MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52118	NC_017270	CAT	2	6	2722517	2722522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425633
52119	NC_017270	AGTCAA	2	12	2722766	2722777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384425633
52120	NC_017270	CAC	2	6	2722873	2722878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425633
52121	NC_017270	CGC	2	6	2722893	2722898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425633
52122	NC_017270	TGA	2	6	2722910	2722915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425633
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52127	NC_017270	GT	3	6	2723104	2723109	0 %	50 %	50 %	0 %	384425634
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52153	NC_017270	GCT	2	6	2724871	2724876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52155	NC_017270	GGC	2	6	2724930	2724935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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52158	NC_017270	GCTC	2	8	2724986	2724993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52159	NC_017270	TACC	2	8	2724996	2725003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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52223	NC_017270	TG	3	6	2728020	2728025	0 %	50 %	50 %	0 %	384425639
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52232	NC_017270	GCCCAT	2	12	2728713	2728724	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384425640
52233	NC_017270	T	6	6	2728730	2728735	0 %	100 %	0 %	0 %	384425640
52234	NC_017270	CCA	2	6	2728758	2728763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425640
52235	NC_017270	AAT	2	6	2728780	2728785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425640
52236	NC_017270	TCA	2	6	2728790	2728795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425640
52237	NC_017270	CAC	2	6	2728815	2728820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425641
52238	NC_017270	TCA	2	6	2729074	2729079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425641
52239	NC_017270	TGC	2	6	2729135	2729140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425641
52240	NC_017270	GCG	2	6	2729242	2729247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425641
52241	NC_017270	AAG	2	6	2729285	2729290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425641
52242	NC_017270	CCT	2	6	2729339	2729344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384425641
52243	NC_017270	CAG	2	6	2729349	2729354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425641
52244	NC_017270	GCG	2	6	2729420	2729425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425641
52245	NC_017270	ACTC	2	8	2729447	2729454	25 %	25 %	0 %	50 %	384425641
52246	NC_017270	TCA	2	6	2729545	2729550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425641
52247	NC_017270	GAT	2	6	2729642	2729647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425641
52248	NC_017270	GC	3	6	2729656	2729661	0 %	0 %	50 %	50 %	384425641
52249	NC_017270	CCG	2	6	2729690	2729695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425641
52250	NC_017270	CA	3	6	2729715	2729720	50 %	0 %	0 %	50 %	384425641
52251	NC_017270	TCT	2	6	2729755	2729760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425641
52252	NC_017270	GCA	2	6	2729771	2729776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425641
52253	NC_017270	CGC	2	6	2729838	2729843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425641
52254	NC_017270	CGCTG	2	10	2729858	2729867	0 %	20 %	40 %	40 %	384425641
52255	NC_017270	CTT	2	6	2729930	2729935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425641
52256	NC_017270	GCT	2	6	2729936	2729941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425641
52257	NC_017270	ACT	2	6	2729982	2729987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425641
52258	NC_017270	GCG	3	9	2730028	2730036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425642
52259	NC_017270	AAT	2	6	2730129	2730134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425642
52260	NC_017270	TTC	2	6	2730155	2730160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425642
52261	NC_017270	ATC	2	6	2730214	2730219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425642
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52264	NC_017270	TAAGG	2	10	2730377	2730386	40 %	20 %	40 %	0 %	384425642
52265	NC_017270	C	6	6	2730404	2730409	0 %	0 %	0 %	100 %	384425642
52266	NC_017270	TGT	2	6	2730413	2730418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425642
52267	NC_017270	CG	3	6	2730421	2730426	0 %	0 %	50 %	50 %	384425642
52268	NC_017270	CTCG	2	8	2730430	2730437	0 %	25 %	25 %	50 %	384425642
52269	NC_017270	CCAA	2	8	2730444	2730451	50 %	0 %	0 %	50 %	384425642
52270	NC_017270	CCG	2	6	2730456	2730461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425642
52271	NC_017270	ATC	2	6	2730476	2730481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425642
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52274	NC_017270	T	6	6	2730634	2730639	0 %	100 %	0 %	0 %	384425642
52275	NC_017270	AAGC	2	8	2730686	2730693	50 %	0 %	25 %	25 %	384425642
52276	NC_017270	GGCT	2	8	2730764	2730771	0 %	25 %	50 %	25 %	384425642
52277	NC_017270	T	6	6	2730814	2730819	0 %	100 %	0 %	0 %	384425642
52278	NC_017270	CTG	2	6	2730856	2730861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425642
52279	NC_017270	GCA	2	6	2730920	2730925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425642
52280	NC_017270	ACGCC	2	10	2730966	2730975	20 %	0 %	20 %	60 %	384425642
52281	NC_017270	CT	3	6	2731002	2731007	0 %	50 %	0 %	50 %	384425643
52282	NC_017270	TCT	2	6	2731164	2731169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425643
52283	NC_017270	GA	3	6	2731186	2731191	50 %	0 %	50 %	0 %	384425643
52284	NC_017270	TGC	2	6	2731200	2731205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425643
52285	NC_017270	CCA	2	6	2731229	2731234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425643
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52288	NC_017270	AGC	2	6	2731359	2731364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425643
52289	NC_017270	GCTC	2	8	2731387	2731394	0 %	25 %	25 %	50 %	384425643
52290	NC_017270	CG	3	6	2731485	2731490	0 %	0 %	50 %	50 %	384425643
52291	NC_017270	CGG	2	6	2731498	2731503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425643
52292	NC_017270	TGC	2	6	2731513	2731518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425643
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52296	NC_017270	CGG	2	6	2731724	2731729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425644
52297	NC_017270	GTCC	2	8	2731759	2731766	0 %	25 %	25 %	50 %	384425644
52298	NC_017270	CGC	2	6	2731791	2731796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425644
52299	NC_017270	TCT	2	6	2731859	2731864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425644
52300	NC_017270	TGAC	2	8	2731894	2731901	25 %	25 %	25 %	25 %	384425644
52301	NC_017270	CGC	2	6	2731920	2731925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425644
52302	NC_017270	CAAG	2	8	2731958	2731965	50 %	0 %	25 %	25 %	384425644
52303	NC_017270	TCA	2	6	2731985	2731990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425644
52304	NC_017270	T	6	6	2732152	2732157	0 %	100 %	0 %	0 %	384425645
52305	NC_017270	TCA	2	6	2732177	2732182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425645
52306	NC_017270	AG	3	6	2732186	2732191	50 %	0 %	50 %	0 %	384425645
52307	NC_017270	CCA	2	6	2732228	2732233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425645
52308	NC_017270	CTT	2	6	2732259	2732264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425645
52309	NC_017270	TGGTT	2	10	2732271	2732280	0 %	60 %	40 %	0 %	384425645
52310	NC_017270	CGG	2	6	2732319	2732324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425645
52311	NC_017270	A	6	6	2732333	2732338	100 %	0 %	0 %	0 %	384425645
52312	NC_017270	AGC	2	6	2732408	2732413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425645
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52315	NC_017270	CTT	2	6	2732652	2732657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425646
52316	NC_017270	TTGG	2	8	2732792	2732799	0 %	50 %	50 %	0 %	384425646
52317	NC_017270	GTC	2	6	2732831	2732836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425646
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52319	NC_017270	TTG	2	6	2732908	2732913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425646
52320	NC_017270	TTG	2	6	2732927	2732932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425646
52321	NC_017270	ACA	2	6	2732948	2732953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425646
52322	NC_017270	CAC	2	6	2732977	2732982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425646
52323	NC_017270	ACC	2	6	2732984	2732989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425646
52324	NC_017270	GTTT	2	8	2733014	2733021	0 %	75 %	25 %	0 %	384425646
52325	NC_017270	T	7	7	2733027	2733033	0 %	100 %	0 %	0 %	384425646
52326	NC_017270	CGC	2	6	2733061	2733066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52327	NC_017270	GAC	2	6	2733071	2733076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52328	NC_017270	TGT	2	6	2733214	2733219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425647
52329	NC_017270	GC	3	6	2733234	2733239	0 %	0 %	50 %	50 %	384425647
52330	NC_017270	CAC	2	6	2733271	2733276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425647
52331	NC_017270	GCA	2	6	2733289	2733294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425647
52332	NC_017270	GGA	2	6	2733300	2733305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425647
52333	NC_017270	TCA	2	6	2733400	2733405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425647
52334	NC_017270	GC	3	6	2733479	2733484	0 %	0 %	50 %	50 %	384425647
52335	NC_017270	GACC	2	8	2733604	2733611	25 %	0 %	25 %	50 %	384425647
52336	NC_017270	AGC	2	6	2733612	2733617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425647
52337	NC_017270	TAC	2	6	2733719	2733724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425647
52338	NC_017270	CAA	2	6	2733731	2733736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425647
52339	NC_017270	ACCG	2	8	2733749	2733756	25 %	0 %	25 %	50 %	384425647
52340	NC_017270	ACC	2	6	2733762	2733767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425647
52341	NC_017270	CAC	2	6	2733770	2733775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425647
52342	NC_017270	CGCC	2	8	2733877	2733884	0 %	0 %	25 %	75 %	384425647
52343	NC_017270	TCA	2	6	2733906	2733911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425647
52344	NC_017270	AG	3	6	2733941	2733946	50 %	0 %	50 %	0 %	384425647
52345	NC_017270	GC	3	6	2733969	2733974	0 %	0 %	50 %	50 %	384425647
52346	NC_017270	CCA	2	6	2733979	2733984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425647
52347	NC_017270	CG	3	6	2734025	2734030	0 %	0 %	50 %	50 %	384425647
52348	NC_017270	GC	3	6	2734145	2734150	0 %	0 %	50 %	50 %	384425647
52349	NC_017270	CCA	2	6	2734168	2734173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425647
52350	NC_017270	T	6	6	2734247	2734252	0 %	100 %	0 %	0 %	384425647
52351	NC_017270	CTT	2	6	2734323	2734328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52352	NC_017270	CAT	2	6	2734365	2734370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52353	NC_017270	CG	3	6	2734390	2734395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52354	NC_017270	CGCC	2	8	2734419	2734426	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52355	NC_017270	CAT	2	6	2734452	2734457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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52475	NC_017270	CTG	2	6	2739643	2739648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425651
52476	NC_017270	CTGCAA	2	12	2739682	2739693	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384425651
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52478	NC_017270	TCA	2	6	2739719	2739724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425651
52479	NC_017270	AAC	2	6	2739733	2739738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425651
52480	NC_017270	CAA	2	6	2739739	2739744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425651
52481	NC_017270	GCGTG	2	10	2739747	2739756	0 %	20 %	60 %	20 %	384425651
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52486	NC_017270	TGC	2	6	2739995	2740000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425651
52487	NC_017270	TAAC	2	8	2740055	2740062	50 %	25 %	0 %	25 %	384425651
52488	NC_017270	CAG	2	6	2740094	2740099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425651
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52490	NC_017270	GCT	2	6	2740175	2740180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425651
52491	NC_017270	TGC	2	6	2740194	2740199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425651
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52493	NC_017270	TCA	2	6	2740333	2740338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425651
52494	NC_017270	A	6	6	2740429	2740434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52495	NC_017270	AT	3	6	2740545	2740550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52496	NC_017270	TGG	2	6	2740580	2740585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52497	NC_017270	AACTG	2	10	2740764	2740773	40 %	20 %	20 %	20 %	384425652
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52499	NC_017270	GTG	2	6	2740841	2740846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425652
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