MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 53460

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017270	AT	3	6	234741	234746	50 %	50 %	0 %	0 %	384423571
4502	NC_017270	CTA	2	6	234777	234782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423571
4503	NC_017270	A	7	7	234782	234788	100 %	0 %	0 %	0 %	384423571
4504	NC_017270	ATGT	2	8	234890	234897	25 %	50 %	25 %	0 %	384423571
4505	NC_017270	TAT	2	6	234915	234920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423571
4506	NC_017270	TA	3	6	234924	234929	50 %	50 %	0 %	0 %	384423571
4507	NC_017270	AAG	2	6	234946	234951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423571
4508	NC_017270	CTAC	2	8	234986	234993	25 %	25 %	0 %	50 %	384423571
4509	NC_017270	ATC	2	6	234998	235003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423571
4510	NC_017270	GTG	2	6	235023	235028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423571
4511	NC_017270	GTTT	2	8	235054	235061	0 %	75 %	25 %	0 %	384423571
4512	NC_017270	CTG	2	6	235089	235094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423571
4513	NC_017270	ATT	2	6	235142	235147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423571
4514	NC_017270	TCAA	2	8	235150	235157	50 %	25 %	0 %	25 %	384423571
4515	NC_017270	ATT	2	6	235236	235241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423571
4516	NC_017270	CAA	2	6	235256	235261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423571
4517	NC_017270	AAG	2	6	235316	235321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423571
4518	NC_017270	ATC	2	6	235344	235349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423571
4519	NC_017270	TAT	2	6	235365	235370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423571
4520	NC_017270	ATTTT	2	10	235503	235512	20 %	80 %	0 %	0 %	384423571
4521	NC_017270	GA	3	6	235562	235567	50 %	0 %	50 %	0 %	384423571
4522	NC_017270	ATT	2	6	235593	235598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423571
4523	NC_017270	CT	4	8	235606	235613	0 %	50 %	0 %	50 %	384423571
4524	NC_017270	GGT	2	6	235655	235660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423571
4525	NC_017270	GAA	2	6	235745	235750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423571
4526	NC_017270	GAAA	2	8	235792	235799	75 %	0 %	25 %	0 %	384423571
4527	NC_017270	AT	3	6	235837	235842	50 %	50 %	0 %	0 %	384423571
4528	NC_017270	T	6	6	235916	235921	0 %	100 %	0 %	0 %	384423571
4529	NC_017270	T	6	6	235954	235959	0 %	100 %	0 %	0 %	384423572
4530	NC_017270	GAT	2	6	236112	236117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423572
4531	NC_017270	AT	3	6	236259	236264	50 %	50 %	0 %	0 %	384423572
4532	NC_017270	TTC	3	9	236278	236286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423572
4533	NC_017270	ATA	2	6	236287	236292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423572
4534	NC_017270	ACCA	2	8	236294	236301	50 %	0 %	0 %	50 %	384423572
4535	NC_017270	GCTA	2	8	236397	236404	25 %	25 %	25 %	25 %	384423572
4536	NC_017270	CTTT	2	8	236473	236480	0 %	75 %	0 %	25 %	384423572
4537	NC_017270	AATT	2	8	236566	236573	50 %	50 %	0 %	0 %	384423572
4538	NC_017270	ATA	2	6	236583	236588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423572
4539	NC_017270	TAG	2	6	236623	236628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423572
4540	NC_017270	T	6	6	236692	236697	0 %	100 %	0 %	0 %	384423572
4541	NC_017270	GTA	2	6	236702	236707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423572
4542	NC_017270	ACA	2	6	236773	236778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423573
4543	NC_017270	TGG	2	6	236793	236798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423573
4544	NC_017270	AGA	2	6	236874	236879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423573
4545	NC_017270	TAT	2	6	236895	236900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423573
4546	NC_017270	CCA	2	6	236956	236961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423573
4547	NC_017270	TGAC	2	8	237002	237009	25 %	25 %	25 %	25 %	384423573
4548	NC_017270	CAA	2	6	237097	237102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423573
4549	NC_017270	GAA	2	6	237109	237114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423573
4550	NC_017270	AT	3	6	237224	237229	50 %	50 %	0 %	0 %	384423573
4551	NC_017270	TGA	2	6	237258	237263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423573
4552	NC_017270	AAG	2	6	237307	237312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423573
4553	NC_017270	GTT	2	6	237322	237327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423573
4554	NC_017270	TCT	2	6	237331	237336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423573
4555	NC_017270	ACT	2	6	237431	237436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423573
4556	NC_017270	A	6	6	237451	237456	100 %	0 %	0 %	0 %	384423573
4557	NC_017270	A	6	6	237470	237475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017270	GAA	2	6	237519	237524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423574
4559	NC_017270	A	6	6	237523	237528	100 %	0 %	0 %	0 %	384423574
4560	NC_017270	TAT	2	6	237569	237574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423574
4561	NC_017270	TAA	2	6	237575	237580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423574
4562	NC_017270	AAT	2	6	237632	237637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423574
4563	NC_017270	AGT	2	6	237662	237667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423574
4564	NC_017270	AGA	2	6	237695	237700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423574
4565	NC_017270	TAAT	2	8	237724	237731	50 %	50 %	0 %	0 %	384423574
4566	NC_017270	GA	3	6	237758	237763	50 %	0 %	50 %	0 %	384423575
4567	NC_017270	A	8	8	237853	237860	100 %	0 %	0 %	0 %	384423575
4568	NC_017270	TAA	2	6	237919	237924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423575
4569	NC_017270	TATT	2	8	238047	238054	25 %	75 %	0 %	0 %	384423575
4570	NC_017270	A	6	6	238056	238061	100 %	0 %	0 %	0 %	384423575
4571	NC_017270	TTA	2	6	238071	238076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423575
4572	NC_017270	ATAG	2	8	238082	238089	50 %	25 %	25 %	0 %	384423575
4573	NC_017270	ATA	2	6	238101	238106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423575
4574	NC_017270	TAC	2	6	238156	238161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423575
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4578	NC_017270	AT	3	6	238429	238434	50 %	50 %	0 %	0 %	384423575
4579	NC_017270	ATG	2	6	238617	238622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423575
4580	NC_017270	ATC	2	6	238667	238672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423575
4581	NC_017270	ATA	2	6	238674	238679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423575
4582	NC_017270	GTT	2	6	238820	238825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423575
4583	NC_017270	AAT	2	6	238861	238866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423575
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4588	NC_017270	TTG	2	6	238995	239000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423575
4589	NC_017270	A	6	6	239084	239089	100 %	0 %	0 %	0 %	384423575
4590	NC_017270	TATAG	2	10	239090	239099	40 %	40 %	20 %	0 %	384423575
4591	NC_017270	TCT	2	6	239150	239155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423575
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4594	NC_017270	CCTT	2	8	239290	239297	0 %	50 %	0 %	50 %	384423576
4595	NC_017270	TTA	2	6	239333	239338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423576
4596	NC_017270	GGC	2	6	239455	239460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423576
4597	NC_017270	TGC	2	6	239577	239582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423576
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4599	NC_017270	GCT	2	6	239623	239628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423576
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4601	NC_017270	AAC	2	6	239745	239750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423576
4602	NC_017270	CT	4	8	239762	239769	0 %	50 %	0 %	50 %	384423576
4603	NC_017270	TGAT	2	8	239795	239802	25 %	50 %	25 %	0 %	384423576
4604	NC_017270	TGA	2	6	239810	239815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423576
4605	NC_017270	AAT	2	6	239841	239846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423576
4606	NC_017270	AGC	2	6	239884	239889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423576
4607	NC_017270	CAA	2	6	239908	239913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423576
4608	NC_017270	GCT	2	6	239914	239919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423576
4609	NC_017270	GGGT	2	8	239929	239936	0 %	25 %	75 %	0 %	384423576
4610	NC_017270	TTA	2	6	240022	240027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423576
4611	NC_017270	TAA	2	6	240111	240116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423576
4612	NC_017270	ATT	2	6	240123	240128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423576
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4614	NC_017270	CTG	2	6	240224	240229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423576
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4616	NC_017270	ACTT	2	8	240376	240383	25 %	50 %	0 %	25 %	384423577
4617	NC_017270	CAT	2	6	240396	240401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423577
4618	NC_017270	A	7	7	240436	240442	100 %	0 %	0 %	0 %	384423577
4619	NC_017270	GAT	2	6	240543	240548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423577
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4622	NC_017270	AGG	2	6	240658	240663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384423577
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