MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017270	CAT	2	6	260201	260206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423591
5002	NC_017270	CAC	2	6	260243	260248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423591
5003	NC_017270	TGC	2	6	260298	260303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423591
5004	NC_017270	TGT	2	6	260341	260346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423591
5005	NC_017270	TGC	2	6	260394	260399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423591
5006	NC_017270	TCA	2	6	260409	260414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423591
5007	NC_017270	GCG	2	6	260452	260457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423591
5008	NC_017270	GTT	2	6	260498	260503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423591
5009	NC_017270	CATCGC	2	12	260552	260563	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384423591
5010	NC_017270	GC	3	6	260600	260605	0 %	0 %	50 %	50 %	384423591
5011	NC_017270	GCA	2	6	260668	260673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423591
5012	NC_017270	GA	3	6	260675	260680	50 %	0 %	50 %	0 %	384423591
5013	NC_017270	CAG	2	6	260767	260772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423591
5014	NC_017270	ACC	2	6	260802	260807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423591
5015	NC_017270	GCA	2	6	260829	260834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423591
5016	NC_017270	TTG	2	6	260933	260938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423591
5017	NC_017270	AT	4	8	261027	261034	50 %	50 %	0 %	0 %	384423591
5018	NC_017270	TCT	2	6	261088	261093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_017270	GAA	2	6	261136	261141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017270	T	6	6	261173	261178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017270	TC	3	6	261241	261246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_017270	GTT	2	6	261293	261298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017270	TCGAT	2	10	261387	261396	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5024	NC_017270	AGC	2	6	261486	261491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423592
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5026	NC_017270	TAC	2	6	261702	261707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_017270	AGC	2	6	261743	261748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423593
5028	NC_017270	TCCT	2	8	261754	261761	0 %	50 %	0 %	50 %	384423593
5029	NC_017270	T	7	7	261761	261767	0 %	100 %	0 %	0 %	384423593
5030	NC_017270	CT	3	6	261769	261774	0 %	50 %	0 %	50 %	384423593
5031	NC_017270	ATCA	2	8	261823	261830	50 %	25 %	0 %	25 %	384423593
5032	NC_017270	TGG	2	6	261837	261842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423593
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5035	NC_017270	CAG	2	6	262075	262080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423593
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5037	NC_017270	ACAA	2	8	262178	262185	75 %	0 %	0 %	25 %	384423593
5038	NC_017270	CGA	2	6	262362	262367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423593
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5040	NC_017270	GAT	2	6	262381	262386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423593
5041	NC_017270	TG	3	6	262399	262404	0 %	50 %	50 %	0 %	384423593
5042	NC_017270	A	6	6	262459	262464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017270	A	6	6	262475	262480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017270	T	6	6	262496	262501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017270	AAG	2	6	262510	262515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017270	CG	3	6	262552	262557	0 %	0 %	50 %	50 %	384423594
5047	NC_017270	CGG	2	6	262571	262576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423594
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5050	NC_017270	TCACC	2	10	262767	262776	20 %	20 %	0 %	60 %	384423594
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5053	NC_017270	GC	3	6	262829	262834	0 %	0 %	50 %	50 %	384423594
5054	NC_017270	GCT	2	6	262877	262882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423594
5055	NC_017270	CAT	2	6	262915	262920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423594
5056	NC_017270	ATCA	2	8	262987	262994	50 %	25 %	0 %	25 %	384423594
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5058	NC_017270	CCG	2	6	263132	263137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423594
5059	NC_017270	TGG	2	6	263184	263189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423594
5060	NC_017270	TAGG	2	8	263193	263200	25 %	25 %	50 %	0 %	384423594
5061	NC_017270	TTC	2	6	263254	263259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423594
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5063	NC_017270	CTGC	2	8	263273	263280	0 %	25 %	25 %	50 %	384423594
5064	NC_017270	CAA	2	6	263346	263351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423594
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5068	NC_017270	TGCGC	2	10	263519	263528	0 %	20 %	40 %	40 %	384423594
5069	NC_017270	TGGG	2	8	263531	263538	0 %	25 %	75 %	0 %	384423594
5070	NC_017270	GTG	2	6	263592	263597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423594
5071	NC_017270	GAT	2	6	263800	263805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423594
5072	NC_017270	CTTA	2	8	263827	263834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_017270	ATC	2	6	263907	263912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423595
5074	NC_017270	ATCA	2	8	263936	263943	50 %	25 %	0 %	25 %	384423595
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5099	NC_017270	CTT	2	6	264850	264855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423595
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5108	NC_017270	CAC	3	9	265160	265168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423595
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5112	NC_017270	CGTC	2	8	265269	265276	0 %	25 %	25 %	50 %	384423595
5113	NC_017270	CAT	2	6	265277	265282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423595
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5121	NC_017270	AAT	2	6	265663	265668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017270	A	6	6	265673	265678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5124	NC_017270	AGT	2	6	265733	265738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5248	NC_017270	CTG	2	6	271309	271314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423600
5249	NC_017270	GAT	2	6	271319	271324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423600
5250	NC_017270	TTC	2	6	271425	271430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423600
5251	NC_017270	TG	3	6	271433	271438	0 %	50 %	50 %	0 %	384423600
5252	NC_017270	ACC	2	6	271458	271463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423600
5253	NC_017270	TGA	2	6	271514	271519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423600
5254	NC_017270	TGA	2	6	271631	271636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423600
5255	NC_017270	CTG	2	6	271674	271679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423600
5256	NC_017270	TGC	2	6	271723	271728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423600
5257	NC_017270	TGC	2	6	271783	271788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423600
5258	NC_017270	TGC	2	6	271912	271917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423600
5259	NC_017270	TGGCA	2	10	271942	271951	20 %	20 %	40 %	20 %	384423600
5260	NC_017270	TGG	2	6	271996	272001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423600
5261	NC_017270	TCC	2	6	272033	272038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423600
5262	NC_017270	GACA	2	8	272072	272079	50 %	0 %	25 %	25 %	384423600
5263	NC_017270	TG	3	6	272113	272118	0 %	50 %	50 %	0 %	384423600
5264	NC_017270	GC	3	6	272125	272130	0 %	0 %	50 %	50 %	384423600
5265	NC_017270	AG	4	8	272270	272277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_017270	CT	4	8	272286	272293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5267	NC_017270	T	6	6	272293	272298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5268	NC_017270	CGT	2	6	272322	272327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5269	NC_017270	GGC	2	6	272398	272403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423601
5270	NC_017270	GTGCT	2	10	272435	272444	0 %	40 %	40 %	20 %	384423601
5271	NC_017270	TCG	2	6	272474	272479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423601
5272	NC_017270	GTTG	2	8	272517	272524	0 %	50 %	50 %	0 %	384423601
5273	NC_017270	CTG	2	6	272569	272574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423601
5274	NC_017270	TGC	2	6	272609	272614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423601
5275	NC_017270	T	6	6	272650	272655	0 %	100 %	0 %	0 %	384423601
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5280	NC_017270	CGC	2	6	272983	272988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423601
5281	NC_017270	CTT	2	6	273018	273023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423601
5282	NC_017270	AAT	2	6	273172	273177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423601
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5298	NC_017270	TG	3	6	274193	274198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5299	NC_017270	CGA	2	6	274215	274220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5304	NC_017270	TGT	2	6	274562	274567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423603
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5315	NC_017270	CTG	2	6	274999	275004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423604
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5320	NC_017270	GTTG	2	8	275235	275242	0 %	50 %	50 %	0 %	384423604
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5350	NC_017270	TATT	2	8	276994	277001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5351	NC_017270	AAT	2	6	277009	277014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5352	NC_017270	ATT	2	6	277067	277072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5353	NC_017270	TTG	2	6	277102	277107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5354	NC_017270	A	7	7	277147	277153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5359	NC_017270	GCC	2	6	277397	277402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423605
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5370	NC_017270	GGT	2	6	278030	278035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423606
5371	NC_017270	CGC	2	6	278036	278041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423606
5372	NC_017270	GCG	2	6	278061	278066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423606
5373	NC_017270	GCCA	2	8	278168	278175	25 %	0 %	25 %	50 %	384423606
5374	NC_017270	CG	3	6	278195	278200	0 %	0 %	50 %	50 %	384423606
5375	NC_017270	GCC	2	6	278219	278224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423606
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5380	NC_017270	CAG	2	6	278453	278458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423606
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5383	NC_017270	CAG	2	6	278639	278644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423606
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5391	NC_017270	CAG	2	6	278972	278977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423606
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5396	NC_017270	CAG	3	9	279116	279124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423606
5397	NC_017270	AAT	2	6	279131	279136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423606
5398	NC_017270	CGC	2	6	279143	279148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423606
5399	NC_017270	GTA	2	6	279181	279186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5400	NC_017270	GTA	2	6	279357	279362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423607
5401	NC_017270	CAT	2	6	279364	279369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423607
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5405	NC_017270	CAGT	2	8	279739	279746	25 %	25 %	25 %	25 %	384423607
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5427	NC_017270	TGC	2	6	280958	280963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423608
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5430	NC_017270	CGG	2	6	281162	281167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423608
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5435	NC_017270	CGG	2	6	281451	281456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423608
5436	NC_017270	TGC	2	6	281486	281491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423608
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5439	NC_017270	TG	3	6	281717	281722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5440	NC_017270	AC	3	6	281736	281741	50 %	0 %	0 %	50 %	384423609
5441	NC_017270	CGA	2	6	281772	281777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423609
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5444	NC_017270	GCT	2	6	281949	281954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423609
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5455	NC_017270	GGCA	2	8	282271	282278	25 %	0 %	50 %	25 %	384423609
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5467	NC_017270	GAA	2	6	282774	282779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5468	NC_017270	TG	4	8	282802	282809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5469	NC_017270	TAA	2	6	282822	282827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5470	NC_017270	A	6	6	282826	282831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5471	NC_017270	A	6	6	282853	282858	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5472	NC_017270	T	6	6	282886	282891	0 %	100 %	0 %	0 %	384423610
5473	NC_017270	CAT	2	6	282925	282930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423610
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5477	NC_017270	CTT	2	6	283029	283034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423610
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5479	NC_017270	GTA	2	6	283124	283129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423610
5480	NC_017270	CTCTT	2	10	283179	283188	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5481	NC_017270	ATG	2	6	283193	283198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423611
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5484	NC_017270	ATG	2	6	283384	283389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423611
5485	NC_017270	GTC	2	6	283469	283474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423611
5486	NC_017270	GA	3	6	283702	283707	50 %	0 %	50 %	0 %	384423611
5487	NC_017270	GCA	2	6	283814	283819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423611
5488	NC_017270	T	6	6	283848	283853	0 %	100 %	0 %	0 %	384423611
5489	NC_017270	GAT	2	6	283878	283883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423611
5490	NC_017270	CAT	2	6	284034	284039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423611
5491	NC_017270	CGA	2	6	284117	284122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5492	NC_017270	GC	3	6	284189	284194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5493	NC_017270	T	7	7	284205	284211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_017270	CTAGC	2	10	284299	284308	20 %	20 %	20 %	40 %	384423612
5495	NC_017270	GCC	2	6	284431	284436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423612
5496	NC_017270	TGA	2	6	284454	284459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423612
5497	NC_017270	GGCC	2	8	284481	284488	0 %	0 %	50 %	50 %	384423612
5498	NC_017270	ACC	2	6	284501	284506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423612
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5500	NC_017270	AGT	2	6	284600	284605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423612

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