MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017270	AGA	2	6	822102	822107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384424039
16002	NC_017270	AAGA	2	8	822130	822137	75 %	0 %	25 %	0 %	384424039
16003	NC_017270	CA	3	6	822204	822209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16004	NC_017270	GAT	2	6	822215	822220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_017270	CTT	2	6	822324	822329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_017270	CTT	2	6	822626	822631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_017270	AGTG	2	8	822645	822652	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_017270	TGT	2	6	822674	822679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_017270	GTT	2	6	822694	822699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_017270	ACTT	2	8	822736	822743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16011	NC_017270	TC	3	6	822775	822780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16012	NC_017270	CAA	2	6	822789	822794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_017270	AACA	2	8	822850	822857	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16014	NC_017270	AAT	2	6	822887	822892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384424040
16015	NC_017270	AAT	2	6	822925	822930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384424040
16016	NC_017270	TTCATC	2	12	822931	822942	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384424040
16017	NC_017270	CTA	2	6	822945	822950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424040
16018	NC_017270	AG	3	6	822991	822996	50 %	0 %	50 %	0 %	384424040
16019	NC_017270	GGC	2	6	823006	823011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384424040
16020	NC_017270	CCA	2	6	823030	823035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384424040
16021	NC_017270	CAT	2	6	823039	823044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424040
16022	NC_017270	GCT	2	6	823118	823123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424040
16023	NC_017270	GA	3	6	823171	823176	50 %	0 %	50 %	0 %	384424040
16024	NC_017270	CTT	2	6	823255	823260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384424040
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16026	NC_017270	CT	3	6	823360	823365	0 %	50 %	0 %	50 %	384424040
16027	NC_017270	T	7	7	823368	823374	0 %	100 %	0 %	0 %	384424040
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16029	NC_017270	AATT	2	8	823413	823420	50 %	50 %	0 %	0 %	384424040
16030	NC_017270	AAC	2	6	823485	823490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384424040
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16033	NC_017270	T	6	6	823573	823578	0 %	100 %	0 %	0 %	384424040
16034	NC_017270	GGC	2	6	823591	823596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384424040
16035	NC_017270	TCA	2	6	823650	823655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424040
16036	NC_017270	AGT	2	6	823721	823726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384424040
16037	NC_017270	TAG	2	6	824054	824059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384424040
16038	NC_017270	CTCTTT	2	12	824131	824142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384424040
16039	NC_017270	TGTC	2	8	824182	824189	0 %	50 %	25 %	25 %	384424040
16040	NC_017270	GCT	2	6	824260	824265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_017270	GTT	2	6	824298	824303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_017270	T	6	6	824306	824311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_017270	A	6	6	824328	824333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_017270	TGG	2	6	824364	824369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_017270	G	6	6	824375	824380	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_017270	TAC	2	6	824416	824421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_017270	CAC	2	6	824444	824449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16048	NC_017270	GGA	2	6	824584	824589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_017270	GCT	2	6	824612	824617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_017270	TCG	2	6	824630	824635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_017270	T	7	7	824646	824652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_017270	TCA	2	6	824817	824822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424041
16053	NC_017270	TTTC	2	8	824850	824857	0 %	75 %	0 %	25 %	384424041
16054	NC_017270	ATTTTG	2	12	824903	824914	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384424041
16055	NC_017270	ACGA	2	8	824919	824926	50 %	0 %	25 %	25 %	384424041
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16057	NC_017270	TGC	2	6	825059	825064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424041
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16059	NC_017270	T	6	6	825226	825231	0 %	100 %	0 %	0 %	384424041
16060	NC_017270	T	6	6	825275	825280	0 %	100 %	0 %	0 %	384424041
16061	NC_017270	TTTG	2	8	825328	825335	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_017270	TTGTG	2	10	825377	825386	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_017270	G	6	6	825410	825415	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_017270	GCAGA	2	10	825508	825517	40 %	0 %	40 %	20 %	384424042
16065	NC_017270	ATG	2	6	825533	825538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384424042
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16067	NC_017270	GTT	2	6	825566	825571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384424042
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16071	NC_017270	GAGTTT	2	12	825787	825798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384424042
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16080	NC_017270	A	7	7	826236	826242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_017270	CTTTT	2	10	826261	826270	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16082	NC_017270	T	6	6	826267	826272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_017270	GAA	2	6	826304	826309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384424044
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16088	NC_017270	TTG	2	6	826526	826531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384424044
16089	NC_017270	TGAT	2	8	826548	826555	25 %	50 %	25 %	0 %	384424044
16090	NC_017270	TCGAT	2	10	826557	826566	20 %	40 %	20 %	20 %	384424044
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16094	NC_017270	ATA	2	6	826689	826694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_017270	A	6	6	826781	826786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_017270	AC	3	6	827006	827011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16097	NC_017270	GCT	2	6	827057	827062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_017270	TCA	2	6	827090	827095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16100	NC_017270	TCG	2	6	827214	827219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_017270	GC	3	6	827262	827267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16102	NC_017270	GCA	2	6	827274	827279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_017270	GCTCA	2	10	827308	827317	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16104	NC_017270	GCGG	2	8	827387	827394	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16105	NC_017270	CAA	2	6	827398	827403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16106	NC_017270	TGC	2	6	827478	827483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_017270	ATG	2	6	827525	827530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_017270	CG	3	6	827535	827540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16109	NC_017270	TCT	2	6	827565	827570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_017270	AGT	2	6	827611	827616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_017270	CCA	2	6	827662	827667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16112	NC_017270	ATCA	2	8	827708	827715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16113	NC_017270	CTT	2	6	827755	827760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_017270	CG	3	6	827783	827788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16115	NC_017270	CGC	2	6	827809	827814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16116	NC_017270	TTG	2	6	827927	827932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16119	NC_017270	GA	3	6	828127	828132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_017270	TAA	2	6	828151	828156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16121	NC_017270	TGA	2	6	828181	828186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_017270	TCT	2	6	828228	828233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_017270	GGC	2	6	828272	828277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16124	NC_017270	ACC	2	6	828329	828334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16126	NC_017270	T	6	6	828556	828561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_017270	GTA	2	6	828647	828652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384424045
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16247	NC_017270	GCG	2	6	833675	833680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384424048
16248	NC_017270	CTT	2	6	833707	833712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384424048
16249	NC_017270	GAA	2	6	833722	833727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384424048
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16251	NC_017270	GA	3	6	833850	833855	50 %	0 %	50 %	0 %	384424049
16252	NC_017270	CGA	2	6	834008	834013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384424049
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16257	NC_017270	TGC	2	6	834416	834421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424050
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16290	NC_017270	GATC	2	8	836591	836598	25 %	25 %	25 %	25 %	384424052
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16298	NC_017270	CCAT	2	8	837132	837139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16299	NC_017270	CTTTTG	2	12	837148	837159	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16300	NC_017270	GT	4	8	837239	837246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16301	NC_017270	A	7	7	837288	837294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16302	NC_017270	GCA	2	6	837430	837435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16305	NC_017270	TTCTT	2	10	837564	837573	0 %	80 %	0 %	20 %	384424054
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16308	NC_017270	TTTGA	2	10	837626	837635	20 %	60 %	20 %	0 %	384424054
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16345	NC_017270	GACT	2	8	839860	839867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16348	NC_017270	TAT	2	6	839929	839934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16349	NC_017270	ACA	2	6	839960	839965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16350	NC_017270	CA	3	6	839982	839987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16351	NC_017270	TTC	2	6	840002	840007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16352	NC_017270	CTT	2	6	840109	840114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384424057
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16356	NC_017270	GCT	2	6	840214	840219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424057
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16359	NC_017270	TCG	2	6	840279	840284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424057
16360	NC_017270	CATAGC	2	12	840292	840303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384424057
16361	NC_017270	T	6	6	840320	840325	0 %	100 %	0 %	0 %	384424057
16362	NC_017270	CTG	2	6	840326	840331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424057
16363	NC_017270	CATC	2	8	840406	840413	25 %	25 %	0 %	50 %	384424057
16364	NC_017270	TGT	2	6	840430	840435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384424057
16365	NC_017270	AGG	2	6	840436	840441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384424057
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16368	NC_017270	CCACC	2	10	840514	840523	20 %	0 %	0 %	80 %	384424057
16369	NC_017270	GC	3	6	840569	840574	0 %	0 %	50 %	50 %	384424057
16370	NC_017270	CAT	2	6	840590	840595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424057
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16372	NC_017270	CTG	2	6	840685	840690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424057
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