MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
46001	NC_017270	TGT	2	6	2398699	2398704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425341
46002	NC_017270	AACC	2	8	2398756	2398763	50 %	0 %	0 %	50 %	384425342
46003	NC_017270	TTA	2	6	2398816	2398821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384425342
46004	NC_017270	AAG	2	6	2398843	2398848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425342
46005	NC_017270	TTC	2	6	2398860	2398865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425342
46006	NC_017270	AAT	2	6	2398908	2398913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425342
46007	NC_017270	TCG	2	6	2398923	2398928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425342
46008	NC_017270	TAA	2	6	2399097	2399102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425342
46009	NC_017270	CGCATT	2	12	2399103	2399114	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384425342
46010	NC_017270	CT	3	6	2399215	2399220	0 %	50 %	0 %	50 %	384425342
46011	NC_017270	AG	4	8	2399334	2399341	50 %	0 %	50 %	0 %	384425342
46012	NC_017270	GTT	2	6	2399348	2399353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425342
46013	NC_017270	TCG	2	6	2399372	2399377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425342
46014	NC_017270	ACC	2	6	2399388	2399393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425342
46015	NC_017270	CAC	2	6	2399406	2399411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425342
46016	NC_017270	A	7	7	2399415	2399421	100 %	0 %	0 %	0 %	384425342
46017	NC_017270	CAC	2	6	2399426	2399431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425342
46018	NC_017270	TGT	2	6	2399437	2399442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425342
46019	NC_017270	TTG	2	6	2399488	2399493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425342
46020	NC_017270	AAGGT	2	10	2399805	2399814	40 %	20 %	40 %	0 %	384425343
46021	NC_017270	CAG	2	6	2399910	2399915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425343
46022	NC_017270	ATC	2	6	2399968	2399973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425343
46023	NC_017270	ATC	2	6	2400014	2400019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425343
46024	NC_017270	CGC	2	6	2400049	2400054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425343
46025	NC_017270	CGTCA	2	10	2400061	2400070	20 %	20 %	20 %	40 %	384425343
46026	NC_017270	GTG	2	6	2400082	2400087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425343
46027	NC_017270	ATC	2	6	2400094	2400099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425343
46028	NC_017270	ACG	2	6	2400151	2400156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425343
46029	NC_017270	CG	3	6	2400181	2400186	0 %	0 %	50 %	50 %	384425343
46030	NC_017270	CTG	2	6	2400325	2400330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425343
46031	NC_017270	TCT	2	6	2400368	2400373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425343
46032	NC_017270	GGC	2	6	2400396	2400401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425343
46033	NC_017270	ATC	2	6	2400433	2400438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425343
46034	NC_017270	CGC	2	6	2400516	2400521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425343
46035	NC_017270	ACC	2	6	2400670	2400675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425343
46036	NC_017270	ATCCA	2	10	2400691	2400700	40 %	20 %	0 %	40 %	384425343
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46039	NC_017270	ACG	2	6	2400808	2400813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425343
46040	NC_017270	CGC	2	6	2400838	2400843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425343
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46042	NC_017270	CCCCG	2	10	2401039	2401048	0 %	0 %	20 %	80 %	384425343
46043	NC_017270	CCAATA	2	12	2401049	2401060	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384425343
46044	NC_017270	GAT	2	6	2401169	2401174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425344
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46047	NC_017270	GC	3	6	2401217	2401222	0 %	0 %	50 %	50 %	384425344
46048	NC_017270	AAT	2	6	2401239	2401244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425344
46049	NC_017270	GCT	2	6	2401300	2401305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425344
46050	NC_017270	GGC	2	6	2401316	2401321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425344
46051	NC_017270	TGCT	2	8	2401352	2401359	0 %	50 %	25 %	25 %	384425344
46052	NC_017270	CGCC	2	8	2401399	2401406	0 %	0 %	25 %	75 %	384425344
46053	NC_017270	CAT	2	6	2401480	2401485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425344
46054	NC_017270	GC	3	6	2401504	2401509	0 %	0 %	50 %	50 %	384425344
46055	NC_017270	GCA	3	9	2401521	2401529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425344
46056	NC_017270	TTG	2	6	2401547	2401552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425344
46057	NC_017270	TGA	2	6	2401569	2401574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425344
46058	NC_017270	GCC	2	6	2401599	2401604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425344
46059	NC_017270	GGTTT	2	10	2401619	2401628	0 %	60 %	40 %	0 %	384425344
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46063	NC_017270	GCA	2	6	2401849	2401854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425344
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46067	NC_017270	CAAC	2	8	2402102	2402109	50 %	0 %	0 %	50 %	384425344
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46071	NC_017270	T	6	6	2402198	2402203	0 %	100 %	0 %	0 %	384425345
46072	NC_017270	TCA	2	6	2402212	2402217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425345
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46074	NC_017270	ATA	2	6	2402299	2402304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425345
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46085	NC_017270	TCA	2	6	2402953	2402958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425345
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46087	NC_017270	CAAT	2	8	2403092	2403099	50 %	25 %	0 %	25 %	384425345
46088	NC_017270	AGT	2	6	2403118	2403123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425345
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46093	NC_017270	GA	3	6	2403498	2403503	50 %	0 %	50 %	0 %	384425346
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46101	NC_017270	CTCAG	2	10	2403941	2403950	20 %	20 %	20 %	40 %	384425346
46102	NC_017270	CG	3	6	2403972	2403977	0 %	0 %	50 %	50 %	384425346
46103	NC_017270	CAC	2	6	2404045	2404050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425346
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46105	NC_017270	CAC	2	6	2404099	2404104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425346
46106	NC_017270	TTGGC	2	10	2404136	2404145	0 %	40 %	40 %	20 %	384425346
46107	NC_017270	TCC	2	6	2404151	2404156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384425346
46108	NC_017270	GCC	2	6	2404315	2404320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425346
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46110	NC_017270	AC	3	6	2404353	2404358	50 %	0 %	0 %	50 %	384425346
46111	NC_017270	CATGC	2	10	2404422	2404431	20 %	20 %	20 %	40 %	384425346
46112	NC_017270	ACA	2	6	2404451	2404456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425346
46113	NC_017270	TTG	2	6	2404477	2404482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425346
46114	NC_017270	GTGCA	2	10	2404567	2404576	20 %	20 %	40 %	20 %	384425346
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46116	NC_017270	GCT	2	6	2404590	2404595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425346
46117	NC_017270	GGT	2	6	2404604	2404609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425346
46118	NC_017270	CG	3	6	2404614	2404619	0 %	0 %	50 %	50 %	384425346
46119	NC_017270	GAT	2	6	2404647	2404652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425346
46120	NC_017270	AG	3	6	2404675	2404680	50 %	0 %	50 %	0 %	384425346
46121	NC_017270	ACG	2	6	2404700	2404705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425346
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46123	NC_017270	GAT	2	6	2404809	2404814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425347
46124	NC_017270	CAC	2	6	2405018	2405023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425347
46125	NC_017270	CCAACG	2	12	2405024	2405035	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384425347
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46127	NC_017270	CAC	3	9	2405118	2405126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425347
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46132	NC_017270	ACC	2	6	2405359	2405364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425347
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46222	NC_017270	AGAT	2	8	2410011	2410018	50 %	25 %	25 %	0 %	384425350
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46230	NC_017270	CAG	3	9	2410343	2410351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425350
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46233	NC_017270	TTG	2	6	2410510	2410515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425351
46234	NC_017270	TTC	2	6	2410543	2410548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425351
46235	NC_017270	AGC	2	6	2410682	2410687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425351
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46238	NC_017270	AAGG	2	8	2410908	2410915	50 %	0 %	50 %	0 %	384425352
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46249	NC_017270	ATGA	2	8	2411494	2411501	50 %	25 %	25 %	0 %	384425352
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46257	NC_017270	CCA	2	6	2411869	2411874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46258	NC_017270	ATG	2	6	2411887	2411892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46261	NC_017270	CCT	2	6	2412001	2412006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46262	NC_017270	ATCCC	2	10	2412124	2412133	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
46263	NC_017270	CGG	2	6	2412148	2412153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46264	NC_017270	CT	3	6	2412158	2412163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46265	NC_017270	C	6	6	2412187	2412192	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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46339	NC_017270	GCA	2	6	2415781	2415786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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46344	NC_017270	T	6	6	2416105	2416110	0 %	100 %	0 %	0 %	384425354
46345	NC_017270	TGC	3	9	2416136	2416144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425354
46346	NC_017270	CAC	2	6	2416165	2416170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425354
46347	NC_017270	TTCA	2	8	2416181	2416188	25 %	50 %	0 %	25 %	384425354
46348	NC_017270	GAC	2	6	2416228	2416233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425354
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46350	NC_017270	AGTC	2	8	2416339	2416346	25 %	25 %	25 %	25 %	384425354
46351	NC_017270	CTTCTG	2	12	2416399	2416410	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384425354
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46353	NC_017270	TGAA	2	8	2416462	2416469	50 %	25 %	25 %	0 %	384425354
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