MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017270	GGC	2	6	284656	284661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423612
5502	NC_017270	AGTACC	2	12	284761	284772	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384423612
5503	NC_017270	ATCC	2	8	284881	284888	25 %	25 %	0 %	50 %	384423612
5504	NC_017270	TGAC	2	8	285093	285100	25 %	25 %	25 %	25 %	384423612
5505	NC_017270	TTC	2	6	285112	285117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423612
5506	NC_017270	AGT	2	6	285329	285334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017270	TGAT	2	8	285342	285349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017270	CGG	2	6	285376	285381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_017270	G	6	6	285397	285402	0 %	0 %	100 %	0 %	384423613
5510	NC_017270	TTG	2	6	285461	285466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423613
5511	NC_017270	ATC	2	6	285498	285503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423613
5512	NC_017270	TGA	2	6	285559	285564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423613
5513	NC_017270	ATC	2	6	285573	285578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423613
5514	NC_017270	TG	3	6	285616	285621	0 %	50 %	50 %	0 %	384423613
5515	NC_017270	GCC	2	6	285641	285646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423613
5516	NC_017270	TCT	2	6	285747	285752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423613
5517	NC_017270	GCT	2	6	285790	285795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423613
5518	NC_017270	TTC	2	6	285974	285979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423613
5519	NC_017270	CTT	2	6	286000	286005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423613
5520	NC_017270	CCA	2	6	286006	286011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423613
5521	NC_017270	ACGTG	2	10	286098	286107	20 %	20 %	40 %	20 %	384423613
5522	NC_017270	GTT	2	6	286142	286147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423613
5523	NC_017270	GGC	2	6	286151	286156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423613
5524	NC_017270	CAC	2	6	286211	286216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423613
5525	NC_017270	ACC	2	6	286229	286234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423613
5526	NC_017270	GCC	3	9	286235	286243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423613
5527	NC_017270	ATA	2	6	286254	286259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423613
5528	NC_017270	TCG	2	6	286302	286307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423613
5529	NC_017270	T	6	6	286352	286357	0 %	100 %	0 %	0 %	384423613
5530	NC_017270	CCG	2	6	286516	286521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423613
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5532	NC_017270	GAA	2	6	286672	286677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423613
5533	NC_017270	ATT	2	6	286740	286745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423614
5534	NC_017270	AAC	2	6	286750	286755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423614
5535	NC_017270	CAA	2	6	286791	286796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423614
5536	NC_017270	TCA	2	6	286839	286844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423614
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5538	NC_017270	GCT	2	6	286991	286996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423614
5539	NC_017270	GCT	2	6	287015	287020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423614
5540	NC_017270	CTGGTG	2	12	287046	287057	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384423614
5541	NC_017270	AACT	2	8	287164	287171	50 %	25 %	0 %	25 %	384423614
5542	NC_017270	CTT	2	6	287179	287184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423614
5543	NC_017270	TTTC	2	8	287204	287211	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5544	NC_017270	GCA	2	6	287287	287292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423615
5545	NC_017270	TGA	2	6	287365	287370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423615
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5547	NC_017270	ATG	2	6	287488	287493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423615
5548	NC_017270	TCAA	2	8	287527	287534	50 %	25 %	0 %	25 %	384423615
5549	NC_017270	TAA	2	6	287658	287663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423615
5550	NC_017270	TG	3	6	287733	287738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017270	TTA	2	6	287805	287810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017270	GCA	2	6	287846	287851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_017270	AGA	2	6	287974	287979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017270	GA	3	6	287985	287990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_017270	GCAA	2	8	288033	288040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_017270	CTT	2	6	288306	288311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423616
5557	NC_017270	CAT	2	6	288339	288344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423616
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5559	NC_017270	CCA	2	6	288429	288434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423616
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5562	NC_017270	AGC	2	6	288641	288646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423616
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5570	NC_017270	TGCG	2	8	289017	289024	0 %	25 %	50 %	25 %	384423616
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5585	NC_017270	CGA	2	6	289902	289907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423616
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5587	NC_017270	TTCGT	2	10	290108	290117	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5588	NC_017270	TCAG	2	8	290127	290134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5589	NC_017270	TG	3	6	290183	290188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_017270	A	6	6	290206	290211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_017270	GA	3	6	290216	290221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_017270	CGC	2	6	290225	290230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_017270	AC	3	6	290245	290250	50 %	0 %	0 %	50 %	384423617
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5622	NC_017270	CAC	2	6	291652	291657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423618
5623	NC_017270	AGC	2	6	291660	291665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423618
5624	NC_017270	GGA	2	6	291683	291688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384423618
5625	NC_017270	GAT	2	6	291712	291717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423618
5626	NC_017270	TGTT	2	8	291800	291807	0 %	75 %	25 %	0 %	384423618
5627	NC_017270	TCA	2	6	291824	291829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423618
5628	NC_017270	GAGT	2	8	291869	291876	25 %	25 %	50 %	0 %	384423618
5629	NC_017270	GA	3	6	291901	291906	50 %	0 %	50 %	0 %	384423618
5630	NC_017270	TCA	3	9	291966	291974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423618
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5633	NC_017270	TGCA	2	8	292075	292082	25 %	25 %	25 %	25 %	384423618
5634	NC_017270	GTT	2	6	292191	292196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423618
5635	NC_017270	GCT	2	6	292215	292220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423618
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5637	NC_017270	CTG	2	6	292294	292299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423618
5638	NC_017270	TCAA	2	8	292310	292317	50 %	25 %	0 %	25 %	384423618
5639	NC_017270	TTA	2	6	292337	292342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423618
5640	NC_017270	A	7	7	292385	292391	100 %	0 %	0 %	0 %	384423618
5641	NC_017270	GCA	2	6	292401	292406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423618
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5643	NC_017270	TTC	2	6	292453	292458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423618
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5645	NC_017270	ATC	2	6	292483	292488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423618
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5647	NC_017270	ATCA	2	8	292585	292592	50 %	25 %	0 %	25 %	384423618
5648	NC_017270	TGC	2	6	292646	292651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423618
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5653	NC_017270	GAT	2	6	292811	292816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_017270	CCG	2	6	292817	292822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5655	NC_017270	T	6	6	292896	292901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5656	NC_017270	GC	3	6	292927	292932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5657	NC_017270	T	6	6	293011	293016	0 %	100 %	0 %	0 %	384423619
5658	NC_017270	CGAC	2	8	293079	293086	25 %	0 %	25 %	50 %	384423619
5659	NC_017270	TTGG	2	8	293096	293103	0 %	50 %	50 %	0 %	384423619
5660	NC_017270	TGC	2	6	293136	293141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423619
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5663	NC_017270	GGC	2	6	293237	293242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423619
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5732	NC_017270	TTGG	2	8	297370	297377	0 %	50 %	50 %	0 %	384423620
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5739	NC_017270	TCTAAC	2	12	297865	297876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423621
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5743	NC_017270	T	6	6	298182	298187	0 %	100 %	0 %	0 %	384423621
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