MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_017270	TGA	2	6	2187874	2187879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425174
42003	NC_017270	TCG	2	6	2187898	2187903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425174
42004	NC_017270	TCGG	2	8	2187932	2187939	0 %	25 %	50 %	25 %	384425174
42005	NC_017270	GAT	2	6	2187985	2187990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425174
42006	NC_017270	CAT	2	6	2188015	2188020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425174
42007	NC_017270	GGC	2	6	2188022	2188027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425174
42008	NC_017270	CCA	2	6	2188047	2188052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425174
42009	NC_017270	A	6	6	2188059	2188064	100 %	0 %	0 %	0 %	384425174
42010	NC_017270	CAT	2	6	2188078	2188083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425174
42011	NC_017270	GT	3	6	2188110	2188115	0 %	50 %	50 %	0 %	384425174
42012	NC_017270	TGA	2	6	2188140	2188145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425174
42013	NC_017270	ATG	2	6	2188241	2188246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425174
42014	NC_017270	CCA	2	6	2188341	2188346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425174
42015	NC_017270	CAA	2	6	2188421	2188426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425174
42016	NC_017270	ATC	2	6	2188575	2188580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42017	NC_017270	TCA	2	6	2188873	2188878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425175
42018	NC_017270	CT	3	6	2188908	2188913	0 %	50 %	0 %	50 %	384425175
42019	NC_017270	TTG	2	6	2188967	2188972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425175
42020	NC_017270	T	6	6	2189022	2189027	0 %	100 %	0 %	0 %	384425175
42021	NC_017270	CTT	2	6	2189092	2189097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425175
42022	NC_017270	GATC	2	8	2189104	2189111	25 %	25 %	25 %	25 %	384425175
42023	NC_017270	CCA	2	6	2189197	2189202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425175
42024	NC_017270	TGG	2	6	2189215	2189220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425175
42025	NC_017270	CAG	2	6	2189282	2189287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425175
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42028	NC_017270	GCC	2	6	2189423	2189428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425175
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42033	NC_017270	GCT	2	6	2189557	2189562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425175
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42035	NC_017270	TGG	2	6	2189691	2189696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425175
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42041	NC_017270	CAAAC	2	10	2190032	2190041	60 %	0 %	0 %	40 %	384425175
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42051	NC_017270	GAA	2	6	2190486	2190491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425175
42052	NC_017270	CAAG	2	8	2190529	2190536	50 %	0 %	25 %	25 %	384425175
42053	NC_017270	CTC	2	6	2190754	2190759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384425175
42054	NC_017270	CG	3	6	2190880	2190885	0 %	0 %	50 %	50 %	384425175
42055	NC_017270	CAT	2	6	2190898	2190903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425175
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42057	NC_017270	CGC	2	6	2191272	2191277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425175
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42063	NC_017270	GC	3	6	2191571	2191576	0 %	0 %	50 %	50 %	384425175
42064	NC_017270	ATTG	2	8	2191615	2191622	25 %	50 %	25 %	0 %	384425175
42065	NC_017270	CGTC	2	8	2191623	2191630	0 %	25 %	25 %	50 %	384425175
42066	NC_017270	ACTC	2	8	2191669	2191676	25 %	25 %	0 %	50 %	384425175
42067	NC_017270	AGGT	2	8	2191693	2191700	25 %	25 %	50 %	0 %	384425175
42068	NC_017270	GA	3	6	2191704	2191709	50 %	0 %	50 %	0 %	384425175
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42074	NC_017270	GTTT	2	8	2192172	2192179	0 %	75 %	25 %	0 %	384425175
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42085	NC_017270	GTA	2	6	2192793	2192798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425175
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42093	NC_017270	AG	3	6	2193176	2193181	50 %	0 %	50 %	0 %	384425175
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42104	NC_017270	CG	3	6	2193928	2193933	0 %	0 %	50 %	50 %	384425175
42105	NC_017270	GGC	2	6	2193984	2193989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425175
42106	NC_017270	T	6	6	2194037	2194042	0 %	100 %	0 %	0 %	384425175
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42235	NC_017270	AGT	2	6	2201195	2201200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425179
42236	NC_017270	TGC	2	6	2201207	2201212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425179
42237	NC_017270	CAC	2	6	2201228	2201233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425179
42238	NC_017270	TCA	2	6	2201311	2201316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425179
42239	NC_017270	CAG	2	6	2201327	2201332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425179
42240	NC_017270	AGT	2	6	2201345	2201350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425179
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42242	NC_017270	TTTG	2	8	2201376	2201383	0 %	75 %	25 %	0 %	384425179
42243	NC_017270	ATC	3	9	2201415	2201423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425179
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42247	NC_017270	T	6	6	2201568	2201573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42248	NC_017270	ATT	2	6	2201581	2201586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42250	NC_017270	TTA	2	6	2201705	2201710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42251	NC_017270	TAA	2	6	2201799	2201804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42252	NC_017270	A	6	6	2201803	2201808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42253	NC_017270	GGCTTT	2	12	2201826	2201837	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42254	NC_017270	AAC	2	6	2201849	2201854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425180
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42259	NC_017270	CAC	2	6	2202123	2202128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425180
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42262	NC_017270	TGC	2	6	2202191	2202196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425180
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42264	NC_017270	CAC	2	6	2202238	2202243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425180
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42296	NC_017270	AAGGTT	2	12	2203433	2203444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42297	NC_017270	AGG	2	6	2203466	2203471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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42321	NC_017270	GCA	2	6	2204514	2204519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425181
42322	NC_017270	AGCA	2	8	2204644	2204651	50 %	0 %	25 %	25 %	384425181
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42332	NC_017270	TGC	2	6	2205766	2205771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425181
42333	NC_017270	GCA	2	6	2205785	2205790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425181
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42335	NC_017270	ATG	2	6	2205847	2205852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425181
42336	NC_017270	GCTG	2	8	2205866	2205873	0 %	25 %	50 %	25 %	384425181
42337	NC_017270	GCAGTG	2	12	2205892	2205903	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384425181
42338	NC_017270	TCA	2	6	2205942	2205947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425181
42339	NC_017270	GTG	2	6	2205957	2205962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425181
42340	NC_017270	ATTT	2	8	2206022	2206029	25 %	75 %	0 %	0 %	384425181
42341	NC_017270	ACA	2	6	2206030	2206035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425181
42342	NC_017270	GCG	2	6	2206110	2206115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425181
42343	NC_017270	CTC	2	6	2206124	2206129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384425181
42344	NC_017270	ATG	2	6	2206220	2206225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425182
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42346	NC_017270	TGC	2	6	2206359	2206364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425182
42347	NC_017270	ACA	2	6	2206368	2206373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425182
42348	NC_017270	AGC	2	6	2206386	2206391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425182
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42470	NC_017270	GTCC	2	8	2213938	2213945	0 %	25 %	25 %	50 %	384425190
42471	NC_017270	ATA	2	6	2213948	2213953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425190
42472	NC_017270	GCT	2	6	2214013	2214018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425190
42473	NC_017270	TGA	2	6	2214076	2214081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425190
42474	NC_017270	CAT	2	6	2214301	2214306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425190
42475	NC_017270	GATTC	2	10	2214310	2214319	20 %	40 %	20 %	20 %	384425190
42476	NC_017270	GTA	2	6	2214350	2214355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425190
42477	NC_017270	GAT	2	6	2214428	2214433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425190
42478	NC_017270	GAG	2	6	2214498	2214503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425190
42479	NC_017270	CGGA	2	8	2214512	2214519	25 %	0 %	50 %	25 %	384425190
42480	NC_017270	CTG	2	6	2214527	2214532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425190
42481	NC_017270	AATA	2	8	2214541	2214548	75 %	25 %	0 %	0 %	384425190
42482	NC_017270	A	7	7	2214635	2214641	100 %	0 %	0 %	0 %	384425190
42483	NC_017270	AAT	2	6	2214647	2214652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425190
42484	NC_017270	TTTC	2	8	2214677	2214684	0 %	75 %	0 %	25 %	384425190
42485	NC_017270	TCT	2	6	2214724	2214729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42486	NC_017270	TAA	2	6	2214767	2214772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42487	NC_017270	ATACC	2	10	2214802	2214811	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42488	NC_017270	AGAA	2	8	2214852	2214859	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42489	NC_017270	TCA	2	6	2215112	2215117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425191
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42493	NC_017270	ATC	2	6	2215247	2215252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425191
42494	NC_017270	GCC	2	6	2215255	2215260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425191
42495	NC_017270	ACC	2	6	2215280	2215285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425191
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42499	NC_017270	CGT	2	6	2215794	2215799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42500	NC_017270	TAA	2	6	2215840	2215845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425192

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