MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017269	TTC	2	6	74	79	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017269	TGA	3	9	146	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422537
3	NC_017269	ATAA	2	8	155	162	75 %	25 %	0 %	0 %	384422537
4	NC_017269	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422537
5	NC_017269	CAAG	2	8	244	251	50 %	0 %	25 %	25 %	384422537
6	NC_017269	TCC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017269	GAT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017269	CAG	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017269	TTC	2	6	325	330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017269	A	6	6	334	339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017269	TCA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017269	GAT	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017269	TCG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017269	TGA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017269	TCAA	2	8	546	553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017269	AAC	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017269	ATC	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017269	CT	3	6	694	699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017269	ATC	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017269	AGGA	2	8	732	739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017269	TG	3	6	787	792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017269	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017269	AAT	2	6	938	943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017269	ACA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017269	TTTA	2	8	1059	1066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017269	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422538
27	NC_017269	AGC	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
28	NC_017269	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422538
29	NC_017269	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	384422538
30	NC_017269	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
31	NC_017269	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
32	NC_017269	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	384422538
33	NC_017269	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	384422538
34	NC_017269	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	384422538
35	NC_017269	AAAAGC	2	12	1546	1557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384422538
36	NC_017269	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	384422538
37	NC_017269	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	384422538
38	NC_017269	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
39	NC_017269	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
40	NC_017269	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
41	NC_017269	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	384422538
42	NC_017269	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
43	NC_017269	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
44	NC_017269	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	384422538
45	NC_017269	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422538
46	NC_017269	TC	3	6	1928	1933	0 %	50 %	0 %	50 %	384422538
47	NC_017269	A	6	6	1944	1949	100 %	0 %	0 %	0 %	384422538
48	NC_017269	GC	3	6	2091	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	384422538
49	NC_017269	T	6	6	2190	2195	0 %	100 %	0 %	0 %	384422538
50	NC_017269	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422538
51	NC_017269	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
52	NC_017269	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
53	NC_017269	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
54	NC_017269	TC	3	6	2405	2410	0 %	50 %	0 %	50 %	384422538
55	NC_017269	GAAGG	2	10	2412	2421	40 %	0 %	60 %	0 %	384422538
56	NC_017269	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422538
57	NC_017269	ATGTG	2	10	2522	2531	20 %	40 %	40 %	0 %	384422538
58	NC_017269	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422538
59	NC_017269	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
60	NC_017269	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
61	NC_017269	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
62	NC_017269	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422538
63	NC_017269	GT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	50 %	0 %	384422538
64	NC_017269	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
65	NC_017269	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422538
66	NC_017269	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	384422538
67	NC_017269	AGATG	2	10	3086	3095	40 %	20 %	40 %	0 %	384422538
68	NC_017269	ACA	2	6	3155	3160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017269	CCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017269	TGA	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017269	GCTC	2	8	3271	3278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017269	T	7	7	3279	3285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017269	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422539
74	NC_017269	TGAGAT	2	12	3415	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422539
75	NC_017269	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	384422539
76	NC_017269	AGCA	2	8	3487	3494	50 %	0 %	25 %	25 %	384422539
77	NC_017269	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422539
78	NC_017269	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422539
79	NC_017269	GCTTT	2	10	3646	3655	0 %	60 %	20 %	20 %	384422539
80	NC_017269	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422539
81	NC_017269	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422539
82	NC_017269	GT	3	6	3763	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	384422539
83	NC_017269	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	384422539
84	NC_017269	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422539
85	NC_017269	A	7	7	3811	3817	100 %	0 %	0 %	0 %	384422539
86	NC_017269	AG	3	6	3959	3964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017269	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422540
88	NC_017269	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422540
89	NC_017269	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422540
90	NC_017269	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422540
91	NC_017269	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422540
92	NC_017269	CTTA	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017269	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	384422541
94	NC_017269	A	7	7	4548	4554	100 %	0 %	0 %	0 %	384422541
95	NC_017269	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422541
96	NC_017269	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	384422541
97	NC_017269	CAG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017269	AG	3	6	4796	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017269	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422542
100	NC_017269	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422542
101	NC_017269	A	6	6	4973	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	384422542
102	NC_017269	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	384422542
103	NC_017269	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422542
104	NC_017269	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	384422542
105	NC_017269	CA	3	6	5193	5198	50 %	0 %	0 %	50 %	384422542
106	NC_017269	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422542
107	NC_017269	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422542
108	NC_017269	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422542
109	NC_017269	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	384422542
110	NC_017269	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422542
111	NC_017269	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422542
112	NC_017269	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422542
113	NC_017269	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422542
114	NC_017269	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422543
115	NC_017269	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422543
116	NC_017269	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	384422543
117	NC_017269	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422543
118	NC_017269	TG	3	6	6051	6056	0 %	50 %	50 %	0 %	384422543
119	NC_017269	CGA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422543
120	NC_017269	GGCAG	2	10	6133	6142	20 %	0 %	60 %	20 %	384422543
121	NC_017269	GC	3	6	6148	6153	0 %	0 %	50 %	50 %	384422543
122	NC_017269	TC	3	6	6196	6201	0 %	50 %	0 %	50 %	384422543
123	NC_017269	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422543
124	NC_017269	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	384422543
125	NC_017269	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	384422543
126	NC_017269	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	384422543
127	NC_017269	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422543
128	NC_017269	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422543
129	NC_017269	TCA	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017269	AAC	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017269	GC	3	6	6636	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	384422544
132	NC_017269	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422544
133	NC_017269	TGCTC	2	10	6776	6785	0 %	40 %	20 %	40 %	384422544
134	NC_017269	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422544
135	NC_017269	T	6	6	6845	6850	0 %	100 %	0 %	0 %	384422544
136	NC_017269	GCC	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422544
137	NC_017269	CACG	2	8	6878	6885	25 %	0 %	25 %	50 %	384422544
138	NC_017269	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422544
139	NC_017269	TG	3	6	6963	6968	0 %	50 %	50 %	0 %	384422544
140	NC_017269	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	384422544
141	NC_017269	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422544
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145	NC_017269	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	384422544
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169	NC_017269	AGCGGT	2	12	8329	8340	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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172	NC_017269	AGTG	2	8	8483	8490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017269	AG	3	6	8516	8521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017269	CAT	2	6	8561	8566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422545
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271	NC_017269	GGC	2	6	13179	13184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422546
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273	NC_017269	ACCA	2	8	13342	13349	50 %	0 %	0 %	50 %	384422546
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275	NC_017269	GAGT	2	8	13380	13387	25 %	25 %	50 %	0 %	384422546
276	NC_017269	CTG	2	6	13402	13407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422546
277	NC_017269	ACC	2	6	13439	13444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422546
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