MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_017270	GCT	2	6	2162225	2162230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425150
41502	NC_017270	CAC	2	6	2162245	2162250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425151
41503	NC_017270	GTC	2	6	2162298	2162303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425151
41504	NC_017270	TGA	2	6	2162356	2162361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425151
41505	NC_017270	CAA	2	6	2162377	2162382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425151
41506	NC_017270	CT	3	6	2162399	2162404	0 %	50 %	0 %	50 %	384425151
41507	NC_017270	AGA	2	6	2162428	2162433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425151
41508	NC_017270	GCG	2	6	2162471	2162476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425151
41509	NC_017270	GCG	2	6	2162526	2162531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425151
41510	NC_017270	TGG	2	6	2162536	2162541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425151
41511	NC_017270	ATC	2	6	2162545	2162550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425151
41512	NC_017270	GAT	2	6	2162606	2162611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425151
41513	NC_017270	GAA	2	6	2162696	2162701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425151
41514	NC_017270	TGA	2	6	2162793	2162798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425151
41515	NC_017270	CTT	2	6	2162828	2162833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425151
41516	NC_017270	A	6	6	2162859	2162864	100 %	0 %	0 %	0 %	384425151
41517	NC_017270	GCT	2	6	2162908	2162913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425151
41518	NC_017270	CGGGA	2	10	2162938	2162947	20 %	0 %	60 %	20 %	384425151
41519	NC_017270	A	7	7	2163105	2163111	100 %	0 %	0 %	0 %	384425151
41520	NC_017270	CCAA	2	8	2163321	2163328	50 %	0 %	0 %	50 %	384425152
41521	NC_017270	TGG	2	6	2163346	2163351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425152
41522	NC_017270	CCG	2	6	2163431	2163436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425152
41523	NC_017270	GTT	2	6	2163471	2163476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425152
41524	NC_017270	GCAGA	2	10	2163531	2163540	40 %	0 %	40 %	20 %	384425152
41525	NC_017270	CTT	2	6	2163548	2163553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425152
41526	NC_017270	ACA	2	6	2163568	2163573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425152
41527	NC_017270	CTG	2	6	2163591	2163596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425152
41528	NC_017270	TGT	2	6	2163629	2163634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425152
41529	NC_017270	TGG	2	6	2163650	2163655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425152
41530	NC_017270	GTGC	2	8	2163660	2163667	0 %	25 %	50 %	25 %	384425152
41531	NC_017270	CGT	2	6	2163720	2163725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425152
41532	NC_017270	CG	3	6	2163729	2163734	0 %	0 %	50 %	50 %	384425152
41533	NC_017270	TG	3	6	2163783	2163788	0 %	50 %	50 %	0 %	384425152
41534	NC_017270	GTG	2	6	2163853	2163858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425152
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41536	NC_017270	GGC	2	6	2163980	2163985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425152
41537	NC_017270	GCTG	2	8	2164022	2164029	0 %	25 %	50 %	25 %	384425152
41538	NC_017270	TCG	2	6	2164037	2164042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425152
41539	NC_017270	GAT	2	6	2164130	2164135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41540	NC_017270	T	6	6	2164165	2164170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41541	NC_017270	TG	3	6	2164180	2164185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41542	NC_017270	TG	3	6	2164205	2164210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41543	NC_017270	T	6	6	2164390	2164395	0 %	100 %	0 %	0 %	384425153
41544	NC_017270	TTG	2	6	2164411	2164416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425153
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41546	NC_017270	CAC	2	6	2164449	2164454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425153
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41550	NC_017270	TGG	2	6	2164590	2164595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425153
41551	NC_017270	CAA	2	6	2164632	2164637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425153
41552	NC_017270	CGC	2	6	2164746	2164751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425153
41553	NC_017270	AC	3	6	2164821	2164826	50 %	0 %	0 %	50 %	384425153
41554	NC_017270	TCG	2	6	2164872	2164877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425154
41555	NC_017270	AGC	2	6	2164936	2164941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425154
41556	NC_017270	TGTGCC	2	12	2164981	2164992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425154
41557	NC_017270	ACG	2	6	2165048	2165053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425154
41558	NC_017270	GGCG	2	8	2165083	2165090	0 %	0 %	75 %	25 %	384425154
41559	NC_017270	GTA	2	6	2165159	2165164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425154
41560	NC_017270	GCT	2	6	2165166	2165171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425154
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41564	NC_017270	GCTG	2	8	2165251	2165258	0 %	25 %	50 %	25 %	384425154
41565	NC_017270	GC	3	6	2165275	2165280	0 %	0 %	50 %	50 %	384425154
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41582	NC_017270	AAAAT	2	10	2166210	2166219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41587	NC_017270	CCT	2	6	2166398	2166403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41588	NC_017270	TCT	2	6	2166507	2166512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41591	NC_017270	CAG	2	6	2166545	2166550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41592	NC_017270	TAT	2	6	2166675	2166680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41593	NC_017270	TC	3	6	2166683	2166688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41594	NC_017270	ATG	2	6	2166739	2166744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41597	NC_017270	GGT	2	6	2166803	2166808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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41601	NC_017270	CAA	2	6	2167008	2167013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41602	NC_017270	TCT	2	6	2167089	2167094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41603	NC_017270	TGA	2	6	2167108	2167113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41604	NC_017270	ATC	2	6	2167119	2167124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41605	NC_017270	GAT	2	6	2167209	2167214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41606	NC_017270	TCT	2	6	2167313	2167318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41607	NC_017270	ATG	2	6	2167391	2167396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41608	NC_017270	CGT	2	6	2167416	2167421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41609	NC_017270	CCA	2	6	2167424	2167429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41610	NC_017270	GGT	2	6	2167454	2167459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41611	NC_017270	CCT	2	6	2167523	2167528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41612	NC_017270	ATT	2	6	2167629	2167634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41615	NC_017270	TCT	2	6	2167741	2167746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41618	NC_017270	ATT	2	6	2167856	2167861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41620	NC_017270	TCT	2	6	2167968	2167973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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41622	NC_017270	TTG	2	6	2168020	2168025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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41870	NC_017270	CTAG	2	8	2180741	2180748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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41932	NC_017270	TAT	2	6	2184445	2184450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41939	NC_017270	TGG	2	6	2184673	2184678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425169
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41948	NC_017270	TG	3	6	2185182	2185187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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41964	NC_017270	A	6	6	2186141	2186146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41965	NC_017270	TTG	2	6	2186229	2186234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425172
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