MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 63871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_019955	TCA	2	6	329767	329772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656639
6502	NC_019955	CGT	2	6	329781	329786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656639
6503	NC_019955	GAA	2	6	329802	329807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656639
6504	NC_019955	GAT	2	6	329826	329831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656639
6505	NC_019955	TAA	2	6	329879	329884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656639
6506	NC_019955	CCA	2	6	329929	329934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656639
6507	NC_019955	GTG	2	6	329941	329946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656639
6508	NC_019955	CCAG	2	8	330002	330009	25 %	0 %	25 %	50 %	433656639
6509	NC_019955	AGC	2	6	330052	330057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656639
6510	NC_019955	TCG	2	6	330100	330105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656639
6511	NC_019955	TGG	2	6	330155	330160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656639
6512	NC_019955	CTT	2	6	330174	330179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656639
6513	NC_019955	TGAT	2	8	330201	330208	25 %	50 %	25 %	0 %	433656639
6514	NC_019955	CAA	2	6	330214	330219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656640
6515	NC_019955	A	6	6	330236	330241	100 %	0 %	0 %	0 %	433656640
6516	NC_019955	CGG	2	6	330312	330317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656640
6517	NC_019955	CGG	2	6	330345	330350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656640
6518	NC_019955	CGC	2	6	330403	330408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656640
6519	NC_019955	TGG	2	6	330420	330425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656640
6520	NC_019955	TGG	2	6	330519	330524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656640
6521	NC_019955	GCG	2	6	330551	330556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656640
6522	NC_019955	GGC	2	6	330592	330597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656640
6523	NC_019955	CAT	2	6	330706	330711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656640
6524	NC_019955	TGG	2	6	330771	330776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656640
6525	NC_019955	ATCC	2	8	330880	330887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6526	NC_019955	TCAA	2	8	330922	330929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6527	NC_019955	GCC	2	6	331033	331038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6528	NC_019955	GAGC	2	8	331084	331091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6529	NC_019955	GT	3	6	331280	331285	0 %	50 %	50 %	0 %	433656641
6530	NC_019955	TCGTCT	2	12	331296	331307	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	433656641
6531	NC_019955	AAC	2	6	331351	331356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656641
6532	NC_019955	GAA	2	6	331371	331376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656641
6533	NC_019955	ACG	2	6	331444	331449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656641
6534	NC_019955	ACA	2	6	331487	331492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656641
6535	NC_019955	CCG	2	6	331510	331515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656641
6536	NC_019955	TGG	2	6	331532	331537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656641
6537	NC_019955	CG	3	6	331541	331546	0 %	0 %	50 %	50 %	433656641
6538	NC_019955	CGA	2	6	331629	331634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656641
6539	NC_019955	AGCA	2	8	331659	331666	50 %	0 %	25 %	25 %	433656641
6540	NC_019955	ACC	2	6	331747	331752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656641
6541	NC_019955	GCC	2	6	331840	331845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656641
6542	NC_019955	A	6	6	331860	331865	100 %	0 %	0 %	0 %	433656641
6543	NC_019955	TGA	2	6	331905	331910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656641
6544	NC_019955	CAAG	2	8	331997	332004	50 %	0 %	25 %	25 %	433656641
6545	NC_019955	TGA	2	6	332022	332027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656641
6546	NC_019955	ACCC	2	8	332089	332096	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6547	NC_019955	GAT	2	6	332158	332163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656642
6548	NC_019955	GAC	2	6	332240	332245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656642
6549	NC_019955	TAT	2	6	332249	332254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656642
6550	NC_019955	TTTC	2	8	332288	332295	0 %	75 %	0 %	25 %	433656642
6551	NC_019955	TGGT	2	8	332412	332419	0 %	50 %	50 %	0 %	433656642
6552	NC_019955	TGC	3	9	332568	332576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656642
6553	NC_019955	CTG	2	6	332595	332600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656642
6554	NC_019955	TG	3	6	332613	332618	0 %	50 %	50 %	0 %	433656642
6555	NC_019955	GCA	2	6	332677	332682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656642
6556	NC_019955	TGT	2	6	332712	332717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656642
6557	NC_019955	CCA	2	6	332766	332771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656642
6558	NC_019955	TTTGAT	2	12	332804	332815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	433656642
6559	NC_019955	TGT	2	6	332853	332858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656642
6560	NC_019955	ACT	2	6	332863	332868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656642
6561	NC_019955	GCA	2	6	332916	332921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656642
6562	NC_019955	GGT	2	6	332955	332960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656642
6563	NC_019955	CCG	2	6	333011	333016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656642
6564	NC_019955	CAAC	2	8	333043	333050	50 %	0 %	0 %	50 %	433656642
6565	NC_019955	TTG	2	6	333158	333163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656642
6566	NC_019955	ATT	2	6	333230	333235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656642
6567	NC_019955	TAC	2	6	333276	333281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656642
6568	NC_019955	T	6	6	333314	333319	0 %	100 %	0 %	0 %	433656642
6569	NC_019955	TGC	2	6	333384	333389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656642
6570	NC_019955	CAGTAT	2	12	333401	333412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	433656642
6571	NC_019955	TGGC	2	8	333436	333443	0 %	25 %	50 %	25 %	433656642
6572	NC_019955	GTG	2	6	333455	333460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656642
6573	NC_019955	TGG	2	6	333550	333555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656642
6574	NC_019955	TACCT	2	10	333568	333577	20 %	40 %	0 %	40 %	433656642
6575	NC_019955	GATG	2	8	333610	333617	25 %	25 %	50 %	0 %	433656642
6576	NC_019955	GGT	2	6	333625	333630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656642
6577	NC_019955	TTG	3	9	333644	333652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656642
6578	NC_019955	GAT	2	6	333721	333726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656643
6579	NC_019955	TTGAG	2	10	333761	333770	20 %	40 %	40 %	0 %	433656643
6580	NC_019955	CATC	2	8	333852	333859	25 %	25 %	0 %	50 %	433656643
6581	NC_019955	ACA	2	6	333977	333982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656643
6582	NC_019955	GCA	2	6	334050	334055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656643
6583	NC_019955	GTT	2	6	334133	334138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656643
6584	NC_019955	A	7	7	334224	334230	100 %	0 %	0 %	0 %	433656643
6585	NC_019955	CAT	2	6	334270	334275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656643
6586	NC_019955	CTTTGT	2	12	334305	334316	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	433656643
6587	NC_019955	GGTG	2	8	334338	334345	0 %	25 %	75 %	0 %	433656643
6588	NC_019955	TTCG	2	8	334393	334400	0 %	50 %	25 %	25 %	433656643
6589	NC_019955	GCT	2	6	334402	334407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656643
6590	NC_019955	ATG	2	6	334413	334418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656643
6591	NC_019955	A	6	6	334427	334432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_019955	T	7	7	334453	334459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_019955	ATA	2	6	334589	334594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656644
6594	NC_019955	TTG	2	6	334629	334634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656644
6595	NC_019955	TCA	3	9	334676	334684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656644
6596	NC_019955	GCT	3	9	334710	334718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656644
6597	NC_019955	CGC	2	6	334738	334743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656644
6598	NC_019955	AAGT	2	8	334757	334764	50 %	25 %	25 %	0 %	433656644
6599	NC_019955	TTGC	2	8	334830	334837	0 %	50 %	25 %	25 %	433656644
6600	NC_019955	TC	3	6	334921	334926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6601	NC_019955	GTT	2	6	334970	334975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656645
6602	NC_019955	ACG	2	6	334986	334991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656645
6603	NC_019955	CAG	2	6	335013	335018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656645
6604	NC_019955	CAAG	2	8	335025	335032	50 %	0 %	25 %	25 %	433656645
6605	NC_019955	CGA	2	6	335144	335149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656645
6606	NC_019955	CGT	2	6	335159	335164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656645
6607	NC_019955	TCAG	2	8	335167	335174	25 %	25 %	25 %	25 %	433656645
6608	NC_019955	CGT	2	6	335208	335213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656645
6609	NC_019955	CCA	2	6	335376	335381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656645
6610	NC_019955	GAA	2	6	335394	335399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656645
6611	NC_019955	TAA	2	6	335415	335420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656645
6612	NC_019955	CAC	2	6	335434	335439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656645
6613	NC_019955	CCA	2	6	335454	335459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656645
6614	NC_019955	AGA	2	6	335477	335482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656645
6615	NC_019955	ATG	2	6	335494	335499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656645
6616	NC_019955	CCA	2	6	335526	335531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656645
6617	NC_019955	CAA	2	6	335547	335552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656645
6618	NC_019955	AAAC	2	8	335567	335574	75 %	0 %	0 %	25 %	433656645
6619	NC_019955	TGC	2	6	335652	335657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656645
6620	NC_019955	GACC	2	8	335675	335682	25 %	0 %	25 %	50 %	433656645
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6622	NC_019955	ATC	2	6	335691	335696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656645
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6990	NC_019955	GTG	2	6	353299	353304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6991	NC_019955	ACAA	2	8	353308	353315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6992	NC_019955	ATTGA	2	10	353362	353371	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6993	NC_019955	ACT	3	9	353385	353393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6994	NC_019955	TTG	2	6	353409	353414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6995	NC_019955	GAC	2	6	353489	353494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6996	NC_019955	CGT	3	9	353592	353600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6997	NC_019955	GGT	2	6	353679	353684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656664
6998	NC_019955	TTTA	2	8	353705	353712	25 %	75 %	0 %	0 %	433656664
6999	NC_019955	GAA	2	6	353805	353810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656664
7000	NC_019955	AGA	2	6	353873	353878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656664

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