	0 %	0 %	433656830
11079	NC_019955	TGG	2	6	563084	563089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656830
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11081	NC_019955	GAT	2	6	563233	563238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656830
11082	NC_019955	CT	3	6	563272	563277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11083	NC_019955	AAG	2	6	563308	563313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_019955	TGT	2	6	563331	563336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_019955	ATC	2	6	563411	563416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_019955	TAA	2	6	563425	563430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_019955	CAAT	2	8	563434	563441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11088	NC_019955	CTGG	2	8	563465	563472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11089	NC_019955	ATT	2	6	563568	563573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656831
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11092	NC_019955	GAT	2	6	563701	563706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656831
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11095	NC_019955	GTTG	2	8	563818	563825	0 %	50 %	50 %	0 %	433656831
11096	NC_019955	TCG	2	6	563828	563833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656831
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11099	NC_019955	CAC	2	6	563892	563897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656831
11100	NC_019955	ACGC	2	8	563958	563965	25 %	0 %	25 %	50 %	433656831
11101	NC_019955	GTT	2	6	563980	563985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656831
11102	NC_019955	TGA	2	6	563991	563996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656831
11103	NC_019955	GTT	2	6	564114	564119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656831
11104	NC_019955	GAT	2	6	564172	564177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656831
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11107	NC_019955	TGG	2	6	564292	564297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656831
11108	NC_019955	GC	3	6	564358	564363	0 %	0 %	50 %	50 %	433656831
11109	NC_019955	TTCT	2	8	564421	564428	0 %	75 %	0 %	25 %	433656831
11110	NC_019955	CTT	2	6	564462	564467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656831
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11112	NC_019955	CTG	2	6	564558	564563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656831
11113	NC_019955	TGGT	3	12	564662	564673	0 %	50 %	50 %	0 %	433656831
11114	NC_019955	TCG	2	6	564674	564679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656831
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11118	NC_019955	T	6	6	564759	564764	0 %	100 %	0 %	0 %	433656831
11119	NC_019955	CTT	2	6	564960	564965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656831
11120	NC_019955	GGTA	2	8	565013	565020	25 %	25 %	50 %	0 %	433656831
11121	NC_019955	GAA	2	6	565147	565152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656831
11122	NC_019955	AG	3	6	565157	565162	50 %	0 %	50 %	0 %	433656831
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11124	NC_019955	TTTGT	2	10	565293	565302	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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11251	NC_019955	CGAT	2	8	572513	572520	25 %	25 %	25 %	25 %	433656838
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11362	NC_019955	GGC	2	6	579235	579240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11363	NC_019955	CGT	2	6	579274	579279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11365	NC_019955	GTAG	2	8	579416	579423	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11366	NC_019955	G	6	6	579434	579439	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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11368	NC_019955	GAT	2	6	579527	579532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11370	NC_019955	CCA	2	6	579691	579696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11494	NC_019955	AGTG	2	8	586351	586358	25 %	25 %	50 %	0 %	433656848
11495	NC_019955	TTAG	2	8	586369	586376	25 %	50 %	25 %	0 %	433656848
11496	NC_019955	CG	3	6	586395	586400	0 %	0 %	50 %	50 %	433656848
11497	NC_019955	ATG	2	6	586417	586422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656848
11498	NC_019955	T	6	6	586454	586459	0 %	100 %	0 %	0 %	433656848
11499	NC_019955	CGT	2	6	586598	586603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656848
11500	NC_019955	CTT	2	6	586613	586618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656848

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