MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_017270	AT	3	6	2528456	2528461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48502	NC_017270	TGC	2	6	2528533	2528538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48503	NC_017270	CAT	2	6	2528579	2528584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48504	NC_017270	GTA	2	6	2528736	2528741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48505	NC_017270	TCC	2	6	2528826	2528831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48506	NC_017270	ATTTA	2	10	2528846	2528855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48507	NC_017270	CTG	2	6	2528999	2529004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425443
48508	NC_017270	TCTG	2	8	2529007	2529014	0 %	50 %	25 %	25 %	384425443
48509	NC_017270	GGC	2	6	2529127	2529132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425443
48510	NC_017270	CG	3	6	2529211	2529216	0 %	0 %	50 %	50 %	384425443
48511	NC_017270	TTG	2	6	2529270	2529275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425443
48512	NC_017270	TCT	2	6	2529355	2529360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425443
48513	NC_017270	ATGAA	2	10	2529396	2529405	60 %	20 %	20 %	0 %	384425443
48514	NC_017270	CAA	2	6	2529430	2529435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425443
48515	NC_017270	TGG	2	6	2529453	2529458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425443
48516	NC_017270	ATG	2	6	2529516	2529521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425443
48517	NC_017270	ATG	2	6	2529768	2529773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425443
48518	NC_017270	ACCAA	2	10	2529774	2529783	60 %	0 %	0 %	40 %	384425443
48519	NC_017270	TGA	2	6	2529871	2529876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425443
48520	NC_017270	GTA	2	6	2530072	2530077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48521	NC_017270	G	6	6	2530140	2530145	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48522	NC_017270	T	6	6	2530147	2530152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48523	NC_017270	CAT	2	6	2530210	2530215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425444
48524	NC_017270	GAGTTG	2	12	2530241	2530252	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384425444
48525	NC_017270	CGG	2	6	2530411	2530416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425444
48526	NC_017270	GAA	2	6	2530432	2530437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425444
48527	NC_017270	AAG	2	6	2530509	2530514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425444
48528	NC_017270	CG	3	6	2530519	2530524	0 %	0 %	50 %	50 %	384425444
48529	NC_017270	GTC	2	6	2530635	2530640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425444
48530	NC_017270	AAC	2	6	2530727	2530732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425444
48531	NC_017270	TGA	2	6	2530891	2530896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425444
48532	NC_017270	CA	3	6	2530908	2530913	50 %	0 %	0 %	50 %	384425444
48533	NC_017270	GC	3	6	2530955	2530960	0 %	0 %	50 %	50 %	384425444
48534	NC_017270	TGC	2	6	2530974	2530979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425444
48535	NC_017270	CAC	2	6	2531005	2531010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425444
48536	NC_017270	TCT	2	6	2531272	2531277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425445
48537	NC_017270	GCA	2	6	2531285	2531290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425445
48538	NC_017270	TCA	2	6	2531318	2531323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425445
48539	NC_017270	CAA	2	6	2531337	2531342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425445
48540	NC_017270	GTG	2	6	2531395	2531400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425445
48541	NC_017270	AAG	2	6	2531401	2531406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425445
48542	NC_017270	TAA	2	6	2531433	2531438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425445
48543	NC_017270	TGCC	2	8	2531445	2531452	0 %	25 %	25 %	50 %	384425445
48544	NC_017270	CA	3	6	2531471	2531476	50 %	0 %	0 %	50 %	384425445
48545	NC_017270	GAA	2	6	2531511	2531516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425445
48546	NC_017270	GC	3	6	2531560	2531565	0 %	0 %	50 %	50 %	384425445
48547	NC_017270	CAG	2	6	2531600	2531605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48548	NC_017270	ACG	2	6	2531625	2531630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48549	NC_017270	TACC	2	8	2531634	2531641	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48550	NC_017270	A	6	6	2531690	2531695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48551	NC_017270	TGA	2	6	2531981	2531986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425446
48552	NC_017270	CTTT	2	8	2532134	2532141	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48553	NC_017270	TCAGC	2	10	2532181	2532190	20 %	20 %	20 %	40 %	384425447
48554	NC_017270	TCA	2	6	2532223	2532228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425447
48555	NC_017270	GTT	2	6	2532320	2532325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425447
48556	NC_017270	AC	3	6	2532359	2532364	50 %	0 %	0 %	50 %	384425447
48557	NC_017270	AAT	2	6	2532371	2532376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425447
48558	NC_017270	CTTTGG	2	12	2532520	2532531	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384425447
48559	NC_017270	TTG	2	6	2532534	2532539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425447
48560	NC_017270	ATCA	2	8	2532545	2532552	50 %	25 %	0 %	25 %	384425447
48561	NC_017270	TGG	2	6	2532675	2532680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425447
48562	NC_017270	CGC	2	6	2532764	2532769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425447
48563	NC_017270	AACA	2	8	2532816	2532823	75 %	0 %	0 %	25 %	384425447
48564	NC_017270	CAAACA	2	12	2532835	2532846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425447
48565	NC_017270	ACTGCC	2	12	2532861	2532872	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384425447
48566	NC_017270	GAA	2	6	2532917	2532922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48567	NC_017270	GAG	2	6	2532961	2532966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48568	NC_017270	GATA	2	8	2533051	2533058	50 %	25 %	25 %	0 %	384425448
48569	NC_017270	GC	3	6	2533141	2533146	0 %	0 %	50 %	50 %	384425448
48570	NC_017270	CAT	2	6	2533283	2533288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425448
48571	NC_017270	CAG	2	6	2533292	2533297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425448
48572	NC_017270	GCG	2	6	2533336	2533341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425448
48573	NC_017270	GTAC	2	8	2533344	2533351	25 %	25 %	25 %	25 %	384425448
48574	NC_017270	CTT	2	6	2533426	2533431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425448
48575	NC_017270	GCG	2	6	2533506	2533511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425448
48576	NC_017270	AAG	2	6	2533515	2533520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425448
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48578	NC_017270	CGC	2	6	2533673	2533678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425448
48579	NC_017270	CA	3	6	2533717	2533722	50 %	0 %	0 %	50 %	384425448
48580	NC_017270	GC	3	6	2533768	2533773	0 %	0 %	50 %	50 %	384425448
48581	NC_017270	GCT	2	6	2533837	2533842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425448
48582	NC_017270	GC	3	6	2533871	2533876	0 %	0 %	50 %	50 %	384425448
48583	NC_017270	C	6	6	2533890	2533895	0 %	0 %	0 %	100 %	384425448
48584	NC_017270	CTTGAC	2	12	2533906	2533917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384425448
48585	NC_017270	CCA	2	6	2533927	2533932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425448
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48587	NC_017270	CTT	2	6	2534256	2534261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425449
48588	NC_017270	ATC	2	6	2534350	2534355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425449
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48590	NC_017270	TTC	2	6	2534442	2534447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425449
48591	NC_017270	TTG	2	6	2534460	2534465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425449
48592	NC_017270	TTG	2	6	2534472	2534477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425449
48593	NC_017270	CTG	2	6	2534505	2534510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425450
48594	NC_017270	GTT	2	6	2534571	2534576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425450
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48596	NC_017270	AAAG	2	8	2534681	2534688	75 %	0 %	25 %	0 %	384425450
48597	NC_017270	AACTG	2	10	2534772	2534781	40 %	20 %	20 %	20 %	384425450
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48600	NC_017270	TTCA	2	8	2535240	2535247	25 %	50 %	0 %	25 %	384425451
48601	NC_017270	CTT	2	6	2535263	2535268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425451
48602	NC_017270	GTT	2	6	2535311	2535316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425451
48603	NC_017270	TCA	2	6	2535356	2535361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425451
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48605	NC_017270	GAG	2	6	2535429	2535434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425451
48606	NC_017270	T	6	6	2535441	2535446	0 %	100 %	0 %	0 %	384425451
48607	NC_017270	CCAC	2	8	2535484	2535491	25 %	0 %	0 %	75 %	384425452
48608	NC_017270	ACC	2	6	2535751	2535756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425452
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48612	NC_017270	CA	3	6	2536112	2536117	50 %	0 %	0 %	50 %	384425453
48613	NC_017270	GCC	2	6	2536223	2536228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425453
48614	NC_017270	ATC	2	6	2536251	2536256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425453
48615	NC_017270	CAG	2	6	2536259	2536264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425453
48616	NC_017270	CAT	2	6	2536328	2536333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425453
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48618	NC_017270	TCA	2	6	2536363	2536368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425453
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48726	NC_017270	ACG	2	6	2542139	2542144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425460
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48728	NC_017270	A	7	7	2542242	2542248	100 %	0 %	0 %	0 %	384425460
48729	NC_017270	TCA	2	6	2542285	2542290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425460
48730	NC_017270	ACGT	2	8	2542300	2542307	25 %	25 %	25 %	25 %	384425460
48731	NC_017270	TG	4	8	2542319	2542326	0 %	50 %	50 %	0 %	384425460
48732	NC_017270	GGAA	2	8	2542364	2542371	50 %	0 %	50 %	0 %	384425460
48733	NC_017270	AAT	2	6	2542389	2542394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425460
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