MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 17931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2252	NC_017269	TGC	2	6	117938	117943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422630
2253	NC_017269	TGGGG	2	10	117954	117963	0 %	20 %	80 %	0 %	384422630
2254	NC_017269	TG	3	6	117970	117975	0 %	50 %	50 %	0 %	384422630
2255	NC_017269	CGAC	2	8	117977	117984	25 %	0 %	25 %	50 %	384422630
2256	NC_017269	TG	3	6	118129	118134	0 %	50 %	50 %	0 %	384422630
2257	NC_017269	GGTAC	2	10	118330	118339	20 %	20 %	40 %	20 %	384422630
2258	NC_017269	CA	3	6	118431	118436	50 %	0 %	0 %	50 %	384422630
2259	NC_017269	GTGAT	2	10	118639	118648	20 %	40 %	40 %	0 %	384422631
2260	NC_017269	T	6	6	118695	118700	0 %	100 %	0 %	0 %	384422631
2261	NC_017269	G	6	6	118767	118772	0 %	0 %	100 %	0 %	384422631
2262	NC_017269	AGC	2	6	118777	118782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422631
2263	NC_017269	T	6	6	118793	118798	0 %	100 %	0 %	0 %	384422631
2264	NC_017269	GATT	2	8	118807	118814	25 %	50 %	25 %	0 %	384422631
2265	NC_017269	TAC	2	6	118848	118853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422631
2266	NC_017269	TGG	2	6	118906	118911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422631
2267	NC_017269	ATT	2	6	119022	119027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422631
2268	NC_017269	ATTG	2	8	119166	119173	25 %	50 %	25 %	0 %	384422631
2269	NC_017269	TAT	2	6	119186	119191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422631
2270	NC_017269	T	6	6	119228	119233	0 %	100 %	0 %	0 %	384422631
2271	NC_017269	TGG	2	6	119269	119274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422631
2272	NC_017269	GATG	2	8	119318	119325	25 %	25 %	50 %	0 %	384422631
2273	NC_017269	TGA	2	6	119622	119627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422632
2274	NC_017269	GCA	2	6	119664	119669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422632
2275	NC_017269	AGTG	2	8	119737	119744	25 %	25 %	50 %	0 %	384422632
2276	NC_017269	GAA	2	6	119792	119797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422632
2277	NC_017269	ACCA	2	8	119890	119897	50 %	0 %	0 %	50 %	384422632
2278	NC_017269	GCG	2	6	119936	119941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422632
2279	NC_017269	CCT	2	6	119952	119957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384422632
2280	NC_017269	GAT	2	6	119963	119968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422632
2281	NC_017269	AGC	2	6	119979	119984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422632
2282	NC_017269	TGC	2	6	120027	120032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422632
2283	NC_017269	AGA	2	6	120253	120258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422632
2284	NC_017269	CA	3	6	120314	120319	50 %	0 %	0 %	50 %	384422632
2285	NC_017269	TG	3	6	120452	120457	0 %	50 %	50 %	0 %	384422632
2286	NC_017269	CAA	2	6	120479	120484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422632
2287	NC_017269	GTGA	2	8	120485	120492	25 %	25 %	50 %	0 %	384422632
2288	NC_017269	CGT	2	6	120604	120609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422632
2289	NC_017269	GCG	2	6	120626	120631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422632
2290	NC_017269	CAC	2	6	120723	120728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422632
2291	NC_017269	TGC	2	6	120735	120740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422632
2292	NC_017269	CCA	2	6	120748	120753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422632
2293	NC_017269	CA	3	6	120775	120780	50 %	0 %	0 %	50 %	384422632
2294	NC_017269	CTA	2	6	120820	120825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422632
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2296	NC_017269	TCG	2	6	120988	120993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422633
2297	NC_017269	GTC	2	6	121134	121139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422633
2298	NC_017269	A	6	6	121168	121173	100 %	0 %	0 %	0 %	384422633
2299	NC_017269	GAG	2	6	121258	121263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422633
2300	NC_017269	GAA	2	6	121317	121322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422633
2301	NC_017269	TATT	2	8	121454	121461	25 %	75 %	0 %	0 %	384422634
2302	NC_017269	CAG	2	6	121483	121488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422634
2303	NC_017269	CAC	2	6	121632	121637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422634
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2307	NC_017269	CGT	2	6	121795	121800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422634
2308	NC_017269	ACG	2	6	121840	121845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422634
2309	NC_017269	GTG	2	6	121954	121959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422634
2310	NC_017269	TTA	2	6	122021	122026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422634
2311	NC_017269	GAGC	2	8	122050	122057	25 %	0 %	50 %	25 %	384422634
2312	NC_017269	TGC	3	9	122123	122131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422634
2313	NC_017269	TC	3	6	122211	122216	0 %	50 %	0 %	50 %	384422634
2314	NC_017269	GT	5	10	122217	122226	0 %	50 %	50 %	0 %	384422634
2315	NC_017269	GTC	2	6	122255	122260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422634
2316	NC_017269	GCC	2	6	122262	122267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422634
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2319	NC_017269	ATC	2	6	122452	122457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422634
2320	NC_017269	CTA	2	6	122628	122633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422634
2321	NC_017269	TGC	2	6	122700	122705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422634
2322	NC_017269	A	6	6	122766	122771	100 %	0 %	0 %	0 %	384422635
2323	NC_017269	TGT	2	6	122791	122796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422635
2324	NC_017269	CGA	2	6	122798	122803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422635
2325	NC_017269	A	6	6	122809	122814	100 %	0 %	0 %	0 %	384422635
2326	NC_017269	ACT	2	6	122830	122835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422635
2327	NC_017269	TGAT	2	8	122869	122876	25 %	50 %	25 %	0 %	384422635
2328	NC_017269	ACA	2	6	122932	122937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422635
2329	NC_017269	TTTA	2	8	123216	123223	25 %	75 %	0 %	0 %	384422635
2330	NC_017269	GCC	2	6	123301	123306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422635
2331	NC_017269	CTG	2	6	123315	123320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422635
2332	NC_017269	AGC	2	6	123321	123326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422635
2333	NC_017269	AG	3	6	123332	123337	50 %	0 %	50 %	0 %	384422635
2334	NC_017269	CCGA	2	8	123360	123367	25 %	0 %	25 %	50 %	384422635
2335	NC_017269	GTGC	2	8	123375	123382	0 %	25 %	50 %	25 %	384422635
2336	NC_017269	CAGA	2	8	123398	123405	50 %	0 %	25 %	25 %	384422635
2337	NC_017269	TG	3	6	123410	123415	0 %	50 %	50 %	0 %	384422635
2338	NC_017269	TGC	2	6	123475	123480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422635
2339	NC_017269	TCAA	2	8	123502	123509	50 %	25 %	0 %	25 %	384422635
2340	NC_017269	TCAA	2	8	123511	123518	50 %	25 %	0 %	25 %	384422635
2341	NC_017269	GGT	2	6	123542	123547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2342	NC_017269	CT	3	6	123700	123705	0 %	50 %	0 %	50 %	384422636
2343	NC_017269	CAAG	2	8	123723	123730	50 %	0 %	25 %	25 %	384422636
2344	NC_017269	CTG	2	6	123820	123825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422636
2345	NC_017269	AAG	2	6	123839	123844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422636
2346	NC_017269	GCT	2	6	123849	123854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422636
2347	NC_017269	GTTT	2	8	123953	123960	0 %	75 %	25 %	0 %	384422636
2348	NC_017269	A	6	6	123985	123990	100 %	0 %	0 %	0 %	384422636
2349	NC_017269	GAT	2	6	123999	124004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422636
2350	NC_017269	GCC	2	6	124069	124074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422636
2351	NC_017269	TCCTG	2	10	124140	124149	0 %	40 %	20 %	40 %	384422636
2352	NC_017269	TGG	2	6	124175	124180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422636
2353	NC_017269	CGC	2	6	124195	124200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422636
2354	NC_017269	AAC	2	6	124204	124209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422636
2355	NC_017269	TGG	2	6	124217	124222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422636
2356	NC_017269	TGGC	2	8	124277	124284	0 %	25 %	50 %	25 %	384422636
2357	NC_017269	CCCA	2	8	124291	124298	25 %	0 %	0 %	75 %	384422636
2358	NC_017269	TGAT	2	8	124391	124398	25 %	50 %	25 %	0 %	384422636
2359	NC_017269	AAG	2	6	124472	124477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422636
2360	NC_017269	GTG	2	6	124520	124525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422636
2361	NC_017269	GGC	2	6	124539	124544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422636
2362	NC_017269	GAC	2	6	124545	124550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422636
2363	NC_017269	CGAT	2	8	124631	124638	25 %	25 %	25 %	25 %	384422636
2364	NC_017269	CA	3	6	124685	124690	50 %	0 %	0 %	50 %	384422636
2365	NC_017269	TCA	2	6	124697	124702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422636
2366	NC_017269	TGA	2	6	124704	124709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422636
2367	NC_017269	GTC	2	6	124754	124759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422636
2368	NC_017269	AGCG	2	8	124927	124934	25 %	0 %	50 %	25 %	384422636
2369	NC_017269	GCA	3	9	125001	125009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422636
2370	NC_017269	A	6	6	125009	125014	100 %	0 %	0 %	0 %	384422636
2371	NC_017269	TGG	2	6	125018	125023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422636
2372	NC_017269	ATC	2	6	125029	125034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422636
2373	NC_017269	GCTGA	2	10	125044	125053	20 %	20 %	40 %	20 %	384422636
2374	NC_017269	GCAAGA	2	12	125070	125081	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384422636
2375	NC_017269	TGG	2	6	125096	125101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422636
2376	NC_017269	GC	4	8	125344	125351	0 %	0 %	50 %	50 %	384422636
2377	NC_017269	CGT	2	6	125359	125364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422636
2378	NC_017269	CTG	2	6	125389	125394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422636
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2383	NC_017269	GGT	2	6	125601	125606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422636
2384	NC_017269	TGA	2	6	125613	125618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422636
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2387	NC_017269	TGA	2	6	125790	125795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422636
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2389	NC_017269	CTGCT	2	10	125831	125840	0 %	40 %	20 %	40 %	384422636
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2492	NC_017269	ACCGCC	2	12	130553	130564	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384422640
2493	NC_017269	TGC	2	6	130590	130595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422640
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2495	NC_017269	TGC	2	6	130830	130835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422640
2496	NC_017269	GAA	2	6	130865	130870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422640
2497	NC_017269	GCGA	2	8	130949	130956	25 %	0 %	50 %	25 %	384422640
2498	NC_017269	GTG	2	6	130983	130988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422640
2499	NC_017269	CAA	2	6	131009	131014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422640
2500	NC_017269	TACC	2	8	131019	131026	25 %	25 %	0 %	50 %	384422640

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