MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017270	GTC	2	6	77470	77475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423433
1502	NC_017270	GCC	2	6	77568	77573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_017270	T	7	7	77606	77612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017270	ATG	2	6	77629	77634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423434
1505	NC_017270	ATT	2	6	77656	77661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423434
1506	NC_017270	GCG	2	6	77671	77676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423434
1507	NC_017270	GCA	2	6	77689	77694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423434
1508	NC_017270	GGC	2	6	77697	77702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423434
1509	NC_017270	TGC	2	6	77723	77728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423434
1510	NC_017270	A	6	6	77740	77745	100 %	0 %	0 %	0 %	384423434
1511	NC_017270	GGT	2	6	77770	77775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423434
1512	NC_017270	CGG	2	6	77807	77812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423434
1513	NC_017270	ACT	2	6	77816	77821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423434
1514	NC_017270	AACC	2	8	77989	77996	50 %	0 %	0 %	50 %	384423434
1515	NC_017270	AGC	2	6	78005	78010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423434
1516	NC_017270	TGG	2	6	78098	78103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423434
1517	NC_017270	GC	3	6	78282	78287	0 %	0 %	50 %	50 %	384423434
1518	NC_017270	AAG	2	6	78308	78313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423434
1519	NC_017270	TAC	2	6	78353	78358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423434
1520	NC_017270	CAC	2	6	78393	78398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423434
1521	NC_017270	GTT	2	6	78429	78434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423434
1522	NC_017270	AGT	2	6	78436	78441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423434
1523	NC_017270	AAG	2	6	78446	78451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423434
1524	NC_017270	CTG	2	6	78641	78646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423434
1525	NC_017270	CGG	2	6	78657	78662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423434
1526	NC_017270	GATG	2	8	78738	78745	25 %	25 %	50 %	0 %	384423434
1527	NC_017270	CTGG	2	8	78749	78756	0 %	25 %	50 %	25 %	384423434
1528	NC_017270	GGC	2	6	78760	78765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423434
1529	NC_017270	CTG	2	6	78864	78869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423435
1530	NC_017270	AAT	2	6	78885	78890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423435
1531	NC_017270	ATG	2	6	78934	78939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423435
1532	NC_017270	GC	3	6	78993	78998	0 %	0 %	50 %	50 %	384423435
1533	NC_017270	GC	3	6	79019	79024	0 %	0 %	50 %	50 %	384423435
1534	NC_017270	AACC	2	8	79081	79088	50 %	0 %	0 %	50 %	384423435
1535	NC_017270	GTG	2	6	79093	79098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423435
1536	NC_017270	CAGCGC	2	12	79131	79142	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384423435
1537	NC_017270	CAG	2	6	79230	79235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423435
1538	NC_017270	CAG	2	6	79242	79247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423435
1539	NC_017270	CAC	2	6	79311	79316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423435
1540	NC_017270	GCC	2	6	79384	79389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423435
1541	NC_017270	AGC	2	6	79447	79452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423435
1542	NC_017270	TAAA	2	8	79463	79470	75 %	25 %	0 %	0 %	384423435
1543	NC_017270	GTA	2	6	79512	79517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423435
1544	NC_017270	GCA	2	6	79567	79572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423435
1545	NC_017270	AAGCC	2	10	79691	79700	40 %	0 %	20 %	40 %	384423435
1546	NC_017270	CG	3	6	79710	79715	0 %	0 %	50 %	50 %	384423435
1547	NC_017270	TCAT	2	8	79720	79727	25 %	50 %	0 %	25 %	384423435
1548	NC_017270	CT	3	6	79735	79740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_017270	CAA	2	6	79780	79785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_017270	AGTG	2	8	79894	79901	25 %	25 %	50 %	0 %	384423436
1551	NC_017270	TGG	2	6	79928	79933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423436
1552	NC_017270	AGC	2	6	79938	79943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423436
1553	NC_017270	CAA	2	6	79973	79978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423436
1554	NC_017270	AGC	2	6	79983	79988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423436
1555	NC_017270	GCA	2	6	80005	80010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423436
1556	NC_017270	GCT	2	6	80029	80034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423436
1557	NC_017270	CAC	2	6	80035	80040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423436
1558	NC_017270	CAA	2	6	80045	80050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423436
1559	NC_017270	CAG	2	6	80171	80176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423436
1560	NC_017270	CGC	2	6	80203	80208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423436
1561	NC_017270	AAG	2	6	80241	80246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423436
1562	NC_017270	TCA	2	6	80251	80256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423436
1563	NC_017270	GCA	2	6	80257	80262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423436
1564	NC_017270	TGG	2	6	80265	80270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423436
1565	NC_017270	GCT	2	6	80290	80295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423436
1566	NC_017270	CAC	2	6	80412	80417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423436
1567	NC_017270	AGC	2	6	80424	80429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423436
1568	NC_017270	AAG	2	6	80541	80546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423436
1569	NC_017270	AGC	2	6	80583	80588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423436
1570	NC_017270	GTG	2	6	80606	80611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423436
1571	NC_017270	GGT	2	6	80740	80745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423436
1572	NC_017270	TGG	2	6	80766	80771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423436
1573	NC_017270	ACTT	2	8	80832	80839	25 %	50 %	0 %	25 %	384423436
1574	NC_017270	ATT	2	6	81002	81007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423436
1575	NC_017270	CAC	2	6	81019	81024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423436
1576	NC_017270	TGG	2	6	81030	81035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423436
1577	NC_017270	AGA	2	6	81142	81147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423436
1578	NC_017270	GGC	2	6	81161	81166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423436
1579	NC_017270	GC	3	6	81165	81170	0 %	0 %	50 %	50 %	384423436
1580	NC_017270	ATTG	2	8	81298	81305	25 %	50 %	25 %	0 %	384423436
1581	NC_017270	CAA	2	6	81314	81319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423436
1582	NC_017270	TAG	2	6	81345	81350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423436
1583	NC_017270	CGC	2	6	81394	81399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_017270	AAT	2	6	81423	81428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423437
1585	NC_017270	CGTA	2	8	81498	81505	25 %	25 %	25 %	25 %	384423437
1586	NC_017270	CAT	2	6	81564	81569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423437
1587	NC_017270	GCG	2	6	81665	81670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423437
1588	NC_017270	GCG	2	6	81785	81790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423437
1589	NC_017270	GAA	2	6	81826	81831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423437
1590	NC_017270	TCTG	2	8	81875	81882	0 %	50 %	25 %	25 %	384423437
1591	NC_017270	CGG	2	6	81939	81944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423437
1592	NC_017270	ATG	2	6	82052	82057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423437
1593	NC_017270	GCTATC	2	12	82064	82075	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384423437
1594	NC_017270	GCAT	2	8	82091	82098	25 %	25 %	25 %	25 %	384423437
1595	NC_017270	ATG	2	6	82123	82128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423437
1596	NC_017270	TTA	2	6	82155	82160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423437
1597	NC_017270	CGG	2	6	82170	82175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423437
1598	NC_017270	GCT	2	6	82212	82217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_017270	TTGC	2	8	82224	82231	0 %	50 %	25 %	25 %	384423438
1600	NC_017270	TCA	2	6	82288	82293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423438
1601	NC_017270	ATG	2	6	82294	82299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423438
1602	NC_017270	CTG	2	6	82320	82325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423438
1603	NC_017270	AATC	2	8	82368	82375	50 %	25 %	0 %	25 %	384423438
1604	NC_017270	TCAG	2	8	82390	82397	25 %	25 %	25 %	25 %	384423438
1605	NC_017270	TGA	2	6	82408	82413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423438
1606	NC_017270	TTC	2	6	82462	82467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423438
1607	NC_017270	CAAG	2	8	82505	82512	50 %	0 %	25 %	25 %	384423438
1608	NC_017270	TGA	2	6	82564	82569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423438
1609	NC_017270	AGA	2	6	82589	82594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423438
1610	NC_017270	TGG	2	6	82621	82626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423438
1611	NC_017270	CA	3	6	82627	82632	50 %	0 %	0 %	50 %	384423438
1612	NC_017270	GC	3	6	82663	82668	0 %	0 %	50 %	50 %	384423438
1613	NC_017270	CAT	2	6	82919	82924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423439
1614	NC_017270	T	6	6	82959	82964	0 %	100 %	0 %	0 %	384423439
1615	NC_017270	GAT	2	6	83056	83061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423439
1616	NC_017270	CCG	2	6	83084	83089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423439
1617	NC_017270	CAAGC	2	10	83147	83156	40 %	0 %	20 %	40 %	384423439
1618	NC_017270	GAA	3	9	83165	83173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423439
1619	NC_017270	TGA	2	6	83200	83205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423439
1620	NC_017270	AC	3	6	83248	83253	50 %	0 %	0 %	50 %	384423439
1621	NC_017270	CGC	2	6	83387	83392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423439
1622	NC_017270	GT	3	6	83652	83657	0 %	50 %	50 %	0 %	384423439
1623	NC_017270	TTC	2	6	83684	83689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423439
1624	NC_017270	CTT	2	6	83827	83832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423439
1625	NC_017270	CGC	2	6	83846	83851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423439
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2000	NC_017270	ACAGC	2	10	104289	104298	40 %	0 %	20 %	40 %	384423459

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