MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017270	TGAT	2	8	206606	206613	25 %	50 %	25 %	0 %	384423543
4003	NC_017270	A	6	6	206620	206625	100 %	0 %	0 %	0 %	384423543
4004	NC_017270	ATG	2	6	206644	206649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423543
4005	NC_017270	CGG	2	6	206657	206662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423543
4006	NC_017270	CAAA	2	8	206712	206719	75 %	0 %	0 %	25 %	384423543
4007	NC_017270	CGA	2	6	206924	206929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423543
4008	NC_017270	TACC	2	8	206965	206972	25 %	25 %	0 %	50 %	384423543
4009	NC_017270	TGA	2	6	207009	207014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423543
4010	NC_017270	CG	3	6	207040	207045	0 %	0 %	50 %	50 %	384423543
4011	NC_017270	TAT	2	6	207117	207122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423543
4012	NC_017270	CAC	2	6	207155	207160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423543
4013	NC_017270	GGC	2	6	207202	207207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423543
4014	NC_017270	CG	3	6	207216	207221	0 %	0 %	50 %	50 %	384423543
4015	NC_017270	CAA	2	6	207358	207363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423543
4016	NC_017270	CGC	2	6	207420	207425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423543
4017	NC_017270	GC	3	6	207448	207453	0 %	0 %	50 %	50 %	384423543
4018	NC_017270	GGC	2	6	207615	207620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423543
4019	NC_017270	GCG	2	6	207688	207693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423543
4020	NC_017270	GCG	2	6	207700	207705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423543
4021	NC_017270	TGG	2	6	207737	207742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423543
4022	NC_017270	GTG	2	6	207866	207871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423543
4023	NC_017270	AG	3	6	207903	207908	50 %	0 %	50 %	0 %	384423543
4024	NC_017270	AGC	2	6	207977	207982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423543
4025	NC_017270	AGA	2	6	207996	208001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423543
4026	NC_017270	CAG	2	6	208027	208032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423543
4027	NC_017270	CGC	2	6	208159	208164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_017270	CCTT	2	8	208203	208210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_017270	CG	3	6	208286	208291	0 %	0 %	50 %	50 %	384423544
4030	NC_017270	CTG	2	6	208297	208302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423544
4031	NC_017270	CTG	3	9	208396	208404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423544
4032	NC_017270	GC	3	6	208422	208427	0 %	0 %	50 %	50 %	384423544
4033	NC_017270	GCA	2	6	208569	208574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423544
4034	NC_017270	TTTA	2	8	208583	208590	25 %	75 %	0 %	0 %	384423544
4035	NC_017270	TA	3	6	208627	208632	50 %	50 %	0 %	0 %	384423544
4036	NC_017270	GCG	2	6	208696	208701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423544
4037	NC_017270	CA	3	6	208766	208771	50 %	0 %	0 %	50 %	384423544
4038	NC_017270	ACC	2	6	208772	208777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423544
4039	NC_017270	GTC	2	6	208876	208881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423544
4040	NC_017270	T	6	6	208995	209000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017270	AG	4	8	209162	209169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_017270	CCA	2	6	209176	209181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_017270	AAC	2	6	209266	209271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423545
4044	NC_017270	A	6	6	209283	209288	100 %	0 %	0 %	0 %	384423545
4045	NC_017270	CTA	2	6	209291	209296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423545
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4047	NC_017270	ATC	2	6	209392	209397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423545
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4049	NC_017270	ATC	2	6	209506	209511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423546
4050	NC_017270	AAG	2	6	209619	209624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423546
4051	NC_017270	A	7	7	209667	209673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017270	T	7	7	209691	209697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017270	CTC	2	6	209751	209756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_017270	ACT	2	6	209767	209772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_017270	AAC	2	6	209898	209903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423547
4056	NC_017270	TATT	2	8	209967	209974	25 %	75 %	0 %	0 %	384423547
4057	NC_017270	A	6	6	210058	210063	100 %	0 %	0 %	0 %	384423547
4058	NC_017270	TGAGT	2	10	210089	210098	20 %	40 %	40 %	0 %	384423547
4059	NC_017270	CACT	2	8	210133	210140	25 %	25 %	0 %	50 %	384423547
4060	NC_017270	A	6	6	210278	210283	100 %	0 %	0 %	0 %	384423547
4061	NC_017270	TGAAGT	2	12	210371	210382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423548
4062	NC_017270	CGG	2	6	210413	210418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423548
4063	NC_017270	TACG	2	8	210439	210446	25 %	25 %	25 %	25 %	384423548
4064	NC_017270	ATT	2	6	210534	210539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423548
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4066	NC_017270	TGA	2	6	210643	210648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423548
4067	NC_017270	CGC	2	6	210681	210686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423548
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4069	NC_017270	AT	3	6	210779	210784	50 %	50 %	0 %	0 %	384423548
4070	NC_017270	GC	3	6	210795	210800	0 %	0 %	50 %	50 %	384423548
4071	NC_017270	TCA	2	6	210826	210831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423548
4072	NC_017270	GTGGGG	2	12	210849	210860	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	384423548
4073	NC_017270	TCCA	2	8	210898	210905	25 %	25 %	0 %	50 %	384423548
4074	NC_017270	TGC	2	6	210970	210975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423548
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4080	NC_017270	GC	3	6	211578	211583	0 %	0 %	50 %	50 %	384423549
4081	NC_017270	GGC	2	6	211632	211637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423549
4082	NC_017270	GAT	2	6	211644	211649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423549
4083	NC_017270	TCA	2	6	211654	211659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423549
4084	NC_017270	GCGCG	2	10	211667	211676	0 %	0 %	60 %	40 %	384423549
4085	NC_017270	TCA	2	6	211768	211773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_017270	ATG	2	6	211830	211835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4090	NC_017270	AAG	2	6	212072	212077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423550
4091	NC_017270	GCA	2	6	212098	212103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423550
4092	NC_017270	GC	3	6	212162	212167	0 %	0 %	50 %	50 %	384423550
4093	NC_017270	T	6	6	212208	212213	0 %	100 %	0 %	0 %	384423550
4094	NC_017270	GAATAC	2	12	212258	212269	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384423550
4095	NC_017270	ATT	2	6	212315	212320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423550
4096	NC_017270	CTG	2	6	212349	212354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423550
4097	NC_017270	GGC	2	6	212362	212367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423550
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4101	NC_017270	CT	3	6	212459	212464	0 %	50 %	0 %	50 %	384423550
4102	NC_017270	GTG	2	6	212495	212500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423550
4103	NC_017270	GTG	2	6	212516	212521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423550
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4105	NC_017270	GCG	2	6	212552	212557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423550
4106	NC_017270	TGCT	2	8	212571	212578	0 %	50 %	25 %	25 %	384423550
4107	NC_017270	TGG	2	6	212622	212627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423550
4108	NC_017270	CTCG	2	8	212634	212641	0 %	25 %	25 %	50 %	384423550
4109	NC_017270	GC	3	6	212649	212654	0 %	0 %	50 %	50 %	384423550
4110	NC_017270	GCA	2	6	212693	212698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423550
4111	NC_017270	TTC	2	6	212723	212728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423550
4112	NC_017270	CGCTG	2	10	212751	212760	0 %	20 %	40 %	40 %	384423550
4113	NC_017270	CGC	2	6	212802	212807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423550
4114	NC_017270	A	6	6	212911	212916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_017270	CTTTGT	2	12	212932	212943	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4116	NC_017270	AG	3	6	213037	213042	50 %	0 %	50 %	0 %	384423551
4117	NC_017270	A	6	6	213074	213079	100 %	0 %	0 %	0 %	384423551
4118	NC_017270	AGC	2	6	213108	213113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423551
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4120	NC_017270	GTG	2	6	213214	213219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423551
4121	NC_017270	ATCGC	2	10	213242	213251	20 %	20 %	20 %	40 %	384423551
4122	NC_017270	TTA	2	6	213434	213439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423551
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4124	NC_017270	ACG	2	6	213598	213603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423551
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4233	NC_017270	TGAG	2	8	219626	219633	25 %	25 %	50 %	0 %	384423557
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4246	NC_017270	TGC	2	6	220379	220384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423559
4247	NC_017270	TGA	2	6	220467	220472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423559
4248	NC_017270	ATG	2	6	220517	220522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423559
4249	NC_017270	T	6	6	220567	220572	0 %	100 %	0 %	0 %	384423559
4250	NC_017270	C	6	6	220586	220591	0 %	0 %	0 %	100 %	384423559
4251	NC_017270	AC	3	6	220597	220602	50 %	0 %	0 %	50 %	384423559
4252	NC_017270	GCT	2	6	220684	220689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423559
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4254	NC_017270	GGCT	2	8	220710	220717	0 %	25 %	50 %	25 %	384423559
4255	NC_017270	CCG	2	6	220731	220736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423559
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4356	NC_017270	CAC	2	6	226655	226660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423565
4357	NC_017270	CAT	2	6	226729	226734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423565
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4359	NC_017270	GCT	2	6	226858	226863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423565
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4362	NC_017270	ATG	3	9	226926	226934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423565
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4364	NC_017270	AGTGC	2	10	227045	227054	20 %	20 %	40 %	20 %	384423565
4365	NC_017270	TCAA	2	8	227073	227080	50 %	25 %	0 %	25 %	384423565
4366	NC_017270	GCTT	2	8	227186	227193	0 %	50 %	25 %	25 %	384423565
4367	NC_017270	GGC	2	6	227212	227217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423565
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4369	NC_017270	TGC	2	6	227483	227488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423565
4370	NC_017270	T	6	6	227624	227629	0 %	100 %	0 %	0 %	384423565
4371	NC_017270	GAC	2	6	227650	227655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423565
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4373	NC_017270	GTGA	2	8	227725	227732	25 %	25 %	50 %	0 %	384423565
4374	NC_017270	TGC	2	6	227806	227811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423565
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4377	NC_017270	ATA	2	6	228001	228006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4378	NC_017270	TCC	2	6	228091	228096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4383	NC_017270	GAATG	2	10	228274	228283	40 %	20 %	40 %	0 %	384423566
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4401	NC_017270	GTT	2	6	229320	229325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4403	NC_017270	ATT	2	6	229405	229410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4444	NC_017270	ATTGA	2	10	231510	231519	40 %	40 %	20 %	0 %	384423568
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4470	NC_017270	AATT	2	8	232822	232829	50 %	50 %	0 %	0 %	384423569
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4475	NC_017270	CCTAG	2	10	233288	233297	20 %	20 %	20 %	40 %	384423569
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4479	NC_017270	TGGA	2	8	233473	233480	25 %	25 %	50 %	0 %	384423570
4480	NC_017270	AT	3	6	233540	233545	50 %	50 %	0 %	0 %	384423570
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4482	NC_017270	ATAA	2	8	233793	233800	75 %	25 %	0 %	0 %	384423570
4483	NC_017270	AT	3	6	233829	233834	50 %	50 %	0 %	0 %	384423570
4484	NC_017270	TG	3	6	233869	233874	0 %	50 %	50 %	0 %	384423570
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