MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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50002	NC_017270	AGC	2	6	2610238	2610243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425537
50003	NC_017270	T	6	6	2610355	2610360	0 %	100 %	0 %	0 %	384425537
50004	NC_017270	CAT	2	6	2610391	2610396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425537
50005	NC_017270	TGC	2	6	2610409	2610414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425538
50006	NC_017270	CTG	2	6	2610446	2610451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425538
50007	NC_017270	TGC	2	6	2610459	2610464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425538
50008	NC_017270	CACAC	2	10	2610553	2610562	40 %	0 %	0 %	60 %	384425538
50009	NC_017270	TGT	2	6	2610585	2610590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425538
50010	NC_017270	GGCT	2	8	2610659	2610666	0 %	25 %	50 %	25 %	384425538
50011	NC_017270	TGA	2	6	2610672	2610677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425538
50012	NC_017270	CGG	2	6	2610820	2610825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425538
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50019	NC_017270	TGA	2	6	2611072	2611077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425538
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50032	NC_017270	TGC	2	6	2611576	2611581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425539
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50053	NC_017270	GCT	2	6	2612627	2612632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425540
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50117	NC_017270	CATCGG	2	12	2616524	2616535	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384425544
50118	NC_017270	CGC	2	6	2616539	2616544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425544
50119	NC_017270	CAT	2	6	2616591	2616596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425544
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50127	NC_017270	CTCC	2	8	2617046	2617053	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50128	NC_017270	CTT	2	6	2617221	2617226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425545
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50157	NC_017270	ATT	2	6	2618594	2618599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50160	NC_017270	CAGT	2	8	2618748	2618755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50161	NC_017270	A	6	6	2618802	2618807	100 %	0 %	0 %	0 %	384425546
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50221	NC_017270	GCA	2	6	2621987	2621992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425548
50222	NC_017270	T	6	6	2622040	2622045	0 %	100 %	0 %	0 %	384425548
50223	NC_017270	GTT	2	6	2622112	2622117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425548
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50229	NC_017270	TGGCT	2	10	2622316	2622325	0 %	40 %	40 %	20 %	384425548
50230	NC_017270	ATC	2	6	2622433	2622438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425548
50231	NC_017270	GCG	2	6	2622550	2622555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425548
50232	NC_017270	CTG	2	6	2622574	2622579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425548
50233	NC_017270	TGC	2	6	2622605	2622610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425548
50234	NC_017270	CAC	2	6	2622895	2622900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425548
50235	NC_017270	TGGT	2	8	2622929	2622936	0 %	50 %	50 %	0 %	384425548
50236	NC_017270	AGTC	2	8	2623006	2623013	25 %	25 %	25 %	25 %	384425548
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50238	NC_017270	TGC	2	6	2623095	2623100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425548
50239	NC_017270	TGG	2	6	2623122	2623127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425548
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50241	NC_017270	GTT	2	6	2623268	2623273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425548
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50250	NC_017270	GCG	2	6	2623933	2623938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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50266	NC_017270	TCT	2	6	2625269	2625274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425550
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50279	NC_017270	ACAAA	2	10	2625971	2625980	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50280	NC_017270	CAC	2	6	2626078	2626083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425551
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50283	NC_017270	GCC	2	6	2626196	2626201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425551
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50301	NC_017270	GA	3	6	2627403	2627408	50 %	0 %	50 %	0 %	384425552
50302	NC_017270	ATGG	2	8	2627409	2627416	25 %	25 %	50 %	0 %	384425552
50303	NC_017270	GCC	2	6	2627480	2627485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50304	NC_017270	CCA	2	6	2627544	2627549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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50332	NC_017270	CAA	2	6	2629252	2629257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425554
50333	NC_017270	CAC	2	6	2629268	2629273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425554
50334	NC_017270	TCT	2	6	2629330	2629335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425554
50335	NC_017270	TAA	2	6	2629481	2629486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384425554
50336	NC_017270	CAC	2	6	2629517	2629522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425554
50337	NC_017270	AG	3	6	2629592	2629597	50 %	0 %	50 %	0 %	384425554
50338	NC_017270	CAT	2	6	2629606	2629611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425554
50339	NC_017270	CG	3	6	2629653	2629658	0 %	0 %	50 %	50 %	384425554
50340	NC_017270	ACA	2	6	2629714	2629719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425554
50341	NC_017270	GCT	2	6	2629732	2629737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425554
50342	NC_017270	CAG	2	6	2629877	2629882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425554
50343	NC_017270	TC	3	6	2629989	2629994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50344	NC_017270	TGGT	2	8	2630077	2630084	0 %	50 %	50 %	0 %	384425555
50345	NC_017270	T	6	6	2630114	2630119	0 %	100 %	0 %	0 %	384425555
50346	NC_017270	CAT	2	6	2630126	2630131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425555
50347	NC_017270	TGC	2	6	2630133	2630138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425555
50348	NC_017270	T	6	6	2630189	2630194	0 %	100 %	0 %	0 %	384425555
50349	NC_017270	CGC	2	6	2630258	2630263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425555
50350	NC_017270	TG	3	6	2630317	2630322	0 %	50 %	50 %	0 %	384425555
50351	NC_017270	GCA	2	6	2630417	2630422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425555
50352	NC_017270	GC	3	6	2630423	2630428	0 %	0 %	50 %	50 %	384425555
50353	NC_017270	GAA	2	6	2630495	2630500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425555
50354	NC_017270	ATG	2	6	2630514	2630519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425555
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50454	NC_017270	GTC	2	6	2635840	2635845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425561
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50457	NC_017270	GCT	2	6	2635961	2635966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425561
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50463	NC_017270	GAT	2	6	2636304	2636309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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50465	NC_017270	ATT	2	6	2636428	2636433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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