MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_017270	CAC	2	6	2296031	2296036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425266
44003	NC_017270	CAA	2	6	2296120	2296125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425266
44004	NC_017270	GGC	3	9	2296297	2296305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425266
44005	NC_017270	GCC	2	6	2296441	2296446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425266
44006	NC_017270	GAT	2	6	2296504	2296509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425266
44007	NC_017270	GATG	2	8	2296557	2296564	25 %	25 %	50 %	0 %	384425266
44008	NC_017270	CAT	2	6	2296570	2296575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425266
44009	NC_017270	CAA	2	6	2296600	2296605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425266
44010	NC_017270	GATG	2	8	2296647	2296654	25 %	25 %	50 %	0 %	384425266
44011	NC_017270	TTTC	2	8	2296682	2296689	0 %	75 %	0 %	25 %	384425266
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44018	NC_017270	CATC	2	8	2296932	2296939	25 %	25 %	0 %	50 %	384425267
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44118	NC_017270	GATT	2	8	2302386	2302393	25 %	50 %	25 %	0 %	384425273
44119	NC_017270	GCA	2	6	2302435	2302440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425273
44120	NC_017270	TGC	2	6	2302494	2302499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425273
44121	NC_017270	CA	3	6	2302500	2302505	50 %	0 %	0 %	50 %	384425273
44122	NC_017270	CG	3	6	2302513	2302518	0 %	0 %	50 %	50 %	384425273
44123	NC_017270	T	6	6	2302585	2302590	0 %	100 %	0 %	0 %	384425273
44124	NC_017270	GCA	2	6	2302591	2302596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425273
44125	NC_017270	GC	3	6	2302678	2302683	0 %	0 %	50 %	50 %	384425273
44126	NC_017270	CCA	3	9	2302855	2302863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425273
44127	NC_017270	ATG	2	6	2302892	2302897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425273
44128	NC_017270	CGC	2	6	2302964	2302969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425273
44129	NC_017270	CAAT	2	8	2303053	2303060	50 %	25 %	0 %	25 %	384425273
44130	NC_017270	GCC	2	6	2303106	2303111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425273
44131	NC_017270	TGG	2	6	2303128	2303133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425273
44132	NC_017270	GCC	2	6	2303193	2303198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425273
44133	NC_017270	GCT	2	6	2303236	2303241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425273
44134	NC_017270	CCA	2	6	2303320	2303325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425273
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44143	NC_017270	CAG	2	6	2303876	2303881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425273
44144	NC_017270	CAT	2	6	2303909	2303914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425273
44145	NC_017270	CAAT	2	8	2303970	2303977	50 %	25 %	0 %	25 %	384425274
44146	NC_017270	GCTTG	2	10	2304004	2304013	0 %	40 %	40 %	20 %	384425274
44147	NC_017270	CCAT	2	8	2304041	2304048	25 %	25 %	0 %	50 %	384425274
44148	NC_017270	AAG	2	6	2304056	2304061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425274
44149	NC_017270	CGC	2	6	2304072	2304077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425274
44150	NC_017270	TGC	2	6	2304083	2304088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44151	NC_017270	GAT	2	6	2304201	2304206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425274
44152	NC_017270	CGC	2	6	2304208	2304213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425274
44153	NC_017270	TCCAG	2	10	2304240	2304249	20 %	20 %	20 %	40 %	384425274
44154	NC_017270	CGCC	2	8	2304330	2304337	0 %	0 %	25 %	75 %	384425274
44155	NC_017270	GGC	2	6	2304436	2304441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425274
44156	NC_017270	TGT	2	6	2304449	2304454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425274
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44158	NC_017270	ATCAA	2	10	2304551	2304560	60 %	20 %	0 %	20 %	384425274
44159	NC_017270	GAT	2	6	2304562	2304567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425274
44160	NC_017270	TG	3	6	2304585	2304590	0 %	50 %	50 %	0 %	384425274
44161	NC_017270	CAAG	2	8	2304741	2304748	50 %	0 %	25 %	25 %	384425274
44162	NC_017270	CTCG	2	8	2304864	2304871	0 %	25 %	25 %	50 %	384425274
44163	NC_017270	AGC	2	6	2304956	2304961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44164	NC_017270	TGC	2	6	2304965	2304970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44165	NC_017270	ACC	2	6	2304982	2304987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425274
44166	NC_017270	GCA	2	6	2305002	2305007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44167	NC_017270	GCG	2	6	2305068	2305073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425274
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44172	NC_017270	GCA	2	6	2305379	2305384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44173	NC_017270	CTG	2	6	2305447	2305452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425274
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44180	NC_017270	AGC	2	6	2305733	2305738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44181	NC_017270	AC	3	6	2305797	2305802	50 %	0 %	0 %	50 %	384425274
44182	NC_017270	CTGA	2	8	2305816	2305823	25 %	25 %	25 %	25 %	384425274
44183	NC_017270	GC	3	6	2305840	2305845	0 %	0 %	50 %	50 %	384425274
44184	NC_017270	TCGCC	2	10	2305890	2305899	0 %	20 %	20 %	60 %	384425274
44185	NC_017270	GTA	2	6	2305981	2305986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425274
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44187	NC_017270	GCC	2	6	2306093	2306098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425274
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44189	NC_017270	TAAA	2	8	2306126	2306133	75 %	25 %	0 %	0 %	384425274
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44193	NC_017270	TCG	2	6	2306381	2306386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44194	NC_017270	TCC	2	6	2306412	2306417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384425274
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44196	NC_017270	AGC	2	6	2306452	2306457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44197	NC_017270	TGAGT	2	10	2306460	2306469	20 %	40 %	40 %	0 %	384425274
44198	NC_017270	TCA	2	6	2306477	2306482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425274
44199	NC_017270	ATG	2	6	2306494	2306499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425274
44200	NC_017270	CCAA	2	8	2306517	2306524	50 %	0 %	0 %	50 %	384425274
44201	NC_017270	GAC	2	6	2306526	2306531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44202	NC_017270	TGA	2	6	2306534	2306539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425274
44203	NC_017270	TTC	2	6	2306633	2306638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425274
44204	NC_017270	GCAA	2	8	2306645	2306652	50 %	0 %	25 %	25 %	384425274
44205	NC_017270	GCA	2	6	2306742	2306747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44206	NC_017270	TGC	2	6	2306822	2306827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44207	NC_017270	GC	3	6	2306842	2306847	0 %	0 %	50 %	50 %	384425274
44208	NC_017270	TTG	2	6	2306857	2306862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425274
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44212	NC_017270	CCA	2	6	2307030	2307035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425274
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44214	NC_017270	TCA	2	6	2307056	2307061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425274
44215	NC_017270	GCT	2	6	2307149	2307154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44216	NC_017270	CATC	2	8	2307156	2307163	25 %	25 %	0 %	50 %	384425274
44217	NC_017270	CAA	2	6	2307181	2307186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425274
44218	NC_017270	CAGC	2	8	2307216	2307223	25 %	0 %	25 %	50 %	384425274
44219	NC_017270	AGC	2	6	2307233	2307238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425274
44220	NC_017270	GC	3	6	2307271	2307276	0 %	0 %	50 %	50 %	384425274
44221	NC_017270	GCG	2	6	2307286	2307291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425274
44222	NC_017270	CAC	2	6	2307337	2307342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425274
44223	NC_017270	TGCC	2	8	2307447	2307454	0 %	25 %	25 %	50 %	384425274
44224	NC_017270	TCA	2	6	2307534	2307539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425274
44225	NC_017270	TCTA	2	8	2307551	2307558	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44226	NC_017270	GGC	2	6	2307660	2307665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44227	NC_017270	GC	3	6	2307676	2307681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44228	NC_017270	AAT	2	6	2307757	2307762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44229	NC_017270	GGC	2	6	2307771	2307776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44230	NC_017270	TCAT	2	8	2307792	2307799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44231	NC_017270	GCA	2	6	2307843	2307848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425275
44232	NC_017270	CG	3	6	2307908	2307913	0 %	0 %	50 %	50 %	384425275
44233	NC_017270	CCA	2	6	2308095	2308100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425275
44234	NC_017270	TGC	2	6	2308124	2308129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425275
44235	NC_017270	GGC	2	6	2308142	2308147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425275
44236	NC_017270	TGC	2	6	2308157	2308162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425275
44237	NC_017270	CTT	2	6	2308167	2308172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425275
44238	NC_017270	GAT	2	6	2308230	2308235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425275
44239	NC_017270	TAA	2	6	2308249	2308254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425275
44240	NC_017270	CGAA	2	8	2308261	2308268	50 %	0 %	25 %	25 %	384425275
44241	NC_017270	TGCG	2	8	2308278	2308285	0 %	25 %	50 %	25 %	384425275
44242	NC_017270	GTA	2	6	2308326	2308331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425275
44243	NC_017270	TGGT	2	8	2308390	2308397	0 %	50 %	50 %	0 %	384425275
44244	NC_017270	T	6	6	2308413	2308418	0 %	100 %	0 %	0 %	384425275
44245	NC_017270	TGC	2	6	2308436	2308441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425275
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44247	NC_017270	CTTGC	2	10	2308486	2308495	0 %	40 %	20 %	40 %	384425275
44248	NC_017270	TGC	2	6	2308502	2308507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425275
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44250	NC_017270	CAG	2	6	2308558	2308563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425275
44251	NC_017270	TCA	2	6	2308577	2308582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425275
44252	NC_017270	ATCC	2	8	2308602	2308609	25 %	25 %	0 %	50 %	384425275
44253	NC_017270	TCA	2	6	2308622	2308627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425275
44254	NC_017270	CAGC	2	8	2308638	2308645	25 %	0 %	25 %	50 %	384425275
44255	NC_017270	GGC	2	6	2308646	2308651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425275
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44258	NC_017270	GAGTG	2	10	2308768	2308777	20 %	20 %	60 %	0 %	384425275
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44266	NC_017270	ACA	2	6	2309067	2309072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425275
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44297	NC_017270	A	6	6	2311313	2311318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44298	NC_017270	AAC	2	6	2311348	2311353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44299	NC_017270	AAC	2	6	2311366	2311371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44300	NC_017270	GGC	2	6	2311387	2311392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44301	NC_017270	AGTG	2	8	2311394	2311401	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44302	NC_017270	GAAC	2	8	2311439	2311446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44303	NC_017270	TG	3	6	2311510	2311515	0 %	50 %	50 %	0 %	384425276
44304	NC_017270	CAC	3	9	2311553	2311561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425276
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44310	NC_017270	GCTG	2	8	2311844	2311851	0 %	25 %	50 %	25 %	384425276
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44317	NC_017270	GCCA	2	8	2312153	2312160	25 %	0 %	25 %	50 %	384425276
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44321	NC_017270	TGC	2	6	2312318	2312323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425276
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44326	NC_017270	TAA	2	6	2312483	2312488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44335	NC_017270	GTTT	2	8	2312816	2312823	0 %	75 %	25 %	0 %	384425277
44336	NC_017270	GCATCC	2	12	2312922	2312933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384425277
44337	NC_017270	AGATG	2	10	2313060	2313069	40 %	20 %	40 %	0 %	384425277
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44339	NC_017270	ATC	2	6	2313089	2313094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425277
44340	NC_017270	GCA	2	6	2313102	2313107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425277
44341	NC_017270	TGC	2	6	2313149	2313154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425277
44342	NC_017270	CG	3	6	2313173	2313178	0 %	0 %	50 %	50 %	384425277
44343	NC_017270	ACC	2	6	2313241	2313246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425277
44344	NC_017270	GCT	2	6	2313287	2313292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425277
44345	NC_017270	CAA	2	6	2313319	2313324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425277
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44347	NC_017270	GC	3	6	2313506	2313511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44348	NC_017270	TGG	2	6	2313516	2313521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44349	NC_017270	TGAA	2	8	2313539	2313546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44350	NC_017270	GTG	2	6	2313617	2313622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425278
44351	NC_017270	GAGAA	2	10	2313633	2313642	60 %	0 %	40 %	0 %	384425278
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44353	NC_017270	CTG	2	6	2313716	2313721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425278
44354	NC_017270	CAAG	2	8	2313751	2313758	50 %	0 %	25 %	25 %	384425278
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44370	NC_017270	TGA	2	6	2314289	2314294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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44472	NC_017270	CAA	2	6	2318890	2318895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425282
44473	NC_017270	CAA	2	6	2318923	2318928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425282
44474	NC_017270	ATC	2	6	2318951	2318956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425282
44475	NC_017270	GTG	2	6	2319050	2319055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425282
44476	NC_017270	AAG	2	6	2319084	2319089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425282
44477	NC_017270	GC	3	6	2319111	2319116	0 %	0 %	50 %	50 %	384425282
44478	NC_017270	CCGA	2	8	2319140	2319147	25 %	0 %	25 %	50 %	384425282
44479	NC_017270	TGA	2	6	2319168	2319173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425282
44480	NC_017270	ATG	2	6	2319203	2319208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425282
44481	NC_017270	TGG	2	6	2319340	2319345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425282
44482	NC_017270	AGA	2	6	2319433	2319438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425282
44483	NC_017270	CTT	2	6	2319442	2319447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425282
44484	NC_017270	CAT	2	6	2319469	2319474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425282
44485	NC_017270	AAC	2	6	2319529	2319534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44486	NC_017270	GGC	2	6	2319550	2319555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44487	NC_017270	AGTG	2	8	2319557	2319564	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44488	NC_017270	ATAG	2	8	2319578	2319585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44489	NC_017270	GAAC	2	8	2319602	2319609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44490	NC_017270	GA	3	6	2319670	2319675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44491	NC_017270	ACGCC	2	10	2319793	2319802	20 %	0 %	20 %	60 %	384425283
44492	NC_017270	TTG	2	6	2319915	2319920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425283
44493	NC_017270	ATG	2	6	2319952	2319957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425283
44494	NC_017270	TAT	2	6	2320041	2320046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384425283
44495	NC_017270	TGA	2	6	2320226	2320231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425283
44496	NC_017270	CGAACT	2	12	2320232	2320243	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384425283
44497	NC_017270	GCA	2	6	2320304	2320309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425283
44498	NC_017270	GAT	2	6	2320320	2320325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425283
44499	NC_017270	CTT	3	9	2320418	2320426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425283
44500	NC_017270	ATC	2	6	2320440	2320445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425283

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