MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017270	CTTT	2	8	156333	156340	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3002	NC_017270	GAC	2	6	156493	156498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423505
3003	NC_017270	T	6	6	156616	156621	0 %	100 %	0 %	0 %	384423505
3004	NC_017270	ATA	2	6	156697	156702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017270	A	6	6	156702	156707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_017270	TCA	2	6	156777	156782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423506
3007	NC_017270	CAA	2	6	156814	156819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423506
3008	NC_017270	CCAGA	2	10	156901	156910	40 %	0 %	20 %	40 %	384423506
3009	NC_017270	ATC	2	6	156987	156992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423506
3010	NC_017270	GCAT	2	8	157035	157042	25 %	25 %	25 %	25 %	384423506
3011	NC_017270	TGT	2	6	157066	157071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423506
3012	NC_017270	CTC	2	6	157079	157084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423506
3013	NC_017270	ACCA	2	8	157127	157134	50 %	0 %	0 %	50 %	384423506
3014	NC_017270	AACC	2	8	157144	157151	50 %	0 %	0 %	50 %	384423506
3015	NC_017270	CAC	2	6	157201	157206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423506
3016	NC_017270	GA	3	6	157250	157255	50 %	0 %	50 %	0 %	384423506
3017	NC_017270	AAG	2	6	157278	157283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423506
3018	NC_017270	GC	3	6	157318	157323	0 %	0 %	50 %	50 %	384423506
3019	NC_017270	TGC	2	6	157387	157392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423506
3020	NC_017270	GCACC	2	10	157447	157456	20 %	0 %	20 %	60 %	384423506
3021	NC_017270	AGCG	2	8	157491	157498	25 %	0 %	50 %	25 %	384423506
3022	NC_017270	CTG	2	6	157555	157560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423506
3023	NC_017270	GTA	2	6	157568	157573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423506
3024	NC_017270	CAT	2	6	157676	157681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423506
3025	NC_017270	CTTTAT	2	12	157732	157743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384423506
3026	NC_017270	CAGATC	2	12	157778	157789	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384423506
3027	NC_017270	TGGTG	2	10	157868	157877	0 %	40 %	60 %	0 %	384423506
3028	NC_017270	GGTT	2	8	157981	157988	0 %	50 %	50 %	0 %	384423506
3029	NC_017270	TGGCT	2	10	157993	158002	0 %	40 %	40 %	20 %	384423506
3030	NC_017270	CAGA	2	8	158104	158111	50 %	0 %	25 %	25 %	384423506
3031	NC_017270	CAT	2	6	158122	158127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423506
3032	NC_017270	CAT	2	6	158408	158413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423506
3033	NC_017270	CAA	2	6	158431	158436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423506
3034	NC_017270	CCAG	2	8	158457	158464	25 %	0 %	25 %	50 %	384423506
3035	NC_017270	GAT	2	6	158585	158590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423506
3036	NC_017270	CGC	2	6	158591	158596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423506
3037	NC_017270	CTT	2	6	158614	158619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423506
3038	NC_017270	ACG	2	6	158646	158651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423506
3039	NC_017270	CAT	2	6	158723	158728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423506
3040	NC_017270	TGA	2	6	158815	158820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423506
3041	NC_017270	ACA	2	6	158902	158907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423506
3042	NC_017270	GCA	2	6	158950	158955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423506
3043	NC_017270	CG	3	6	159044	159049	0 %	0 %	50 %	50 %	384423506
3044	NC_017270	CAC	2	6	159125	159130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423506
3045	NC_017270	CTGA	2	8	159217	159224	25 %	25 %	25 %	25 %	384423506
3046	NC_017270	GTT	2	6	159227	159232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423506
3047	NC_017270	TCA	2	6	159247	159252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423506
3048	NC_017270	GCC	2	6	159276	159281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423506
3049	NC_017270	AC	3	6	159346	159351	50 %	0 %	0 %	50 %	384423506
3050	NC_017270	TCT	2	6	159486	159491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423506
3051	NC_017270	CTT	2	6	159493	159498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423506
3052	NC_017270	GCGA	2	8	159508	159515	25 %	0 %	50 %	25 %	384423506
3053	NC_017270	TAA	2	6	159670	159675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423506
3054	NC_017270	ATG	2	6	159877	159882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017270	CTG	2	6	159907	159912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423507
3056	NC_017270	GTG	2	6	159913	159918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423507
3057	NC_017270	CGA	2	6	159934	159939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423507
3058	NC_017270	TTC	2	6	160085	160090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423507
3059	NC_017270	ATG	2	6	160176	160181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423507
3060	NC_017270	CG	3	6	160188	160193	0 %	0 %	50 %	50 %	384423507
3061	NC_017270	CTT	2	6	160339	160344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423507
3062	NC_017270	TGG	2	6	160516	160521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423507
3063	NC_017270	TAG	2	6	160554	160559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423507
3064	NC_017270	TCA	2	6	160572	160577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423507
3065	NC_017270	GCAG	2	8	160644	160651	25 %	0 %	50 %	25 %	384423507
3066	NC_017270	GC	3	6	160652	160657	0 %	0 %	50 %	50 %	384423507
3067	NC_017270	CTG	2	6	160765	160770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423507
3068	NC_017270	TGT	2	6	160914	160919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423507
3069	NC_017270	CAG	2	6	160952	160957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423507
3070	NC_017270	A	6	6	160976	160981	100 %	0 %	0 %	0 %	384423507
3071	NC_017270	ATC	2	6	161069	161074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423508
3072	NC_017270	GTT	2	6	161118	161123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423508
3073	NC_017270	AGAA	2	8	161138	161145	75 %	0 %	25 %	0 %	384423508
3074	NC_017270	CTG	2	6	161174	161179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423508
3075	NC_017270	AAC	2	6	161193	161198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423508
3076	NC_017270	T	6	6	161218	161223	0 %	100 %	0 %	0 %	384423508
3077	NC_017270	CAA	2	6	161244	161249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423508
3078	NC_017270	GTT	3	9	161250	161258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423508
3079	NC_017270	AGCC	2	8	161305	161312	25 %	0 %	25 %	50 %	384423508
3080	NC_017270	TC	3	6	161367	161372	0 %	50 %	0 %	50 %	384423508
3081	NC_017270	T	6	6	161398	161403	0 %	100 %	0 %	0 %	384423508
3082	NC_017270	TCAA	2	8	161424	161431	50 %	25 %	0 %	25 %	384423508
3083	NC_017270	GAT	2	6	161434	161439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423508
3084	NC_017270	GCT	2	6	161484	161489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423508
3085	NC_017270	GTT	2	6	161619	161624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423509
3086	NC_017270	TTG	2	6	161694	161699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017270	ATT	3	9	161718	161726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017270	GGC	2	6	161727	161732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_017270	TAAA	2	8	161733	161740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017270	CAAGA	2	10	161770	161779	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3091	NC_017270	GGCGGG	2	12	161819	161830	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
3092	NC_017270	TCA	2	6	161848	161853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_017270	TGC	2	6	161906	161911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_017270	GCG	2	6	161931	161936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_017270	CG	3	6	161983	161988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_017270	CAT	2	6	162026	162031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_017270	GAC	2	6	162081	162086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_017270	AGC	2	6	162124	162129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_017270	CTG	2	6	162147	162152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_017270	CCG	2	6	162201	162206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_017270	CAG	3	9	162234	162242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_017270	GAT	2	6	162306	162311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_017270	TGC	2	6	162319	162324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_017270	GCA	2	6	162340	162345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_017270	GAA	2	6	162348	162353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017270	TGG	2	6	162391	162396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017270	TGG	2	6	162472	162477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017270	GAT	2	6	162480	162485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017270	TGCG	2	8	162607	162614	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_017270	AAT	2	6	162708	162713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017270	ATC	2	6	162747	162752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017270	GC	3	6	162883	162888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_017270	CAT	2	6	162901	162906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_017270	TGA	3	9	162934	162942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017270	AGC	2	6	163071	163076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_017270	CGC	2	6	163106	163111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_017270	TGGT	2	8	163121	163128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017270	GC	3	6	163174	163179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_017270	GGT	2	6	163339	163344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017270	ATG	2	6	163367	163372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017270	TGA	2	6	163413	163418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017270	TGA	2	6	163504	163509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_017270	GCG	2	6	163528	163533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_017270	ATGT	2	8	163538	163545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017270	CG	3	6	163556	163561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3126	NC_017270	GT	3	6	163583	163588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3245	NC_017270	TGG	2	6	169206	169211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423512
3246	NC_017270	CTCTG	2	10	169233	169242	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3247	NC_017270	ATT	2	6	169557	169562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423513
3248	NC_017270	GCG	2	6	169584	169589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423513
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3250	NC_017270	TGG	2	6	169657	169662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423513
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3252	NC_017270	GCA	3	9	169777	169785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423513
3253	NC_017270	ATGT	2	8	169827	169834	25 %	50 %	25 %	0 %	384423513
3254	NC_017270	GGTT	2	8	169851	169858	0 %	50 %	50 %	0 %	384423513
3255	NC_017270	CTGGG	2	10	169893	169902	0 %	20 %	60 %	20 %	384423513
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3258	NC_017270	TGG	2	6	170146	170151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423513
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3281	NC_017270	CT	3	6	171142	171147	0 %	50 %	0 %	50 %	384423514
3282	NC_017270	TGG	2	6	171185	171190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423514
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3285	NC_017270	GTAA	2	8	171292	171299	50 %	25 %	25 %	0 %	384423514
3286	NC_017270	GATT	2	8	171304	171311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3289	NC_017270	TGC	2	6	171487	171492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3304	NC_017270	GCA	2	6	172293	172298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3362	NC_017270	T	6	6	174942	174947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3363	NC_017270	GGC	2	6	174949	174954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3364	NC_017270	GTGA	2	8	174962	174969	25 %	25 %	50 %	0 %	384423518
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3373	NC_017270	CG	3	6	175461	175466	0 %	0 %	50 %	50 %	384423518
3374	NC_017270	A	6	6	175471	175476	100 %	0 %	0 %	0 %	384423518
3375	NC_017270	CAA	2	6	175592	175597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423518
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3378	NC_017270	AGC	3	9	175688	175696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423518
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